基因總覽
CD2AP 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 CD2 associated protein。其產物被描述為適配蛋白，可能協助膜蛋白與肌動蛋白細胞骨架建立聯繫。來源亦指出它與細胞連結的形成及細胞分裂有關；至於部分作用，來源以相似性推論描述，應視為可能功能，而非確定結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000359314 ★ | 47,477,789–47,627,263 | 18 |
| ENST00000865252 | 47,477,732–47,627,275 | 18 |
| ENST00000865253 | 47,477,732–47,627,275 | 18 |
| ENST00000865254 | 47,477,732–47,627,275 | 14 |
| ENST00000931707 | 47,477,732–47,627,275 | 18 |
| ENST00000931708 | 47,477,732–47,627,275 | 18 |
| ENST00000931709 | 47,477,732–47,627,275 | 18 |
| ENST00000960842 | 47,477,732–47,627,275 | 17 |
| ENST00000960843 | 47,477,732–47,627,275 | 5 |
| ENST00001007547 | 47,477,732–47,627,017 | 18 |
| ENST00001111118 | 47,477,732–47,609,531 | 16 |
| ENST00001118517 | 47,477,732–47,627,275 | 17 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CD2AP 產物似乎可作為適配蛋白，連接膜蛋白與肌動蛋白細胞骨架。此角色可能使細胞膜上的蛋白質與細胞骨架之間形成協調，但來源未進一步說明其具體分子步驟。
在 RET 訊號調節方面，CD2AP 與 CBLC 協同影響 RET 的周轉速率，可能形成調節關卡，限制 GDNF 對神經元存活的作用強度。依相似性推論，CD2AP 也會調節 CBLC 的功能，使其由 RET 降解的抑制因子轉為促進因子；這項描述屬推論性質。
CD2AP 可能參與 T 細胞與抗原呈現細胞接合處的受體聚集及細胞骨架極性，此功能同樣是依相似性提出。腎小球足細胞中，它可能將裂隙隔膜連接至肌動蛋白細胞骨架。來源另指出 CD2AP 是細胞質分裂所必需，並參與上皮細胞連結的形成。這些不同情境顯示其功能涉及細胞骨架與膜上結構的組織，但各項作用的證據與確定程度並不相同。
Promoter 與基因調控
>CD2AP ENST00000359314 GRCh38 chr6:47476789-47477889 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGTTCAGACAGGTTAATTTATCCAAGGTCCCACAAAAAGTAAATGGCTGTGCTGAGTTTCAAGGACCC ATGTCTGCCTGGATCCAAAGGGCAAGTCAGTTTCAGTGCTGGATGACTGAGAATTACAAAATTTCTTGAA AAAGCACTAGGCACAATAGTTGGCGTTCAACAAACGCTCACACACACATCTGCCCTGGAATTGGGTCTAC TTAAACAGAAGGGGGAAAAAAAGCTTGCTGAAATAATTATACTTCTTCGTAACTACCAAGCTCATGTTTG ACTGACTATAGTAATCCTATGCCCTCCTTCACATTGACGCTAGAAAAAATGCCTGGCAGTATTTCAAATC ATGATGCCTATTTTTCTCTCGATCAAGTAACAACTCAAATTATACTTTAAAAAGAAAAAAAGCAAATTAT AAAGTTGCATTCAGCTGACAAGAGACTAAAGGAATCTGTGAAACAGAATTTATTTGATGCCTAGGTTTCT CCCTCACCCGACGAAGACCAAATGCTGCTGATCCGTAAGTAACTTCGCAAGGTAAACTGAGGGGCCTGGC AGCATCTGGGCCTCCCTTAAAGGTCGAAATCAAGTGCGCTCGCCCTCCTTCTGTCCGCCTTTTCCCTTTA AGGTCCTCGAGGCTGCTTCGCTGCAGAAAGTAACTCCGCGTCGCCGCCGCGGAAAGTGGGGCAACTTTGC CTATCAGCAGAAACCTTTTGATCCATCTGAGGCGACAAACCAGACCAAACGCCCGCCCAAGCTGTTCCGA GCCTCCGGGGGGAGAGCGAGCCCAAGCTCCTCTGCACCGCTTCCTCATCCGCTCGCTGCACCTGGACGCG GTCGGCGCGCGACCCCCGGCCGTGACGTCACCGCACCTGGCAGCAGCCGTGGGGACCGGGAGAGAGCCCG AACGCGACGGGGCGGGGTGGGGCGGGGAGAACGAGGGCGTTCTCGCGAGATTTGCCTCCTCCCGGTCCCA GCTCCCCGCACCTTCTCGGCCTCTGTCTGGGTCCCCACCTTAGTCTACGGTGTCGCCTTTTCTAACTGCG AGTGCTAAGGAAGAGGCGAGGGGCGGGCTCCGAGGCTAGGCGGGCGCTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CD2AP_1 ↗ | 6:47,477,789 | 正股 | 47,477,740–47,477,799 |
| CD2AP_2 ↗ | 6:47,478,189 | 正股 | 47,478,140–47,478,199 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9NSRP · promoter · 47477299–47477799 · regulatory
ENSR6_5F6HWF · CTCF_binding_site · 47477747–47477768 · regulatory
ENSR6_83DNLM · enhancer · 47477800–47478054 · regulatory
ENSR6_BCFDZ · promoter · 47478055–47478650 · regulatory
· motif · 47476869–47476883 · motif
· motif · 47477401–47477411 · motif
· motif · 47477505–47477527 · motif
· motif · 47477505–47477527 · motif
· motif · 47477615–47477624 · motif
· motif · 47477648–47477661 · motif
· motif · 47477648–47477661 · motif
· motif · 47477660–47477669 · motif
· motif · 47477749–47477765 · motif
· motif · 47478009–47478022 · motif
· motif · 47478110–47478126 · motif
· motif · 47478172–47478189 · motif
· motif · 47478327–47478344 · motif
· motif · 47482710–47482723 · motif
· motif · 47482710–47482723 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：639 aa
CD2AP 蛋白長 639 個胺基酸，含三個 SH3 區域，其中第一個標註為截短型。其序列另有多段預測為無序的區域，並包含三個 SH3 結合基序。N 端區域（胺基酸 1–175）與 ANLN 互作及定位至中體有關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CD2AP 可見於細胞質、細胞骨架、膜皺褶及細胞連結；在膜皺褶中與 F-actin、BCAR1/p130Cas 共定位。 依相似性推論，它也位於腎小球足細胞足突之間的裂隙隔膜。 細胞分裂後期，它會聚集於中區微管附近，並在末期聚集於中體。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, ruffle；Cell junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- BLNKQ8WV28 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CBLBQ13191 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- CD2P06729 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FYNP06241 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQGAP1P46940 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PDCD6IPQ8WUM4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIN3Q8TB24 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3KBP1Q96B97 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TSG101Q99816 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CD2AP 可形成同源二聚體，並與 F-actin、PKD2、NPHS1、NPHS2 等蛋白互作；它也直接結合 DDN。CD2AP 與非活化 RET 及 CBLC 有直接互作；RET 受 GDNF 活化後，推測 CD2AP 會以 CBLC:CD2AP 複合體形式離開 RET。另有資料指出 CD2AP 與 CGNL1、SH3BP1 可能共同組成細胞連結處的複合體。感染情境下，CD2AP 的 SH3 區域與 Chikungunya virus non-structural protein 3 的 C 端互作，並與病毒複製起始有關。
疾病與遺傳關聯
CD2AP 基因變異與局部節段性腎小球硬化症 3 的疾病易感性相關；此關聯不表示變異必然造成疾病。此腎臟病理以腎小球局部節段硬化為特徵，可伴隨蛋白尿、腎絲球過濾率降低及腎功能逐步惡化；腎功能不全可能進展至末期腎病，屆時可能需要透析或腎臟移植。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CD2AP 可能作為適配蛋白連接膜蛋白與肌動蛋白細胞骨架。它與 CBLC 協同調節 RET 周轉，可能限制 GDNF 對神經元存活的作用；依相似性推論，CD2AP 可使 CBLC 由抑制因子轉為促進 RET 降解的因子。它也可能參與免疫細胞接合處的受體聚集與細胞骨架極性、足細胞裂隙隔膜固定，並參與細胞質分裂及上皮細胞連結形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Seems to act as an adapter protein between membrane proteins and the actin cytoskeleton. In collaboration with CBLC, modulates the rate of RET turnover and may act as regulatory checkpoint that limits the potency of GDNF on neuronal survival. Controls CBLC function, converting it from an inhibitor to a promoter of RET degradation (By similarity). May play a role in receptor clustering and cytoskeletal polarity in the junction between T-cell and antigen-presenting cell (By similarity). May anchor the podocyte slit diaphragm to the actin cytoskeleton in renal glomerolus. Also required for cytokinesis. Plays a role in epithelial cell junctions formation PMID 10339567 ↗ · PMID 15800069 ↗ · PMID 22891260 ↗ |
| 交互作用 | CD2AP 可形成同源二聚體，並與 F-actin、PKD2、NPHS1、NPHS2、WTIP 等互作；與 DDN 的互作為直接互作。它也可透過 SH3 區域結合 CBL 或 BCAR1/p130Cas，並與多種蛋白互作。CD2AP 直接結合非活化 RET 與 CBLC；RET 受 GDNF 活化後，推測其會以 CBLC:CD2AP 複合體形式離開 RET。它可能與 CGNL1、SH3BP1 組成細胞連結處複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with F-actin, PKD2, NPHS1 and NPHS2. Interacts with WTIP. Interacts with DDN; interaction is direct. Interacts (via SH3 2 domain) with CBL (via phosphorylated C-terminus). Interacts with BCAR1/p130Cas (via SH3 domain). Interacts with MVB12A and ARHGAP17. Interacts with ANLN, CD2 and CBLB. Interacts with PDCD6IP and TSG101. Interacts with RIN3. Interacts directly with RET (inactive) and CBLC; upon RET activation by GDNF suggested to dissociate from RET as CBLC:CD2AP complex (Probable) (Ref.30). Interacts with CGNL1 and SH3BP1; probably part of a complex at cell junctions. Interacts with CAPZA1 PMID 10339567 ↗ · PMID 11067845 ↗ · PMID 15800069 ↗ · PMID 16678097 ↗ · PMID 16895919 ↗ · PMID 17020880 ↗ · PMID 17853893 ↗ · PMID 18753381 ↗ · PMID 22891260 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，CD2AP 透過 SH3 區域與 Chikungunya virus non-structural protein 3 的 C 端互作；此互作與病毒複製起始有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via SH3 domains) with Chikungunya virus non-structural protein 3 (via C-terminus); this interaction plays a role in initiation of viral replication PMID 31493651 ↗ |
| 細胞定位 | CD2AP 位於細胞質、細胞骨架、膜皺褶及細胞連結，並在膜皺褶與 F-actin、BCAR1/p130Cas 共定位。依相似性推論，它也位於足細胞足突間的裂隙隔膜。細胞分裂後期，CD2AP 聚集於中區微管附近；至末期則聚集在中體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Cell projection, ruffle; Cell junction; Colocalizes with F-actin and BCAR1/p130Cas in membrane ruffles. Located at podocyte slit diaphragm between podocyte foot processes (By similarity). During late anaphase and telophase, concentrates in the vicinity of the midzone microtubules and in the midbody in late telophase PMID 15800069 ↗ · PMID 10339567 ↗ · PMID 22891260 ↗ |
| 疾病關聯 | CD2AP 基因變異與局部節段性腎小球硬化症 3 的疾病易感性相關，並非必然因果關係。此病以腎小球局部節段硬化為特徵，可造成蛋白尿、腎絲球過濾率下降與腎功能逐步惡化；腎功能不全常可能進展至末期腎病，需透析或腎臟移植。 | 含實驗來源 | 證據與來源Focal segmental glomerulosclerosis 3 FSGS3 A renal pathology defined by the presence of segmental sclerosis in glomeruli and resulting in proteinuria, reduced glomerular filtration rate and progressive decline in renal function. Renal insufficiency often progresses to end-stage renal disease, a highly morbid state requiring either dialysis therapy or kidney transplantation. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 607832 PMID 12764198 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTCTGTCTGGGTCCCCACCTTAGTCTACGGTGTCGCCTTT40TCTAACTGCGAGTGCTAAGGAAGAGGCGAGGGGCGGGCTC80CGAGGCTAGGCGGGCGCTCGGGGTTGGAGCCGAGGGTCTG120GGCAAACCGGTGGGTCCCTCCCCACTGCGGGAGCGGCCAG160GGTGGGAAAACCGCGGTCGGGCGGGCGGGGTAGGGCCCTC200CCGCCGCCGTGGCTCCTGGGGAGGCCAGGGGTGAGGAGCT240GTCGCCGCCTTTGCCTCTGCCTCGAGGGCCGCGCTGAAGA280GACTGGTAGGAGAGCGCCGCGGGCGGATGGAGGCGACTCT320TCGCCCCGCCTGAGCTCAGGAGGGGCTAGCGCGGAGCGCG360GGTCCCGCCTCCAGCCGCGGGAGCGGCCGCGCGAGCCACC400ACTGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCGGACGTCGGCTTCTCCC440CGCGGGAGCCCCCAGCATGGTTGACTATATTGTGGAGTAT480GACTATGATGCTGTACATGATGATGAATTAACTATTCGAG520TTGGAGAAATCATCAGGAATGTGAAAAAGCTACAGGAGGA560AGGGTGGCTGGAAGGAGAACTAAATGGGAGAAGAGGAATG600TTCCCTGACAATTTCGTTAAGGAAATTAAAAGAGAGACGG640AATTCAAGGATGACAGTTTGCCCATCAAACGGGAAAGGCA680TGGGAATGTAGCAAGTCTTGTACAACGAATAAGCACCTAT720GGACTTCCAGCTGGAGGAATTCAGCCACATCCACAAACCA760AAAACATTAAGAAGAAGACCAAGAAGCGTCAGTGTAAAGT800TCTTTTTGAGTACATTCCACAAAATGAGGATGAACTGGAG840CTGAAAGTGGGAGATATTATTGATATTAATGAAGAGGTAG880AAGAAGGCTGGTGGAGTGGAACCCTGAATAACAAGTTGGG920ACTGTTTCCCTCAAATTTTGTGAAAGAATTAGAGGTAACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。