基因總覽
CLEC11A 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 C-type lectin domain containing 11A。其蛋白質含有 C-type lectin 結構域，長度為 323 個胺基酸；這些基本特徵構成其分子身分。來源將其與成骨作用相聯，並指出其可能參與成人骨骼的修復與維持。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250340 ★ | 50,723,364–50,725,708 | 4 |
| ENST00000599973 | 50,723,283–50,725,469 | 4 |
| ENST00000883280 | 50,723,283–50,725,719 | 4 |
| ENST00000883281 | 50,723,283–50,725,719 | 4 |
| ENST00000883282 | 50,723,283–50,725,719 | 4 |
| ENST00001140058 | 50,723,283–50,725,719 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CLEC11A 的蛋白質產物可促進成骨作用。來源指出，它會刺激間質前驅細胞分化為成熟成骨細胞，將前驅細胞的分化與骨形成相連。這項功能描述的重點在於促進細胞成熟，而非僅泛指與骨骼相關；來源未進一步說明其作用途徑或分子機制。
此外，CLEC11A 被認為與成人骨骼的修復及維持有關。這項描述的證據標示為 By similarity，因此應視為相似性推論，不能等同於已直接證實的成人骨骼作用。來源也未提供修復或維持過程中的具體細胞、調控步驟或作用條件。
整體而言，現有資料支持 CLEC11A 促進間質前驅細胞朝成熟成骨細胞分化，並指出其可能對成人骨骼的修復與維持具有重要性；但可據以描述的內容限於這些功能關聯，不能據此補充更細的作用機制。
Promoter 與基因調控
>CLEC11A ENST00000250340 GRCh38 chr19:50722364-50723464 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGGCCCGGGCTTGGCTTCCCTCCTGCTTATGATGGGAAGGTGGGGGAGCAGGGGAGTGGGGAGTGATGT GATCTGATTTATGGTTTGGAAGGATTGCTTTGGCTGCGGCAAGCAGCCGGGATTGGAGGGGCTCAGGAGG AAGGAGGGGGAGGGCGAGACTGCAGTGGTCCAGGCTGAAATGAGGTGGCTTGCTGAATGCTCAGAGCTCC TTGAGCACACAACCTAGCGTCTGTCGATTTCACCTCCTGGAGAAACCTTCCCTGACTGCTCCGCCAGACT CCTCACCCTCTCCCATCTCCAGCCCCCTCATCCCCGGAGCTATCTGGCTGCTGGTCTGCAAGCAGCTGGA GTCCCCAGCATCACCCAGCCCACAGCCTGGCCTGCAGGAGGCTTCTAGTAAAGTGGCCAATTAATCCCCG AGCCCCGTCTTCCAGGGTCATGCACACAGTCACACGCGTGCTCTTCACATGTGTCACCCTGCCCCCACAC ACACTCACTTGGATCTCCAGACAAGGGCTTGGAGGGTAGGATGGGCAATCTAGGGGGCAGGAGGGGCCCT GGAGTCTCCTCCATTGAGTGTGCAGGCGATGGTGGCCACAGGGTAATAACAACCTCAGCGAGACCCTGAG GTCTGCCCCTCCTTAGGAATGGCCAGGCAGGGAAGAAGGGAGCAGTGCTCGGTCCCAGCATCCCACCACT GCCGAGATGGTTCTGAGCGGGTTCCTGGGCTGAGGCCGGGGCCTGTGTTTTCCAAGATTCCTTGGAGAGC CAGCTCCATCCTCTTCCTGATTATCTGATCTTTGGGCTACAGCAGAAGGAAAGAGCAGGGCGGAAGCGAG CTCTGGAAAGTGGAAAGAGGAGGGTGTGCGAGGAGACCCAAGGCGGGATCTAGGCTTTGGAACGTTGGAG GTTTCCGGCCACAGAGGCAGGGCCTCCGGGGAGCCAAGAGGGGCGGGGAGAGACACACACAGAGAAGCAG AGGAGACCAACGGACCGGACAGAGACGAGGAGAGGAACAGGAAGAGAGAAGCTGGGAGAATCGGGAACCT GGGGGCTAGTGACCTGCACACAGGGCAGGGGCACTCGGCAGTTCCCAGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CLEC11A_1 ↗ | 19:50,723,364 | 正股 | 50,723,315–50,723,374 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_BD3QQ · enhancer · 50718348–50719086 · regulatory
ENSR19_83H94N · enhancer · 50719655–50719791 · regulatory
ENSR19_83H94R · promoter · 50719792–50720021 · regulatory
ENSR19_C72W3 · enhancer · 50720667–50721757 · regulatory
ENSR19_5FX532 · CTCF_binding_site · 50721112–50721133 · regulatory
ENSR19_BD3RF · promoter · 50722874–50723533 · regulatory
ENSR19_5FX5LW · CTCF_binding_site · 50724548–50724569 · regulatory
ENSR19_5FX5N4 · CTCF_binding_site · 50724804–50724825 · regulatory
ENSR19_5FX5PN · CTCF_binding_site · 50725142–50725163 · regulatory
ENSR19_BD3S7 · enhancer · 50728195–50728796 · regulatory
· motif · 50721114–50721130 · motif
· motif · 50724463–50724479 · motif
· motif · 50724463–50724479 · motif
· motif · 50724550–50724566 · motif
· motif · 50724804–50724814 · motif
· motif · 50724806–50724822 · motif
· motif · 50724838–50724848 · motif
· motif · 50724889–50724899 · motif
· motif · 50724925–50724935 · motif
· motif · 50724943–50724952 · motif
· motif · 50724987–50724997 · motif
· motif · 50725009–50725019 · motif
· motif · 50725092–50725103 · motif
· motif · 50725092–50725103 · motif
· motif · 50725144–50725160 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：323 aa
CLEC11A 蛋白質長 323 個胺基酸，N 端第 1–21 位標註為訊號序列；第 183–320 位為 C-type lectin 結構域。第 55–106 位及第 272–295 位被註記為無序區，第 61–63 位則標註為細胞附著位點。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CLEC11A 的定位資料列出細胞質與分泌兩種情形；來源未說明這些定位是否依條件或異構型而異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTRP02766 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CLEC11A 促進成骨作用，方式為刺激間質前驅細胞分化成成熟成骨細胞；來源另指出它對成人骨骼的修復與維持很重要，但這項描述標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Promotes osteogenesis by stimulating the differentiation of mesenchymal progenitors into mature osteoblasts. Important for repair and maintenance of adult bone (By similarity) PMID 27976999 ↗ |
| 細胞定位 | CLEC11A 的定位資料列出細胞質與分泌兩種情形。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGACGAGGAGAGGAACAGGAAGAGAGAAGCTGGGAGAA40TCGGGAACCTGGGGGCTAGTGACCTGCACACAGGGCAGGG80GCACTCGGCAGTTCCCAGAGGCCACCCCTCCCACCCCAGA120CATCCAGACATCTGGAACTTTGGGTGCCAAGAGTCCAGCT160TAATGCAGGCAGCCTGGCTTTTGGGGGCTTTGGTGGTCCC200CCAGCTCTTGGGCTTTGGCCATGGGGCTCGGGGAGCAGAG240AGGGAGTGGGAGGGAGGCTGGGGAGGTGCCCAGGAGGAGG280AGCGGGAGAGGGAGGCCCTGATGCTGAAGCATCTGCAGGA320AGCCCTAGGACTGCCTGCTGGGAGGGGGGATGAGAATCCT360GCCGGAACTGTTGAGGGAAAAGAGGACTGGGAGATGGAGG400AGGACCAGGGGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGCAACGCCAAC440CCCATCCTCCGGCCCCAGCCCCTCTCCCACCCCTGAGGAC480ATCGTCACTTACATCCTGGGCCGCCTGGCCGGCCTGGACG520CAGGCCTGCACCAGCTGCACGTCCGTCTGCACGCGTTGGA560CACCCGCGTGGTCGAGCTGACCCAGGGGCTGCGGCAGCTG600CGGAACGCGGCAGGCGACACCCGCGATGCCGTGCAAGCCC640TGCAGGAGGCGCAGGGTCGCGCCGAGCGCGAGCACGGCCG680CTTGGAGGGCTGCCTGAAGGGGCTGCGCCTGGGCCACAAG720TGCTTCCTGCTCTCGCGCGACTTCGAAGCTCAGGCGGCGG760CGCAGGCGCGGTGCACGGCGCGGGGCGGGAGCCTGGCGCA800GCCGGCAGACCGCCAGCAGATGGAGGCGCTCACTCGGTAC840CTGCGCGCGGCGCTCGCTCCCTACAACTGGCCCGTGTGGC880TGGGCGTGCACGATCGGCGCGCCGAGGGCCTCTACCTCTT920CGAAAACGGCCAGCGCGTGTCCTTCTTCGCCTGGCATCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。