演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CNNM3SLC70A3

cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3

CNNM3(cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3)是 ACDP 家族的蛋白質編碼基因,其產物可能具有金屬轉運功能。

Homo sapiens2q11.2UniProt Q8NE01
OFFICIAL SYMBOL
CNNM3
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q8NE01
PDB / ALPHAFOLD
6MN6
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CNNM3 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3。其蛋白質產物屬於 ACDP family,並被註記為可能的金屬轉運蛋白。蛋白質序列包含 CNNM transmembrane domain 與兩個 CBS domain,另有多段跨膜螺旋;這些結構註記構成其基本分子特徵。

Official symbol
CNNM3
Gene name
cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:104
UniProt
Q8NE01
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SLC70A3ACDP3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q11.2
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegCNNM3pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:96,816,238–96,837,543
Gene span
21,306 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305510 ★96,816,268–96,835,3828
ENST0000037706096,816,245–96,835,3827
ENST0000086779796,816,245–96,835,3827
ENST0000094726296,816,245–96,835,3826
ENST0000094726396,816,245–96,835,3828
ENST0000094726496,816,245–96,835,3828
ENST0000094726596,816,245–96,835,3828
ENST0000114264096,816,245–96,835,3828

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CNNM3 被註記為可能的金屬轉運蛋白。此描述指出其可能參與金屬的轉運,但來源未進一步說明所運送的金屬種類、轉運方向、分子機制或調控方式,因此不能據此推定更具體的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 96816268 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CNNM3 ENST00000305510 GRCh38 chr2:96815268-96816368 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGATCATATCTGATGGGTAAAGAATATTCCATACTGTCAACAGACCACACTGTCTTCTAAAATCGCTTC
AGCAGTGAGGATCCTCTGGAATAGATCTTGTTAATCCTGAGGAATTATTCTCCCAGCGGTGAGCTATGAG
AAGTGGAATCACCAGATGTAGTAATTCCTGACAGAACTGCCGCCTGCTTGTGTGGCTGAGATGCTGACCT
AGGTATCAGGCTGGTCGCGCCGGAACCCAGCACCCACGCTGAGTCTTTCTGAGCTCCACTCTGCTCCTGT
TAGATATTAACCACCTGAGGTAGCTGTCCAGATTCAAGGCGGTAGTGATTTTGTGTGTCTGTGTATTTAT
CACGGGGTCCGCGGCGGGAACGCAGGGGCTGTGTCCCACGTCCCCAAACCTCTAGTAGGGTACGGCGCGA
TGAACATCTTCCATAAACCTTAAACCTCCCGGCGCTCAGTCACTGGTTCTTATTTCAGCCCTCTTAGCCC
CGTAGGTCGGCGCGCTGAAAACCTTTCTGGTACCTGGGGCCTTTCCTAAGAAAAAGGCACATGTCTCGCA
CATTTCAGTCTGGTCTGCAACTTCAGGCGCGCCAGCACCCGAGGTTCTTCCGACCGGCCGCTCCGCTCCC
AAGCCGGGAACTTCCCAGAGAATTGGCTCGGCCTCCGGGCGCGGGGGACAGCATCGGGAGGAGTGGGACT
CCGGGCGCCGCGCACGGGCCGAGGACAGCCGGGCTTGGGAGGCCCTGCCCGCCGCCCCGCGTCCTCCCGG
CCACTGCCACCCCGCGCATCCGGAGCCGCAGCAGACTCGGCGGGGCCCGGAGCCCCACGCCCCCGGCCCG
CCCCTGGCCGCCACTTGTTTACTCCCCGGCGCAGCCTAGTCCGACCCTGGGGCCCGCCCCCGCCCACCGC
CTATTGGCCGAGGAGGCGCGAAGAGCCGTAACGATTGGCCCGGGGAGGCGCGGGGCGAGCGGGGTAGGCT
GCGCGAGAGGCCGAGAGGGGGCAGCAGGCGATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGT
TGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGGGGAGGCCGCGCCGGGCC
CNNM3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CNNM3_1 ↗2:96,816,270正股96,816,221–96,816,280

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_93FFHQ · enhancer · 96811908–96812392 · regulatory

ENSR2_BP7QW · enhancer · 96815234–96816047 · regulatory

ENSR2_5SQSPJ · CTCF_binding_site · 96815412–96815433 · regulatory

ENSR2_84ST4T · promoter · 96816048–96816278 · regulatory

ENSR2_5SQSTG · CTCF_binding_site · 96816254–96816275 · regulatory

ENSR2_5SQSWC · CTCF_binding_site · 96816450–96816471 · regulatory

ENSR2_5SQSWP · CTCF_binding_site · 96816531–96816552 · regulatory

ENSR2_BP7RF · enhancer · 96818861–96819630 · regulatory

ENSR2_93FFL4 · enhancer · 96819949–96820348 · regulatory

ENSR2_5SQTJZ · CTCF_binding_site · 96820258–96820279 · regulatory

· motif · 96812240–96812248 · motif

· motif · 96815414–96815430 · motif

· motif · 96815815–96815831 · motif

· motif · 96815815–96815831 · motif

· motif · 96816091–96816101 · motif

· motif · 96816093–96816106 · motif

· motif · 96816102–96816112 · motif

· motif · 96816158–96816168 · motif

· motif · 96816160–96816173 · motif

· motif · 96816164–96816174 · motif

· motif · 96816256–96816272 · motif

· motif · 96816276–96816286 · motif

· motif · 96816278–96816291 · motif

· motif · 96816285–96816302 · motif

· motif · 96816344–96816357 · motif

· motif · 96816452–96816468 · motif

· motif · 96816518–96816531 · motif

· motif · 96816533–96816549 · motif

· motif · 96816548–96816561 · motif

· motif · 96816579–96816590 · motif

· motif · 96816579–96816590 · motif

· motif · 96816585–96816596 · motif

· motif · 96816585–96816596 · motif

· motif · 96816721–96816732 · motif

· motif · 96816748–96816759 · motif

· motif · 96816774–96816783 · motif

· motif · 96818087–96818098 · motif

· motif · 96819370–96819385 · motif

· motif · 96819370–96819385 · motif

· motif · 96820260–96820276 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:707 aa

1 aa707 aa結構域功能區域跨膜區
依 Q8NE01 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CNNM3 蛋白質長 707 個胺基酸。序列註記包含 CNNM transmembrane domain,以及 CBS 1 和 CBS 2 兩個 CBS domain;另標示四段跨膜螺旋,位置分別為 11–27、193–213、221–241 與 261–281。C 端 678–707 區段註記為無序區。

跨膜區Helical11–27 aa
跨膜區Helical193–213 aa
跨膜區Helical221–241 aa
跨膜區Helical261–281 aa
結構域CNNM transmembrane130–308 aa
結構域CBS 1318–379 aa
結構域CBS 2386–452 aa
功能區域Disordered678–707 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6MN6…

PDB · 6MN6

X-ray · 3.36 A · A/B=299-658

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

CNNM3 被註記為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 來源未提供其定位改變條件或不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLC70A3CNNM3ACTN2AGR2AGR3AKAP8LCALCOCO2CARD10CBY2CCNDBP1COG6CYSRT1EFEMP2EXOSC8FHL3FHL5GOLGA6L9HNRNPKHOXA1HSF2BPKHDRBS2KHDRBS3KPRPKRT31KRT33BKRT40KRTAP1-1KRTAP1-3KRTAP10-5KRTAP10-7KRTAP10-8KRTAP10-9KRTAP12-2KRTAP12-3KRTAP17-1KRTAP2-3KRTAP3-1KRTAP3-2KRTAP5-9KRTAP6-3KRTAP9-2KRTAP9-3KRTAP9-8LZTS2MDFIMID2MTUS2NOTCH2NLCP4HBPM20D2PNMA1PNMA2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 64 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CNNM3 被描述為可能的金屬轉運蛋白;此註記支持其可能具有金屬轉運角色,但未指出具體金屬種類、轉運方向或作用機制。推論支持
證據與來源

Probable metal transporter

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CNNM3 被註記為細胞膜上的多次跨膜蛋白;此定位描述未提供定位變動條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305510 · 4,900 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGCAGGCGATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGG40
41TTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCG80
81CGGGGGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTG120
121CCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTACGC160
161GGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCC200
201TGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGCTCTTGGTC240
241CTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCG280
281GCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGCGCTGCTGCGCTTGC320
321GCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCT360
361GGCGGTGCGCGTGGAGCCGGGTGGCGGGGCGGCTGAGGAG400
401GCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGC440
441TGCTGGCGCTGGCAGCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAG480
481CGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGC520
521GAGAGCGGCTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTT560
561TGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGC600
601GCTGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCG640
641GTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTGCCCG680
681CCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGA720
721GGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTGGACGCTGGCG760
761CTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCC800
801TGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGCCCGTGGGGCAGCTGCT840
841GGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTG880
881CTGGAGCTGGCGCGCGGCGGCGGCGACCCCTACAGCGATC920
921TCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。