基因總覽
CNNM3 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3。其蛋白質產物屬於 ACDP family,並被註記為可能的金屬轉運蛋白。蛋白質序列包含 CNNM transmembrane domain 與兩個 CBS domain,另有多段跨膜螺旋;這些結構註記構成其基本分子特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305510 ★ | 96,816,268–96,835,382 | 8 |
| ENST00000377060 | 96,816,245–96,835,382 | 7 |
| ENST00000867797 | 96,816,245–96,835,382 | 7 |
| ENST00000947262 | 96,816,245–96,835,382 | 6 |
| ENST00000947263 | 96,816,245–96,835,382 | 8 |
| ENST00000947264 | 96,816,245–96,835,382 | 8 |
| ENST00000947265 | 96,816,245–96,835,382 | 8 |
| ENST00001142640 | 96,816,245–96,835,382 | 8 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CNNM3 被註記為可能的金屬轉運蛋白。此描述指出其可能參與金屬的轉運,但來源未進一步說明所運送的金屬種類、轉運方向、分子機制或調控方式,因此不能據此推定更具體的作用。
Promoter 與基因調控
>CNNM3 ENST00000305510 GRCh38 chr2:96815268-96816368 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGATCATATCTGATGGGTAAAGAATATTCCATACTGTCAACAGACCACACTGTCTTCTAAAATCGCTTC AGCAGTGAGGATCCTCTGGAATAGATCTTGTTAATCCTGAGGAATTATTCTCCCAGCGGTGAGCTATGAG AAGTGGAATCACCAGATGTAGTAATTCCTGACAGAACTGCCGCCTGCTTGTGTGGCTGAGATGCTGACCT AGGTATCAGGCTGGTCGCGCCGGAACCCAGCACCCACGCTGAGTCTTTCTGAGCTCCACTCTGCTCCTGT TAGATATTAACCACCTGAGGTAGCTGTCCAGATTCAAGGCGGTAGTGATTTTGTGTGTCTGTGTATTTAT CACGGGGTCCGCGGCGGGAACGCAGGGGCTGTGTCCCACGTCCCCAAACCTCTAGTAGGGTACGGCGCGA TGAACATCTTCCATAAACCTTAAACCTCCCGGCGCTCAGTCACTGGTTCTTATTTCAGCCCTCTTAGCCC CGTAGGTCGGCGCGCTGAAAACCTTTCTGGTACCTGGGGCCTTTCCTAAGAAAAAGGCACATGTCTCGCA CATTTCAGTCTGGTCTGCAACTTCAGGCGCGCCAGCACCCGAGGTTCTTCCGACCGGCCGCTCCGCTCCC AAGCCGGGAACTTCCCAGAGAATTGGCTCGGCCTCCGGGCGCGGGGGACAGCATCGGGAGGAGTGGGACT CCGGGCGCCGCGCACGGGCCGAGGACAGCCGGGCTTGGGAGGCCCTGCCCGCCGCCCCGCGTCCTCCCGG CCACTGCCACCCCGCGCATCCGGAGCCGCAGCAGACTCGGCGGGGCCCGGAGCCCCACGCCCCCGGCCCG CCCCTGGCCGCCACTTGTTTACTCCCCGGCGCAGCCTAGTCCGACCCTGGGGCCCGCCCCCGCCCACCGC CTATTGGCCGAGGAGGCGCGAAGAGCCGTAACGATTGGCCCGGGGAGGCGCGGGGCGAGCGGGGTAGGCT GCGCGAGAGGCCGAGAGGGGGCAGCAGGCGATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGT TGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGGGGAGGCCGCGCCGGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CNNM3_1 ↗ | 2:96,816,270 | 正股 | 96,816,221–96,816,280 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_93FFHQ · enhancer · 96811908–96812392 · regulatory
ENSR2_BP7QW · enhancer · 96815234–96816047 · regulatory
ENSR2_5SQSPJ · CTCF_binding_site · 96815412–96815433 · regulatory
ENSR2_84ST4T · promoter · 96816048–96816278 · regulatory
ENSR2_5SQSTG · CTCF_binding_site · 96816254–96816275 · regulatory
ENSR2_5SQSWC · CTCF_binding_site · 96816450–96816471 · regulatory
ENSR2_5SQSWP · CTCF_binding_site · 96816531–96816552 · regulatory
ENSR2_BP7RF · enhancer · 96818861–96819630 · regulatory
ENSR2_93FFL4 · enhancer · 96819949–96820348 · regulatory
ENSR2_5SQTJZ · CTCF_binding_site · 96820258–96820279 · regulatory
· motif · 96812240–96812248 · motif
· motif · 96815414–96815430 · motif
· motif · 96815815–96815831 · motif
· motif · 96815815–96815831 · motif
· motif · 96816091–96816101 · motif
· motif · 96816093–96816106 · motif
· motif · 96816102–96816112 · motif
· motif · 96816158–96816168 · motif
· motif · 96816160–96816173 · motif
· motif · 96816164–96816174 · motif
· motif · 96816256–96816272 · motif
· motif · 96816276–96816286 · motif
· motif · 96816278–96816291 · motif
· motif · 96816285–96816302 · motif
· motif · 96816344–96816357 · motif
· motif · 96816452–96816468 · motif
· motif · 96816518–96816531 · motif
· motif · 96816533–96816549 · motif
· motif · 96816548–96816561 · motif
· motif · 96816579–96816590 · motif
· motif · 96816579–96816590 · motif
· motif · 96816585–96816596 · motif
· motif · 96816585–96816596 · motif
· motif · 96816721–96816732 · motif
· motif · 96816748–96816759 · motif
· motif · 96816774–96816783 · motif
· motif · 96818087–96818098 · motif
· motif · 96819370–96819385 · motif
· motif · 96819370–96819385 · motif
· motif · 96820260–96820276 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:707 aa
CNNM3 蛋白質長 707 個胺基酸。序列註記包含 CNNM transmembrane domain,以及 CBS 1 和 CBS 2 兩個 CBS domain;另標示四段跨膜螺旋,位置分別為 11–27、193–213、221–241 與 261–281。C 端 678–707 區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CNNM3 被註記為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 來源未提供其定位改變條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 64 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGR2O95994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGR3Q8TD06 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKAP8LQ9ULX6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBY2Q8NA61 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COG6Q9Y2V7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOSC8Q96B26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL3Q13643 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNRNPKP61978-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KHDRBS2Q5VWX1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KHDRBS3O75525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KPRPQ5T749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT33BQ14525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAGCAGGCGATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGG40TTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCG80CGGGGGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTG120CCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTACGC160GGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCC200TGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGCTCTTGGTC240CTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCG280GCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGCGCTGCTGCGCTTGC320GCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCT360GGCGGTGCGCGTGGAGCCGGGTGGCGGGGCGGCTGAGGAG400GCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGC440TGCTGGCGCTGGCAGCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAG480CGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGC520GAGAGCGGCTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTT560TGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGC600GCTGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCG640GTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTGCCCG680CCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGA720GGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTGGACGCTGGCG760CTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCC800TGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGCCCGTGGGGCAGCTGCT840GGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTG880CTGGAGCTGGCGCGCGGCGGCGGCGACCCCTACAGCGATC920TCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。