演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CMYA5SPRYD2

cardiomyopathy associated 5

CMYA5 編碼 Cardiomyopathy-associated protein 5,這種大型蛋白質可能參與肌肉中的訊號調節,並協助組裝橫紋肌的 RYR2 簇。

Homo sapiens5q14.1UniProt Q8N3K9
OFFICIAL SYMBOL
CMYA5
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q8N3K9
PDB / ALPHAFOLD
無模型
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CMYA5(cardiomyopathy associated 5)是蛋白質編碼基因,其產物 Cardiomyopathy-associated protein 5 長 4,069 個胺基酸。此蛋白質具有多個預測為無序的區域,並在 C 端帶有 Fibronectin type-III、B30.2/SPRY 等結構域,也包含兩段兩親性螺旋及 B-box coiled-coil 區域。來源所述功能多帶有「可能」或依序列相似性推定的限定;其涉及肌肉細胞內的訊號調節,以及橫紋肌中 RYR2 簇的組裝。

Official symbol
CMYA5
Gene name
cardiomyopathy associated 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14305
UniProt
Q8N3K9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SPRYD2DKFZp451G223TRIM76C5orf10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q14.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegCMYA5pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:79,689,356–79,800,607
Gene span
111,252 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000446378 ★79,689,836–79,800,22213
ENST0000085693479,689,777–79,800,60713
ENST0000094089079,689,777–79,800,6079
ENST0000094089179,689,777–79,800,60713
ENST0000094089279,689,777–79,800,21613
ENST0000113422279,689,777–79,800,60713

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CMYA5 可能協助安排 protein kinase A(PKA)在細胞內不同區域的分布。它可藉由結合 PRKAR2A 發揮錨定蛋白作用,讓 PKA 的區室化受到調節;此功能描述屬於依序列相似性推定,來源未將其列為已確立的普遍機制。

在肌肉的轉錄調控方面,CMYA5 可能抑制 calcineurin 介導的轉錄活性,並削弱 calcineurin 誘導慢肌纖維基因程式的能力。這些作用可能使 CMYA5 負向調節骨骼肌再生;相關描述同樣具有推論性,不能視為已證實的因果關係或單一作用路徑。

此外,CMYA5 依序列相似性被認為參與橫紋肌中 ryanodine receptor(RYR2)簇的組裝。這項功能將 CMYA5 與肌肉細胞內受體聚集的組織過程連結,但來源未進一步說明其組裝步驟、調節方向或對肌肉活動的具體影響。

因此,現有資料描繪的 CMYA5 可能同時參與細胞訊號區室化、calcineurin 相關轉錄調節,以及 RYR2 簇的組織。這些不同面向提示其功能涉及肌肉細胞內的空間安排與調控,但各項功能的證據限定仍需保留,不能據此推演未載明的生理或疾病機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 79689836 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CMYA5 ENST00000446378 GRCh38 chr5:79688836-79689936 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCGTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGCACTGGACCGAGATCGCGCCATTG
CACTCCAGTCTGGGCGACAAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGAGTAGACAGGTAAAACATG
GCCTGTTAGGCAACCGTTACCTTTGTGAGGGTGTTGGGGTTCAGTCTTTGAGCAGTGGGAAGCCATTGAG
GGGTTTTAACCACAACTTGATCCGGGGAAAGGTTTGGGGCATTTGGGCCAGTTTCAGACAAAACTTAGCT
TTTTGCTAACGTGGGGGAAATTGCTCCTCCTCAAGGTTTAAGATGAGTGGAGATAAAGTTTCCTGGCTCA
ATAACAGGGACCACTGAGCAAGAAAATACACAGTATATTGACTTGCGATATAAAGAGAGCCGGGACGGAA
CACTGGTTCAAAACTGGGCTTTTGAGCAGGGCACGCCTAGCTTTGTTTCTCATTGGGTCATTTTACTAGC
AATGACAGCCTGAGCTGCTGGAGCTCTTCGGAGTCTCAGTTTCCTCATCTGGGAAACCAGCACTACAGTA
AAACCTTCTACAGGTACCACCACAGAATCGAGGTAATGAAAGCGAGACCCTTAGCAGAGTGCCTGGTAGT
TAAGTGCCCAGCTCAGGGTATTGTTTGGGATAAAGGGTCCAGAAAGTAGCTCAGCTCAAAACCGAAAAGA
CTCACTCTGGAGGAAATAAGAGACGGGGCTAGGTTGCCTTTCCTCCTTTGAACCCCCTGGTGCAGCCGGA
GCCCGCGCCCCTTAAAGTGATCTCCAGTTGTCCGAAAGGCCCGCCAGGGATCTGGCGAAACGGGGGCGGG
GGAGGGCTCAGGGAAGAGGAGAAGCTGAGCCCGGGCCCCAGAAGCTCGGTGGCGAAACTTTGACGCCTTC
TATTTAAAGTCGCGGGGCTCGCCCGCCCCCGGCGCCGGGAACCCGAGCCGCCCCCGCAGGGGCAGGGCTG
GGGAGGGCAGGGGCCAGAGCAGTCGGAGGGAGAACACCAGGCGCGGCGCGGGCGGCTCCGGCTCCGGCCC
CGGCCCAGGCCCGGGAGAGGCGATGGCGAGCCGCGATAGCAACCACGCTGG
CMYA5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CMYA5_1 ↗5:79,689,836正股79,689,787–79,689,846

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_84C8XH · enhancer · 79685735–79685944 · regulatory

ENSR5_936M2B · promoter · 79689346–79689846 · regulatory

ENSR5_936M3T · enhancer · 79694706–79694994 · regulatory

· motif · 79690453–79690463 · motif

由杜興氏肌肉失養症(DMD)患者來源的肌肉細胞株中,CMYA5 表現量呈下調。此結果描述的是特定來源細胞株中的表現變化;資料未指出造成下調的機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:4069 aa

1 aa4069 aa結構域功能區域
依 Q8N3K9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Cardiomyopathy-associated protein 5 長 4,069 個胺基酸,含有多個預測為無序的區域。其 C 端註記有 Fibronectin type-III 1、Fibronectin type-III 2 與 B30.2/SPRY 結構域;另有 Amphipathic helix H1、B-box coiled-coil(BBC)、Amphipathic helix H2 與 H3。3052–3365 位的區域被註記為 RYR2 clustering 所需;此註記依序列相似性而來。

結構域Fibronectin type-III 13704–3805 aa
結構域Fibronectin type-III 23806–3898 aa
結構域B30.2/SPRY3880–4065 aa
功能區域Disordered1–177 aa
功能區域Disordered341–387 aa
功能區域Disordered442–525 aa
功能區域Disordered538–558 aa
功能區域Disordered597–705 aa
功能區域Disordered732–793 aa
功能區域Disordered844–872 aa
功能區域Disordered890–948 aa
功能區域Disordered979–1009 aa
功能區域Disordered1041–1097 aa
功能區域Disordered1160–1179 aa
功能區域Disordered1205–1237 aa
功能區域Disordered1540–1575 aa
功能區域Disordered1594–1742 aa
功能區域Disordered1757–1809 aa
功能區域Disordered1892–1988 aa
功能區域Disordered2064–2175 aa
功能區域Disordered2187–2259 aa
功能區域Disordered2385–2412 aa
功能區域Disordered2425–2463 aa
功能區域Disordered2494–2527 aa
功能區域Disordered2653–2706 aa
功能區域Disordered2750–2862 aa
功能區域Disordered3015–3037 aa
功能區域Required for RYR2 clustering3052–3365 aa
功能區域Disordered3119–3156 aa
功能區域Disordered3204–3231 aa
功能區域Disordered3386–3421 aa
功能區域Disordered3465–3495 aa
功能區域Amphipathic helix H13517–3544 aa
功能區域B-box coiled-coil; BBC3545–3672 aa
功能區域Amphipathic helix H23631–3648 aa
功能區域Amphipathic helix H33751–3767 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
目前沒有可用的 PDB 或 AlphaFold DB 模型。
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Sarcoplasmic reticulum;Cytoplasm;Cytoplasm, perinuclear region;Cytoplasm, myofibril, sarcomere, M line

CMYA5 在細胞中主要分布於細胞核周邊,也可見於細胞其他區域;在骨骼肌中,它沿肌纖維周邊及 costameres 定位,通常鄰近 Z-disks,偶爾出現在 M-band。 它也被描述為位於 lysosomes,並在肌漿網與 RYR2 共定位;這些定位資訊部分依序列相似性推定。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Sarcoplasmic reticulum。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SPRYD2CMYA5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CMYA5 與 PRKAR2A、ACTN2、DTNBP1、DES、DMD、PPP3CA、TTN、CAPN3 及 FSD2 有互作記錄;其中部分為依序列相似性推定。資料另將 CMYA5 列於由 FSD2、CMYA5 與 RYR2 組成的複合體中。CMYA5 與 CAPN3 的互作會導致 CMYA5 蛋白質水解,且可能保護 CAPN3 免於自體水解;此保護作用帶有推測性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CMYA5 可能透過結合 PRKAR2A,作為錨定蛋白協助安排 PKA 在細胞內的區室分布;也可能抑制 calcineurin 介導的轉錄活性,減弱其誘導肌肉慢肌纖維基因程式的能力,並負向調節骨骼肌再生。另依序列相似性推定,CMYA5 參與橫紋肌中 RYR2 簇的組裝。推論支持
證據與來源

May serve as an anchoring protein that mediates the subcellular compartmentation of protein kinase A (PKA) via binding to PRKAR2A (By similarity). May function as a repressor of calcineurin-mediated transcriptional activity. May attenuate calcineurin ability to induce slow-fiber gene program in muscle and may negatively modulate skeletal muscle regeneration (By similarity). Plays a role in the assembly of ryanodine receptor (RYR2) clusters in striated muscle (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CMYA5 與 PRKAR2A、ACTN2、DTNBP1、DES、DMD、PPP3CA、TTN、CAPN3 及 FSD2 有互作記錄,部分互作依序列相似性推定。它也被列於 FSD2、CMYA5 與 RYR2 組成的複合體中。CMYA5 與 CAPN3 的互作會造成 CMYA5 蛋白質水解,且可能保護 CAPN3 免於自體水解。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PRKAR2A. Interacts with ACTN2 and DTNBP1/dysbindin (By similarity). Interacts with DES. Interacts with DMD/dystrophin (By similarity). Interacts with the calcineurin catalytic subunit PPP3CA (By similarity). Interacts with TTN. Interacts with CAPN3; this interaction, which results in CMYA5 proteolysis, may protect CAPN3 from autolysis. Interacts with FSD2 (By similarity). Identified in a complex composed of FSD2, CMYA5 and RYR2 (By similarity)

PMID 17872945 ↗ · PMID 20634290 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CMYA5 主要位於細胞核周邊,但也分布於細胞其他區域,並被描述為位於 lysosomes。在骨骼肌中,它沿肌纖維周邊及 costameres 分布,通常鄰近 Z-disks,偶爾位於 M-band;它也在肌漿網與 RYR2 共定位。部分定位描述依序列相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Sarcoplasmic reticulum; Cytoplasm; Cytoplasm, perinuclear region; Cytoplasm, myofibril, sarcomere, M line; Found predominantly at the periphery of the nucleus but also throughout the cell. Localized in lysosomes (By similarity). In skeletal muscles, localizes along myofiber periphery, at costameres (By similarity). Predominantly flanks Z-disks (By similarity). Occasionally present at the M-band level. Colocalized with RYR2 in the sarcoplasmic reticulum (By similarity)

PMID 20634290 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控由杜興氏肌肉失養症(DMD)患者來源的肌肉細胞株中,CMYA5 表現量下調。此敘述限於該類患者來源細胞株,未提供表現降低的原因。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated in muscle cell lines derived from patients with Duchenne muscular dystrophy (DMD)

PMID 11297942 ↗ · PMID 14688250 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000446378 · 12,888 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTCGGAGGGAGAACACCAGGCGCGGCGCGGGCGGCTCCG40
41GCTCCGGCCCCGGCCCAGGCCCGGGAGAGGCGATGGCGAG80
81CCGCGATAGCAACCACGCTGGCGAGAGCTTTCTCGGCTCC120
121GACGGGGACGAGGAGGCGACCCGGGAGCTGGAGACCGAGG160
161AGGAGTCGGAGGGCGAGGAGGACGAGACGGCGGCGGAGTC200
201GGAGGAGGAGCCGGACTCCAGGTTATCAGACCAGGATGAA240
241GAGGGAAAGATCAAGCAGGAGTATATCATATCTGACCCCT280
281CCTTTTCCATGGTGACAGTCCAAAGGGAAGATAGTGGGAT320
321AACCTGGGAAACCAATTCAAGTAGATCTTCTACTCCTTGG360
361GCTTCAGAAGAAAGTCAGACTTCTGGTGTGTGTAGTCGGG400
401AAGGGTCAACTGTGAATTCTCCTCCTGGAAATGTTTCCTT440
441TATTGTGGATGAAGTGAAAAAGGTTCGGAAAAGGACTCAT480
481AAGTCAAAGCATGGTTCACCATCATTACGCCGGAAAGGCA520
521ACAGAAAAAGAAATTCTTTTGAATCCCAAGATGTTCCAAC560
561AAACAAAAAAGGCAGTCCTTTAACTTCAGCAAGCCAGGTA600
601CTAACCACGGAGAAAGAGAAGTCATATACTGGCATTTATG640
641ATAAAGCAAGAAAAAAGAAGACCACTTCAAATACACCTCC680
681GATTACTGGGGCAATATACAAAGAACACAAGCCATTAGTG720
721TTAAGACCAGTCTACATAGGAACAGTACAATATAAAATTA760
761AGATGTTTAATTCGGTTAAAGAAGAATTAATTCCTCTACA800
801ATTTTATGGAACATTGCCAAAGGGTTATGTAATTAAAGAA840
841ATACATTATAGGAAAGGGAAAGATGCATCCATTAGTCTAG880
881AGCCAGATTTGGACAATAGTGGTTCTAATACAGTGTCCAA920
921AACACGCAAATTAGTAGCCCAAAGCATAGAGGATAAAGTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。