基因總覽
CEMIP2 的正式名稱為 cell migration inducing hyaluronidase 2,屬於蛋白質編碼基因,產物為 CEMIP family 成員。此蛋白是細胞表面透明質酸酶,具有單次穿膜的第二型膜蛋白拓樸:N 端位於細胞質,跨膜區之後的大部分蛋白質位於細胞外。其長鏈細胞外區域含有 G8 與 GG-type lectin 結構域,也有多個 PbH1 重複序列。這些特徵勾勒出一種以細胞表面定位、細胞外作用為主的膜蛋白;其具體底物作用與生物學角色見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377044 ★ | 71,683,366–71,768,513 | 24 |
| ENST00000377066 | 71,681,395–71,768,902 | 23 |
| ENST00000396272 | 71,681,395–71,704,932 | 7 |
| ENST00000853336 | 71,681,395–71,769,496 | 24 |
| ENST00000853337 | 71,681,395–71,768,902 | 19 |
| ENST00000911423 | 71,681,395–71,769,496 | 23 |
| ENST00000971297 | 71,681,395–71,769,496 | 25 |
| ENST00001014817 | 71,681,395–71,768,902 | 23 |
| ENST00001136453 | 71,681,395–71,768,902 | 24 |
| ENST00001114733 | 71,697,490–71,768,902 | 20 |
| ENST00000377055 | 71,699,192–71,709,330 | 4 |
| ENST00000377043 | 71,704,417–71,712,154 | 3 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CEMIP2 是細胞表面透明質酸酶,可催化透明質酸中的 (1→4) 鍵隨機水解,切開 N-acetyl-beta-D-glucosamine 與 D-glucuronate 殘基之間的連結。它負責細胞外高分子量透明質酸的初步切割,產生約 10–5 kDa 的中等大小片段。來源指出,CEMIP2 對透明質酸具有高度專一性,不能切解 chondroitin sulfate 或 dermatan sulfate。
在全身性透明質酸分解與更新中,CEMIP2 被描述為具有必要功能。它也可透過在黏著斑位置分解透明質酸,調節細胞黏附與移動;這些作用為 By similarity 所支持,應視為相似性推論,而非來源所述的直接驗證結果。
來源亦指出,CEMIP2 可藉由分解細胞外透明質酸調節 VEGF 訊號,並因此參與血管生成與心臟形態形成的調控。這些生物學角色同樣標示為 By similarity。整體而言,資料支持 CEMIP2 的核心作用是選擇性切解細胞外透明質酸,並將基質分解與細胞行為及特定發育過程的調節連結;來源未提供進一步的作用條件或實驗細節。
Promoter 與基因調控
>CEMIP2 ENST00000377044 GRCh38 chr9:71768413-71769513 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGTGGGAAGACCTAAGTATATTTATTCCGGCCTGCGAGCGGGATGCTGGGGTTGCTCCAAGGGACCAGAA GAGCTGCCCTGTGTCCCAGAGCAGGCTGGTTCTTCTGACAGCGCTGAGAACCTGGCGCTCGCGCCTGGCC AGGTAGGGGCTGTGACTGGACGCTCAGAACATTTGTGGGAGTGTGGAAATCTCTTTACGGGTGATGGGGC TCAAAGTCTGACGCAGCCGAGGGTTGATGGGGTGCAGTCACGCTCAGCCAGGGGACTTTGGGGGCGCAGT GTCAGGCTCAGCCAGGGAGTGACAGGCGCAGTACCAGCCTTATCTGGGGGTGCTGGAGGCACAGGCTCCG GTTCGGCCAGGCGGGTGTGCGCGCCCAGGAAGGGTAGGAGCCTGCAGCCGCAGCGGGGGGCGCTGGCTGG GGCTCTGCCCCGCCGGCAGTGCGCTCGGGCGCTGTTCCAGCGCGCGGCAGCGAGTGGCGCTGAGCCTCCG CTTTCGCAGCTCGCGGGGAGCGGGGCCGGCGGGAGGGGCCGGGCGGGGCCACCGCCTCCTCTGATGGCAG GCTCCTCCTCTCCCTCCGCCTCCCTCGCTCTCCACCGCCCGCCCGCCCGCCCGCCCAATCCACAGTTCCC GGCCCAGCCGAGCCGGGCTGCTTGTCTGGCCGGCGGAGGCTGAGCGCGACCCTAGCAAGCCGCGGCGCCC GCCGACCAGGGACAAGAGCGACTCCTGGGACCCCACTCTGCCCCGCGCCGCCGCCTCCTCCCCTGTTGTC GCGGGGACGCTCAGGCCCGCGCCGCCCGGGCCACGATTCTCCTCCTCTTTCTCCCGGAGGGGAAGGAACG GAGAAAGCCGAGCGGCGGCTCCGGGAGAGAGCGAGCCGAGGCCCCTGCCCCCGAGGCTCGGGGCAGGAGG AGGAGGAGGAGGAGGAGGCGGAGGCGGAGGGAAGTGCGCGTCACTCTCGGGAGGAGAGTATTTCACCTCC AGGCAGAGGCTGCGGCTGCCAGTTGAGTACGAGCGGCAGCTGCGGGCGCCGGCAATCGAGTGGCTTCCTG GCCATGGAGAGGAGATCTGGACCCGAGGACGCCAGGGACTCCTCTCCGTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| TMEM2_2 ↗ | 9:71,768,513 | 負股 | 71,768,503–71,768,562 |
| TMEM2_1 ↗ | 9:71,768,892 | 負股 | 71,768,882–71,768,941 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BJ8JF · enhancer · 71762908–71763592 · regulatory
ENSR9_BJ8JJ · enhancer · 71763712–71764293 · regulatory
ENSR9_933H4L · enhancer · 71765781–71766061 · regulatory
ENSR9_C959H · enhancer · 71766394–71768375 · regulatory
ENSR9_5LTQTD · CTCF_binding_site · 71767805–71767826 · regulatory
ENSR9_BJ8K7 · promoter · 71768376–71769003 · regulatory
ENSR9_5LTR69 · CTCF_binding_site · 71769508–71769529 · regulatory
ENSR9_933H5S · enhancer · 71770004–71770273 · regulatory
ENSR9_5LTR8R · CTCF_binding_site · 71770049–71770070 · regulatory
· motif · 71767545–71767560 · motif
· motif · 71767807–71767823 · motif
· motif · 71768576–71768589 · motif
· motif · 71768582–71768595 · motif
· motif · 71769510–71769526 · motif
· motif · 71770051–71770067 · motif
在正常人類真皮纖維母細胞(NHDF)中,促發炎細胞激素會使 CEMIP2 表現上調。來源未進一步說明是哪一種細胞激素或其調控方式。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1383 aa
CEMIP2 蛋白質全長為 1383 個胺基酸,屬於 CEMIP family。其 N 端第 1–82 位位於細胞質,第 83–103 位為螺旋型跨膜區,可作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 104–1383 位則位於細胞外。細胞外區含 G8 與兩個 GG-type lectin 結構域,並有三段 PbH1 重複序列。另有註解指出,N 端第 1–50 位為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CEMIP2 位於細胞膜,為單次穿膜的第二型膜蛋白;其 N 端朝向細胞質,而大部分蛋白質位於細胞外。 來源未提供定位隨條件改變或異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CEMIP2 是細胞表面透明質酸酶,負責將細胞外高分子量透明質酸初步切解為約 10–5 kDa 的中等大小片段。它高度專一於透明質酸,不能切解 chondroitin sulfate 或 dermatan sulfate;並參與全身性透明質酸分解與更新,藉由在黏著斑分解透明質酸調節細胞黏附及移動。另有相似性推論指出,它可透過分解細胞外透明質酸調節 VEGF 訊號,進而調控血管生成與心臟形態形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell surface hyaluronidase that mediates the initial cleavage of extracellular high-molecular-weight hyaluronan into intermediate-size hyaluronan of approximately 10-5 kDa fragments. Very specific to hyaluronan; not able to cleave chondroitin sulfate or dermatan sulfate. Has an essential function in systemic hyaluronan catabolism and turnover and regulates cell adhesion and migration via hyaluronan degradation at focal adhesion sites (By similarity). Acts as a regulator of angiogenesis and heart morphogenesis by mediating degradation of extracellular hyaluronan, thereby regulating VEGF signaling (By similarity) PMID 37527776 ↗ |
| 分子活性 | CEMIP2 可隨機水解透明質酸中 N-acetyl-beta-D-glucosamine 與 D-glucuronate 殘基之間的 (1→4) 鍵。 | 含實驗來源 | 證據與來源Random hydrolysis of (1->4)-linkages between N-acetyl-beta-D-glucosamine and D-glucuronate residues in hyaluronate. PMID 37527776 ↗ |
| 細胞定位 | CEMIP2 位於細胞膜,是單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 調控 | 在正常人類真皮纖維母細胞(NHDF)中,促發炎細胞激素會使 CEMIP2 上調。 | 含實驗來源 | 證據與來源Up-regulated in by pro-inflammatory cytokines in normal human dermal fibroblasts (NHDF) PMID 37196767 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTGAGTACGAGCGGCAGCTGCGGGCGCCGGCAATCGAG40TGGCTTCCTGGCCATGGAGAGGAGATCTGGACCCGAGGAC80GCCAGGGACTCCTCTCCGTCTCCCTGGACCGCTGTGTAGG120CACCTGAGTTAACGGACGCTAAGCGGGGTAGGGGAAGTAA160CAGTGTATCATGTATGCCACTGATTCCAGGGGACACTCCC200CTGCTTTCCTCCAACCTCAGAATGGAAATAGTCGTCACCC240ATCTGGCTATGTTCCAGGGAAGGTTGTCCCATTGCGTCCC280CCTCCTCCTCCAAAGAGTCAAGCTTCAGCCAAATTTACCT320CCATCAGACGAGAAGACCGGGCAACCTTCGCATTCTCACC360TGAAGAACAGCAAGCCCAGAGAGAAAGTCAAAAGCAAAAG400AGACACAAAAATACTTTCATTTGTTTTGCTATTACTAGTT440TCTCATTTTTTATTGCACTTGCAATCATTTTAGGAATATC480CTCAAAATATGCTCCAGATGAAAATTGCCCAGATCAAAAT520CCTCGTCTCAGGAATTGGGATCCAGGACAAGATTCTGCAA560AGCAAGTTGTTATCAAGGAGGGAGATATGCTCCGTCTGAC600CTCAGACGCCACCGTGCATTCTATAGTCATTCAGGATGGA640GGACTGCTTGTATTTGGGGACAATAAAGATGGATCCAGAA680ATATTACTTTGAGGACTCATTACATCCTGATCCAGGATGG720TGGGGCGCTTCATATTGGAGCAGAAAAATGCCGCTATAAA760TCCAAAGCGACAATTACCTTGTATGGCAAGTCAGATGAAG800GTGAAAGTATGCCAACATTTGGCAAAAAGTTTATTGGTGT840GGAAGCTGGCGGGACACTGGAGTTACATGGGGCACGGAAG880GCATCGTGGACGTTGTTGGCAAGGACCCTGAATTCCTCAG920GCTTGCCCTTTGGGTCCTATACCTTTGAAAAGGACTTTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。