演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CDH24CDH11L

cadherin 24

CDH24 編碼 cadherin 24,屬於鈣離子依賴型細胞黏附蛋白,能介導強烈的細胞間黏附。

Homo sapiens14q11.2UniProt Q86UP0
OFFICIAL SYMBOL
CDH24
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q86UP0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CDH24 是蛋白質編碼基因,產物為 cadherin 24。它屬於 cadherin 家族,這類蛋白質具有鈣離子依賴型細胞黏附特性。cadherin 24 的蛋白質結構包含多個 Cadherin 結構域,並具有跨膜區段。

Official symbol
CDH24
Gene name
cadherin 24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14265
UniProt
Q86UP0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CDH11L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegCDH24pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:23,047,062–23,057,668
Gene span
10,607 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000487137 ★23,047,067–23,057,52013
ENST0000039735923,047,062–23,057,64914
ENST0000107466423,047,062–23,057,64913
ENST0000107466523,047,062–23,057,64912
ENST0000107466723,047,062–23,057,64912
ENST0000107466823,047,062–23,057,64911
ENST0000113702923,047,067–23,057,64913
ENST0000026738323,047,660–23,055,82612
ENST0000055403423,047,660–23,055,82611
ENST0000110772123,050,898–23,057,6499
ENST0000110772223,051,545–23,057,6499

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Cadherin 24 介導強烈的細胞間黏附。作為 cadherin 家族成員,它具有鈣離子依賴型細胞黏附的特性。

Cadherin 通常優先與相鄰細胞上的同類分子進行同源性互動,因而可促成細胞彼此連接。這類選擇性互動也可能參與異質細胞類型的分選;不過,來源將此作用描述為可能的貢獻,並未指出其在 cadherin 24 中的具體分選情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23057520 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CDH24 ENST00000487137 GRCh38 chr14:23057420-23058520 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GATATCTGAGCGTGGACATCTGAGGATATCTGGAGTAGGAGTTGCTCTCATTCCATGTGTTCCTTTAGGC
TGACTGCTTCCTGCTTATTGAACTTCCCACGTCTTTTATCCCCTGCCTTGGCCCTGACCAACCCAAAGCT
GTGGACCTTCCTCATTCGGGAAGGCATGGAGCAACCTGTGTCCGTGGCGGCACCCCAGCAGGGCTAGGAG
GGTGGGTCCTCTTCTGGTTCCTGGTCCTGTGCACGGTTAAATTAGGGGTTTGGTCACCTGCCTGCCACCT
TGGTGCCTCCCACAACTACCACCAGGGGGCGGCAGCTCCTCGCTCTGTTGGCCCCTGTAACCGAGCTTCC
CAAGAAGGGTTCCACTGCCCGCCTCCGACCTCCCGCCGATGTCGTGCCTCTGTTCCCGACCCGCTCCCTG
GGCCCGGGCCTCGGACTCTCTGGACCCTTCTGCCGTCCTTAAGTGTCCCCCAGCTGACCTGCTACCGTGC
TTTGCATGGGCTCTCAAAACGCCGCCGCCTTGCAGCTGGGATTCCATCCACACCAGTCCCAAAAGCCAGC
CGGGAACCGGGAGCCCGGAGCCGGGTCTCTCCGCAGTGGGCTCCGAATTCCCCACCTCACCGCGCGCTCG
CCCGTTTTCCGCTGCGGGCGGGGACTGGCAGCTTCGCGCTCCCGGGTGCACCCGCCCCGCCAGCTCTTCG
GAAATGGCCTGGCGCCGTGGCCTGGACGTCCTCCCGCCCGAGTGCCCTGCCGGGCGCTGCGGGCCCGGTC
CGGGAGGGGCGCCGCATCTGTATGCGCCCCGCAGCCCAGGAGCGCCGAGGGGGCGGACGCGCGGCGCCGC
CTCCGCCCCCGCCCCCGCCGCGCGGGCCCGGCTGGCCGGGGAGGGTCGGAGGCTGGGCTCTCCTCTCCCG
CGCGGCGCGGAGCCGCCTCGCTCCTCCGCAGGCGGAGTCTTCTTCCCCCGCCCCCTCCGTCTCGCTCCCT
TGTTCTCGCCGGGGCCGCTCAGACCTGCAGCGGAGCCGCGGCGCCCGCTCCAATCGGCTCGGGGCTGTGC
CCCCGGGACCCGGCGACGGGGGCGGGCGGGGGCGCTTCCCGCCGGCCTGGG
CDH24 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CDH24_1 ↗14:23,057,520負股23,057,510–23,057,569

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_9C64B · promoter · 23055816–23056316 · regulatory

ENSR14_57FFF8 · CTCF_binding_site · 23056316–23056337 · regulatory

ENSR14_8NB7F · enhancer · 23057317–23057509 · regulatory

ENSR14_8NB7J · promoter · 23057510–23057703 · regulatory

ENSR14_57FFQ2 · CTCF_binding_site · 23058206–23058227 · regulatory

ENSR14_57FG23 · CTCF_binding_site · 23059732–23059753 · regulatory

ENSR14_57FGFP · CTCF_binding_site · 23062253–23062274 · regulatory

· motif · 23055357–23055369 · motif

· motif · 23055359–23055366 · motif

· motif · 23055519–23055526 · motif

· motif · 23055813–23055826 · motif

· motif · 23056318–23056334 · motif

· motif · 23057551–23057564 · motif

· motif · 23057660–23057673 · motif

· motif · 23057666–23057679 · motif

· motif · 23057672–23057685 · motif

· motif · 23057694–23057707 · motif

· motif · 23057946–23057960 · motif

· motif · 23058131–23058142 · motif

· motif · 23058208–23058224 · motif

· motif · 23058217–23058234 · motif

· motif · 23058282–23058296 · motif

· motif · 23058288–23058302 · motif

· motif · 23058435–23058446 · motif

· motif · 23058747–23058761 · motif

· motif · 23058747–23058761 · motif

· motif · 23058985–23058996 · motif

· motif · 23058986–23058997 · motif

· motif · 23059734–23059750 · motif

· motif · 23062255–23062271 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:819 aa

1 aa819 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q86UP0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

cadherin 24 長 819 個胺基酸。其 N 端訊號區位於第 1–19 位,胞外區為第 45–641 位,包含五個 Cadherin 結構域;第 642–662 位為螺旋型跨膜區,胞質區延伸至第 819 位。第 768–800 位另標註為無序區。

訊號胜肽1–19 aa
拓樸區域Extracellular45–641 aa
跨膜區Helical642–662 aa
拓樸區域Cytoplasmic663–819 aa
結構域Cadherin 146–150 aa
結構域Cadherin 2151–259 aa
結構域Cadherin 3260–374 aa
結構域Cadherin 4375–517 aa
結構域Cadherin 5517–630 aa
功能區域Disordered768–800 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q86UP0…

AlphaFold · Q86UP0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

cadherin 24 位於細胞膜,是單次跨膜的 I 型膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CDH11LCDH24
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

cadherin 24 與 alpha-, beta- 和 delta-catenins 有關聯。來源僅描述這些關聯,未進一步界定是否為直接結合或共同組成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Cadherin 家族蛋白質依賴鈣離子介導細胞黏附,並傾向與相連細胞上的同類分子進行同源性互動,因此可能參與異質細胞類型的分選。Cadherin-24 則可介導強烈的細胞間黏附。含實驗來源
證據與來源

Cadherins are calcium-dependent cell adhesion proteins. They preferentially interact with themselves in a homophilic manner in connecting cells; cadherins may thus contribute to the sorting of heterogeneous cell types. Cadherin-24 mediate strong cell-cell adhesion

PMID 12734196 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用來源指出此蛋白質與 alpha-, beta- 及 delta-catenins 有關聯,但沒有進一步說明這些關聯是否為直接結合,或是否代表共同組成特定複合體。資料庫紀錄
證據與來源

Associates with alpha-, beta- and delta-catenins

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此蛋白質定位於細胞膜,屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白;該定位描述未提供條件變化或不同異構型之間的差異。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000487137 · 3,415 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACCTGCAGCGGAGCCGCGGCGCCCGCTCCAATCGGCTC40
41GGGGCTGTGCCCCCGGGACCCGGCGACGGGGGCGGGCGGG80
81GGCGCTTCCCGCCGGCCTGGGCCCCTCGGCAGTGCCAGGT120
121GTGGATCCATGGGGTAGCCTCAACGCATCTGCCCCTCCAC160
161CCCAGCCAGCTCATGGGCCACGTGGCCTGGCCCAGCCTCA200
201GCACCCAGGGCCAGTGAACAGAGCCCTGGCTGGAGTCCAA240
241ACATGTGGGGCCTGGTGAGGCTCCTGCTGGCCTGGCTGGG280
281TGGCTGGGGCTGCATGGGGCGTCTGGCAGCCCCAGCCCGG320
321GCCTGGGCAGGGTCCCGGGAACACCCAGGGCCTGCTCTGC360
361TGCGGACTCGAAGGAGCTGGGTCTGGAACCAGTTCTTTGT400
401CATTGAGGAATATGCTGGTCCAGAGCCTGTTCTCATTGGC440
441AAGCTGCACTCGGATGTTGACCGGGGAGAGGGCCGCACCA480
481AGTACCTGTTGACCGGGGAGGGGGCAGGCACCGTATTTGT520
521GATTGATGAGGCCACAGGCAATATTCATGTTACCAAGAGC560
561CTTGACCGGGAGGAAAAGGCGCAATATGTGCTACTGGCCC600
601AAGCCGTGGACCGAGCCTCCAACCGGCCCCTGGAGCCCCC640
641ATCAGAGTTCATCATCAAAGTGCAAGACATCAACGACAAT680
681CCACCCATTTTTCCCCTTGGGCCCTACCATGCCACCGTGC720
721CCGAGATGTCCAATGTCGGGACATCAGTGATCCAGGTGAC760
761TGCTCACGATGCTGATGACCCCAGCTATGGGAACAGTGCC800
801AAGCTGGTGTACACTGTTCTGGATGGACTGCCTTTCTTCT840
841CTGTGGACCCCCAGACTGGAGTGGTGCGTACAGCCATCCC880
881CAACATGGACCGGGAGACACAGGAGGAGTTCTTGGTGGTG920
921ATCCAGGCCAAGGACATGGGCGGCCACATGGGGGGGCTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。