演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CNNM2SLC70A2

cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2

CNNM2 是 ACDP 家族的多次跨膜蛋白;依相似性推定可運送二價金屬陽離子,且不同離子的運輸能力有排序。

Homo sapiens10q24.32UniProt Q9H8M5
OFFICIAL SYMBOL
CNNM2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q9H8M5
PDB / ALPHAFOLD
6N7E
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CNNM2(cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 ACDP 家族。此蛋白長 875 個胺基酸,具有多個跨膜區段,並含有 CNNM transmembrane、CBS 1 與 CBS 2 結構域。其拓樸註解顯示蛋白質分布於膜兩側,細胞質側區域延伸至 C 端。來源將其基本角色描述為二價金屬陽離子轉運蛋白;特定離子的運輸能力與排序則屬於相似性推定,相關機制見功能說明。

Official symbol
CNNM2
Gene name
cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:103
UniProt
Q9H8M5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SLC70A2ACDP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q24.32
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegCNNM2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:102,918,123–103,090,222
Gene span
172,100 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000369878 ★102,918,294–103,090,2228
ENST00000369875102,918,123–102,927,6182
ENST00000433628102,918,123–103,090,2227
ENST00000970832102,918,123–103,090,2227
ENST00001119355102,918,123–102,928,1713
ENST00001119356102,918,123–102,927,9023
ENST00001140995102,918,123–103,090,2228

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CNNM2 被註解為二價金屬陽離子轉運蛋白,來源指出它可介導此類離子的運輸。這項功能描述涵蓋多種二價陽離子,但沒有提供運輸方向、細胞或組織背景,也未說明轉運過程所需的條件,因此不宜據此延伸為特定生理情境下的完整機制。

依相似性推定,CNNM2 對不同離子的運輸能力有一個由高至低的次序:Mg(2+) > Co(2+) > Mn(2+) > Sr(2+) > Ba(2+) > Cu(2+) > Fe(2+)。這項排序表示 Mg(2+) 位於所列離子之首,Fe(2+) 則在末位;但來源未提供比較方法、數值或實驗系統,故此排序應保留為相似性推定,不應視為已由此資料直接證實的定量結果。

這項功能註解將 CNNM2 與多種二價金屬陽離子的跨膜運輸聯繫起來,並特別呈現其對 Mg(2+) 的相對運輸偏好。來源未進一步說明 CNNM2 如何辨識或移動離子,也未提供其他分子參與、調控方式或下游效應的資料;因此目前可支持的結論限於其轉運角色與上述推定的離子排序。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 102918294 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CNNM2 ENST00000369878 GRCh38 chr10:102917294-102918394 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAGACCCTAGCAGAGTTTGGTCAGTGTGATTAAGAATGAGCCTCTGTGGGTCTGTTTAGGATGCTTGCC
CCCTCCCATTTCCTTAACTTGCCTGAATTCCTGCTGGGAATACAGATTCGGGGCCCTTCCCACTCTGTAA
ATATGGGAAAAGGTCTAGGAAGTATATACTCCTAGCAATAATATGTAGGGGTTCTATGACTAGGAAATTT
GGGGAACTGTCCCCCTGACCGCTCCATCCGTAACTTCTGCACACCTTTTGGGGTACGCCGCCGACCTGGA
AAGCGTTGCAGGGCGCTCATGCTGCCCGCAGGTGGCGCCACGTGATCGCGAGCCGCAGAGAGCCCGTACC
CTAGGAGTCTCGAGGCGCGAGGACTGCTGGTCCGCAGCTGTGCCGGGGCCACCGACGCCGCTTACCCCGG
CGGAGCGCCGCGCAGGTGGAGTTGGGGACAGCGGCCGGTGCCCCGGCTTTTTAGGCTGTGTGCATCCCAA
GCCGCCTCTAGTTGGCTTCTCGGGCTTCCGGGGCAGGAGGGCGCGCGGCTTTGTGCCTACGAATTGAGAA
CTGGAGAGCCAGTAACCGGTGCACCGGGAACCTGCCGCCTTGCGCCGCAGGGCTTTAGTCCAAACCTGGC
CGGTCCAGGCTCCGGGATCTACTACAGGGGCCCCTGGGGAGCGCGGGCCCCAGGGACGGCTCCTTCCCAT
TGGCAGCAGGACGGATGCCACGCCCCTTTTTCTTCAGCTCTCATCTTTGACTGGCTCTCGAGTCCCAGAT
GGCCACGCCCCCTCCCCTCGCACATACACAAGAGTCACGCGCCTTTCAGTTGGAAACTTGGCGTGCAGAC
GGGGACGGTGGCTCTCGTCGCCCCACCCACTTACCTTGCCATTGGTCCGCGGAGCGGCACACGGTCACGC
CCCCATTCCAGCCCCCTGGCTGGGAGGGCGGGCACCCGCTTGTGATTGGCTGGTCGGCCTGCCTCTCGCG
GGAGCAGCCGGCGCTCCTCTCCCTCCCTCTTTCCCTCCCGCGAGCCTCGGGGTTCCTCAGCTGGCTGAGG
TGGAGTCAGTGTCAGTCAGGGAGGCGAACTGCTGAGCACTGGCCGCGGACG
CNNM2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CNNM2_1 ↗10:102,918,294正股102,918,245–102,918,304

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_CD7PS · enhancer · 102916894–102917947 · regulatory

ENSR10_5W7KZN · CTCF_binding_site · 102917226–102917247 · regulatory

ENSR10_93HSXK · promoter · 102917948–102918367 · regulatory

ENSR10_5W7L9H · CTCF_binding_site · 102918911–102918932 · regulatory

ENSR10_5W7L9Z · CTCF_binding_site · 102919016–102919037 · regulatory

· motif · 102917228–102917244 · motif

· motif · 102917519–102917536 · motif

· motif · 102917610–102917619 · motif

· motif · 102917610–102917619 · motif

· motif · 102917616–102917631 · motif

· motif · 102917724–102917733 · motif

· motif · 102917806–102917815 · motif

· motif · 102917952–102917965 · motif

· motif · 102917952–102917965 · motif

· motif · 102918010–102918020 · motif

· motif · 102918065–102918075 · motif

· motif · 102918071–102918081 · motif

· motif · 102918153–102918163 · motif

· motif · 102918197–102918207 · motif

· motif · 102918427–102918438 · motif

· motif · 102918515–102918525 · motif

· motif · 102918557–102918567 · motif

· motif · 102918651–102918668 · motif

· motif · 102918913–102918929 · motif

· motif · 102919018–102919034 · motif

· motif · 102919117–102919130 · motif

· motif · 102920179–102920189 · motif

· motif · 102920180–102920190 · motif

· motif · 102920244–102920254 · motif

· motif · 102923139–102923152 · motif

· motif · 102923139–102923152 · motif

· motif · 102923243–102923254 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:875 aa

1 aa875 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9H8M5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CNNM2 長 875 個胺基酸,含 CNNM transmembrane、CBS 1 與 CBS 2 結構域。註解預測其具有三段螺旋跨膜區,並標示出細胞外與細胞質側區域;另有兩段區域被註記為無序區。此蛋白屬於 ACDP 家族。

拓樸區域Extracellular1–250 aa
跨膜區Helical251–271 aa
拓樸區域Cytoplasmic272–313 aa
拓樸區域Cytoplasmic335–338 aa
跨膜區Helical339–359 aa
拓樸區域Extracellular360–368 aa
跨膜區Helical369–389 aa
拓樸區域Cytoplasmic390–875 aa
結構域CNNM transmembrane251–431 aa
結構域CBS 1450–511 aa
結構域CBS 2518–584 aa
功能區域Disordered121–151 aa
功能區域Disordered742–763 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6N7E…

PDB · 6N7E

X-ray · 3.50 A · A/B/C/D=429-722, A/B/C/D=768-817

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

CNNM2 被註記為細胞膜上的多次跨膜蛋白。 現有資料未描述定位隨條件改變的情形,也未提供異構型間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLC70A2CNNM2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CNNM2 相關變異被列為與 Hypomagnesemia 6 有關。此腎臟疾病的特徵是血清鎂嚴重降低,且沒有其他電解質異常;患者尿鎂排泄量未能適當升高,反映腎小管再吸收缺陷。發病年齡差異很大,部分患者無症狀。另有一種疾病以腎臟流失鎂、低血清鎂、癲癇及程度不一的心理動作發育遲緩為特徵,也被列為由影響 CNNM2 的變異所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CNNM2 被註解為二價金屬陽離子轉運蛋白,可介導這類離子的運輸。依相似性推定,其運輸能力由高至低排序為 Mg(2+)、Co(2+)、Mn(2+)、Sr(2+)、Ba(2+)、Cu(2+)及 Fe(2+);來源未提供排序的實驗條件或定量資料。推論支持
證據與來源

Divalent metal cation transporter. Mediates transport of divalent metal cations in an order of Mg(2+) > Co(2+) > Mn(2+) > Sr(2+) > Ba(2+) > Cu(2+) > Fe(2+) (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CNNM2 被註記為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Hypomagnesemia 6 是一種腎臟疾病,特徵為血清鎂嚴重降低,但沒有其他電解質異常。患者的尿鎂排泄未能適當升高,顯示腎小管再吸收有缺陷;臨床發病年齡差異很大,部分患者沒有症狀。此病被列為由影響 CNNM2 的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Hypomagnesemia 6 HOMG6 A renal disease characterized by severely lowered serum magnesium levels in the absence of other electrolyte disturbances. Affected individuals show an inappropriately normal urinary magnesium excretion, demonstrating a defect in tubular reabsorption. Age of clinical onset is highly variable and some affected individuals are asymptomatic. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613882

PMID 21397062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Hypomagnesemia, seizures, and impaired intellectual development 1 的特徵包括腎臟流失鎂、血清鎂偏低、癲癇,以及程度不一的心理動作發育遲緩。此病被列為由影響 CNNM2 的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Hypomagnesemia, seizures, and impaired intellectual development 1 HOMGSMR1 A disease characterized by renal wasting of magnesium, low serum magnesium, seizures, and variable degrees of delayed psychomotor development. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616418

PMID 24699222 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000369878 · 15,857 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCTCCCTCTTTCCCTCCCGCGAGCCTCGGGGTTCCTCAG40
41CTGGCTGAGGTGGAGTCAGTGTCAGTCAGGGAGGCGAACT80
81GCTGAGCACTGGCCGCGGACGCTCCGTTGCAGTCTCGCCC120
121AGGGGCCGGTACCTGCGCTCGCGCCGCCGGGTTGAAAGGA160
161TGAAGCCGCAGCTGGAGCAGCCACCCTATGATTGGCTGTG200
201GCGCTTGTGAACCCAAAGTAAAGATGGCGGGCGGGCAGGC240
241AGCCGCCGCACTGCCCACTTGGAAGATGGCGGCGCGCCGC280
281AGCCTCAGCGCTCGCGGCCGGGGGATCCTGCAGGCGGCTG320
321CGGGGCGGCTGCTGCCGCTGCTCCTGCTGAGCTGCTGCTG360
361CGGTGCGGGCGGCTGCGCAGCGGTGGGCGAGAATGAGGAG400
401ACGGTGATCATCGGGCTGCGACTGGAGGACACGAACGACG440
441TGTCGTTCATGGAAGGGGGGGCGCTGCGGGTGAGCGAACG480
481GACCCGGGTCAAGCTGCGGGTGTACGGGCAGAACATCAAT520
521AACGAGACGTGGTCCCGCATCGCCTTCACCGAGCACGAGC560
561GGCGGCGCCACAGCCCGGGGGAGCGCGGGCTGGGGGGCCC600
601CGCGCCGCCAGAGCCGGACAGCGGCCCCCAGCGATGCGGC640
641ATCCGCACCTCAGACATCATCATCTTGCCCCACATCATTC680
681TCAACCGCCGCACCTCGGGCATCATCGAGATCGAGATCAA720
721ACCGCTACGCAAGATGGAGAAGAGCAAGTCCTATTACCTG760
761TGCACGTCGCTCTCCACGCCCGCCCTGGGCGCCGGCGGCT800
801CGGGGTCCACGGGTGGCGCCGTCGGGGGCAAGGGTGGCTC840
841GGGGGTGGCCGGGCTCCCGCCGCCCCCGTGGGCCGAGACC880
881ACCTGGATTTACCACGACGGCGAGGACACCAAGATGATCG920
921TAGGCGAAGAGAAGAAGTTCCTGCTGCCCTTCTGGCTGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。