基因總覽
CHST7 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，產物 carbohydrate sulfotransferase 7 屬於 sulfotransferase 1 family 的 Gal/GlcNAc/GalNAc subfamily。此蛋白質是單次穿膜的第二型膜蛋白，包含短的細胞質端、跨膜區及較長的腔內區；這些特徵構成其基本的膜蛋白架構。其主要角色是催化特定醣類受體的硫酸化，受體種類與反應偏好見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000276055 ★ | 46,573,765–46,598,496 | 2 |
| ENST00000868793 | 46,573,391–46,598,400 | 2 |
| ENST00000868794 | 46,573,391–46,584,554 | 2 |
| ENST00001120809 | 46,573,391–46,626,260 | 2 |
| ENST00001135014 | 46,573,391–46,599,954 | 2 |
| ENST00000925570 | 46,573,809–46,599,954 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
carbohydrate sulfotransferase 7 使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate（PAPS）作為硫酸基供體，催化硫酸基轉移至非還原端 N-acetylglucosamine（GlcNAc）殘基的第 6 位。其受質偏好並非相同：對連接於 mannose 的 GlcNAc 作用較佳，也能將硫酸基轉移至 chondroitin 中 N-acetylgalactosamine（GalNAc）殘基的第 6 位。
此酵素亦可作用於 core 2 mucin-type oligosaccharide 與 N-acetyllactosamine 寡聚物，但效率較低。對 keratan sulfate 及含有 Galbeta1-4GlcNAc 的寡醣則僅有微弱活性或沒有活性，顯示其作用受到醣類結構限制。它能催化 beta-benzyl GlcNAc 的 6-O-硫酸化，但不催化 alpha-或 beta-benzyl GalNAc 的硫酸化。
在 chondroitin 反應中，酵素以 3'-phosphoadenylyl sulfate 提供硫酸基，使 chondroitin 轉為 chondroitin 6'-sulfate；反應同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+)。因此，CHST7 的功能包括修飾特定 GlcNAc 與 GalNAc 醣殘基，而其能否作用及作用效率取決於受質的醣類組成與結構。
Promoter 與基因調控
>CHST7 ENST00000276055 GRCh38 chrX:46572765-46573865 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTTCCAATTTGAACACCTTCCCCTGGTGGAGATAAGTAGATATGCTTTCTATGTTTTATTAACTTTACA ACACCTTCCCCAAGCTGGTGAAAGGAAGCTCTCACTTCCTTATTCATTAGCCTGATGAAACAGAGCAAAA TGTATCTTTTTTGGTTCTGTTTTGAATTTTAGTAACTCTAGTCTTCATCTGCCTGTTGGACTTCCTGTCT CTTTTTCATCTATCTTTGGGTACACATTTCTTCTTACGGGTCCTTTTAAACACCGAGCTCCTGAGAAAGG TCACCATTCTACCACTTTGATTCTGTAAATGTCTTTTGCTCATAGGTGTCAGAATAGGCTGGGTTATACT GTGGTAACAACCCCCAAATCTCGCAATCCCAGGAGGTACATGGGTACTAAGAATTATTCACATTTTACAA ATGACCAAACTGGGCCCCAGAGTATTGGTAAAATGTGCAGAGCCCATCAGCTGGTGAAACCCTAAGGAAC ACAACACTTAGAATTTCACAAAGGCTAGACTTTATGAAATGTGCTGCGTGGATGCAGTAGTATCTCCAAC CCCCCTGGACCGCTCTGCCACGTACAATCTTCTATCTTTCAGTCCGGAACTCAGTAACACCCACTCCAGG GCTGATGGGGGCGCTGGATGTATAGTGGCGAGTGTTTATCTGCCTAGGATAGCGATGGCTAGGCAGGGGA CATAAAACAGAAGAGGCAGTGACCTTCTCCGGGTGGGGTCTATGGCCCTTTACTGGGTACATTCTGTACA CACAGGCCCCTCCTTTGCCTGAAGTCATTGATGAAGACTTCATTACGGAGGGTTTGGGGAAAGGTGGGGG TCTGGCTGGGTAAGCCGGCGTCCCAGCCCCGCTACAGCCCCGCCCAGATCTGGCAGAGCCGTGGGCGAAC CCAGGCGGGCAGAAAGGCGGGGCGGGCGGCTGCCAAGCCGGCCAATAGGCGGCTCTCCGGCTGCTAAGCC GAGAGGGCAGGGGCGCCGTCAGTAGCACCACCGCCTTCCAAGTTTCCCCTTGTGGATGCGCGGCCCCGCG GCTCTGCTCCTCCCGGCGCAGAGGGGCCGGGAGAGGCCACAGGAGCGGACC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CHST7_1 ↗ | X:46,573,765 | 正股 | 46,573,716–46,573,775 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_5DXQNG · CTCF_binding_site · 46572494–46572515 · regulatory
ENSRX_9NH55 · promoter · 46573275–46573775 · regulatory
ENSRX_5DXQWM · CTCF_binding_site · 46573837–46573858 · regulatory
ENSRX_5DXQZK · CTCF_binding_site · 46574248–46574269 · regulatory
ENSRX_5DXR2P · CTCF_binding_site · 46574497–46574518 · regulatory
ENSRX_5DXR3S · CTCF_binding_site · 46574737–46574758 · regulatory
ENSRX_5DXR5G · CTCF_binding_site · 46575086–46575107 · regulatory
ENSRX_5DXR68 · CTCF_binding_site · 46575256–46575277 · regulatory
ENSRX_5DXRC2 · CTCF_binding_site · 46576290–46576311 · regulatory
ENSRX_5DXRDK · CTCF_binding_site · 46576627–46576648 · regulatory
ENSRX_9NH69 · enhancer · 46577265–46577644 · regulatory
· motif · 46571414–46571436 · motif
· motif · 46571414–46571436 · motif
· motif · 46571534–46571542 · motif
· motif · 46571552–46571564 · motif
· motif · 46572496–46572512 · motif
· motif · 46572867–46572878 · motif
· motif · 46572867–46572878 · motif
· motif · 46572867–46572880 · motif
· motif · 46572963–46572972 · motif
· motif · 46573839–46573855 · motif
· motif · 46574244–46574260 · motif
· motif · 46574244–46574260 · motif
· motif · 46574250–46574266 · motif
· motif · 46574301–46574312 · motif
· motif · 46574499–46574515 · motif
· motif · 46574524–46574536 · motif
· motif · 46574739–46574755 · motif
· motif · 46574827–46574836 · motif
· motif · 46574829–46574845 · motif
· motif · 46574829–46574845 · motif
· motif · 46575088–46575104 · motif
· motif · 46575253–46575262 · motif
· motif · 46575258–46575274 · motif
· motif · 46575264–46575280 · motif
· motif · 46575264–46575280 · motif
· motif · 46575910–46575921 · motif
· motif · 46576057–46576079 · motif
· motif · 46576057–46576079 · motif
· motif · 46576292–46576308 · motif
· motif · 46576405–46576420 · motif
· motif · 46576629–46576645 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：486 aa
carbohydrate sulfotransferase 7 長 486 個胺基酸，屬於 sulfotransferase 1 family 的 Gal/GlcNAc/GalNAc subfamily。其第 1–13 位為細胞質區，第 14–34 位是作為第二型膜蛋白 signal-anchor 的螺旋跨膜區，第 35–486 位位於腔內；第 66–92 位及第 459–486 位被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
carbohydrate sulfotransferase 7 位於 Golgi apparatus 膜，為單次穿膜的第二型膜蛋白。 現有定位資料未提供條件依賴的定位改變或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CHST7 以 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate（PAPS）為硫酸基供體，主要將硫酸基加至非還原端 GlcNAc 的第 6 位，並偏好 mannose 連接的 GlcNAc。它也可修飾 chondroitin 中 GalNAc 的第 6 位，或作用於 core 2 mucin-type oligosaccharide 與 N-acetyllactosamine 寡聚物，但效率較低；對 keratan sulfate 及含 Galbeta1-4GlcNAc 的寡醣活性微弱或缺乏，且可硫酸化 beta-benzyl GlcNAc，不能硫酸化 alpha-或 beta-benzyl GalNAc。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) as sulfonate donor to catalyze the transfer of sulfate to position 6 of non-reducing N-acetylglucosamine (GlcNAc) residues. Preferentially acts on mannose-linked GlcNAc. Also able to catalyze the transfer of sulfate to position 6 of the N-acetylgalactosamine (GalNAc) residue of chondroitin. Also acts on core 2 mucin-type oligosaccharide and N-acetyllactosamine oligomer with a lower efficiency. Has weak or no activity toward keratan sulfate and oligosaccharides containing the Galbeta1-4GlcNAc. Catalyzes 6-O-sulfation of beta-benzyl GlcNAc but not alpha- or beta-benzyl GalNAc PMID 10781596 ↗ · PMID 10913333 ↗ · PMID 10956661 ↗ |
| 分子活性 | chondroitin beta-D-glucuronate + n 3'-phosphoadenylyl sulfate = chondroitin 6'-sulfate + n adenosine 3',5'-bisphosphate + n H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源chondroitin beta-D-glucuronate + n 3'-phosphoadenylyl sulfate = chondroitin 6'-sulfate + n adenosine 3',5'-bisphosphate + n H(+) PMID 10781596 ↗ |
| 細胞定位 | carbohydrate sulfotransferase 7 定位於 Golgi apparatus 膜，並具有單次穿膜的第二型膜蛋白特徵。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTAGCACCACCGCCTTCCAAGTTTCCCCTTGTGGATGCG40CGGCCCCGCGGCTCTGCTCCTCCCGGCGCAGAGGGGCCGG80GAGAGGCCACAGGAGCGGACCTGGCACGGGATTTCTGAGG120AACGGGAGAAGACTGGCGCCCGACCCGCTCTGGAGGGTCG160GTGAACGATGAAGGGCCGGCGGCGGCGACGCCGAGAGTAC200TGCAAGTTCGCGCTGCTGTTGGTGCTGTACACGCTGGTGC240TGTTGCTCGTCCCCTCCGTATTGGACGGCGGCCGCGACGG280GGACAAGGGCGCCGAGCACTGCCCCGGCCTGCAGCGCAGC320CTGGGAGTGTGGAGCCTGGAGGCGGCGGCGGCCGGCGAAC360GCGAGCAGGGAGCGGAGGCGCGGGCCGCCGAGGAAGGGGG400CGCGAACCAGTCTCCTCGGTTCCCAAGCAACCTCAGCGGC440GCTGTCGGGGAGGCAGTGTCTCGCGAGAAGCAGCACATCT480ACGTGCATGCCACCTGGCGCACCGGCTCGTCCTTCCTGGG520CGAACTCTTTAACCAGCACCCGGACGTTTTCTACTTGTAT560GAGCCCATGTGGCATCTATGGCAGGCGCTGTATCCGGGCG600ACGCCGAGAGCTTGCAGGGCGCGCTGCGCGACATGCTGCG640TTCGCTCTTCCGCTGCGACTTCTCCGTGCTGCGGCTGTAC680GCGCCGCCGGGGGACCCCGCTGCGCGCGCCCCGGACACGG720CCAATCTTACCACGGCCGCCCTCTTCCGCTGGCGGACTAA760CAAGGTCATCTGCTCGCCGCCACTGTGTCCTGGCGCACCC800CGTGCCCGGGCCGAGGTGGGCCTCGTCGAGGACACCGCCT840GCGAGCGCAGCTGCCCACCCGTGGCGATACGCGCCCTGGA880GGCCGAGTGCCGAAAGTACCCGGTGGTGGTCATCAAGGAC920GTGCGCCTGCTCGATCTGGGCGTGCTGGTGCCCCTGTTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。