基因總覽
CLEC4C 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 C-type lectin domain family 4 member C，屬於 C-type lectin 家族。此蛋白質是細胞表面的 lectin 型受體，可能參與樹突細胞的抗原捕捉。其結構包含一段跨膜區與細胞外的 C-type lectin 結構域，符合單次穿膜的第二型膜蛋白拓撲。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000360345 ★ | 7,729,383–7,747,375 | 6 |
| ENST00000354629 | 7,724,646–7,751,620 | 7 |
| ENST00000850852 | 7,727,114–7,751,618 | 7 |
| ENST00001100104 | 7,727,114–7,751,620 | 7 |
| ENST00000850847 | 7,727,117–7,751,620 | 9 |
| ENST00001140618 | 7,729,383–7,747,505 | 6 |
| ENST00000542353 | 7,729,415–7,749,473 | 7 |
| ENST00001100106 | 7,729,433–7,747,505 | 5 |
| ENST00000540085 | 7,729,442–7,747,505 | 5 |
| ENST00000537530 | 7,729,443–7,737,575 | 3 |
| ENST00001100107 | 7,729,444–7,747,505 | 4 |
| ENST00001100105 | 7,729,445–7,751,620 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CLEC4C 的產物是 lectin 型細胞表面受體，可能參與樹突細胞捕捉抗原。它可辨識特定的雙天線型醣鏈：醣鏈末端含有半乳糖，且不帶唾液酸；其辨識表位為 Gal(beta1-3/4)GlcNAc(beta1-2)Man。這項辨識特性提供受體捕捉特定醣鏈配體的分子基礎。
此受體也會結合血清中的 IgG。受體與配體的作用可有效將配體導向抗原處理及胜肽裝載區室，供後續呈遞給 T 細胞。來源指出此導引作用的結果與抗原呈遞相關，但未進一步限定其對不同抗原或 T 細胞反應的影響。
在漿細胞樣樹突細胞中，CLEC4C 可能強烈抑制 IFN-alpha/beta 表現的誘導；來源以「可能」描述此作用，並未將其表述為所有條件下均發生的結果。此外，CLEC4C 可能具有訊號受體功能，可活化 protein-tyrosine kinases 並動員細胞內鈣。這些觀察顯示該受體除了捕捉與導引配體，也可能參與細胞訊號調節；其訊號作用的具體條件與下游效應未在來源中詳述。
Promoter 與基因調控
>CLEC4C ENST00000360345 GRCh38 chr12:7747275-7748375 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTTGTATTTTTAGTAGAAACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCGTGA TCCGCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCTCAAAACTTTT TTCTCACTACTCTACAATTAAATCTCAGTTGAACTCTGGGAAGATTCTGGAATACCTAGGTTCTTTCTTT CTCAGTGTCTATTTCACCAGTAGTTGTAACCATCCTTCAACCAAACATCTCCATTTGAGTAGCATAGGCT ATAATGGATTTTCTCTATTTAAGATTACTCAGCAGTGGCCGGGCACGTGGTGGCTCACAACGGTAACCCC AGGACTTTGGGAGGCTGTATTAGTCCGTTTTCATACTGCTGATAAAGACATACCTGAGACTGGGCAATTT ACAAATGAAAGAGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGT GCAACGGCAGGAGGTCAGGAGTTCGAGACAAGCCTGGCCAGTATGATGAAACCCTGTCACTACTAAAAAT ACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT CGCTTGAACCCGCGAGGCAGAGGTAGTAGTGAGCTGAGATTGCACCACTATACTCCAGCCTGGGTGGCAG AGTGAGACCCTGTCTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAATCAGACCTGCAACCATGAACTG TTTTTCATGTATTTCTCGATTTCCTTGTTTGTGTTTCCTTATTTCTGAACATGATGTATGTTTTAAATTG AAAGCTTTAGCTCACTGCAGAGTCTCCTAAGTCACATCTCTTCCTTTGCAAGAGTAGGCGAAGAAGGATC TAAGGGCTTGGCTTGTTTGAAAGAACCACACCCCGAAAGTAACATCTTTGGAGAAAGTGATACAAGAGCT TCTGCACCCACCTGATAGAGGAAGTCCAAAGGGTGTGCGCACACACAATGGTGCCTGAAGAAGAGCCTCA AGACCGAGGTAAGCACTCATCTTCTCAGTTCTAGGGAAGGTAGTAGGAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CLEC4C_2 ↗ | 12:7,749,541 | 負股 | 7,749,531–7,749,590 |
| CLEC4C_1 ↗ | 12:7,751,620 | 負股 | 7,751,610–7,751,669 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：213 aa
C-type lectin domain family 4 member C 長 213 個胺基酸。第 1–21 位位於細胞質，第 22–44 位為螺旋跨膜區，並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區；第 45–213 位位於細胞外。C-type lectin 結構域位於第 90–207 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CLEC4C 是單次穿膜的第二型膜蛋白，定位於細胞膜；來源未描述其定位隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CLDN22Q8N7P3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KTN1Q86UP2-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MALP21145 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
CLEC4C 以同源二聚體形式存在。來源未提供其他複合體或實體互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CLEC4C 是 lectin 型細胞表面受體，可能參與樹突細胞捕捉抗原；可辨識特定不帶唾液酸、末端含半乳糖的雙天線型醣鏈，也會結合血清 IgG。受體可將配體導向抗原處理與胜肽裝載區室以供 T 細胞辨識；在漿細胞樣樹突細胞中可能抑制 IFN-alpha/beta 表現誘導，並可能活化 protein-tyrosine kinases、動員細胞內鈣。 | 含實驗來源 | 證據與來源Lectin-type cell surface receptor which may play a role in antigen capturing by dendritic cells. Specifically recognizes non-sialylated galactose-terminated biantennary glycans containing the trisaccharide epitope Gal(beta1-3/4)GlcNAc(beta1-2)Man. Binds to serum IgG. Efficiently targets ligand into antigen-processing and peptide-loading compartments for presentation to T-cells. May mediate potent inhibition of induction of IFN-alpha/beta expression in plasmacytoid dendritic cells. May act as a signaling receptor that activates protein-tyrosine kinases and mobilizes intracellular calcium PMID 11748283 ↗ · PMID 21880719 ↗ · PMID 25995448 ↗ |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | CLEC4C 定位於細胞膜，屬於單次穿膜的第二型膜蛋白；此定位描述未提供不同條件或異構型之間的差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAGTCCAAAGGGTGTGCGCACACACAATGGTGCCTGAAG40AAGAGCCTCAAGACCGAGAGAAAGGACTCTGGTGGTTCCA80GTTGAAGGTCTGGTCCATGGCAGTCGTATCCATCTTGCTC120CTCAGTGTCTGTTTCACTGTGAGTTCTGTGGTGCCTCACA160ATTTTATGTATAGCAAAACTGTCAAGAGGCTGTCCAAGTT200ACGAGAGTATCAACAGTATCATCCAAGCCTGACCTGCGTC240ATGGAAGGAAAGGACATAGAAGATTGGAGCTGCTGCCCAA280CCCCTTGGACTTCATTTCAGTCTAGTTGCTACTTTATTTC320TACTGGGATGCAATCTTGGACTAAGAGTCAAAAGAACTGT360TCTGTGATGGGGGCTGATCTGGTGGTGATCAACACCAGGG400AAGAACAGGATTTCATCATTCAGAATCTGAAAAGAAATTC440TTCTTATTTTCTGGGGCTGTCAGATCCAGGGGGTCGGCGA480CATTGGCAATGGGTTGACCAGACACCATACAATGAAAATG520TCACATTCTGGCACTCAGGTGAACCCAATAACCTTGATGA560GCGTTGTGCGATAATAAATTTCCGTTCTTCAGAAGAATGG600GGCTGGAATGACATTCACTGTCATGTACCTCAGAAGTCAA640TTTGCAAGATGAAGAAGATCTACATATAAATGAAATATTC680TCCCTGGAAATGTGTTTGGGTTGGCATCCACCGTTGTAGA720AAGCTAAATTGATTTTTTAATTTATGTGTAAGTTTTGTAC760AAGGAATGCCCCTAAAATGTTTCAGCAGGCTGTCACCTAT800TACACTTATGATATAATCCATTCACACATTCATTTATTCA840TTTATTCATTTATTCATTCATAAAATGAGTGTTTAGTGAA880CA882cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。