基因總覽
CD40LG 是蛋白質編碼基因，產物 CD40 ligand 為細胞激素，並作為 CD40/TNFRSF5 的配體。現有資料將其描述為免疫訊號分子，涉及 T 細胞與 B 細胞相關反應；至於家族分類與蛋白質結構特色，則不在本段來源所提供的資訊範圍內。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370629 ★ | 136,648,158–136,660,390 | 5 |
| ENST00000695724 | 136,648,139–136,660,388 | 4 |
| ENST00000695725 | 136,648,139–136,660,390 | 2 |
| ENST00000370628 | 136,648,139–136,660,390 | 4 |
| ENST00001132969 | 136,648,139–136,660,390 | 5 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CD40 ligand 作為 CD40/TNFRSF5 的配體，參與 CD40 訊號作用。它也能與 ITGA5:ITGB1 及 ITGAV:ITGB3 兩種整合素結合；資料指出，整合素與 CD40 皆是啟動 CD40-CD40LG 訊號所需的條件。這條訊號的效應依細胞類型而異，所列結果包括 B 細胞活化、NF-κB 訊號與抗凋亡訊號。
在 T 細胞中，CD40 ligand 的交聯可提供共同刺激訊號，促進 T 細胞增殖及細胞激素生成。當此作用伴隨 TCR/CD3 接合與 CD28 共同刺激時，IL4 和 IL10 的生成會增加。相關資料也指出，CD40 ligand 可誘導 NF-κB 活化，並在 T 細胞中誘導 MAPK8 與 PAK2 激酶活化；此外，CD28 的 isoform 3 可發生酪胺酸磷酸化。
在 B 細胞方面，資料指出 CD40 ligand 可在沒有共同刺激的情況下介導細胞增殖；在有 IL4 時，則可促進 IgE 生成。它也參與免疫球蛋白類別轉換。後述兩項作用標示為依相似性推定，解讀時應保留這項證據限制。
Promoter 與基因調控
>CD40LG ENST00000370629 GRCh38 chrX:136647158-136648258 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGTTAAACTCATGTCTTAGGCTAAATAAATTCCAAAAAATTCAGGATGAGAATTGTTTATTGCTTAACG TGTTTCAAATTTCTTCCATGCACATCTTTATTAGATCTTCACAGCAACCTACAGGATAAGCAAGACAGGT GCAAGTGCCTCCTTTGGGTATGAGGAAACTGAGGTCTAAAGAGATGAAGTGATTTGCCCAAGGCTCATAG CAATTTATTGGTAGAGCAAAGACTAGAATTCAGATCTCTTAACTGCAGCCTATTTTCCCTATTCTGAACT GTTACATCAGCATCAACAATTATCTAATGGATTGGAACAGTGTACACAGGCAGCTTAGCTACGTCAAGTC ACGATTTTTACTTTAACTTCAATTCCAGAGTCTTGGCCTGATTTCCCTCAAGACCCTACTTATCTTTGCC TTTGCAAAATTTATTTTTCTTGCATTATCTTTCCAGCTAAATTTTATTTAATAACCATCAGCATGCTTTT TTTGCTTTATGCCATGTAGACTTGACCTGAAAACCTGCCAGGCTTTCATTGAGTTTAGTGATTAAAGAAG TAAAGTTCTGAGAAGCAATTAGTTGATGGGACACCAGTCATAAAATCAATCCAAACTTTTGTTGACATGT GTTTCTTTCTCCATATACCAGGTTCCCGCTTCGTATTAGTAAGATTGAAATTGAAATAAGTCTATTGCTG GTGGATGAATTTGTCACTTTCCTTGAAACTGGTGAACCCAAAAAGTTAGACAGTGATAGGAAAATACTGC CATTGTCTGTTAAGAAGTCTATGACATTTCAAGGCAAGAATGAATATATGGAAGAAGAAACTTGTTTCTT CTTTACTTACAAAAAGGAAAGCCTGGAAGTGAATGATATGGGTATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAA AAACCTTTACGTAACGTTTTTGCTGGGAGAGAAGACTACGAAGCACATTTTCCAGGAAGTGTGGGCTGCA ACGATTGTGCGCTCTTAACTAATCCTGAGTAAGGTGGCCACTTTGACAGTCTTCTCATGCTGCCTCTGCC ACCTTCTCTGCCAGAAGATACCATTTCAACTTTAACACAGCATGATCGAAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CD40LG_1 ↗ | X:136,648,182 | 正股 | 136,648,133–136,648,192 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_B3258F · enhancer · 136652949–136653536 · regulatory
· motif · 136648362–136648373 · motif
· motif · 136649412–136649425 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：261 aa
CD40 ligand 長 261 個胺基酸，屬於腫瘤壞死因子家族。其 N 端第 1–22 位為細胞質區，第 23–46 位為螺旋型跨膜區，並作為第二型膜蛋白的訊號錨；第 47–261 位位於細胞外。THD 結構域位於第 122–261 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CD40 ligand 是單次穿膜的第二型膜蛋白，定位於細胞膜與細胞表面。 另有可溶形式，能被分泌；血小板釋放可溶性 CD40 ligand 的過程，部分受 GP IIb/IIIa、肌動蛋白聚合，以及對基質金屬蛋白酶抑制劑敏感的途徑調節。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CD40 ligand 可形成同源三聚體；可溶形式則可為單體或同源三聚體。它與 CD28 的 isoform 3 有交互作用，並可與 CD40 及整合素形成三元複合體，參與 CD40-CD40LG 訊號。
疾病與遺傳關聯
CD40LG 的變異會導致 X 連鎖高 IgM 症候群第 1 型（HIGM1）。此病的特徵為免疫球蛋白類別轉換缺陷、血清 IgM 升高，以及其他免疫球蛋白類別減少；男性患者通常在一歲內發病，可能反覆出現細菌及伺機性感染。來源並指出，即使接受靜脈注射免疫球蛋白替代治療，整體預後仍較差，約 10% 患者在青春期前死亡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CD40 ligand 是 CD40/TNFRSF5 的配體，可共同刺激 T 細胞增殖與細胞激素生成。於 T 細胞中交聯時，若同時有 TCR/CD3 接合及 CD28 共同刺激，會增加 IL4、IL10 生成；也可誘導 NF-κB、MAPK8、PAK2 活化及 CD28 isoform 3 酪胺酸磷酸化。依相似性資料指出，它可在無共同刺激時介導 B 細胞增殖、在有 IL4 時促進 IgE 生成，並參與免疫球蛋白類別轉換。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that acts as a ligand to CD40/TNFRSF5. Costimulates T-cell proliferation and cytokine production. Its cross-linking on T-cells generates a costimulatory signal which enhances the production of IL4 and IL10 in conjunction with the TCR/CD3 ligation and CD28 costimulation. Induces the activation of NF-kappa-B. Induces the activation of kinases MAPK8 and PAK2 in T-cells. Induces tyrosine phosphorylation of isoform 3 of CD28. Mediates B-cell proliferation in the absence of co-stimulus as well as IgE production in the presence of IL4 (By similarity). Involved in immunoglobulin class switching (By similarity) PMID 1280226 ↗ · PMID 15067037 ↗ · PMID 31331973 ↗ · PMID 8617933 ↗ |
| 功能 | CD40 ligand 可作為 ITGA5:ITGB1 與 ITGAV:ITGB3 的配體。啟動 CD40-CD40LG 訊號需要整合素與 CD40 共同參與；其效應依細胞類型而異，包含 B 細胞活化、NF-κB 訊號及抗凋亡訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a ligand for integrins, specifically ITGA5:ITGB1 and ITGAV:ITGB3; both integrins and the CD40 receptor are required for activation of CD40-CD40LG signaling, which have cell-type dependent effects, such as B-cell activation, NF-kappa-B signaling and anti-apoptotic signaling PMID 31331973 ↗ |
| 交互作用 | CD40 ligand 可形成同源三聚體，並與 CD28 的 isoform 3 交互作用。可溶形式則可為單體或同源三聚體；在 CD40-CD40LG 訊號中，CD40 ligand 還可與 CD40 及整合素形成三元複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer. Interacts with isoform 3 of CD28. CD40 ligand, soluble form: Exists as either a monomer or a homotrimer. Forms a ternary complex between CD40 and integrins for CD40-CD40LG signaling PMID 11676606 ↗ · PMID 15067037 ↗ · PMID 31331973 ↗ · PMID 8589998 ↗ · PMID 8626375 ↗ |
| 細胞定位 | CD40 ligand 定位於細胞膜及細胞表面，屬於單次穿膜的第二型膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type II membrane protein; Cell surface PMID 8626375 ↗ · PMID 15067037 ↗ · PMID 7678552 ↗ |
| 細胞定位 | CD40 ligand 有可溶形式並可被分泌。血小板釋放可溶性 CD40 ligand 的過程，部分受到 GP IIb/IIIa、肌動蛋白聚合，以及對基質金屬蛋白酶抑制劑敏感的途徑調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源CD40 ligand, soluble form; Secreted; Release of soluble CD40L from platelets is partially regulated by GP IIb/IIIa, actin polymerization, and a matrix metalloproteinases (MMP) inhibitor-sensitive pathway PMID 8626375 ↗ |
| 疾病關聯 | CD40LG 變異會導致高 IgM 症候群第 1 型（HIGM1），其特徵為免疫球蛋白類別轉換缺陷、血清 IgM 升高及其他類別減少。男性患者通常在一歲內發病，反覆出現細菌與伺機性感染；即使接受靜脈注射免疫球蛋白替代治療，預後仍較差，約 10% 患者在青春期前死亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency with hyper-IgM, type 1 HIGM1 Immunoglobulin isotype switch defect characterized by elevated concentrations of serum IgM and decreased amounts of all other isotypes. Affected males present at an early age (usually within the first year of life) recurrent bacterial and opportunistic infections, including Pneumocystis carinii pneumonia and intractable diarrhea due to cryptosporidium infection. Despite substitution treatment with intravenous immunoglobulin, the overall prognosis is rather poor, with a death rate of about 10% before adolescence. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 308230 PMID 26545377 ↗ · PMID 31331973 ↗ · PMID 7532185 ↗ · PMID 7678782 ↗ · PMID 7679206 ↗ · PMID 7679801 ↗ · PMID 7717401 ↗ · PMID 8094231 ↗ · PMID 8550833 ↗ · PMID 8889581 ↗ · PMID 9150729 ↗ · PMID 9746782 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AATCCTGAGTAAGGTGGCCACTTTGACAGTCTTCTCATGC40TGCCTCTGCCACCTTCTCTGCCAGAAGATACCATTTCAAC80TTTAACACAGCATGATCGAAACATACAACCAAACTTCTCC120CCGATCTGCGGCCACTGGACTGCCCATCAGCATGAAAATT160TTTATGTATTTACTTACTGTTTTTCTTATCACCCAGATGA200TTGGGTCAGCACTTTTTGCTGTGTATCTTCATAGAAGGTT240GGACAAGATAGAAGATGAAAGGAATCTTCATGAAGATTTT280GTATTCATGAAAACGATACAGAGATGCAACACAGGAGAAA320GATCCTTATCCTTACTGAACTGTGAGGAGATTAAAAGCCA360GTTTGAAGGCTTTGTGAAGGATATAATGTTAAACAAAGAG400GAGACGAAGAAAGAAAACAGCTTTGAAATGCAAAAAGGTG440ATCAGAATCCTCAAATTGCGGCACATGTCATAAGTGAGGC480CAGCAGTAAAACAACATCTGTGTTACAGTGGGCTGAAAAA520GGATACTACACCATGAGCAACAACTTGGTAACCCTGGAAA560ATGGGAAACAGCTGACCGTTAAAAGACAAGGACTCTATTA600TATCTATGCCCAAGTCACCTTCTGTTCCAATCGGGAAGCT640TCGAGTCAAGCTCCATTTATAGCCAGCCTCTGCCTAAAGT680CCCCCGGTAGATTCGAGAGAATCTTACTCAGAGCTGCAAA720TACCCACAGTTCCGCCAAACCTTGCGGGCAACAATCCATT760CACTTGGGAGGAGTATTTGAATTGCAACCAGGTGCTTCGG800TGTTTGTCAATGTGACTGATCCAAGCCAAGTGAGCCATGG840CACTGGCTTCACGTCCTTTGGCTTACTCAAACTCTGAACA880GTGTCACCTTGCAGGCTGTGGTGGAGCTGACGCTGGGAGT920CTTCATAATACAGCACAGCGGTTAAGCCCACCCCCTGTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。