演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CFAP68FLJ23499

cilia and flagella associated protein 68

CFAP68 是一種屬於 CFAP68 family 的蛋白質,作為纖毛軸絲雙聯微管中的微管內蛋白,與運動纖毛的擺動功能相關。

Homo sapiens11q23.1UniProt Q9H5F2
OFFICIAL SYMBOL
CFAP68
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9H5F2
PDB / ALPHAFOLD
7UNG
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CFAP68(cilia and flagella associated protein 68)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 CFAP68 family。其特徵包括位於纖毛軸絲雙聯微管內部的微管內蛋白身分;這使它成為纖毛與鞭毛微管結構相關蛋白的一員。來源資料另標示了兩段區域:第 99–110 位的 Mn 1,以及第 140–150 位的 Mn 2。這些資訊界定了 CFAP68 的家族歸屬與已註記的序列區段;其在纖毛中的具體作用則見功能說明。

Official symbol
CFAP68
Gene name
cilia and flagella associated protein 68
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1163
UniProt
Q9H5F2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ23499C11orf1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q23.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegCFAP68pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:111,878,935–111,885,975
Gene span
7,041 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000260276 ★111,879,541–111,885,9754
ENST00000528125111,878,935–111,885,9754
ENST00000530214111,878,971–111,885,9753
ENST00000984552111,878,971–111,885,9754
ENST00001086026111,878,971–111,885,9753
ENST00001138795111,878,971–111,885,9754
ENST00000530799111,879,561–111,883,8055
ENST00000529270111,880,776–111,885,9754

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CFAP68 是纖毛軸絲雙聯微管中的微管內蛋白(microtubule inner protein, MIP)。這類定位描述指出它位於雙聯微管內部;來源並將其描述為 dynein-decorated doublet microtubules(DMTs)的一部分,亦即含有 dynein 裝飾的雙聯微管結構。資料支持的功能重點,是 CFAP68 作為此微管結構的一員,而不是將它描述為 dynein 本身。

在運動纖毛中,這些雙聯微管構成軸絲的一部分。來源指出,CFAP68 所屬的微管結構對運動纖毛的擺動是必要的,因此 CFAP68 與運動纖毛拍動所需的軸絲構造相關。這項敘述說明其結構性角色與纖毛運動的關聯,但沒有進一步界定 CFAP68 如何影響微管或拍動,也未提供特定實驗條件下的作用機制。

另一筆資料將 CFAP68 描述為精子鞭毛雙聯微管的微管內蛋白組成部分。這支持它與鞭毛軸絲微管結構的關聯;但資料未說明它在精子鞭毛中的具體功能,也未指出其作用是否與運動纖毛中的角色完全相同。依現有資訊,CFAP68 的功能可概括為參與纖毛或鞭毛雙聯微管內部結構,並與運動纖毛所需的擺動能力相關。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 111879541 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CFAP68 ENST00000260276 GRCh38 chr11:111878541-111879641 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGCTCCTTTCCTCACCTTTGGAAAAATTTGGCAAGCAGTTCCCTGTTCTTAGCTACGCCAGCTTTGCGTC
CACAATGCGGGAAGATGAAATAAATTTGATCAAATTCTCTCTCGTGCAGTTCAAAGACATCTGCCAGCTG
GGTGCAGTCCACACCGAAACGTACATCGATACCTGGCAAAGATAGTTTGGGGGCGCAAAATATAGACAGG
AGGATGCCTCAAGACATGGAACAGAAAAACTCTTCCTAACTTAAACCGTGCAGACCAGCCCAAGTCTGGG
CACAAAGCCGGCTTTATGTGAATATCCGTGGGACGATCAAGAACAATCTCCACGTGGGTTACATCCCCAC
GCCCCCACCCTTTCCACTTTGGGACGCGCCGGCCGCTGGGCGGGGTTTCGCAGAGGGGCGGGCTCGCTAC
CTCGCTCGCGCAGGCACTGCAGATTCTCCCAGGCCAGTGGATCCCGAGCCAACTCGGCCGGGCGCTGGAG
GCAGGTGGCGGTAAGTTGAGTGCTCTGATCCAGGGTTTCGCTCAGAGCGGCGGCGAAGGAGAAATTCCCC
TCCCCAACCAACAGGAGGCGCCGAGGGGCCATGGCCTCCACGGACTCCCGGCTCGCGTTCTCTGTGGCGC
TCGTTTTACGTCACTTCCTTCACGGATCTCTCTCCGCCCCGTCTTCTCCCGTCACTAGTTGATGACGCAC
CCATGGCGCCTGGTTGTCTAGACGAGCCGGTGTACCGACTCCCCGGTGGATGATAACTATGAGTGCAAAA
GCAAGACGCGCACTTTCCTGTCACCTCGCCCTTTCACCCCCTCGGGAAGATCAAAGTGTCTTTAGCCCAA
GCATGGCCTTGAGCGACTTCATCACACCTGCATGAGGTCACAAGCAGTCACTAGCGCAGGGGGGTGAGGC
GAGTTCTGGGTGAAAGAAACGGGGCGGGGCTGAGGCCAAGGAAGAGGTTGGACTGTGTCTCGCATGCTCC
TGACGCAGAAGGTTTTGAACCTTTTTTCACCTCGTCTGAAATGGCTGCCTCCCAGTGTCTCTGCTGCTCA
AAATTTCTCTTCCAGGTGCTTAAATCTCCTATCTTCTATTCGTTCAAGAAA
CFAP68 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C11orf1_4 ↗11:111,871,391正股111,871,342–111,871,401
C11orf1_2 ↗11:111,878,935正股111,878,886–111,878,945
C11orf1_3 ↗11:111,879,224正股111,879,175–111,879,234
C11orf1_1 ↗11:111,879,549正股111,879,500–111,879,559

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_5ZBHH8 · CTCF_binding_site · 111878106–111878127 · regulatory

ENSR11_93MDZB · promoter · 111878445–111878945 · regulatory

ENSR11_5ZBHMH · CTCF_binding_site · 111879024–111879045 · regulatory

ENSR11_5ZBHMT · CTCF_binding_site · 111879104–111879125 · regulatory

ENSR11_93MDZH · promoter · 111879155–111879552 · regulatory

ENSR11_BS7HB · enhancer · 111879553–111880216 · regulatory

· motif · 111878108–111878124 · motif

· motif · 111878196–111878207 · motif

· motif · 111878206–111878217 · motif

· motif · 111878472–111878481 · motif

· motif · 111878888–111878901 · motif

· motif · 111879026–111879042 · motif

· motif · 111879106–111879122 · motif

· motif · 111879125–111879138 · motif

· motif · 111879125–111879138 · motif

· motif · 111879337–111879350 · motif

· motif · 111879372–111879388 · motif

· motif · 111879398–111879410 · motif

· motif · 111879412–111879424 · motif

· motif · 111879912–111879924 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:150 aa

1 aa150 aa功能區域
依 Q9H5F2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CFAP68 蛋白質長 150 個胺基酸,屬於 CFAP68 family。序列註記包含兩段區域:Mn 1 位於第 99–110 位,Mn 2 位於第 140–150 位。來源未進一步說明這些區域的分子作用。

功能區域Mn 199–110 aa
功能區域Mn 2140–150 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7UNG…

PDB · 7UNG

EM · 3.60 A · I1=1-150

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme;Nucleus;Cell projection, cilium

CFAP68 被註記位於細胞質中的細胞骨架與纖毛軸絲,也見於鞭毛軸絲、細胞突起中的纖毛及細胞核。 資料涵蓋多個細胞區室,但未描述定位隨條件或時間改變的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 34 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ23499CFAP68AGXTANKRD11ARMC7ATG9AATPAF2BRK1CATSPER1CNOT2COL8A1DMRT3DTX2FOXH1FRS3HGSHOXA1HOXC8HRKANK2KLHL38KRTAP13-2MYO15BOTX1PATZ1PEF1PITX1PLSCR4PRKAB2PROP1PRR35SMYD1TEKT4TLE5TLX3ZIC1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 34 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CFAP68 被描述為精子鞭毛雙聯微管中的微管內蛋白組成部分,支持其屬於該微管結構;來源未提供與特定蛋白質直接結合或形成複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CFAP68 是纖毛軸絲中由 dynein 裝飾的雙聯微管(DMTs)內部蛋白之一;此微管結構是運動纖毛擺動所必需的。來源未進一步說明 CFAP68 如何促成擺動。含實驗來源
證據與來源

Microtubule inner protein (MIP) part of the dynein-decorated doublet microtubules (DMTs) in cilia axoneme, which is required for motile cilia beating

PMID 36191189 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CFAP68 是精子鞭毛雙聯微管中的微管內蛋白組成部分。此敘述支持其屬於鞭毛微管結構,但未提供更具體的功能或作用條件。推論支持
證據與來源

Microtubule inner protein component of sperm flagellar doublet microtubules

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CFAP68 的定位註記包括細胞質中的細胞骨架、纖毛軸絲與鞭毛軸絲,也包括細胞核及細胞突起中的纖毛;來源未說明不同定位的條件或動態變化。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; Nucleus; Cell projection, cilium

PMID 36191189 ↗ · PMID 10873569 ↗ · PMID 38538594 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000260276 · 2,568 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTTTTCACCTCGTCTGAAATGGCTGCCTCCCAGTGTCT40
41CTGCTGCTCAAAATTTCTCTTCCAGAGACAGAACCTCGCC80
81TGTTTCCTCACAAACCCACACTGTGGCAGCCTTGTTAATG120
121CAGATGGCCATGGTGAAGTGTGGACAGATTGGAATAATAT160
161GTCCAAGTTTTTCCAGTATGGATGGCGATGCACCACTAAT200
201GAGAATACCTATTCAAACCGTACCCTGATGGGCAACTGGA240
241ACCAGGAAAGATATGACCTGAGGAATATCGTGCAGCCCAA280
281ACCCTTGCCTTCCCAGTTTGGACACTACTTTGAAACAACA320
321TATGATACAAGCTACAACAACAAAATGCCACTTTCAACAC360
361ATAGATTTAAGCGAGAGCCTCACTGGTTCCCAGGACATCA400
401ACCTGAACTGGATCCTCCCCGATACAAATGCACAGAAAAG440
441TCAACTTACATGAATAGCTATTCAAAGCCTTAAATTGGGC480
481ATCACTCAGGATGTGTATAAGATCTTAATATTGACTAGTT520
521TCACATCCAGGTTTCTAAGAAATGATAAGATACTTCACTT560
561TTCCAGAGTGAAATGTAGGAGGGAGCACATTCTAAGTACA600
601GCTAAAAATTTAGCTCACTGTAACACAGTTTCACTCTCTG640
641AATAAATAAAGCAAAAAACACAGTAAATATTCTTTATCCC680
681TTTTTTTGTTGTTGTTTTAACCAAGATTTAAATGTCAAAT720
721TTAATACAGCAACTCAGTTCTACATTTGGGGTGTTGTAGA760
761AGGGCCTTAAAAAGAATTATTTTAGGCCAGGCACGGTGGC800
801TCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGG840
841TGGATCACGTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCA880
881ACATGGTGAAACACTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTA920
921GCTGAGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。