演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CFAP298FLJ20467

cilia and flagella associated protein 298

CFAP298 是一種屬於 CFAP298 family 的蛋白質,參與運動纖毛功能,並可能影響纖毛運動的啟動及纖毛在細胞表面的定位。

Homo sapiens21q22.11UniProt P57076
OFFICIAL SYMBOL
CFAP298
CHROMOSOME
21
UNIPROT
P57076
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CFAP298(cilia and flagella associated protein 298)是由蛋白質編碼基因 CFAP298 所產生的蛋白質,屬於 CFAP298 family。現有資料指出,它與運動纖毛功能相關;其特定分子作用方式尚未完全釐清,資料所述部分功能也標示為依序列相似性推測。除纖毛相關作用外,CFAP298 亦與纖毛在細胞頂端表面的正確定位有關。

Official symbol
CFAP298
Gene name
cilia and flagella associated protein 298
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1301
UniProt
P57076
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ20467FBB18CILD26KurDNAAF16C21orf48C21orf59

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.11
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegCFAP298pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:32,592,074–32,612,881
Gene span
20,808 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290155 ★32,599,354–32,612,3777
ENST0000109896032,592,074–32,612,8813
ENST0000103205232,592,075–32,612,8816
ENST0000043159932,592,079–32,603,2372
ENST0000113170532,599,354–32,612,8817
ENST0000087767832,599,995–32,612,8816
ENST0000107205932,600,133–32,612,8817
ENST0000098593532,600,695–32,612,8814
ENST0000103205332,601,314–32,612,8815
ENST0000044096632,601,667–32,612,8816
ENST0000038254932,601,667–32,612,8815
ENST0000087767932,601,667–32,612,8457

顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CFAP298 參與運動纖毛功能,可能透過影響外動力蛋白臂(outer dynein arm)的組裝發揮作用。這項作用目前以可能性描述,來源並未進一步說明它如何促成組裝,也未提供更細的分子步驟。

依序列相似性推測,CFAP298 對纖毛運動的啟動可能比維持已建立的運動更重要。這表示其功能或與運動形成的起始階段相關,但現有資料沒有交代此差異所依據的具體實驗條件,因此不宜將它延伸解讀為已確立的完整調控機制。

CFAP298 也被描述為纖毛在細胞頂端表面正確定位所必需;此觀察提示它可能另有參與平面細胞極性(planar cell polarity,PCP)路徑的作用。這項定位功能與纖毛運動相關,但來源並未說明兩者之間的直接因果關係。

此外,依序列相似性推測,CFAP298 可能抑制典型 Wnt 訊號活性。此作用仍屬推測,不能視為已確認的調控結果。整體而言,現有資料支持 CFAP298 與運動纖毛的功能、運動啟動及細胞表面定位相關,並提出其可能影響 PCP 路徑與典型 Wnt 訊號;各項作用的證據確定程度並不相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 32612377 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CFAP298 ENST00000290155 GRCh38 chr21:32612277-32613377 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCACGCGCCACTACGTTCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGG
CTGCTTTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCTCCTCGGCCTCCCTAAGTGTTGGGATTACACGCGT
GAGCCACCGCTCCTGGCCTGTCCATTTATTTTTGTTTTCTTTTTGTCACACTAAAATATAAGCTCCATGA
GAGCAGTGACTCTGGATCTGTGGGGCCCGGAATAAACAGCGACTGACGCCGACTGCCTTCAGCAAGAGTC
CGCTGGAGGATGGCTGGATATTTCTGGGAGGGTCGCTCTGGCAGGGGCCGCTGGAGCTACCCCAGCAACG
CCATCCAAATCAACCTGAACGAAGAAGTGCGGACACTCGCCCTGGCCCCTCCGTCCTGAAAAGCTGACCC
GCGCAAACAGCAGCGAACAGCAAGACTCAGTTCTGGGTCGCTGCCGCCGAACTTTCCCAGGCCGGAAACA
GCGTGGAAACGTTGCCGGAAGTGGAGACTGAAAGCGGCGGAAGGGACGCTGGAATGTGGAGCGGTTGTGG
GGCGGCAGCTGCGGAACTGCGCGATTGTGGTTCCCGCCGTATTTCCCGTTCCCCATCTAGTAACTCCCAT
CTCAGCCCACGTATCTCCCTGAGTGGAAATCTCGGGCCCCAGACCAGTCGATTGGGAGGTCCGCCCTCCC
CTTCAGCGACTTGGTCTGTGTTTTGGCAGTTGCCGCGACAACAGTCACTTCCGGGAAGGGGCTCTGCGAA
TCTCCTTCCGTCGGTCCGCTCAGAATCAGCTGTCCTCTCAGACTGTGTGGGTGGTTTCCCCGGCCGCAGC
TCCGTACGGGCTTGGATTGCTGGGCCTCGGTGCACCCCAGCCTCCCCCACTCGGGTTCTGAGCTTGAGCT
GGCGGCTCTTTAACTCTGCTTCACTGTTGCTCTTGGCAACATCCACTTCCGGGAGCGAGTGCCGTTTCCC
CCGCTCACCGCGGGCTAGGGAGCGTGGGATTCCGGACTGTGAGCGGCTGTTAGTGCGTCGCAGCTGCTGG
CGATCCGGCGACCCTCGGCCGGCAGGACCCGCGGGCCACGCAGCCGGGGCC
CFAP298 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C21orf59_4 ↗21:32,604,513負股32,604,503–32,604,562
C21orf59_2 ↗21:32,612,372負股32,612,362–32,612,421
C21orf59_1 ↗21:32,612,586負股32,612,576–32,612,635
C21orf59_3 ↗21:32,612,842負股32,612,832–32,612,891

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_B8GQ9 · promoter · 32612342–32613355 · regulatory

· motif · 32611717–32611728 · motif

· motif · 32612216–32612232 · motif

· motif · 32612240–32612250 · motif

· motif · 32612410–32612424 · motif

· motif · 32612413–32612424 · motif

· motif · 32612413–32612424 · motif

· motif · 32612415–32612424 · motif

· motif · 32612416–32612430 · motif

· motif · 32612553–32612566 · motif

· motif · 32612621–32612632 · motif

· motif · 32612621–32612632 · motif

· motif · 32612623–32612632 · motif

· motif · 32612630–32612643 · motif

· motif · 32612733–32612746 · motif

· motif · 32612764–32612778 · motif

· motif · 32612776–32612793 · motif

· motif · 32612830–32612839 · motif

· motif · 32612852–32612872 · motif

· motif · 32612859–32612873 · motif

· motif · 32612865–32612874 · motif

· motif · 32612865–32612876 · motif

· motif · 32612865–32612876 · motif

· motif · 32612888–32612897 · motif

· motif · 32612945–32612962 · motif

· motif · 32613284–32613296 · motif

· motif · 32613286–32613293 · motif

· motif · 32613286–32613301 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:290 aa

CFAP298 屬於 CFAP298 family。現有來源未提供可進一步描述的結構域、功能區域或序列特徵。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P57076…

AlphaFold · P57076

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cytoplasm, cytoskeleton, cilium basal body

CFAP298 被記錄於細胞質及纖毛基底體相關的細胞骨架位置。 它與 SASS6 僅部分共定位於細胞質斑點;這項觀察提示可能有中心體定位,但並非直接確認其完整定位範圍。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ20467CFAP298PEX7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CFAP298 與 ZMYND10 有交互作用。來源未說明此關係是否代表兩者直接結合、共同組成複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CFAP298 的基因變異與原發性纖毛運動障礙 26(CILD26)相關。患者可能有運動纖毛異常,呼吸道纖毛缺陷可造成反覆呼吸道感染,並伴隨慢性發炎與支氣管擴張;胚胎節點的單根纖毛功能異常則可能導致左右側身體不對稱隨機化及內臟反位。若原發性纖毛運動障礙合併內臟反位,稱為 Kartagener syndrome。鼻上皮纖毛可見外、內動力蛋白臂成分均缺失,且完全麻痺。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CFAP298 參與運動纖毛功能,可能藉由影響外動力蛋白臂組裝發揮作用。依序列相似性推測,它可能較重要於纖毛運動的啟動,而非維持;也可能是纖毛在細胞頂端表面正確定位所必需,提示其參與平面細胞極性路徑。此外,它可能抑制典型 Wnt 訊號活性。含實驗來源
證據與來源

Plays a role in motile cilium function, possibly by acting on outer dynein arm assembly. Seems to be important for initiation rather than maintenance of cilium motility (By similarity). Required for correct positioning of the cilium at the apical cell surface, suggesting an additional role in the planar cell polarity (PCP) pathway (By similarity). May suppress canonical Wnt signaling activity (By similarity)

PMID 24094744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CFAP298 與 ZMYND10 有交互作用;來源未進一步說明此關係是否為直接結合或涉及複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ZMYND10

PMID 29601588 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CFAP298 位於細胞質及纖毛基底體相關的細胞骨架位置。它與 SASS6 在細胞質斑點中部分共定位,這項觀察提示 CFAP298 可能具有中心體定位。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, cilium basal body; Partially colocalized with SASS6 in cytoplasmic puncta, suggesting a centrosomal localization

PMID 29601588 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯CFAP298 基因變異與原發性纖毛運動障礙 26 相關。疾病可造成運動纖毛異常及反覆呼吸道感染,進而伴隨慢性發炎與支氣管擴張;胚胎節點單根纖毛功能異常也可能使左右側身體不對稱隨機化或造成內臟反位。合併內臟反位的原發性纖毛運動障礙稱為 Kartagener syndrome。患者鼻上皮纖毛可缺乏外、內動力蛋白臂成分,並完全麻痺。含實驗來源
證據與來源

Ciliary dyskinesia, primary, 26 CILD26 A disorder characterized by abnormalities of motile cilia. Respiratory infections leading to chronic inflammation and bronchiectasis are recurrent, due to defects in the respiratory cilia. Patients may exhibit randomization of left-right body asymmetry and situs inversus, due to dysfunction of monocilia at the embryonic node. Primary ciliary dyskinesia associated with situs inversus is referred to as Kartagener syndrome. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry. Cilia in nasal epithelia show the absence of both outer and inner dynein-arm components and complete paralysis MIM: 615500

PMID 24094744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290155 · 3,516 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCGTGGGATTCCGGACTGTGAGCGGCTGTTAGTGCGTCG40
41CAGCTGCTGGCGATCCGGCGACCCTCGGCCGGCAGGACCC80
81GCGGGCCACGCAGCCGGGGCCTTCTCAACGCCTCAGTACC120
121TCGGCGGGACCGCCATGGTTCTGCTGCACGTGAAGCGGGG160
161CGACGAGAGCCAGTTCCTGCTGCAGGCGCCTGGGAGTACC200
201GAGCTGGAGGAGCTCACGGTGCAGGTGGCCCGGGTCTATA240
241ATGGGCGGCTCAAGGTGCAGCGCCTCTGCTCAGAAATGGA280
281AGAATTAGCCGAACATGGCATATTTCTCCCTCCTAATATG320
321CAAGGACTGACCGATGATCAGATTGAAGAATTGAAATTGA360
361AGGATGAATGGGGTGAAAAATGCGTACCCAGCGGAGGTGC400
401AGTGTTTAAAAAGGATGATATTGGACGAAGGAATGGGCAA440
441GCTCCAAATGAGAAGATGAAGCAAGTGTTAAAGAAGACTA480
481TAGAAGAAGCCAAAGCAATAATATCTAAGAAACAAGTGGA520
521AGCCGGTGTCTGTGTTACCATGGAGATGGTGAAAGATGCC560
561TTGGACCAGCTTCGAGGCGCGGTGATGATTGTTTACCCCA600
601TGGGGTTGCCACCGTATGATCCCATCCGCATGGAGTTTGA640
641AAATAAGGAAGACTTGTCGGGAACACAGGCAGGGCTCAAC680
681GTCATTAAAGAGGCAGAGGCGCAGCTGTGGTGGGCAGCCA720
721AGGAGCTGAGAAGAACGAAGAAGCTTTCAGACTACGTGGG760
761GAAGAATGAAAAAACCAAAATTATCGCCAAGATTCAGCAA800
801AGGGGACAGGGAGCTCCAGCCCGAGAGCCTATTATTAGCA840
841GTGAGGAGCAGAAGCAGCTGATGCTGTACTATCACAGAAG880
881ACAAGAGGAGCTCAAGAGATTGGAAGAAAATGATGATGAT920
921GCCTATTTAAACTCACCATGGGCGGATAACACTGCTTTGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。