演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CDK15PFTAIRE2

cyclin dependent kinase 15

CDK15 是一種絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,屬於 CMGC 蛋白激酶家族;來源指出它可透過磷酸化 BIRC5,抵抗 TRAIL 誘導的細胞凋亡。

Homo sapiens2q33.1UniProt Q96Q40
OFFICIAL SYMBOL
CDK15
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q96Q40
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CDK15(cyclin dependent kinase 15)是蛋白質編碼基因,其產物為絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,歸屬於 protein kinase 超級家族中的 CMGC Ser/Thr protein kinase 家族及 CDC2/CDKX 次家族。來源描述其與抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡有關,並指出其作用涉及 BIRC5 的磷酸化。蛋白質序列註解包含一個 protein kinase 結構域;此區域構成其已註解的主要結構特徵。

Official symbol
CDK15
Gene name
cyclin dependent kinase 15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14434
UniProt
Q96Q40
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PFTAIRE2ALS2CR7PFTK2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q33.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegCDK15pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:201,790,461–201,895,550
Gene span
105,090 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000652192 ★201,806,537–201,895,55014
ENST00000410091201,790,461–201,895,55015
ENST00000260967201,806,375–201,895,55014
ENST00000450471201,806,537–201,895,55014
ENST00000434439201,806,537–201,889,45713

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CDK15 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。來源指出,它可藉由促進 BIRC5 在 Thr-34 位點磷酸化,抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡;因此,這項作用與細胞凋亡反應的調節相關。

其酵素反應可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質中的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並產生 ADP。這描述了 CDK15 所屬激酶的磷酸化反應類型;來源另具體指出 BIRC5 的 Thr-34 是與抵抗 TRAIL 誘導凋亡相關的磷酸化位點。現有資料未進一步說明此作用的其他分子步驟或條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 201806537 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CDK15 ENST00000652192 GRCh38 chr2:201805537-201806637 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATATCTCTAGATTGAATCTTGGAATTGGCTTAAGTCTCTTCTCTTGTGGCAATTTTGAAATGAAAAAAT
ACATGCTCATAATTAAATTACCTGAACATTTTAAAAAACCATCATGAGGTTCAAATATCAAATATTCATA
AATATTGTTGTGATAATAGACATAACTCTTATTTTTTCCCTTAATAATGATTGTTTATATATCCTCCATT
CTGTCTCACTTTATGATTAGTATATTATAGTGGCAATAATCTTAGGAATCTAACAGAGAAAAGTGTTGCA
TTTGAAGACTACAGACTGCAAACCAATTTAAGCCAGATTCCTTGACATGTTGTGCTGTTAATATAGTACT
TTACATATAGTAAACATTAATTACATATATGTGGAAGGAAGCAAGCAAGAAAGGAAGAAAGTATTTCATT
CAAACTCCTCTCTCTCCATCACCATTGGCTAATATCATCATTTGTACAGTTAAGAACAACATAGGTGCTC
ACCACATAGTTTTTGAATAAATGAATGAATGGCAACCCTTCTAAGACTATTGGATACACTATTGTTTGAA
GGCAAAGAGATGCAGTAGATATTTTCAACTTTTTTCCTGTTTTATGATTCTGTGGTTTCTTTGACTACTA
AAAGTTAGCTAGGTAGCAAATTTGTTTTAAAGTCTGAAAACCAAAATGCTTTCAGATAAAAGGTAGGGAG
AAAAATACTCCTCAACATGTCCACTTTAGCACCAGGAAAACCTAATATCAATATCACCATCAATGATATC
ATATAAATATCATTGCATAGATAAGCAATGTCAATCCCTAAAAACTATGTATACCAATAGCACTAACTTG
TGGCCAGAACAAGAACCTTAACTGTGCCAAATTTTATTCTATTCAATAACAGCTGCCTCGTTTTCAGTTG
TGCACATCTGAATGCAAGCAATCCCTGTCTGATGTGGAGTTTCTTGCACTGATAAGGAAAAACTGCTGAA
GTTGTGAGGCTGCTCCAGGCAGAGCCATCATGTGAGTCATATGAAAGCTCCACGCTGCTGACCTCTGGCA
AAAAGGGAGAGAACAAGGATAGGAGAGGCAGTGGGGGAAAGGTTCAAGTGC
CDK15 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CDK15_3 ↗2:201,790,507正股201,790,458–201,790,517
CDK15_1 ↗2:201,806,583正股201,806,534–201,806,593
CDK15_2 ↗2:201,806,714正股201,806,665–201,806,724

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_94Z4P3 · promoter · 201806285–201806631 · regulatory

· motif · 201801763–201801772 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:435 aa

1 aa435 aa結構域
依 Q96Q40 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CDK15 蛋白長 435 個胺基酸,含有註解於第 103 至 387 位胺基酸的 protein kinase 結構域。其家族分類為 CMGC Ser/Thr protein kinase 家族的 CDC2/CDKX 次家族。

結構域Protein kinase103–387 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96Q40…

AlphaFold · Q96Q40

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PFTAIRE2CDK15CDC37FKBP5HSP90AA1HSP90AB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CDK15 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可透過促進 BIRC5 在 Thr-34 位點磷酸化,抵抗 TRAIL/TNFSF10 誘導的細胞凋亡。含實驗來源
證據與來源

Serine/threonine-protein kinase that acts like an antiapoptotic protein that counters TRAIL/TNFSF10-induced apoptosis by inducing phosphorylation of BIRC5 at 'Thr-34'

PMID 24866247 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 24866247 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 24866247 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000652192 · 3,719 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCCATCATGTGAGTCATATGAAAGCTCCACGCTGCTG40
41ACCTCTGGCAAAAAGGGAGAGAACAAGGATAGGAGAGGCA80
81GTGGGGGAAAGGTTCAAGTGCGGGTTTTCTCCTTGAACCT120
121ACAAGATTATGGGTCAAGAGCTGTGTGCAAAGACTGTACA160
161GCCTGGATGCAGCTGCTACCATTGTTCAGAGGGAGGCGAG200
201GCACACAGCTGTCGGAGGAGTCAGCCTGAGACCACGGAGG240
241CTGCGTTCAAGCTAACAGACCTAAAAGAAGCATCATGTTC280
281CATGACTTCATTTCACCCCAGGGGACTTCAAGCTGCCCGT320
321GCCCAGAAGTTCAAGAGTAAAAGGCCACGGAGTAACAGTG360
361ATTGTTTTCAGGAAGAGGATCTGAGGCAGGGTTTTCAGTG400
401GAGGAAGAGCCTCCCTTTTGGGGCAGCCTCATCTTACTTG440
441AACTTGGAGAAGCTGGGTGAAGGCTCTTATGCGACAGTTT480
481ACAAGGGGATTAGCAGAATAAATGGACAACTAGTGGCTTT520
521AAAAGTCATCAGCATGAATGCAGAGGAAGGAGTCCCATTT560
561ACAGCTATCCGAGAAGCTTCTCTCCTGAAGGGTTTGAAAC600
601ATGCCAATATTGTGCTCCTGCATGACATAATCCACACCAA640
641AGAGACACTGACATTCGTTTTTGAATACATGCACACAGAC680
681CTGGCCCAGTATATGTCTCAGCATCCAGGAGGGCTTCATC720
721CTCATAATGTCAGACTTTTCATGTTTCAACTTTTGCGGGG760
761CCTGGCGTACATCCACCACCAACACGTTCTTCACAGGGAC800
801CTGAAACCTCAGAACTTACTCATCAGTCACCTGGGAGAGC840
841TCAAACTGGCTGATTTTGGTCTTGCCCGGGCCAAGTCCAT880
881TCCCAGCCAGACATACTCTTCAGAAGTCGTGACCCTCTGG920
921TACCGGCCCCCTGATGCTTTGCTGGGAGCCACTGAATATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。