基因總覽
CHRAC1 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 chromatin accessibility complex subunit 1，也稱 Chromatin accessibility complex protein 1。它是 CHRAC 染色質重塑複合體的組成部分，並與 POLE3 形成異源二聚體。此蛋白質可與 DNA 結合；其在複合體中的角色與 DNA 及核小體重塑相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000220913 ★ | 140,511,322–140,517,154 | 3 |
| ENST00000519533 | 140,511,288–140,516,467 | 2 |
| ENST00000970390 | 140,511,288–140,516,699 | 3 |
| ENST00001100794 | 140,511,288–140,516,700 | 3 |
| ENST00001138263 | 140,511,288–140,517,154 | 3 |
| ENST00000518971 | 140,511,918–140,515,185 | 2 |
| ENST00000519618 | 140,511,982–140,515,765 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CHRAC1 與 DNA polymerase epsilon subunit POLE3 形成複合體，並可結合裸露 DNA。這些 DNA 隨後被納入染色質；此過程受到 ISWI/SNF2H 與 ACF1 的核小體重塑活性協助。
CHRAC1 也是 CHRAC ISWI 染色質重塑複合體的組成部分。該複合體至少包含 SMARCA5/SNF2H、BAZ1A/ACF1、CHRAC1 與 POLE3，並具有 ATP 依賴性的核小體重塑活性。複合體透過 CHRAC1-POLE3 異源二聚體優先結合 DNA。
在複合體內，CHRAC1-POLE3 異源二聚體與 SMARCA5/SNF2H 直接互作；此互作會增強由 SMARCA5/SNF2H 與 BAZ1A/ACF1 互作所促進的核小體滑動活性。異源二聚體也與 BAZ1A/ACF1 直接互作。另一方面，CHRAC1 不會增強 ACF-5 ISWI 染色質重塑複合體的核小體滑動活性。
Promoter 與基因調控
>CHRAC1 ENST00000220913 GRCh38 chr8:140510322-140511422 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGGTGTTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCTGTG TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAGTTGGACCCCTTACTCTTCCAAGGGCCTCCCCACTCATTCA GAGCGAATTCTGCGGTCTCCGCGGCCTTCCCTGGTCTGGCCCCTGACCATCTCCTGCCTCTCTCCTCCCA GCTGCTGTCCCCTTGGTACTGCCGGCCTCCTGAGGGCCACGTTCCTGGGTTCTCGTAATCATCTTCTACC TGGTCTCTGTGATTCCGGCCTTACGCGCACCCACGCCCTCCCAGCCGGCAGCTGCAGGGATCCTTTTAAA ACTGCCCGGGACTCCACTGCTCAAACCCTACCACCACTTCCCATTTTCCTTAGAAAAAAAAATCCAACAG GACCTAGCCCCGGGCTGCCTGTCAGACCTCGGCGAGCACGCCAGGCTCTGCACACCGTCTCTCGGAGCAG TCCCGAAGAGGCCGTTCCCACCAGACTCCGGGACCTCCTCAGGGCAGCTCTTCGTCCTCCACCCCGCAGG AAGGCTCTTCTCCCAATCACCCCGCGGCGCAGCAAGCCTGGCCCCGCCGCATCGCCCGCGCTGGACTCTG CTCTTCCACCGGTCGCCTGGCTACCGGCGCAGGACGCATCCGCTGTCCGCTTGGTCGTCCCCCCTGGACT TTGTGCTTCAAGAAAGCGTCACTTTTTGCCGACGGCGGCACGCCCGGTCCTAGTACAGCGCAGGCGCTTA ACACACAGCACCCAGCCACGAGGCCCGGAGTCAGAGGGCTTTGCTTGCCCATTCACAGAGCCCTCACCCG CGGATCAAAGTCGTATTCCGCGACCGCAGCCCGGAGACTCCCGGGAGCGGCGCGGTGCGCCCCGCCCCCG CCAGGCTCTCGGCTGCCGGTTCCGCGCCGGGCCTCGCACTCGGGGGCGGTGTCCGAGCGTCGGCGCATGC GCAGATCGGGGGCGCGAGGCCTCACGGAGCTCGTAGTTTCCCGGACGGGCCGCTCCCGGCCTCGCGGCCT CGCCTCCCCACACTACAACTCCCACGGGGCAGCGGGCGCGGCTCCCCGTAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CHRAC1_1 ↗ | 8:140,511,325 | 正股 | 140,511,276–140,511,335 |
| CHRAC1_3 ↗ | 8:140,511,449 | 正股 | 140,511,400–140,511,459 |
| CHRAC1_2 ↗ | 8:140,511,996 | 正股 | 140,511,947–140,512,006 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_B32TW3 · enhancer · 140507141–140507762 · regulatory
ENSR8_865JKG · enhancer · 140507867–140508032 · regulatory
ENSR8_943QRB · promoter · 140508033–140508499 · regulatory
ENSR8_943QRL · enhancer · 140509039–140509484 · regulatory
ENSR8_B32TWK · promoter · 140510821–140511332 · regulatory
ENSR8_D8Z87 · enhancer · 140511333–140513414 · regulatory
ENSR8_5383C7Q · CTCF_binding_site · 140511606–140511627 · regulatory
ENSR8_5383CB5 · CTCF_binding_site · 140512124–140512145 · regulatory
ENSR8_865JNT · enhancer · 140513753–140513932 · regulatory
· motif · 140508971–140508982 · motif
· motif · 140509193–140509202 · motif
· motif · 140510941–140510956 · motif
· motif · 140511014–140511029 · motif
· motif · 140511015–140511029 · motif
· motif · 140511078–140511089 · motif
· motif · 140511078–140511089 · motif
· motif · 140511162–140511177 · motif
· motif · 140511182–140511197 · motif
· motif · 140511222–140511235 · motif
· motif · 140511268–140511281 · motif
· motif · 140511293–140511304 · motif
· motif · 140511293–140511304 · motif
· motif · 140511389–140511402 · motif
· motif · 140511389–140511402 · motif
· motif · 140511498–140511508 · motif
· motif · 140511566–140511575 · motif
· motif · 140511608–140511624 · motif
· motif · 140511646–140511659 · motif
· motif · 140511657–140511670 · motif
· motif · 140511789–140511800 · motif
· motif · 140511789–140511800 · motif
· motif · 140511815–140511828 · motif
· motif · 140511846–140511859 · motif
· motif · 140512063–140512072 · motif
· motif · 140512115–140512128 · motif
· motif · 140512126–140512142 · motif
· motif · 140512255–140512268 · motif
· motif · 140512255–140512268 · motif
· motif · 140512731–140512745 · motif
· motif · 140512731–140512745 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：131 aa
CHRAC1 蛋白質長 131 個胺基酸。序列第 109 至 131 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- POLE3Q9NRF9 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
CHRAC1 與 POLE3 形成異源二聚體，且可結合 DNA。此異源二聚體是 CHRAC 複合體偏好結合 DNA 的部分；複合體至少包含 SMARCA5/SNF2H、BAZ1A/ACF1、CHRAC1 與 POLE3。異源二聚體分別與 SMARCA5/SNF2H 及 BAZ1A/ACF1 直接互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CHRAC1 與 POLE3 形成複合體並結合裸露 DNA，這些 DNA 隨後被納入染色質，且此過程受到 ISWI/SNF2H 與 ACF1 核小體重塑活性的協助；但 CHRAC1 不會增強 ACF-5 ISWI 複合體的核小體滑動活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a complex with DNA polymerase epsilon subunit POLE3 and binds naked DNA, which is then incorporated into chromatin, aided by the nucleosome remodeling activity of ISWI/SNF2H and ACF1. Does not enhance nucleosome sliding activity of the ACF-5 ISWI chromatin remodeling complex PMID 14759371 ↗ |
| 交互作用 | CHRAC1 與 POLE3 形成異源二聚體並結合 DNA，且是 CHRAC ISWI 複合體的組成部分；該複合體至少包含 SMARCA5/SNF2H、BAZ1A/ACF1、CHRAC1 與 POLE3，具有 ATP 依賴性核小體重塑活性。異源二聚體偏好結合 DNA，並直接互作 SMARCA5/SNF2H 與 BAZ1A/ACF1；前者互作可增強核小體滑動活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with POLE3; binds to DNA. Component of the CHRAC ISWI chromatin remodeling complex at least composed of SMARCA5/SNF2H, BAZ1A/ACF1, CHRAC1 and POLE3; the complex preferentially binds DNA through the CHRAC1-POLE3 heterodimer and possesses ATP-dependent nucleosome-remodeling activity. Within the complex, the heterodimer with POLE3 interacts with SMARCA5/SNF2H; the interaction is direct and enhances nucleosome sliding activity by the SMARCA5/SNF2H and BAZ1A/ACF1 interaction. Within the complex, the heterodimer with POLE3 interacts with BAZ1A/ACF1; the interactions are direct PMID 10880450 ↗ · PMID 12434153 ↗ · PMID 14759371 ↗ |
| 細胞定位 | CHRAC1 定位於細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTCACGGAGCTCGTAGTTTCCCGGACGGGCCGCTCCCGGC40CTCGCGGCCTCGCCTCCCCACACTACAACTCCCACGGGGC80AGCGGGCGCGGCTCCCCGTACCCACCAGCTGGCCGGGCAG120GGCAGCCACTTCGCGGTCGGGCCCGCCGGCTGCGGGCACC160CGCGCGACGGGCGGGAAGATGGCGGACGTGGTCGTGGGTA200AAGACAAGGGCGGGGAGCAGCGGCTCATCTCGCTGCCTCT240ATCCCGCATCCGGGTCATCATGAAGAGCTCCCCCGAGGTG280TCCAGCATCAACCAGGAGGCGTTGGTGCTCACGGCCAAGG320CCACGGAGCTCTTTGTTCAATGCCTAGCCACCTATTCCTA360CAGACACGGCAGTGGAAAGGAAAAGAAAGTACTGACTTAC400AGTGATTTAGCAAACACTGCACAGCAATCAGAAACTTTTC440AGTTTCTTGCAGATATATTACCAAAGAAGATTTTAGCTAG480TAAATACCTGAAAATGCTTAAAGAGGAAAAGAGGGAAGAA520GATGAGGAGAATGACAATGATAATGAAAGTGACCATGATG560AAGCTGACTCCTAAACCAAAAGTGCTTTAAAAACCAGCCT600GGCGAGGACAGCCCTGGACCCACTCCACTGTCTCTAAGTA640AACACAGCACTGCCCGCTTTTAGCGTCTTCACTTCTTCAC680AGAGTTCCAGTGTGTGGTATTCTTTCGAGGTATTCTTTCC720AGGCCGAGATTGAGCACCTCATGTACCTACGCCACAGACA760GCCAGAGGGAAAGCGACCCAGACAGCAGCCCCTCCTCGAC800AGGCCCACCCTGCAGCTCAGGCACCAAGAAAACAGCCGAT840ACTGGCAGCCATTGCAGCTCCAAACTGCAGAGGCAAGGCC880AATTTTAACTTTTCAATTTACAGTCGATTTTGAAGAGCTT920CTACATATCGGTTATGTAAATTCATATATGTATATTTTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。