基因總覽
cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit 是由 CHRNA10 編碼的蛋白質,屬於配體門控離子通道家族中的乙醯膽鹼受體亞家族,並歸入 Alpha-10/CHRNA10 次亞家族。它是神經型乙醯膽鹼受體(nAChR)的組成亞基;這類受體由多個亞基組成,通常形成五聚體通道。CHRNA10 可與 CHRNA9 組成異源五聚體,參與耳蝸毛細胞相關的受體構成。來源指出此基因產物表現於內耳、交感神經元,以及皮膚角質形成細胞和淋巴球等非神經細胞。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250699 ★ | 3,665,587–3,671,384 | 5 |
| ENST00000534359 | 3,665,587–3,671,367 | 5 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CHRNA10 是神經型乙醯膽鹼受體的組成亞基。受體由五個亞基組成,作為配體門控陽離子通道運作;不同亞基會影響通道活化、去活化與去敏感化的動力學,也會影響 pH 敏感性、陽離子通透性及對異位調節劑的結合。這些受體特性在來源中標示為可能的功能。CHRNA10 與 CHRNA9 可形成異源五聚體,該受體參與聽覺刺激的調節。
CHRNA9:CHRNA10 受體可通透多種二價陽離子,包括 Ca²⁺。Ca²⁺流入可能進一步活化鉀離子電流,使細胞膜超極化。在耳內,這類受體介導橄欖耳蝸傳出纖維與耳蝸毛細胞之間的突觸傳遞;此作用可能降低基底膜運動,改變聽神經纖維的活動,並縮小動態聽覺範圍。來源也指出,這些效應可能有助於抵禦聲學創傷,但未將此保護作用表述為確定結果。
除耳內功能外,CHRNA10 也表現於角質形成細胞及其他非神經細胞。來源提出它可能參與調節角質形成細胞的黏附;此項功能標示為相似性推論,應與耳蝸受體的已述功能區分。不同亞基所賦予的通道特性,以及受體所在細胞情境,共同關聯到其在聽覺調節與非神經細胞中的可能作用。
Promoter 與基因調控
>CHRNA10 ENST00000250699 GRCh38 chr11:3671284-3672384 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCTTCTCCCACACTGCCCACAGTGTTTGGGCAAGGTGAAAAAACAGGCTCAGATGGGAATGACTGCAGG GAGTCTGAGGAGAGGATGTGGGCTCCATCTTCTGCTCCACTGGGTCATCTGGAGTGGCCTGAGGCTCAGC ACTACTCCCACCAGGAGGGAAGGGCTTGCTTGACCCAAAGTGCCTAGCCTGGAGTGTCTAGTCCCGCACT GCAAGGAGAGCTGCAGGTCTAAGGCAAACCTCCACCTCCAGAATTCAGGCAATGGTGGCTAAGATGAGAG GACAGTTATCCATCCACTGACCCTGGCCCCTCACACTCTTAAGCCCTGGTCTTCCACATACCCTGACCCA GCATACCTGTACTCTCCAACACCCGAGGATGGGCCTGAGCTGAGTCTGTGTGCTGCTTTACAGAGTTTGA ATAATTCAAGCCCCAGAGGCCCGAGGTATCAGTTTCCGTTGCTCTGTTGTCATAGGCACGGTGTAATTAA GCTAATGAAAGGGCAGAGAGGGAGGGGCTGTGGTCCTGTGCCTCGGACGACTCTGGGCTGATCAAGGGAG GAGTCCCTGGTCCCTGTTCTGCTGAGAGAGCAGCAGGCCCATCTAGAGTCCAGGTGTGGGGAATGGAAGA AGGAAGGAATGAGGGATGAAACAGAAGTAGGAGAAAGGGAGAGAGAGTGGAAAGAGGCAGGCAGGGGATG ATCAGAGTCAGGGAGGCAGAGAGACCAAGAAAGTTACAGACGGAAAGAGAAGGAAGCAGAAACAGAGTGA AAGACAAAGCAGGTGGGGAGCATAGGAAAGGGCAGAGGCAGAGGCCAGAAGAGGCAAGGACCAGCAGAGA AGAAGAAAGACCAAGTACTAAAATCCAGGGGCAGGCACAAATTGGAGGGTCAGAAGACTGGAGGGGCTGC AGGGCTCGCTGGAGGGTGGCTGGACCCACCAGAGATCTGTCTTACTTCTGACTTCTAGGTACTGTCCACA CCATCCTTGCCAGCTGGGCCTAATTTTGCCCTAGGTCTGGCCAGGAGGCCTCACATCCAGAGACCTGCCC CCGCTCTTGCAGTGCCAGGGCCATGGGGCTCCGGAGCCACCACCTCAGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CHRNA10_1 ↗ | 11:3,679,664 | 負股 | 3,679,654–3,679,713 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_93GD7 · enhancer · 3674175–3674595 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:450 aa
cholinergic receptor nicotinic alpha 10 subunit 長 450 個胺基酸。其 N 端含訊號胜肽,胞外區約位於第 25–237 位;蛋白質具有四段螺旋跨膜區,胞質區位於第 323–428 位。第 355–380 位另被註記為無序區。這些結構註解描述其多次跨膜蛋白特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CHRNA10 被註記位於細胞膜及突觸細胞膜,並屬多次跨膜蛋白。 來源沒有提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CHRNA10 可與 CHRNA9 共同組成寡聚通道;耳蝸外毛細胞的天然受體可能由兩者形成異源寡聚體。相似性資料指出一種化學計量形式為 (CHRNA9)₂:(CHRNA10)₃。來源另提及同源或異源寡聚通道,但未進一步說明同源通道的組成。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CHRNA10 是神經型乙醯膽鹼受體的亞基;此受體為高鈣通透性的五聚體配體門控陽離子通道,亞基組成會影響通道動力學、pH 敏感性、離子通透性及異位調節。它可與 CHRNA9 組成異源五聚體,並在內耳、交感神經元、角質形成細胞及淋巴球等處表現。耳蝸受體參與聽覺調節,其效應可能包括降低動態聽覺範圍及保護免受聲學創傷;調節角質形成細胞黏附則屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of neuronal acetylcholine receptors (nAChRs) that function as pentameric, ligand-gated cation channels with high calcium permeability. nAChRs are excitatory neurotrasnmitter receptors formed by a collection of nAChR subunits. Each nAchR subunit confers differential attributes to channel properties, including activation, deactivation and desensitization kinetics, pH sensitivity, cation permeability, and binding to allosteric modulators (Probable). Forms heteropentamers with CHRNA9. Expressed in the inner ear, in sympathetic neurons and in other non-neuronal cells, such as skin keratinocytes and lymphocytes. nAChR formed by CHRNA9:CHRNA10 is involved in modulation of auditory stimuli. The channel is permeable to a range of divalent cations including calcium, the influx of which may activate a potassium current which hyperpolarizes the cell membrane. In the ear, mediates synaptic transmission between efferent olivocochlear fibers and hair cells of the cochlea, this may lead to a reduction in basilar membrane motion, altering the activity of auditory nerve fibers and reducing the range of dynamic hearing. This may protect against acoustic trauma. May also regulate keratinocyte adhesion (By similarity) PMID 11752216 ↗ · PMID 15531379 ↗ · PMID 18723036 ↗ |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | K(+)(in) = K(+)(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | Na(+)(in) = Na(+)(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | Mg(2+)(in) = Mg(2+)(out) | 推論支持 | |
| 交互作用 | CHRNA10 可形成同源或異源寡聚通道。耳蝸外毛細胞的天然受體可能由 CHRNA9 與 CHRNA10 組成異源寡聚體;相似性資料另指出其化學計量形式為 (CHRNA9)₂:(CHRNA10)₃。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms homo- or heterooligomeric channels in conjunction with CHRNA10. The native outer hair cell receptor may be composed of CHRNA9:CHRNA10 heterooligomers. Found in the stoichiometric form (CHRNA9)2:(CHRNA10)3 (By similarity) PMID 11752216 ↗ |
| 細胞定位 | CHRNA10 被註記定位於突觸細胞膜與細胞膜,並具有多次跨膜蛋白特徵。 | 推論支持 | 證據與來源Synaptic cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein |
核酸與蛋白質序列
TAATTTTGCCCTAGGTCTGGCCAGGAGGCCTCACATCCAG40AGACCTGCCCCCGCTCTTGCAGTGCCAGGGCCATGGGGCT80CCGGAGCCACCACCTCAGCCTGGGCCTTCTGCTTCTGTTT120CTACTCCCTGCAGAGTGCCTGGGAGCTGAGGGCCGGCTGG160CTCTCAAGCTGTTCCGTGACCTCTTTGCCAACTACACAAG200TGCCCTGAGACCTGTGGCAGACACAGACCAGACTCTGAAT240GTGACCCTGGAGGTGACACTGTCCCAGATCATCGACATGG280ATGAACGGAACCAGGTGCTGACCCTGTATCTGTGGATACG320GCAGGAGTGGACAGATGCCTACCTACGATGGGACCCCAAT360GCCTATGGTGGCCTGGATGCCATCCGCATCCCCAGCAGTC400TTGTGTGGCGGCCAGACATCGTACTCTATAACAAAGCCGA440CGCGCAGCCTCCAGGTTCCGCCAGCACCAACGTGGTCCTG480CGCCACGATGGCGCCGTGCGCTGGGACGCGCCGGCCATCA520CGCGCAGCTCGTGCCGCGTGGATGTAGCAGCCTTCCCGTT560CGACGCCCAGCACTGCGGCCTGACGTTCGGCTCCTGGACT600CACGGCGGGCACCAACTGGATGTGCGGCCGCGCGGCGCTG640CAGCCAGCCTGGCGGACTTCGTGGAGAACGTGGAGTGGCG680CGTGCTGGGCATGCCGGCGCGGCGGCGCGTGCTCACCTAC720GGCTGCTGCTCCGAGCCCTACCCCGACGTCACCTTCACGC760TGCTGCTGCGCCGCCGCGCCGCCGCCTACGTGTGCAACCT800GCTGCTGCCCTGCGTGCTCATCTCGCTGCTTGCGCCGCTC840GCCTTCCACCTGCCTGCCGACTCAGGCGAGAAGGTGTCGC880TGGGCGTCACCGTGCTGCTGGCGCTCACCGTCTTCCAGTT920GCTGCTGGCCGAGAGCATGCCACCGGCCGAGAGCGTGCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。