基因總覽
complement factor B 是由 CFB 編碼的蛋白質，屬於 peptidase S1 家族。其前驅蛋白經切割後產生 Ba 與 Bb 兩條鏈；其中 Bb 是替代補體途徑中 C3、C5 轉化酶的催化成分。這項蛋白質的基本特徵，是以可被活化的前驅形式參與補體系統，並具有多個 Sushi 結構域、VWFA 結構域及 Peptidase S1 結構域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000425368 ★ | 31,946,095–31,952,084 | 18 |
| ENST00000885706 | 31,945,935–31,952,086 | 19 |
| ENST00000483004 | 31,945,942–31,952,086 | 16 |
| ENST00000698628 | 31,945,942–31,952,086 | 16 |
| ENST00000885707 | 31,945,942–31,952,086 | 17 |
| ENST00000885708 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
| ENST00000885709 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
| ENST00000885710 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
| ENST00000885711 | 31,945,942–31,952,086 | 17 |
| ENST00000885712 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
| ENST00000885713 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
| ENST00000885714 | 31,945,942–31,952,086 | 18 |
顯示 12/46 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CFB 經 CFD 切割並活化後，形成 Ba 與 Bb；Bb 與補體 C3b 組成替代途徑的 C3 轉化酶。此酵素會切割 C3 alpha-chain 中的 Arg-|-Ser 鍵，產生 C3a 與 C3b。C3a 是 anaphylatoxin，C3b 則是 opsonin，並可繼續參與補體途徑。這些反應使補體級聯得以推進，促進病原體的吞噬與分解，並傳遞可強化適應性免疫的訊號。
當另一個 C3b 分子結合 C3 轉化酶時，複合體轉為 C5 轉化酶。其催化成分 Bb 可切割 C5 alpha-chain 中的 Arg-|-Xaa 鍵，產生 C5a 與 C5b；C5a 是 anaphylatoxin，C5b 則是膜攻擊複合體的組成成分。由此，CFB 活化後形成的催化成分可依複合體組成參與 C3 與 C5 的切割活化。
替代補體途徑也具有放大作用：藉由促進更多 C3 與 C5 轉化酶形成，可增強 classical、lectin 與 GZMK 等其他補體途徑的反應。除補體轉化酶相關作用外，CFB 亦被報告與預先活化 B 淋巴球的增殖及分化、周邊血液單核球快速展開、淋巴球母細胞化刺激，以及紅血球溶解有關。
Promoter 與基因調控
>CFB ENST00000425368 GRCh38 chr6:31945095-31946195 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGGCCTTTGAGGGATCTAGGGAGGTTGGGGCTTACAGTTGGGGCTGTGGCAGCCTCCCAGCCAGTTCTC TCCTTTTCTCCAGGTGGGTCTGGTGAGCTGGGGTCTTTACAACCCCTGCCTTGGCTCTGCTGACAAAAAC TCCCGCAAAAGGGCCCCTCGTAGCAAGGTCCCGCCGCCACGAGACTTTCACATCAATCTCTTCCGCATGC AGCCCTGGCTGAGGCAGCACCTGGGGGATGTCCTGAATTTTTTACCCCTCTAGCCATGGCCACTGAGCCC TCTGCTGCCCTGCCAGAATCTGCCGCCCCTCCATCTTCTACCTCTGAATGGCCACCCTTAGACCCTGTGA TCCATCCTCTCTCCTAGCTGAGTAAATCCGGGTCTCTAGGATGCCAGAGGCAGCGCACACAAGCTGGGAA ATCCTCAGGGCTCCTACCAGCAGGACTGCCTCGCTGCCCCACCTCCCGCTCCTTGGCCTGTCCCCAGATT CCTTCCCTGGTTGACTTGACTCATGCTTGTTTCACTTTCACATGGAATTTCCCAGTTATGAAATTAATAA AAATCAATGGTTTCCACATCTCTCAGTGCCTCTATCTGGAGGCCAGGTAGGGCTGGCCTTGGGGGAGGGG GAGGCCAGAATGACTCCAAGAGCTACAGGAAGGCAGGTCAGAGACCCCACTGGACAAACAGTGGCTGGAC TCTGCACCATAACACACAATCAACAGGGGAGTGAGCTGGATCCTTATTTCTGGTCCCTAAGTGGGTGGTT TGGGCTTACTGGGGAGGAGCTAAGGCCGGAGAGGAGGTACTGAAGGGGAGAGTCCTGGACCTTTGGCAGC AAAGGGTGGGACTTCTGCAGTTTCTGTTTCCTTGACTGGCAGCTCAGCGGGGCCCTCCCGCTTGGATGTT CCGGGAAAGTGATGTGGGTAGGACAGGCGGGGCGAGCCGCAGGTGCCAGAACACAGATTGTATAAAAGGC TGGGGGCTGGTGGGGAGCAGGGGAAGGGAATGTGACCAGGTCTAGGTCTGGAGTTTCAGCTTGGACACTG AGCCAAGCAGACAAGCAAAGCAAGCCAGGACACACCATCCTGCCCCAGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CFB_1 ↗ | 6:31,946,097 | 正股 | 31,946,048–31,946,107 |
| CFB_3 ↗ | 6:31,951,439 | 正股 | 31,951,390–31,951,449 |
| CFB_2 ↗ | 6:31,951,895 | 正股 | 31,951,846–31,951,905 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_B8C6R · promoter · 31945510–31946105 · regulatory
· motif · 31945550–31945560 · motif
· motif · 31945715–31945725 · motif
· motif · 31945788–31945803 · motif
· motif · 31945788–31945803 · motif
· motif · 31945819–31945829 · motif
· motif · 31946076–31946086 · motif
· motif · 31946388–31946403 · motif
· motif · 31947519–31947531 · motif
· motif · 31947523–31947536 · motif
· motif · 31947526–31947538 · motif
· motif · 31947530–31947543 · motif
· motif · 31948476–31948489 · motif
· motif · 31948510–31948523 · motif
· motif · 31948571–31948584 · motif
· motif · 31948571–31948584 · motif
· motif · 31949244–31949253 · motif
· motif · 31949244–31949253 · motif
· motif · 31950336–31950347 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：764 aa
complement factor B 前驅蛋白長 764 個胺基酸，N 端具有訊號序列（第 1–25 位）。其序列註解包含三個 Sushi 結構域（第 35–220 位）、VWFA 結構域（第 270–469 位）及 Peptidase S1 結構域（第 477–757 位），並歸屬 peptidase S1 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
complement factor B 為分泌蛋白。 切割後的 Bb 可被補體 C3b opsonin 招募至病原體表面；因此，來源所述的細胞表面定位是 Bb 在 C3b 介導下的定位，不應與未切割前驅蛋白的分泌位置混為一談。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- C3P01024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CFHR4Q92496-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
complement factor B 以單體形式存在，並可在有 Mg(2+) 時與補體 C3b 互作。切割產生的 Bb 與 C3b 組成替代途徑 C3 轉化酶 C3bBb；再加入 C3b 可形成 C5 轉化酶 C3bBb3b。CFP 也與 CFB 互作，該互作有助於穩定活性的 C3 轉化酶複合體。
疾病與遺傳關聯
CFB 變異與年齡相關黃斑部病變的易感性可能相關；相關單倍型分析辨識出一種常見風險單倍型及兩種保護性單倍型，特定 CFB 與 C2 變異組合則與風險顯著降低有關。非典型溶血性尿毒症的易感性也與 CFB 變異相關，但補體級聯其他成分或調節因子的突變及其他基因亦可能影響表型。另有補體因子 B 缺乏症，其疾病由影響 CFB 的變異造成，並與替代補體途徑缺陷及細菌感染易感性增加有關，尤其包括 Neisseria 感染。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 11 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CFB 是替代補體途徑 C3 與 C5 轉化酶催化成分的前驅物。替代途徑可透過促進更多轉化酶形成，放大 classical、lectin 與 GZMK 等其他補體途徑的反應。CFB 經 CFD 切割活化後產生 Ba 與 Bb，其中 Bb 構成轉化酶的催化成分；補體級聯可促進病原體吞噬與分解，並傳遞強化適應性免疫的訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Precursor of the catalytic component of the C3 and C5 convertase complexes of the alternative pathway of the complement system, a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. The alternative complement pathway acts as an amplification loop that enhances other complement pathways (classical, lectin and GZMK) by promoting formation of additional C3 and C5 convertases. CFB is cleaved and activated by CFD to generate Ba and Bb chains; Bb chain constituting the catalytic component of the C3 and C5 convertases PMID 3638964 ↗ · PMID 624565 ↗ · PMID 6554279 ↗ · PMID 6769474 ↗ · PMID 6919543 ↗ · PMID 9748277 ↗ |
| 功能 | CFB 是替代補體途徑 C3 與 C5 轉化酶的絲胺酸蛋白酶成分。經 CFD 切割活化後，CFB 與 C3b 形成 C3 轉化酶，切割並活化 C3，產生 anaphylatoxin C3a 與 opsonin C3b。若再結合一個 C3b，則形成 C5 轉化酶，進一步切割 C5，產生 anaphylatoxin C5a 與膜攻擊複合體的組成成分 C5b。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine protease component of the complement C3 and C5 convertase complexes of the alternative complement pathway. Following cleavage and activation by factor D (CFD), forms the C3 convertase together with complement C3b. As part of the C3 convertase, cleaves and activates C3 into C3a anaphylatoxin and C3b opsonin, the next components of the complement pathways. When an additional complement C3b molecule binds to the C3 convertase, forms the C5 convertase, which cleaves and activates C5 into C5a anaphylatoxin and C5b component of the membrane attack complex PMID 30643019 ↗ · PMID 3638964 ↗ · PMID 624565 ↗ · PMID 6554279 ↗ · PMID 6919543 ↗ · PMID 9748277 ↗ |
| 功能 | CFB 被報告與多種細胞反應有關，包括預先活化 B 淋巴球的增殖與分化、周邊血液單核球快速展開、淋巴球母細胞化受到刺激，以及紅血球溶解；來源未進一步提供這些作用的分子機制或條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in proliferation and differentiation of preactivated B-lymphocytes, rapid spreading of peripheral blood monocytes, stimulation of lymphocyte blastogenesis and lysis of erythrocytes PMID 3486249 ↗ |
| 分子活性 | CFB 相關酵素活性包括切割補體成分 C3 alpha-chain 的 Arg-|-Ser 鍵，產生 C3a 與 C3b；也包括切割 C5 alpha-chain 的 Arg-|-Xaa 鍵，產生 C5a 與 C5b。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cleavage of Arg-|-Ser bond in complement component C3 alpha-chain to yield C3a and C3b, and Arg-|-Xaa bond in complement component C5 alpha-chain to yield C5a and C5b. PMID 3638964 ↗ · PMID 624565 ↗ · PMID 6554279 ↗ · PMID 6919543 ↗ · PMID 9748277 ↗ |
| 交互作用 | CFB 以單體形式存在，並可與補體 C3b 互作；此互作依賴 Mg(2+) 存在。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with complement C3b; this interaction is dependent on the presence of Mg(2+) PMID 19574954 ↗ · PMID 28264884 ↗ · PMID 31507604 ↗ |
| 交互作用 | CFB 的 Bb 是替代補體途徑轉化酶的催化成分：與 C3b 組成 C3 轉化酶 C3bBb，並可在額外 C3b 加入後形成 C5 轉化酶 C3bBb3b。CFB 也與 CFP 互作，這項互作有助於穩定活性的 C3 轉化酶複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalytic component of the C3 convertase of the alternative complement pathway, also named C3bBb, composed of complement factor B Bb and complement C3b. Catalytic component of the C5 convertase of the alternative complement pathway, also named C3bBb3b, composed of complement factor B Bb and additional molecules of complement C3b. Interacts to CFP; this interaction contributes to the stabilization of the active C3-convertase enzyme complex PMID 16301317 ↗ · PMID 28264884 ↗ · PMID 30643019 ↗ · PMID 31507604 ↗ · PMID 3638964 ↗ · PMID 624565 ↗ · PMID 6554279 ↗ · PMID 9748277 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 切割後的 complement factor B Bb 位於細胞表面；補體 C3b opsonin 會將其招募至病原體表面。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement factor B Bb; Cell surface; Recruited to the surface of pathogens by complement C3b opsonin PMID 30643019 ↗ |
| 疾病關聯 | 年齡相關黃斑部病變的易感性可能與影響 CFB 的變異有關。單倍型分析辨識出具統計顯著性的常見風險單倍型及兩種保護性單倍型；CFB His-9 與 C2 Asp-318，以及 CFB Gln-32 與 C2 第 10 內含子變異的組合，均與 AMD 風險顯著降低有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Macular degeneration, age-related, 14 ARMD14 A form of age-related macular degeneration, a multifactorial eye disease and the most common cause of irreversible vision loss in the developed world. In most patients, the disease is manifest as ophthalmoscopically visible yellowish accumulations of protein and lipid that lie beneath the retinal pigment epithelium and within an elastin-containing structure known as Bruch membrane. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry. Haplotype analyses have identified a statistically significant common risk haplotype and two protective haplotypes. CFB variant His-9 and C2 variant Asp-318, as well as CFB variant Gln-32 and a variant in intron 10 of C2, confer a significantly reduced risk of AMD MIM: 615489 PMID 16518403 ↗ |
| 疾病關聯 | 非典型溶血性尿毒症的易感性與影響 CFB 的變異相關。此病為複雜遺傳疾病，特徵包括微血管病性溶血性貧血、血小板減少與腎衰竭，且缺乏腸炎及腹瀉發作；相較典型型態，預後較差、死亡率較高，並常進展至末期腎病。補體級聯成分或調節因子的突變可帶來易感性，其他基因也可能修飾表型。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hemolytic uremic syndrome, atypical, 4 AHUS4 An atypical form of hemolytic uremic syndrome. It is a complex genetic disease characterized by microangiopathic hemolytic anemia, thrombocytopenia, renal failure and absence of episodes of enterocolitis and diarrhea. In contrast to typical hemolytic uremic syndrome, atypical forms have a poorer prognosis, with higher death rates and frequent progression to end-stage renal disease. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. Susceptibility to the development of atypical hemolytic uremic syndrome can be conferred by mutations in various components of or regulatory factors in the complement cascade system. Other genes may play a role in modifying the phenotype MIM: 612924 PMID 17182750 ↗ · PMID 20513133 ↗ |
| 疾病關聯 | 補體因子 B 缺乏症由影響 CFB 的變異造成，是一種與替代補體途徑缺陷相關的免疫疾病，患者對細菌感染的易感性增加，尤其包括 Neisseria 感染。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement factor B deficiency CFBD An immunologic disorder characterized by increased susceptibility to bacterial infections, particularly Neisseria infections, due to a defect in the alternative complement pathway. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615561 PMID 24152280 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGAAGGGAATGTGACCAGGTCTAGGTCTGGAGTTTCAGC40TTGGACACTGAGCCAAGCAGACAAGCAAAGCAAGCCAGGA80CACACCATCCTGCCCCAGGCCCAGCTTCTCTCCTGCCTTC120CAACGCCATGGGGAGCAATCTCAGCCCCCAACTCTGCCTG160ATGCCCTTTATCTTGGGCCTCTTGTCTGGAGGTGTGACCA200CCACTCCATGGTCTTTGGCCCGGCCCCAGGGATCCTGCTC240TCTGGAGGGGGTAGAGATCAAAGGCGGCTCCTTCCGACTT280CTCCAAGAGGGCCAGGCACTGGAGTACGTGTGTCCTTCTG320GCTTCTACCCGTACCCTGTGCAGACACGTACCTGCAGATC360TACGGGGTCCTGGAGCACCCTGAAGACTCAAGACCAAAAG400ACTGTCAGGAAGGCAGAGTGCAGAGCAATCCACTGTCCAA440GACCACACGACTTCGAGAACGGGGAATACTGGCCCCGGTC480TCCCTACTACAATGTGAGTGATGAGATCTCTTTCCACTGC520TATGACGGTTACACTCTCCGGGGCTCTGCCAATCGCACCT560GCCAAGTGAATGGCCGATGGAGTGGGCAGACAGCGATCTG600TGACAACGGAGCGGGGTACTGCTCCAACCCGGGCATCCCC640ATTGGCACAAGGAAGGTGGGCAGCCAGTACCGCCTTGAAG680ACAGCGTCACCTACCACTGCAGCCGGGGGCTTACCCTGCG720TGGCTCCCAGCGGCGAACGTGTCAGGAAGGTGGCTCTTGG760AGCGGGACGGAGCCTTCCTGCCAAGACTCCTTCATGTACG800ACACCCCTCAAGAGGTGGCCGAAGCTTTCCTGTCTTCCCT840GACAGAGACCATAGAAGGAGTCGATGCTGAGGATGGGCAC880GGCCCAGGGGAACAACAGAAGCGGAAGATCGTCCTGGACC920CTTCAGGCTCCATGAACATCTACCTGGTGCTAGATGGATC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。