基因總覽
CLEC7A（C-type lectin domain containing 7A）是蛋白質編碼基因，其產物屬於凝集素，並作為模式識別受體（PRR）辨識特定葡聚糖。這些葡聚糖包括致病細菌與真菌細胞壁的成分。CLEC7A的功能與免疫細胞對微生物成分的辨識相關；來源亦指出它能與T細胞結合，且此結合不涉及T細胞表面聚糖。其細胞膜型蛋白質的結構包含胞質區、單次跨膜區與細胞外區，細胞外區具有C-type lectin結構域，胞質區則帶有ITAM-like基序。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000304084 ★ | 10,116,777–10,130,199 | 6 |
| ENST00000353231 | 10,116,777–10,130,259 | 5 |
| ENST00000960577 | 10,116,777–10,130,259 | 5 |
| ENST00001032888 | 10,116,777–10,130,259 | 5 |
| ENST00001096061 | 10,116,777–10,130,259 | 4 |
| ENST00001135392 | 10,116,777–10,130,259 | 6 |
| ENST00000960576 | 10,116,780–10,130,259 | 6 |
| ENST00000991639 | 10,116,783–10,130,259 | 5 |
| ENST00000960578 | 10,116,993–10,130,269 | 7 |
| ENST00000298523 | 10,117,862–10,130,259 | 4 |
| ENST00000396484 | 10,118,068–10,130,259 | 4 |
| ENST00000533022 | 10,118,458–10,130,082 | 5 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CLEC7A辨識β-1,3連結及β-1,6連結的葡聚糖，這些分子是致病細菌與真菌細胞壁的組成成分。此辨識作用使CLEC7A能感知微生物相關成分，並參與免疫細胞對病原體的反應。
在β-glucan結合後，CLEC7A透過ITAM基序招募SYK，促進下游訊號傳遞。來源指出，此路徑可活化部分CARD domain-BCL10-MALT1（CBM）訊號複合體，進而啟動NF-κB與p38 MAP kinase（MAPK11、MAPK12、MAPK13及／或MAPK14）路徑。這些路徑刺激編碼促發炎細胞激素與趨化因子的基因表現。CLEC7A也是TLR2媒介發炎反應及NF-κB活化所必需的因子；相關訊號敘述標示為相似性推定。
在巨噬細胞與樹突細胞中，CLEC7A可增強細胞激素生成；來源將此作用標示為相似性推定。它也被描述為媒介細胞內活性氧生成，並參與白色念珠菌（Candida albicans）分生孢子的吞噬。這些作用分別涉及免疫訊號、細胞反應與對真菌顆粒的攝取。
CLEC7A也與T細胞反應有關：它能以不涉及T細胞表面聚糖的方式與T細胞結合，並參與T細胞活化及促進其增殖。此外，β-glucan結合後會誘導SCIMP磷酸化；此項敘述同樣屬相似性推定。來源未進一步界定這些T細胞相關作用與其他訊號路徑之間的關係。
Promoter 與基因調控
>CLEC7A ENST00000304084 GRCh38 chr12:10130099-10131199 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAGATGTCTCCTGCACTCTACTGGCTTCAAGGTCGGATAAATGAGTTGAACACCTCTTCAGTTTCCAGC AATGTTAGGTGTTTTCTATATTTCTTTGATTTGATCATTACTATGGAAACTGGAAGAGAGGGAAAAAAAA TCAAACATCTAACATAATATTTCAGTCCCAACACCTTCCATAAGCTGTTCCTTGCAATATAAGTGTATGG AATGATGAAAGAGGCAGTGTAGCGTAACAGAAAAGACCACGAGTTTTGCAGCAAGAGTCAGCTTTGATTT GATTCCTTGCTCTAAATTTTTAAAATTAGCTTCTTAAACCTGAGAAAGAGGCTAAATTTTCTGTCTCATT TTTTCATTTGAAAATAGAAATAATAATGCCTACTATATAGACTTGGAAAAGTGAGATTGAACAAGAAAAT ATGTACAACATGTGGTACTTAGCTCATAGTAATTGTTCAATAAATGTTATTTTGTGTTAATATCTGATAA TTCCCAAAGAGATTTGTTTTCTCTGTCTGTTGTTACAACAATGCATCTCCTCATGCCATCCCTCATTTAC CTATCTATATATTTCCTTTATTAAGCAATGAGTTTCTTCATAGGTATCATTTTTCCTTGTATTGTAAGCT CCTACCAATTGAAAAGGTGGGCATCCAGTACCTGTTTATGTAATTTAAAAAATACATGAATAAATACATG AACAAAGTTATGGTAAACTTGGAGCACCAAAACTGAAATAGTTTGCATCGGTTAAATTAATTAATGTCAG ACTTAGTTGTGAGAGTAATGAAGGCAGCATAAGACATTAATGTATGCATTTTTCTTACATTTGGTCTGAA ACAAAGACTCATCTGCTATGCTGCCTTTTAGTTTTCCTGAGTCAGCAGTCTCAGAAACAGGATCTAAAGG TACAAATGGAAAATTACCACAGCATAGTTTCATTTCCTGCTCTTGAATATCTGGTTGAACTACTTAAGCT TAATTTGTTAAACTCCGGTAAGTACCTAGCCCACATGATTTGACTCAGAGATTCTCTTTTGTCCACAGAC AGTCATCTCAGGAGCAGAAAGAAAAGAGCTCCCAAATGCTATATCTATTCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CLEC7A_1 ↗ | 12:10,130,166 | 負股 | 10,130,156–10,130,215 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_54DBNX · CTCF_binding_site · 10128432–10128453 · regulatory
ENSR12_962JR · enhancer · 10128672–10129035 · regulatory
ENSR12_962K7 · promoter · 10130072–10130412 · regulatory
ENSR12_962KJ · enhancer · 10131209–10131587 · regulatory
ENSR12_962KT · enhancer · 10132270–10132694 · regulatory
ENSR12_54DCDG · CTCF_binding_site · 10132437–10132458 · regulatory
· motif · 10128434–10128450 · motif
· motif · 10130312–10130326 · motif
· motif · 10130312–10130326 · motif
· motif · 10130459–10130473 · motif
· motif · 10132409–10132423 · motif
· motif · 10132409–10132423 · motif
· motif · 10132439–10132455 · motif
單核細胞分化為樹突細胞的過程中，CLEC7A表現量上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：247 aa
CLEC7A蛋白質長247個胺基酸。其第1至44位為胞質區，第45至65位為單次跨膜螺旋，並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區；第66至247位位於細胞外。細胞外第127至242位包含C-type lectin結構域，胞質第15至18位則有ITAM-like基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CLEC7A為單次跨膜的第二型膜蛋白，定位於細胞膜。 另有資料記載，isoform 5、isoform 6與isoform 7位於細胞質；來源未提供這些異構型定位差異的條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 45 個夥伴
- ADAM33Q9BZ11-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BNIP3Q12983 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- BNIP3LO60238 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM3AQ9BU27 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL1RL1Q01638 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JAGN1Q8N5M9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KTN1Q86UP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NINJ2Q9NZG7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OCLNQ16625 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTTG1IPP53801 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SMIM3Q9BZL3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SYKP43405 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SYNE4Q8N205 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TMEM79Q9BSE2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- TMPRSS4Q9NRS4-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q9BRL5Q9BRL5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADAM33Q08AM2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARL13BQ3SXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASGR2P07307-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD53P19397 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD74P04233-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTXN3Q4LDR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCGR1AP12314 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FNDC9Q8TBE3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
CLEC7A可形成同源二聚體，並與SYK互作；在真菌病原體存在時，CLEC7A與SYK的互作參與白血球活化。CLEC7A也與CD37互作，此關係可調控CLEC7A介導的IL-6生成。另有資料記載CLEC7A與RANBP9互作，但未提供該互作的功能說明。
疾病與遺傳關聯
家族性念珠菌病4（CANDF4）是一種原發性免疫缺陷疾病，與免疫反應異常及清除真菌感染能力受損有關，且感染易感性選擇性指向Candida。患者可能有皮膚、指甲及黏膜持續或反覆感染，病原體主要為Candida albicans。來源指出，影響CLEC7A的變異可能造成此病；此為變異與疾病的關聯敘述，並未說明所有病例均由此基因變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CLEC7A是辨識β-1,3及β-1,6連結葡聚糖的凝集素受體，這些葡聚糖存在於致病細菌與真菌細胞壁。它透過ITAM基序招募SYK，參與TLR2媒介的發炎反應及NF-κB活化；相關下游路徑促進促發炎細胞激素與趨化因子基因表現。來源亦提及細胞激素生成、活性氧產生、真菌孢子吞噬、T細胞活化與增殖，以及SCIMP磷酸化；部分功能標示為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Lectin that functions as a pattern recognizing receptor (PRR) specific for beta-1,3-linked and beta-1,6-linked glucans, which constitute cell wall constituents from pathogenic bacteria and fungi. Necessary for the TLR2-mediated inflammatory response and activation of NF-kappa-B: upon beta-glucan binding, recruits SYK via its ITAM motif and promotes a signaling cascade that activates some CARD domain-BCL10-MALT1 (CBM) signalosomes, leading to the activation of NF-kappa-B and MAP kinase p38 (MAPK11, MAPK12, MAPK13 and/or MAPK14) pathways which stimulate expression of genes encoding pro-inflammatory cytokines and chemokines (By similarity). Enhances cytokine production in macrophages and dendritic cells (By similarity). Mediates production of reactive oxygen species in the cell (By similarity). Mediates phagocytosis of C.albicans conidia. Binds T-cells in a way that does not involve their surface glycans and plays a role in T-cell activation. Stimulates T-cell proliferation. Induces phosphorylation of SCIMP after binding beta-glucans (By similarity) PMID 11567029 ↗ · PMID 12423684 ↗ · PMID 17230442 ↗ |
| 交互作用 | CLEC7A可形成同源二聚體，並與SYK及CD37互作。CLEC7A與SYK的互作在真菌病原體存在時參與白血球活化；CLEC7A與CD37的互作則控制CLEC7A介導的IL-6生成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with SYK; participates in leukocyte activation in presence of fungal pathogens. Interacts with CD37; this interaction controls CLEC7A-mediated IL-6 production PMID 17182550 ↗ |
| 交互作用 | 來源記載CLEC7A與RANBP9互作，但未說明此互作的條件或功能影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | CLEC7A定位於細胞膜，屬單次跨膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type II membrane protein PMID 11745369 ↗ · PMID 16870151 ↗ · PMID 17182550 ↗ · PMID 17230442 ↗ |
| 細胞定位 | CLEC7A的isoform 5定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | CLEC7A的isoform 6定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | CLEC7A的isoform 7定位於細胞質。 | 推論支持 | |
| 調控 | CLEC7A在單核細胞分化為樹突細胞的過程中表現量上調。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 家族性念珠菌病4（CANDF4）屬原發性免疫缺陷疾病，伴隨免疫反應異常及清除真菌感染能力受損，且對Candida感染易感。其特徵包括皮膚、指甲與黏膜持續或反覆感染，主要病原為Candida albicans。來源指出，影響CLEC7A的變異可能造成此病，未表示所有病例皆由該基因變異引起。 | 含實驗來源 | 證據與來源Candidiasis, familial, 4 CANDF4 A primary immunodeficiency disorder with altered immune responses and impaired clearance of fungal infections, selective against Candida. It is characterized by persistent and/or recurrent infections of the skin, nails and mucous membranes caused by organisms of the genus Candida, mainly Candida albicans. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613108 PMID 19864674 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTACCTAGCCCACATGATTTGACTCAGAGATTCTCTTTT40GTCCACAGACAGTCATCTCAGGAGCAGAAAGAAAAGAGCT80CCCAAATGCTATATCTATTCAGGGGCTCTCAAGAACAATG120GAATATCATCCTGATTTAGAAAATTTGGATGAAGATGGAT160ATACTCAATTACACTTCGACTCTCAAAGCAATACCAGGAT200AGCTGTTGTTTCAGAGAAAGGATCGTGTGCTGCATCTCCT240CCTTGGCGCCTCATTGCTGTAATTTTGGGAATCCTATGCT280TGGTAATACTGGTGATAGCTGTGGTCCTGGGTACCATGGC320TATTTGGAGATCCAATTCAGGAAGCAACACATTGGAGAAT360GGCTACTTTCTATCAAGAAATAAAGAGAACCACAGTCAAC400CCACACAATCATCTTTAGAAGACAGTGTGACTCCTACCAA440AGCTGTCAAAACCACAGGGGTTCTTTCCAGCCCTTGTCCT480CCTAATTGGATTATATATGAGAAGAGCTGTTATCTATTCA520GCATGTCACTAAATTCCTGGGATGGAAGTAAAAGACAATG560CTGGCAACTGGGCTCTAATCTCCTAAAGATAGACAGCTCA600AATGAATTGGGATTTATAGTAAAACAAGTGTCTTCCCAAC640CTGATAATTCATTTTGGATAGGCCTTTCTCGGCCCCAGAC680TGAGGTACCATGGCTCTGGGAGGATGGATCAACATTCTCT720TCTAACTTATTTCAGATCAGAACCACAGCTACCCAAGAAA760ACCCATCTCCAAATTGTGTATGGATTCACGTGTCAGTCAT800TTATGACCAACTGTGTAGTGTGCCCTCATATAGTATTTGT840GAGAAGAAGTTTTCAATGTAAGAGGAAGGGTGGAGAAGGA880GAGAGAAATATGTGAGGTAGTAAGGAGGACAGAAAACAGA920ACAGAAAAGAGTAACAGCTGAGGTCAAGATAAATGCAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。