基因總覽
CDIP1（cell death inducing p53 target 1）是人類蛋白質編碼基因，產生的 Cell death-inducing p53-target protein 1 屬於 CDIP1/LITAF 家族。此蛋白質長 208 個胺基酸，序列包含 LITAF 結構域，並具有一段膜結合兩親性螺旋；其 N 端部分則註記為無序區。這些特徵描述了蛋白質的家族歸屬與序列構成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000567695 ★ | 4,510,669–4,538,773 | 6 |
| ENST00000563332 | 4,510,619–4,538,505 | 6 |
| ENST00000399599 | 4,510,619–4,515,109 | 5 |
| ENST00000564828 | 4,510,619–4,538,828 | 4 |
| ENST00000563507 | 4,510,619–4,538,833 | 6 |
| ENST00000562334 | 4,510,619–4,538,833 | 6 |
| ENST00000857432 | 4,510,619–4,538,833 | 7 |
| ENST00000857433 | 4,510,619–4,538,716 | 6 |
| ENST00000857434 | 4,510,619–4,538,505 | 7 |
| ENST00000857435 | 4,510,619–4,538,833 | 8 |
| ENST00000857436 | 4,510,619–4,538,833 | 6 |
| ENST00000857437 | 4,510,619–4,538,833 | 7 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CDIP1 的產物是 p53/TP53 凋亡途徑的重要效應因子，參與調節細胞凋亡。來源特別指出，它對 TNF 介導的凋亡具有調節作用，而且此作用依賴 p53/TP53；因此，這項功能描述限定於 p53/TP53 參與的條件，不能據此推論為不依賴 p53/TP53 的普遍效應。
就目前提供的資料而言，CDIP1 的主要功能重點，是連結 p53/TP53 與 TNF 介導的凋亡調節。來源沒有進一步說明其分子作用步驟、調節方向、涉及的細胞或實驗條件，也未描述其他生物過程，因此不宜延伸為特定機制或更廣泛的功能主張。
Promoter 與基因調控
>CDIP1 ENST00000567695 GRCh38 chr16:4538673-4539773 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TACCTAGGATCAACTGGGGAGGTTTAGAATCTTGTGGCCTCTGGGTGCATGACTCCTAAACCGTAATTTC TTTCTTTCTTTCTTTTTTTGAGATGGAGTCTCAGTCTCTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGAGGCATAATCTC AGCTCACTGCAACCTCCATCTCTCGGGTTCAAGCAATTTTTGGGCTTCAGCCTCCCTAGTAGTTGGGATT ACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAAATAGAGACATGGTTTCACCATGTTGGC CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCGTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAG GCGTTAGCCACTGAGCTGGGCCCTAAACTATAATGTCTAATCTTGTAGCTAACGTGTTACTCTTACAAAG GAAGCCTGGTTCTCAGGCAACAAGGGGGTTTGTTTTGGGAAAGGGCTGTTAACTATCTTTGTTTCAATAT TAAACTATAAACTAAGTTGCTCCCAAAGTTAGTTCTGCCTATGCCTAGGAATGAACAAGGACAACCTGGA GGTTAGAAGCAAGATGGAGTGGGTTAGGTCAGCTCTCTTTCACTGTCATAATTTTCTGTTGTAATTTTTG CAAAGGCAGTTTCAAGCGCAGGGACAGTGACCGTGTGGTTCAAGGTTTTATGTAATGCACCTCCCAAACT CAATAAATATTAGTCGCATAAAAGAAAAAATGCAGCCCTGGAGGAAGATGCCCTGCCCTGTTGCTGGCAT GAGTGAAGAGGAGGCGCTCACAGGGACGGTTCTTTCCCTATTCTCCAGCCTCGTGTACATTGGGCAAACA GGCCCCGACCATCCCACGTGCTCAGCCCCAGCTCTAGGCCAAATCGCCTCCGCTCCCACTGACGTCATCA CGGCGCATCACGTGCCTCCCGAGACCCCACCCCCCACCGTGACGTCCCGGGCCTCGGCCCTGGTCCAAAG TCTACCCGCCTCCTTGTGACAGAAGTGCGACTGCCAGCTGCCGAGGCGTTCGGTCCTGCTGTTGCGGCCG CTGCCCCAGGGCTGCGGGGACGGTGAGTCGACTGGACGCATTCGGAGACGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CDIP1_2 ↗ | 16:4,538,429 | 負股 | 4,538,419–4,538,478 |
| CDIP1_1 ↗ | 16:4,538,773 | 負股 | 4,538,763–4,538,822 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_CG69 · enhancer · 4537323–4538459 · regulatory
ENSR16_BWBM · promoter · 4538460–4539181 · regulatory
ENSR16_533S8T · CTCF_binding_site · 4538771–4538792 · regulatory
· motif · 4535514–4535529 · motif
· motif · 4536684–4536706 · motif
· motif · 4536684–4536706 · motif
· motif · 4536879–4536892 · motif
· motif · 4537391–4537404 · motif
· motif · 4537991–4538003 · motif
· motif · 4538448–4538461 · motif
· motif · 4538506–4538521 · motif
· motif · 4538569–4538582 · motif
· motif · 4538596–4538611 · motif
· motif · 4538596–4538611 · motif
· motif · 4538599–4538611 · motif
· motif · 4538700–4538713 · motif
· motif · 4538773–4538789 · motif
· motif · 4538788–4538803 · motif
· motif · 4538788–4538803 · motif
· motif · 4538789–4538803 · motif
· motif · 4538848–4538857 · motif
· motif · 4538848–4538857 · motif
· motif · 4538864–4538877 · motif
· motif · 4538864–4538877 · motif
CDIP1 的表現受 p53/TP53 上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：208 aa
Cell death-inducing p53-target protein 1 長 208 個胺基酸，屬於 CDIP1/LITAF 家族。蛋白質含有位於第 122 至 206 個胺基酸的 LITAF 結構域；第 1 至 71 個胺基酸區段註記為無序區。第 164 至 184 個胺基酸則為膜結合兩親性螺旋。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CDIP1 是周邊膜蛋白，位於晚期胞內體與溶酶體膜的細胞質側。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- DCUN1D1Q96GG9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DESI1Q6ICB0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- EPN2O95208-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTUB2Q96DC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTUD7BQ6GQQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNIP1Q15025 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TOLLIPQ9H0E2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBBP0CG47 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBCP0CG48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CDIP1 的產物是 p53/TP53 凋亡效應因子，並參與調節 TNF 介導的細胞凋亡；此調節作用依賴 p53/TP53。資料未進一步描述作用方向或分子機制，因此不應延伸為不受 p53/TP53 條件限制的效應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as an important p53/TP53-apoptotic effector. Regulates TNF-mediated apoptosis in a p53/TP53-dependent manner PMID 17599062 ↗ |
| 細胞定位 | CDIP1 是周邊膜蛋白，位於晚期胞內體膜及溶酶體膜的細胞質側。此定位資料列出兩種細胞器膜，未提供定位變化條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Late endosome membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Lysosome membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side PMID 27582497 ↗ |
| 調控 | p53/TP53 會上調 CDIP1；此項資料指出調控方向為上調，未提供其他調控條件或詳細機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAAGTGCGACTGCCAGCTGCCGAGGCGTTCGGTCCTGCT40GTTGCGGCCGCTGCCCCAGGGCTGCGGGGACGCTCCCGGA80GCCCTGCCTGTTCCCTGTCCATCCAGGCCAGCAGCTGAAG120GAGCCTCACCTGCCTCCCTTCTCTGAGTAGCACGGATTTG160AGGAGAAGCAGCGAAGATGTCCAGCGAGCCTCCCCCTCCT200TATCCTGGGGGCCCCACAGCCCCACTTCTGGAAGAGAAAA240GTGGAGCCCCGCCCACCCCAGGCCGTTCCTCCCCAGCTGT280GATGCAGCCCCCTCCAGGCATGCCACTGCCCCCTGCGGAC320ATTGGCCCCCCACCCTATGAGCCGCCGGGTCACCCAATGC360CCCAGCCTGGCTTCATCCCACCACACATGAGTGCAGATGG400CACCTACATGCCTCCGGGTTTCTACCCTCCTCCAGGCCCC440CACCCACCCATGGGCTACTACCCCCCAGGGCCCTACACGC480CAGGGCCCTACCCTGGCCCTGGGGGCCACACAGCCACAGT520CCTGGTCCCTTCAGGAGCTGCCACCACGGTGACAGTGCTG560CAGGGAGAGATCTTTGAGGGAGCGCCTGTGCAGACGGTGT600GTCCCCACTGCCAGCAGGCCATCACCACCAAGATCTCCTA640CGAGATTGGCTTGATGAATTTCGTGCTGGGTTTCTTCTGT680TGCTTCATGGGATGTGATCTGGGCTGCTGCCTGATCCCCT720GCCTCATCAATGACTTCAAGGATGTGACGCACACATGCCC760CAGCTGCAAAGCCTACATCTACACGTACAAGCGCCTGTGC800TAACGGAGCTGGGACTCGGGACTCCCCCGCCTGTCAGTCT840GGCCCCCTGTGCTTTGCTCCCTGTGCTCAGTGGTCACTTT880CCCGCTCCCACTTGGGGCTGGGAGCCGTGCCACCATCCCC920TAGAAGTCCTGTCCTCTTCACCCTGCCCTACCTGAGCCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。