演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CEP41DKFZp762H1311

centrosomal protein 41

CEP41(centrosomal protein 41)是 CEP41 family 的蛋白質,與纖毛形成期間的微管麩胺酸化相關。

Homo sapiens7q32.2UniProt Q9BYV8
OFFICIAL SYMBOL
CEP41
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9BYV8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CEP41 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 centrosomal protein 41,其產物屬於 CEP41 family。來源將此蛋白質與纖毛形成期間的微管麩胺酸化相聯繫,並指出它可能參與 TTLL6 在基底體與纖毛之間的運輸。蛋白質序列含有 Rhodanese domain,也有被註記為無序的區域;這些結構特徵提供其基本分子描述,但來源未進一步說明各區域的作用。

Official symbol
CEP41
Gene name
centrosomal protein 41
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12370
UniProt
Q9BYV8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZp762H1311FLJ22445JBTS15TSGA14

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q32.2
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegCEP41pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:130,393,771–130,442,433
Gene span
48,663 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000223208 ★130,393,771–130,441,01611
ENST00000675649130,393,771–130,441,0199
ENST00000541543130,393,771–130,442,43311
ENST00000675596130,393,771–130,441,23710
ENST00000676312130,393,771–130,441,28411
ENST00000675168130,393,771–130,441,02010
ENST00000674539130,393,771–130,441,0667
ENST00000676243130,393,771–130,441,05911
ENST00000675962130,393,771–130,441,0269
ENST00000675803130,393,771–130,440,84811
ENST00000343969130,393,771–130,441,01610
ENST00000675935130,393,771–130,441,07811

顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CEP41 在纖毛形成(ciliogenesis)期間,對纖毛中的微管麩胺酸化是必要的。來源提出,CEP41 可能藉由參與 TTLL6 在基底體與纖毛之間的運輸來發揮作用;TTLL6 是一種微管多麩胺酸化酶。此運輸作用被描述為可能的機制,而非已確定的作用方式。資料未提供其他細胞或實驗條件,也未詳述 CEP41 如何影響 TTLL6 的運送,或微管麩胺酸化變化對纖毛形成的具體後續影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 130441016 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CEP41 ENST00000223208 GRCh38 chr7:130440916-130442016 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGAAGTAGCTCAAATGTGTGCTATTATTCACTAACAGACAACTGGCGAGTATGAACTGCTCAGAGTAAC
CTTTCTCCATTCCTGGAAAAACAACTTAGAGCAAAGGACAAAGGGTTACTGTGTTGTTCCTTTCATGTAA
AAGGAAATAATAATTTTGATGGATTTGGTGGGACATTTAGGAGCCAAGTCAAACTGTGTGTGTAATTGTT
TTGTAAAGGTGCTAGGACTTCATTTTCAGATCCGGAATGGGAACAGGTGGTGGCTGGTGGCAGGAGTCAC
AATGGTTTCCATGACGACGGGATTGGGTCCTAGTCATCCTCCCATTCTCCACAAGACCTACTGCAGCTTT
TCTCATAAGGTGCTTATTAAGTATTTGTTAAATGAACGATGAACCACAGAATAGCGCGTGTGCTTTGCAA
TTAAGGATGTCGCTCTATAGCTAGCCTAAAAGCTTTTAAAGCACCGATAATTACTGTATTTACCCATGTA
TTTTGCATAATTCGCATATTAACTTAACCAGAAAATAATAAACCATACTCTCCCATTTCTGCTGAACAAC
CCTGGCCCATATAATATTCCCTGTTGTGGAATCAGTAGCCCAGATGTTTGGTTGAAACGGCCATAAAACG
GAGCTGGGGGATGGGGAGTCTTGTGTTGTATTTATGGTTCCACATTAGCTAAAACTCGTGTTTTGTCCCG
GCTCTCAAGCCACTGCCCCCGCCCCCGGCTTTGCGCAGGCGCCAGCCTTCCCCTCCCCCCGCGCCTCTCT
TCCCGCCCTAAGGCTGGAGCCGGCGAGCCCCAGCCCAGAGAACAAAAGGCCTCGCTAGCCGGCGTCCCGC
GTTGCCCTTGGCAACCATTGAGCGGCGTCTTGCCCTTCTGCGACCCTGAGATGAGAGAGTAAACGGGGCC
CCCATTGGCCGGCCGGGGAAGACGGGCCAATCGGAGAAGAGGGTATAGGGAGGCGGCTGAACAAGGTTGT
GGGGGTAGGAAGCTAGGGTTAGAGGCAACCCGTGAGGCTAGAACCCCGAACGTGGTCGGTTGGAGAAAAT
ATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCTGAGGTGAGGGCCAGGTCTCGG
CEP41 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CEP41_1 ↗7:130,441,016負股130,441,006–130,441,065

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_CGXGT · promoter · 130440838–130442148 · regulatory

ENSR7_93WQXC · enhancer · 130444295–130444633 · regulatory

ENSR7_85SJW5 · enhancer · 130445079–130445291 · regulatory

ENSR7_535NF5X · CTCF_binding_site · 130445184–130445205 · regulatory

· motif · 130440413–130440430 · motif

· motif · 130440581–130440590 · motif

· motif · 130440581–130440590 · motif

· motif · 130440583–130440599 · motif

· motif · 130440583–130440599 · motif

· motif · 130440892–130440902 · motif

· motif · 130441258–130441268 · motif

· motif · 130441274–130441285 · motif

· motif · 130441274–130441285 · motif

· motif · 130441291–130441301 · motif

· motif · 130441371–130441381 · motif

· motif · 130445186–130445202 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:373 aa

1 aa373 aa結構域功能區域
依 Q9BYV8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CEP41 蛋白質長 373 個胺基酸,屬於 CEP41 family。其第 169–266 位胺基酸區段註記為 Rhodanese domain;第 89–137 位及第 275–373 位則被預測為無序區域。

結構域Rhodanese169–266 aa
功能區域Disordered89–137 aa
功能區域Disordered275–373 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BYV8…

AlphaFold · Q9BYV8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome;Cell projection, cilium;Cytoplasm, cytoskeleton, cilium basal body

CEP41 主要定位於纖毛基底體,也見於初級纖毛。 來源亦將其定位記錄於細胞質細胞骨架、微管組織中心及中心體等位置。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZp762H131CEP41DMWDSPRED1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CEP41 被記錄為與 TTLL6 同處於一個複合體中。來源未提供兩者直接結合的證據或更詳細的複合體組成。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 CEP41 的變異被記載為可造成 Joubert syndrome 15(JBTS15),此病為自體隱性疾病。另有資料指出 CEP41 的遺傳變異可能與自閉症易感性相關;此處描述的是易感性關聯,並非因果結論。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CEP41 在纖毛形成期間對纖毛中的微管麩胺酸化是必要的;它可能藉由參與微管多麩胺酸化酶 TTLL6 在基底體與纖毛之間的運輸而發揮作用。含實驗來源
證據與來源

Required during ciliogenesis for tubulin glutamylation in cilium. Probably acts by participating in the transport of TTLL6, a tubulin polyglutamylase, between the basal body and the cilium

PMID 22246503 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CEP41 被記錄為與 TTLL6 同處於一個複合體中;此敘述未進一步說明兩者是否直接結合或複合體的其他組成。資料庫紀錄
證據與來源

Found in a complex with TTLL6

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CEP41 主要定位於纖毛基底體及初級纖毛;資料也將其列於細胞質細胞骨架、微管組織中心、中心體、纖毛與纖毛基底體等位置。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cell projection, cilium; Cytoplasm, cytoskeleton, cilium basal body; Localizes mainly to the cilium basal body and in primary cilia

PMID 14654843 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 CEP41 的變異會造成 Joubert syndrome 15(JBTS15),這是一種自體隱性疾病,可有小腦共濟失調、眼球運動失用、肌張力低下、新生兒呼吸異常及精神運動發展遲緩等表現。影像特徵包括小腦蚓部發育不全或缺如、上小腦腳增厚並改變方向,以及腳間窩異常擴大所形成的磨牙徵;其他可能表現有視網膜病變、腎病、肝纖維化與多指。含實驗來源
證據與來源

Joubert syndrome 15 JBTS15 An autosomal recessive disorder presenting with cerebellar ataxia, oculomotor apraxia, hypotonia, neonatal breathing abnormalities and psychomotor delay. Neuroradiologically, it is characterized by cerebellar vermian hypoplasia/aplasia, thickened and reoriented superior cerebellar peduncles, and an abnormally large interpeduncular fossa, giving the appearance of a molar tooth on transaxial slices (molar tooth sign). Additional variable features include retinal dystrophy, renal disease, liver fibrosis and polydactyly. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614464

PMID 22246503 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯CEP41 的遺傳變異可能與自閉症易感性相關;來源僅描述可能的易感性關聯,未將其表述為 CEP41 變異直接造成自閉症。含實驗來源
證據與來源

Genetic variations in CEP41 may be associated with susceptibility to autism

PMID 21438139 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000223208 · 6,292 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGGCAACCCGTGAGGCTAGAACCCCGAACGTGGTCGGT40
41TGGAGAAAATATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCT80
81GAGTATCTGATGAAAAGGATACCACAGAACCCAAGATACC120
121AGCATATCAAATCAAGACTGGACACTGGTAACAGTATGAC160
161TAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATTAT200
201AGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTA240
241CAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCTTCCCTCTC280
281TGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGG320
321CTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTCAGACCCTGATGCTG360
361AAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGA400
401GCAGTCGCCGAGCCCTGAGCAGTTCATAAACAACGCAGGA440
441GCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCA480
481GTGGTGTTGGGGAACTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAA520
521GAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGAC560
561TGCCCCTTCCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTT600
601ACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAAT640
641TGCAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGAT680
681ATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATCATTC720
721TGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCAC760
761CACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCTCTTCATGCTT800
801TCCGGAGGTCTAAAAGTCTTAGCTCAGAAATTCCCGGAAG840
841GACTGATTACTGGTTCCCTGCCAGCATCTTGCCAGCAGGC880
881CCTTCCTCCTGGGTCTGCCCGGAAACGATCCAGCCCCAAA920
921GGGCCACCCCTACCAGCTGAGAATAAATGGAGATTTACCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。