基因總覽
CLEC6A（C-type lectin domain containing 6A）是蛋白質編碼基因，產物屬於 C-type lectin。這種鈣離子依賴型 lectin 可作為先天免疫的模式辨識受體，辨識 Candida albicans 表面的 alpha-mannans。其受體辨識也涉及塵蟎與真菌過敏原，以及曼氏血吸蟲卵中的可溶性成分；來源指出這些辨識作用與不同免疫反應相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000382073 ★ | 8,455,962–8,478,330 | 6 |
| ENST00001135584 | 8,455,950–8,479,779 | 6 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CLEC6A 是先天免疫的模式辨識受體，能以鈣離子依賴方式辨識並結合 Candida albicans 菌絲上的 alpha-mannans。這項辨識使受體複合體中的 FCER1G，其 immunoreceptor tyrosine-based activation motif（ITAM）發生磷酸化，進而啟動 SYK、CARD9 與 NF-kappa-B。來源指出，這條訊號作用會促進抗原呈現細胞成熟，並影響抗原特異性 T 細胞的初始活化，使其朝向效應型 T-helper 1 與 T-helper 17 細胞亞型發展；此段後續作用依據為相似性推論。
CLEC6A 也能以 mannose 依賴方式辨識塵蟎與真菌的過敏原，並促進 cysteinyl leukotriene 生成。此項作用同樣是依相似性推論描述，來源未進一步交代辨識後的訊號步驟或所涉細胞類型。
此外，CLEC6A 可辨識曼氏血吸蟲卵中的可溶性成分，並改變適應性免疫反應。這項作用亦屬相似性推論；來源未說明其具體分子機制或免疫反應改變的方向。
Promoter 與基因調控
>CLEC6A ENST00000382073 GRCh38 chr12:8454962-8456062 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTAGGGTTCAGTTAGTCTAGAACCTACATAGCAAATGGCTTCAAGAGGTAAATTTCGTGCAAGGTGGCA GTGAGGCATGACTCCTGTCATATCTCTCTCATGAGTCCACTCTGGACTTGATAGTTTCAAGGCACTCACA TTCCTCAAATAACAGTTTTTTTTTTTTTTCGTTCTCAGCACTCCATAGATTTATGGCTGTTTGTTAACAT ACTATTTAAGCAAGGCCTGTAAGCCACTGCCATGAAAGAGATAAATACATTTGAACTGAGTTCTCTCCTG AGTGATGGGTATAACACACATTGATAAACTGCTGCTTTTTCTCTTGTTTCTCTGCCTTTTGTTTTCAGGA CAGTGTCTCTACTAAGAATCTATGAGGACAAGAAAACATCATATATTTTCTGTGCTACAATATAAAATTC ATGAAGCCTGTTTCTGATTTTATATCACTTCAGGCTCCCTTTTGCCTAATCAGGGAGATTACAAAATATC ACTGACATCTGCCCAATATTAGTCTGGATGCAGTAAGAATGTTTCATCACCTTTGCAGACTGATTTCAGA ATGTTTCATTTTGCAGTCACATTCCTTAACAATGTTCATGGGTTTTGTTATTTACTATGTTACCCTTCAT ATCTAAACCATATCCATCCAATCAAACTTTTGCTTACTACCTAGGACACTGTTCAACACATGGATTAAGG CTTGCATAAAATAAGCAGCCAATGTAAAGGTTAGTTAGGGAGCACTTAATTTAACCAAGTTCTCTAAATA GATGTCTTTTAGGAGATAAAAAATTTTCTATTTTGCATGCCAGAATGAATAGGAATCAGACAGAGAAATT TTATGTTAGAAACTGAAGAAATGATCTAAGTATTCTTGTCAAAGTTCTCATGAATGGTTTTCAATGTTTC TCAATTCCTCTTTTGTTTTTTTTAACCCCACGTATCGAAATCACTGGAAACTTTAGTTGTAATTGTGACT TCTTCTTTTGAGGTACACTTAATGTTGGAAGTCTCTTAGTCCTATAAGAGTGTGTAGCAGTTTGTCCCTG AGCTCTAGCTTCTTTAAATGAAGCTGAGTCTCTGGGCAACATCTTTAGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CLEC6A_1 ↗ | 12:8,455,987 | 正股 | 8,455,938–8,455,997 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
在 CD14+ 單核球中，GM-CSF、TGF-beta 1 與 TNF 會上調 CLEC6A；IL-4、IL-10 或 UVB 則會使其下調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：209 aa
CLEC6A 蛋白長 209 個胺基酸。其第 1–20 位為細胞質區，第 21–41 位為跨膜螺旋，作為第二型單次跨膜蛋白的訊號錨定區；第 42–209 位位於細胞外。C-type lectin 結構域位於第 86–203 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CLEC6A 是細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CLEC6A 與 FCER1G 相關聯，此關係依相似性描述。CLEC6A 也與 CLEC4D 形成異源二聚體；來源指出，該異源二聚體可作為對抗真菌感染的模式辨識受體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CLEC6A 是鈣離子依賴型先天免疫模式辨識受體，可辨識 Candida albicans 菌絲上的 alpha-mannans。辨識後會促使 FCER1G 的 ITAM 磷酸化並啟動 SYK、CARD9 與 NF-kappa-B，促進抗原呈現細胞成熟及 T 細胞朝效應型 T-helper 1、T-helper 17 亞型初始活化；後續作用屬相似性推論。它也以 mannose 依賴方式辨識塵蟎與真菌過敏原並促進 cysteinyl leukotriene 生成，還可辨識曼氏血吸蟲卵的可溶性成分並改變適應性免疫反應，這些作用亦依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Calcium-dependent lectin that acts as a pattern recognition receptor (PRR) of the innate immune system: specifically recognizes and binds alpha-mannans on C.albicans hypheas. Binding of C.albicans alpha-mannans to this receptor complex leads to phosphorylation of the immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM) of FCER1G, triggering activation of SYK, CARD9 and NF-kappa-B, consequently driving maturation of antigen-presenting cells and shaping antigen-specific priming of T-cells toward effector T-helper 1 and T-helper 17 cell subtypes (By similarity). Recognizes also, in a mannose-dependent manner, allergens from house dust mite and fungi, by promoting cysteinyl leukotriene production (By similarity). Recognizes soluble elements from the eggs of Shistosoma mansoni altering adaptive immune responses (By similarity) PMID 23911656 ↗ · PMID 28652405 ↗ |
| 交互作用 | CLEC6A 與 FCER1G 相關聯，此關係為相似性推論；此外，CLEC6A 可與 CLEC4D 形成異源二聚體。來源指出，CLEC6A–CLEC4D 異源二聚體構成對抗真菌感染的模式辨識受體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Associated with FCER1G (By similarity). Heterodimer with CLEC4D; this heterodimer forms a pattern recognition receptor (PRR) against fungal infection PMID 23911656 ↗ |
| 細胞定位 | CLEC6A 位於細胞膜，是單次跨膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在 CD14+ 單核球中，granulocyte-macrophage colony-stimulating factor（GM-CSF）、TGF-beta 1 與 TNF 會上調 CLEC6A；IL-4、IL-10 或 UVB 則會下調 CLEC6A。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated by granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF), TGF-beta 1, TNF and down-regulated by IL-4, IL-10 or UVB in CD14+ monocytes PMID 15810886 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AATGTTGGAAGTCTCTTAGTCCTATAAGAGTGTGTAGCAG40TTTGTCCCTGAGCTCTAGCTTCTTTAAATGAAGCTGAGTC80TCTGGGCAACATCTTTAGGGAGAGAGGTACAAAAGGTTCC120TGGACCTTCTCAACACAGGGAGCCTGCATAATGATGCAAG160AGCAGCAACCTCAAAGTACAGAGAAAAGAGGCTGGTTGTC200CCTGAGACTCTGGTCTGTGGCTGGGATTTCCATTGCACTC240CTCAGTGCTTGCTTCATTGTGAGCTGTGTAGTAACTTACC280ATTTTACATATGGTGAAACTGGCAAAAGGCTGTCTGAACT320ACACTCATATCATTCAAGTCTCACCTGCTTCAGTGAAGGG360ACAAAGGTGCCAGCCTGGGGATGTTGCCCAGCTTCTTGGA400AGTCATTTGGTTCCAGTTGCTACTTCATTTCCAGTGAAGA440GAAGGTTTGGTCTAAGAGTGAGCAGAACTGTGTTGAGATG480GGAGCACATTTGGTTGTGTTCAACACAGAAGCAGAGCAGA520ATTTCATTGTCCAGCAGCTGAATGAGTCATTTTCTTATTT560TCTGGGGCTTTCAGACCCACAAGGTAATAATAATTGGCAA600TGGATTGATAAGACACCTTATGAGAAAAATGTCAGATTTT640GGCACCTAGGTGAGCCCAATCATTCTGCAGAGCAATGTGC680TTCAATAGTCTTCTGGAAACCTACAGGATGGGGCTGGAAT720GATGTTATCTGTGAAACTAGAAGGAATTCAATATGTGAGA760TGAATAAGATTTACCTATGAGTAGAAGCTTAATTGGAAAG800AAGAGAAGAATTACTGACGTAATTTTTTCCCTGACGTCTT840TAAAATTGAACCCTATCATGAAATGATAATTTCTTCCTGA880ATTTACACATAATCCTTATGTTATAGAGGTTCACAGAAAT920GGAAAGATACCTGTTTCCCTTTAATCAATCTTCTCGTTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。