基因總覽
CDK15(cyclin dependent kinase 15)是蛋白質編碼基因,其產物為絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,歸屬於 protein kinase 超級家族中的 CMGC Ser/Thr protein kinase 家族及 CDC2/CDKX 次家族。來源描述其與抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡有關,並指出其作用涉及 BIRC5 的磷酸化。蛋白質序列註解包含一個 protein kinase 結構域;此區域構成其已註解的主要結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000652192 ★ | 201,806,537–201,895,550 | 14 |
| ENST00000410091 | 201,790,461–201,895,550 | 15 |
| ENST00000260967 | 201,806,375–201,895,550 | 14 |
| ENST00000450471 | 201,806,537–201,895,550 | 14 |
| ENST00000434439 | 201,806,537–201,889,457 | 13 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CDK15 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。來源指出,它可藉由促進 BIRC5 在 Thr-34 位點磷酸化,抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡;因此,這項作用與細胞凋亡反應的調節相關。
其酵素反應可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質中的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並產生 ADP。這描述了 CDK15 所屬激酶的磷酸化反應類型;來源另具體指出 BIRC5 的 Thr-34 是與抵抗 TRAIL 誘導凋亡相關的磷酸化位點。現有資料未進一步說明此作用的其他分子步驟或條件。
Promoter 與基因調控
>CDK15 ENST00000652192 GRCh38 chr2:201805537-201806637 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATATCTCTAGATTGAATCTTGGAATTGGCTTAAGTCTCTTCTCTTGTGGCAATTTTGAAATGAAAAAAT ACATGCTCATAATTAAATTACCTGAACATTTTAAAAAACCATCATGAGGTTCAAATATCAAATATTCATA AATATTGTTGTGATAATAGACATAACTCTTATTTTTTCCCTTAATAATGATTGTTTATATATCCTCCATT CTGTCTCACTTTATGATTAGTATATTATAGTGGCAATAATCTTAGGAATCTAACAGAGAAAAGTGTTGCA TTTGAAGACTACAGACTGCAAACCAATTTAAGCCAGATTCCTTGACATGTTGTGCTGTTAATATAGTACT TTACATATAGTAAACATTAATTACATATATGTGGAAGGAAGCAAGCAAGAAAGGAAGAAAGTATTTCATT CAAACTCCTCTCTCTCCATCACCATTGGCTAATATCATCATTTGTACAGTTAAGAACAACATAGGTGCTC ACCACATAGTTTTTGAATAAATGAATGAATGGCAACCCTTCTAAGACTATTGGATACACTATTGTTTGAA GGCAAAGAGATGCAGTAGATATTTTCAACTTTTTTCCTGTTTTATGATTCTGTGGTTTCTTTGACTACTA AAAGTTAGCTAGGTAGCAAATTTGTTTTAAAGTCTGAAAACCAAAATGCTTTCAGATAAAAGGTAGGGAG AAAAATACTCCTCAACATGTCCACTTTAGCACCAGGAAAACCTAATATCAATATCACCATCAATGATATC ATATAAATATCATTGCATAGATAAGCAATGTCAATCCCTAAAAACTATGTATACCAATAGCACTAACTTG TGGCCAGAACAAGAACCTTAACTGTGCCAAATTTTATTCTATTCAATAACAGCTGCCTCGTTTTCAGTTG TGCACATCTGAATGCAAGCAATCCCTGTCTGATGTGGAGTTTCTTGCACTGATAAGGAAAAACTGCTGAA GTTGTGAGGCTGCTCCAGGCAGAGCCATCATGTGAGTCATATGAAAGCTCCACGCTGCTGACCTCTGGCA AAAAGGGAGAGAACAAGGATAGGAGAGGCAGTGGGGGAAAGGTTCAAGTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CDK15_3 ↗ | 2:201,790,507 | 正股 | 201,790,458–201,790,517 |
| CDK15_1 ↗ | 2:201,806,583 | 正股 | 201,806,534–201,806,593 |
| CDK15_2 ↗ | 2:201,806,714 | 正股 | 201,806,665–201,806,724 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_94Z4P3 · promoter · 201806285–201806631 · regulatory
· motif · 201801763–201801772 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:435 aa
CDK15 蛋白長 435 個胺基酸,含有註解於第 103 至 387 位胺基酸的 protein kinase 結構域。其家族分類為 CMGC Ser/Thr protein kinase 家族的 CDC2/CDKX 次家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FKBP5Q13451 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HSP90AA1P07900 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CDK15 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可透過促進 BIRC5 在 Thr-34 位點磷酸化,抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that acts like an antiapoptotic protein that counters TRAIL/TNFSF10-induced apoptosis by inducing phosphorylation of BIRC5 at 'Thr-34' PMID 24866247 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCCATCATGTGAGTCATATGAAAGCTCCACGCTGCTG40ACCTCTGGCAAAAAGGGAGAGAACAAGGATAGGAGAGGCA80GTGGGGGAAAGGTTCAAGTGCGGGTTTTCTCCTTGAACCT120ACAAGATTATGGGTCAAGAGCTGTGTGCAAAGACTGTACA160GCCTGGATGCAGCTGCTACCATTGTTCAGAGGGAGGCGAG200GCACACAGCTGTCGGAGGAGTCAGCCTGAGACCACGGAGG240CTGCGTTCAAGCTAACAGACCTAAAAGAAGCATCATGTTC280CATGACTTCATTTCACCCCAGGGGACTTCAAGCTGCCCGT320GCCCAGAAGTTCAAGAGTAAAAGGCCACGGAGTAACAGTG360ATTGTTTTCAGGAAGAGGATCTGAGGCAGGGTTTTCAGTG400GAGGAAGAGCCTCCCTTTTGGGGCAGCCTCATCTTACTTG440AACTTGGAGAAGCTGGGTGAAGGCTCTTATGCGACAGTTT480ACAAGGGGATTAGCAGAATAAATGGACAACTAGTGGCTTT520AAAAGTCATCAGCATGAATGCAGAGGAAGGAGTCCCATTT560ACAGCTATCCGAGAAGCTTCTCTCCTGAAGGGTTTGAAAC600ATGCCAATATTGTGCTCCTGCATGACATAATCCACACCAA640AGAGACACTGACATTCGTTTTTGAATACATGCACACAGAC680CTGGCCCAGTATATGTCTCAGCATCCAGGAGGGCTTCATC720CTCATAATGTCAGACTTTTCATGTTTCAACTTTTGCGGGG760CCTGGCGTACATCCACCACCAACACGTTCTTCACAGGGAC800CTGAAACCTCAGAACTTACTCATCAGTCACCTGGGAGAGC840TCAAACTGGCTGATTTTGGTCTTGCCCGGGCCAAGTCCAT880TCCCAGCCAGACATACTCTTCAGAAGTCGTGACCCTCTGG920TACCGGCCCCCTGATGCTTTGCTGGGAGCCACTGAATATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。