基因總覽
CHORDC1 是一個蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1。來源描述它涉及多種細胞調節工作，包括中心體複製、壓力反應，以及受體 EGFR 的定位與後續活性調控。關於 CHORDC1 的分子作用方式，部分內容仍屬推測，例如它可能作為 HSP90 的共同伴護蛋白；因此不宜將這些提議中的角色視為已確立的機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000320585 ★ | 90,200,429–90,223,049 | 11 |
| ENST00001141530 | 90,200,429–90,223,114 | 11 |
| ENST00001088927 | 90,200,433–90,223,114 | 11 |
| ENST00001019362 | 90,200,434–90,223,114 | 11 |
| ENST00000979382 | 90,201,014–90,223,114 | 11 |
| ENST00001095609 | 90,201,087–90,223,114 | 5 |
| ENST00001095613 | 90,201,427–90,223,114 | 8 |
| ENST00000529987 | 90,201,444–90,210,765 | 6 |
| ENST00001095610 | 90,201,444–90,223,114 | 10 |
| ENST00001095615 | 90,201,444–90,223,114 | 4 |
| ENST00000457199 | 90,201,449–90,223,114 | 10 |
| ENST00000907759 | 90,201,451–90,223,114 | 10 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CHORDC1 與中心體複製的調節有關；來源指出，它可能藉由抑制 ROCK2 的激酶活性發揮作用。此機制仍以可能性描述，並提出 CHORDC1 或可透過抑制 ROCK2 與 NPM1 的結合來達成調節效果，因此不應將其視為已確證的作用途徑。
CHORDC1 也被提出可能是 HSP90 的共同伴護蛋白，並可能透過 HSP90 伴護蛋白複合體參與 NOD1 的調節。此外，體外實驗顯示 CHORDC1 具有內在的伴護蛋白活性；這項體外結果與其可能參與伴護功能的說法相符，但來源未將其描述為已證實的細胞內作用機制。
在另一項功能中，CHORDC1 有助於確保酪胺酸激酶受體 EGFR 定位至細胞膜。這項定位作用進而關聯到 EGFR 活性的後續調節，以及 EGF 誘導的肌動蛋白細胞骨架重塑。來源也指出 CHORDC1 參與壓力反應，並具有防止腫瘤形成的作用；未提供足以進一步界定這兩項功能機制的細節。
Promoter 與基因調控
>CHORDC1 ENST00000320585 GRCh38 chr11:90222949-90224049 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGAGAAAGAGAATATGAAAAACTAAAAAGTCTTTAGGGGTAGGAGGACGTGAGCAGATCTCTAAATAA CCTTGAGATCAATGGAAACAGTGTATAGATTTTTAGGTTCACTTATAAGCTGCTGATCTTATTTTAAGAT CCTTCAGTATATGTTATCAAAAAGTGTTTGCTTTTCTTGCAAACGCCCATGTTTGGGAAATATGCAAGTT GAAGCCAATGCATTACTGTACTTTTTATAATGCACCTGAAGTTTTACTAGCTGTTCCAAGAGTGGTGTAC TGAGTATTGATAAATCGTTTAAGTGGAGGCTCACATGAAATATTAACTATTACCCCAGGGCTTTAGAGCA ACTGTGATCAATTCTGGCACAGCATCAGATCCATAATTTTCTTTGCTACTCTGATTTCTACGTTTTTTGT ATTTTCAAAGTAATGTGACCGCAACTGTTAAGTTATTAAAATTGCTCCTGAGATGAGGGCACTCGAGACA CAAACACACGGAGAGGTTCGTCCGCTATTCCTCTCATTTACTAAGCTCACACGTCTACCCTGAGGATTTG GAAACACTGTATGATTCTGCACTTACTGTGCACTTATCCCTTAGTGCTAAGGGGTAAACAGATACCCACC GGGCTGTCTAAGGCGCAGCCTCAAGGCAAGGAAGAAGGGTGCTGGGTCGCAGGGGATGAGAGGGCGGGGC GGCCACTTTGCTGCAGGAGATACCCAAAGCCAGTTAGCACTGAGGAAGTCAGAAGAGAATTGTCAGTCTC TCGGACACCTTCATTTTCTGCCCCGGAAATTTCTCCTCCGCTGTTGTCTGGGCTCCACTTCCGACCCCCA GTTGCTACCAGCTGTAGTCCGACCTATCGTGGCCCGGGCTAGTGCCAGCCTCCCGCCGCTACCTCCGCCT CGTCCCTTCTCCTCTGCGCCTGCGCGACCGGAAAATTCGCGAAGGTTCCTGAAACGCAACGGATCGTTTC CGGAAGCCGGTAGCCGCCTCAGTCGTCAGACCGGTGCTAGCGACACGGGAGTGGCAAACGCATCCTCTTG CCGTTCCCGGTGTTTGGGCCTTGCCTGTGACGGTGGGAAAAGAAAATGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CHORDC1_1 ↗ | 11:90,223,049 | 負股 | 90,223,039–90,223,098 |
| CHORDC1_2 ↗ | 11:90,223,299 | 負股 | 90,223,289–90,223,348 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_84MLPZ · enhancer · 90220469–90220704 · regulatory
ENSR11_93BRW2 · promoter · 90222213–90222713 · regulatory
ENSR11_77B8KT · promoter · 90223039–90223130 · regulatory
ENSR11_BMWG6 · enhancer · 90223131–90223970 · regulatory
· motif · 90218863–90218885 · motif
· motif · 90218863–90218885 · motif
· motif · 90218875–90218887 · motif
· motif · 90218877–90218892 · motif
· motif · 90218877–90218892 · motif
· motif · 90222571–90222580 · motif
· motif · 90222629–90222638 · motif
· motif · 90222629–90222638 · motif
· motif · 90222732–90222749 · motif
· motif · 90222913–90222928 · motif
· motif · 90223062–90223073 · motif
· motif · 90223114–90223125 · motif
· motif · 90223114–90223125 · motif
· motif · 90223249–90223258 · motif
· motif · 90223249–90223260 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：332 aa
CHORDC1 蛋白長 332 個胺基酸，含有兩個 CHORD 結構域，分別位於第 5–64 與第 157–216 個胺基酸；另有位於第 227–316 個胺基酸的 CS 結構域。序列註解將第 2–77 個胺基酸標示為與 PPP5C 互作的區域，並將第 65–316 個胺基酸標示為與 HSP90AA1、HSP90AB1 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- HSP90AA1P07900 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
CHORDC1 與 HSP90AA1、ROCK1 及 ROCK2 有互作註解；來源未進一步說明這些關係是否代表直接結合或同屬特定複合體。與 HSP90AB1 及 PPP5C 的互作則標示為依相似性推定（By similarity），應保留此證據限制。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CHORDC1 參與中心體複製調節，可能透過抑制 ROCK2 激酶活性，且可能藉此阻止 ROCK2 與 NPM1 結合。它被提出可能作為 HSP90 共同伴護蛋白，並透過 HSP90 複合體參與 NOD1 調節；體外亦具伴護活性。此外，它協助 EGFR 定位於細胞膜，關聯後續活性調節與 EGF 誘導的肌動蛋白細胞骨架重塑，也參與壓力反應並防止腫瘤形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulates centrosome duplication, probably by inhibiting the kinase activity of ROCK2. Proposed to act as co-chaperone for HSP90. May play a role in the regulation of NOD1 via a HSP90 chaperone complex. In vitro, has intrinsic chaperone activity. This function may be achieved by inhibiting association of ROCK2 with NPM1. Plays a role in ensuring the localization of the tyrosine kinase receptor EGFR to the plasma membrane, and thus ensures the subsequent regulation of EGFR activity and EGF-induced actin cytoskeleton remodeling. Involved in stress response. Prevents tumorigenesis PMID 20230755 ↗ · PMID 32053105 ↗ |
| 交互作用 | CHORDC1 與 HSP90AA1、ROCK1 及 ROCK2 有互作註解；另與 HSP90AB1、PPP5C 的互作是依相似性推定，應保留此證據限制。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with HSP90AA1, ROCK1 and ROCK2. Interacts with HSP90AB1 and PPP5C (By similarity) |
核酸與蛋白質序列
AGTCGTCAGACCGGTGCTAGCGACACGGGAGTGGCAAACG40CATCCTCTTGCCGTTCCCGGTGTTTGGGCCTTGCCTGTGA80CGGTGGGAAAAGAAAATGGCCTTGCTGTGCTACAACCGGG120GCTGCGGTCAGCGCTTCGATCCTGAGACCAATTCCGACGA160TGCTTGCACATACCACCCAGGTGTTCCGGTCTTTCACGAT200GCATTAAAGGGTTGGTCTTGCTGTAAGAGAAGAACAACTG240ATTTTTCTGATTTCTTAAGCATTGTAGGCTGTACAAAAGG280TAGACATAATAGTGAGAAGCCACCTGAGCCAGTCAAACCT320GAAGTCAAGACTACTGAGAAGAAGGAGCTATGTGAATTAA360AACCCAAATTTCAGGAACACATCATTCAAGCCCCTAAGCC400AGTAGAAGCAATAAAAAGACCAAGCCCAGATGAACCAATG440ACAAATTTGGAATTAAAAATATCTGCCTCCCTAAAACAAG480CACTTGATAAACTTAAACTGTCATCAGGGAATGAAGAAAA520TAAGAAAGAAGAAGACAATGATGAAATTAAGATTGGGACC560TCATGTAAGAATGGAGGGTGTTCAAAGACATACCAGGGTC600TAGAGAGTCTAGAAGAAGTCTGTGTATATCATTCTGGAGT640ACCTATTTTCCATGAGGGGATGAAATACTGGAGCTGTTGT680AGAAGAAAAACTTCTGATTTTAATACATTCTTAGCCCAAG720AGGGCTGTACAAAAGGGAAACACATGTGGACTAAAAAAGA760TGCTGGGAAAAAAGTTGTTCCATGTAGACATGACTGGCAT800CAGACTGGAGGTGAAGTTACCATTTCAGTATATGCTAAAA840ACTCACTTCCAGAACTTAGCCGAGTAGAAGCAAATAGCAC880ATTGTTAAATGTGCATATTGTATTTGAAGGAGAGAAGGAA920TTTGATCAAAATGTGAAATTATGGGGTGTGATTGATGTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。