基因總覽
CLEC4M 是蛋白質編碼基因，產物屬於 C-type lectin domain family。其蛋白質具有細胞膜型與分泌型異構型：部分異構型為單次跨膜的第二型膜蛋白，另有異構型被註記為分泌型。蛋白質序列包含細胞質區、跨膜區及細胞外區；細胞外區具有七段近似串聯重複序列與 C-type lectin 結構域，細胞質區則有內吞訊號。這些結構註解呈現其膜蛋白架構與可能的受體性質。來源將 CLEC4M 描述為可能參與肝臟周邊免疫監視的病原體辨識受體；其具體辨識與攝取功能另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000327325 ★ | 7,763,243–7,769,605 | 7 |
| ENST00000359059 | 7,763,031–7,769,606 | 6 |
| ENST00000596363 | 7,763,031–7,769,606 | 5 |
| ENST00000394122 | 7,763,031–7,769,606 | 6 |
| ENST00000861108 | 7,763,031–7,769,606 | 7 |
| ENST00000861109 | 7,763,031–7,769,606 | 7 |
| ENST00000861110 | 7,763,031–7,769,606 | 8 |
| ENST00000861111 | 7,763,031–7,769,606 | 5 |
| ENST00000861112 | 7,763,031–7,769,606 | 7 |
| ENST00000861113 | 7,763,031–7,769,606 | 7 |
| ENST00000861114 | 7,763,031–7,769,606 | 6 |
| ENST00000861115 | 7,763,031–7,769,606 | 7 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CLEC4M 被描述為可能參與肝臟周邊免疫監視的病原體辨識受體。它可能促進病原體內吞，之後病原體會在溶體區室中降解；來源以「可能」描述此功能，並未將其表述為確定機制。CLEC4M 也被列為 ICAM3 的受體，可能透過辨識類甘露糖醣類與之結合。
在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為多種病毒的附著受體，包括伊波拉病毒（Ebolavirus）、丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus）、HIV-1、人類冠狀病毒 229E、人類巨細胞病毒（Human cytomegalovirus/HHV-5）、流感病毒（Influenzavirus）、SARS-CoV、西尼羅病毒（West-nile virus）、日本腦炎病毒（Japanese encephalitis virus），以及馬堡病毒（Marburg virus）的醣蛋白。這些紀錄說明 CLEC4M 與多種病毒附著相關，但不等同於證明它是各病毒感染所必需的受體，也不代表相同的結合或感染機制適用於所有病毒。
此外，樹突細胞對 M.bovis 的辨識可能有部分透過 CLEC4M 進行。來源未指出這一辨識所占比例或後續免疫結果，因此應限於「可能部分參與辨識」的描述。
Promoter 與基因調控
>CLEC4M ENST00000327325 GRCh38 chr19:7762243-7763343 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTACACCCACTCCTTCCAGAAAGCCCCCAATTTGAGTCCCATCAAAGGTTAGTTCTTCTGCCTATTCTT GAAATTCATGTAAACTCAAAATCTTACAGAATGTATTCATTCTGTTTGGGTTTCTTAACTCTTGTGAGAT TCATCCAAATTGTTGTTTGTATCAGTACTTTGCTTTTTCATTACTGTATAGAATTCCACCCTCTGAATAT GCCATGATATTTGTTTTCATTCACCTGCTGGTGGCCACATGGGTTGTTCCAATTTGGGTTGGGATAGTCT AACTAAAGTTACTATAAATCTTTCTATTTTGCCCTTGATGTTATTAGACCCTCTTTGGTTAACTGGGTGG AGTGTGGAGGAAAACTGCCTGGATTCGAATCTCAGCTCCACCATTTACCAGCTGTGTGACCTTGGGCTAG TTTCTTAATCTCGCAGTGCCTCTATTTTCCCCTATCTGTAAACTGGAGGTCACATGATCTACTGCAGGGT AGGAAAGTTAAATGAAGGAGTTTTATAAAGCTGTTGGAAATGTGCCTATCATAGGTATGAAATAAACAAC TATCGTTCATCTCCAACTCCCAAAAACAAAGGAAATTCCCATGAATGAGAGCATCCGCAGACCAAAAGAG CAGATCCTGGAGGTCAGAGGGCATGGTGGTTCCAGGAACTAGGCGGTACTGCCTGCCCACCCCTGCCCTA CGTAGGGAGGCATAACAAAGTCGCTTTCCATTAGAATGAATTGAATTTTATTAAAAGCATCCCATCGCTC AACCATGTCATGAGTGGAGGAGTCCTTCTCCCTGTCAACCCCAGACCATCCCCCAACACCTCCCTGAAAT TCCTGCAAGGTCAGGCCGATCTCAGGCTCTGACTCCTTTCACTAGCCTTTCTGGTGATGTGATCTTACCC AGCTTCCTGTTTGTCTTCCTGAGAGACAGTAGATTTAGAAAGTGAGGATCAGAGGGTGGAAAATAAAAGC TGTGGTCCCCAGGAGTCCTGAACATCTGGGGACAGCGGGAAAACATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGT GCAGCAGCTGGGCCTCCTGGGTAAGGCTGGGTTGGAACTCTGGGATCCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CLEC4M_1 ↗ | 19:7,763,244 | 正股 | 7,763,195–7,763,254 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 7764287–7764300 · motif
· motif · 7764287–7764300 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：399 aa
所註解的蛋白質長度為 399 個胺基酸。其 N 端細胞質區位於第 1–49 位，之後是第 50–70 位的螺旋跨膜區，並接續第 71–399 位細胞外區。細胞外區含七段近似串聯重複序列及位於第 274–390 位的 C-type lectin 結構域；第 14–15 位另有內吞訊號註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1、2 與 3 被註記為細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白；Isoform 5、6、7 與 10 則被註記為分泌型。 這些資料顯示定位依異構型而異，來源未提供其他定位改變條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ACE2Q9BYF1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IFT20Q8IY31-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLPP6Q8IY26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SP0DTC2 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
CLEC4M 被註記為同源四聚體。感染相關的實體互作包括多種病毒蛋白：伊波拉病毒醣蛋白、丙型肝炎病毒 E1 與 E2、HIV-1 gp120、人類冠狀病毒 229E spike glycoprotein、人類巨細胞病毒 gB、流感病毒 hemagglutinin、SARS-CoV spike glycoprotein、西尼羅病毒 envelope protein E、日本腦炎病毒 E protein，以及馬堡病毒醣蛋白。另有與 M.bovis LprG 的互作紀錄；這些互作資料本身不表示其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 31 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CLEC4M 被認為可能是參與肝臟周邊免疫監視的病原體辨識受體，可能促進病原體內吞，並使其後續在溶體區室中降解。它也可能透過辨識類甘露糖醣類作為 ICAM3 受體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Probable pathogen-recognition receptor involved in peripheral immune surveillance in liver. May mediate the endocytosis of pathogens which are subsequently degraded in lysosomal compartments. Is a receptor for ICAM3, probably by binding to mannose-like carbohydrates PMID 11257134 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為伊波拉病毒（Ebolavirus）的附著受體；此註解指出其與病毒附著相關，未進一步說明該作用對感染的必要性或後續結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for Ebolavirus PMID 12050398 ↗ · PMID 12502850 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為丙型肝炎病毒（Hepatitis C virus）的附著受體；資料將其角色限定為病毒附著，未指出附著之外的感染機制或結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for Hepatitis C virus PMID 15371595 ↗ · PMID 16816373 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為 HIV-1 的附著受體。此項註解支持其與 HIV-1 附著相關，但沒有說明這種作用是否足以促成感染，或是否為感染所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for HIV-1 PMID 12502850 ↗ · PMID 21203928 ↗ |
| 功能 | 在人類冠狀病毒 229E 感染情境中，CLEC4M 被列為病毒附著受體。來源未進一步描述附著的分子方式、受體作用的必要性或其對感染過程的影響。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為人類巨細胞病毒（Human cytomegalovirus/HHV-5）的附著受體。此註解支持病毒附著關聯，沒有提供其對病毒進入或感染結果的進一步說明。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for Human cytomegalovirus/HHV-5 PMID 12433371 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為流感病毒（Influenzavirus）的附著受體。來源僅指出附著受體角色，未說明此作用是否單獨促成感染，亦未描述其他相關條件。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為 SARS-CoV 的附著受體。這項功能註解描述病毒附著關聯，並未指出該受體對病毒感染是否必要或充分。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為西尼羅病毒（West-nile virus）的附著受體。來源未說明其參與病毒附著後的步驟，也未將該角色描述為感染所必需。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為日本腦炎病毒（Japanese encephalitis virus）的附著受體。此註解支持其與病毒附著相關，未提供附著機制或其對感染結果的影響。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for Japanese encephalitis virus PMID 24623090 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 可作為馬堡病毒（Marburg virus）醣蛋白的附著受體。來源指向醣蛋白附著關聯，但未描述受體作用的其他條件或後續感染結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Acts as an attachment receptor for Marburg virus glycoprotein PMID 15479853 ↗ |
| 功能 | 樹突細胞對 M.bovis 的辨識可能有部分透過 CLEC4M 進行。來源以「可能」及「部分」限定此關係，未指出其貢獻比例或辨識後的生物學結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Recognition of M.bovis by dendritic cells may occur partially via this molecule PMID 21277928 ↗ |
| 交互作用 | Homotetramer | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與伊波拉病毒醣蛋白有互作紀錄。此資料描述兩者的互作關係，並未在此項敘述中說明互作對感染或病毒附著的功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與丙型肝炎病毒 E1 及 E2 蛋白有互作紀錄。這項敘述指出互作對象為兩種病毒蛋白，未進一步說明互作機制或生物學後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with hepatitis C virus E1 and E2 protein PMID 15371595 ↗ · PMID 16816373 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與 HIV-1 gp120 有互作紀錄。來源未在此項互作敘述中說明結合條件、相互作用方式或其對病毒感染的影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與人類冠狀病毒 229E spike glycoprotein 有互作紀錄。此項資料僅界定互作分子，未提供互作對感染過程的功能解釋。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與人類巨細胞病毒（HHV-5）的 gB protein 有互作紀錄。來源未說明互作發生的條件，亦未描述其對病毒附著或感染的影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與流感病毒 hemagglutinin 有互作紀錄。這項敘述指出特定互作對象，但未說明互作是否改變病毒附著、進入或其他感染步驟。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與 SARS-CoV spike glycoprotein 有互作紀錄。來源只記載這項互作關係，未提供其分子方式或對感染的功能意義。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與西尼羅病毒 envelope protein E 有互作紀錄。此項資料未說明互作條件、作用方向或其對病毒感染的具體影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與日本腦炎病毒 E protein 有互作紀錄。來源未進一步描述兩者互作的方式，或此關係對病毒附著及感染的功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與馬堡病毒醣蛋白有互作紀錄。此項敘述記載互作對象，未說明互作對病毒附著或感染的影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CLEC4M 與 M.bovis LprG 有互作紀錄。來源未提供該互作的分子方式、條件或其對病原體辨識及免疫反應的功能影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | CLEC4M 的 Isoform 1 被註記為細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白。這筆定位資料描述該異構型的細胞膜定位與膜蛋白類型，未指出定位變動條件。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | CLEC4M 的 Isoform 2 被註記為細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白。來源未說明此異構型在何種條件下改變定位，也未提供額外的細胞區室資訊。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | CLEC4M 的 Isoform 3 被註記為細胞膜上的單次跨膜第二型膜蛋白。此定位描述限於 Isoform 3，來源未指出其他定位狀態或定位改變條件。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Isoform 5; Secreted | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Isoform 6; Secreted | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Isoform 7; Secreted | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Isoform 10; Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AACATCTGGGGACAGCGGGAAAACATGAGTGACTCCAAGG40AACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCC80AACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAA120TTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTC160TTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCAT200GCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTG240TCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGC280AAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC320AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC360TACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGT400TGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT440GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAA480TCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGA520AGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCA560GGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTG600GGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACC640AGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC680AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACC720CAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCA760AGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC800TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGG840ACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCC880AGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGT920GAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。