基因總覽
CCN5（cellular communication network factor 5）是由蛋白質編碼基因 CCN5 產生的蛋白質，屬於 CCN family。其蛋白質序列具有多個註解區域，包括 IGFBP N-terminal、VWFC 與 TSP type-1；此外，序列起始處具有訊號胜肽。這些特徵構成 CCN5 的基本分子架構。現有資料將其主要生物學角色描述為可能參與骨骼更新調節，相關作用包括影響成骨細胞黏附、纖維蛋白原與整合素受體的結合，以及骨鈣素生成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000190983 ★ | 44,715,369–44,727,811 | 4 |
| ENST00000885413 | 44,714,270–44,728,563 | 5 |
| ENST00000372868 | 44,714,836–44,728,563 | 5 |
| ENST00000885414 | 44,714,836–44,728,563 | 5 |
| ENST00000991603 | 44,714,836–44,728,563 | 4 |
| ENST00001044627 | 44,714,836–44,728,563 | 4 |
| ENST00001044629 | 44,714,836–44,727,810 | 4 |
| ENST00000372865 | 44,714,883–44,728,563 | 3 |
| ENST00001102656 | 44,714,883–44,728,563 | 3 |
| ENST00001107774 | 44,714,883–44,725,516 | 3 |
| ENST00001123064 | 44,714,883–44,728,563 | 3 |
| ENST00001132642 | 44,714,883–44,728,563 | 4 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCN5 可能在調節骨骼更新方面扮演重要角色。來源所述的作用包含影響成骨細胞的黏附、抑制纖維蛋白原與整合素受體結合，以及抑制骨鈣素生成；這些觀察指出，CCN5 與骨骼相關細胞及分子活動有所關聯。
在細胞作用方面，CCN5 促進成骨細胞黏附。資料未進一步說明此效應所依賴的分子機制或實驗條件，因此不宜推論其如何直接改變細胞黏附過程。另有一項作用是抑制纖維蛋白原與整合素受體的結合；來源描述的是結合受到抑制，並未指出涉及哪一種整合素受體，也沒有提供更細的作用步驟。
CCN5 也會抑制骨鈣素生成。這項作用與其可能參與骨骼更新調節的描述相互呼應，但來源沒有交代骨鈣素變化如何影響骨骼更新，也未提供相關條件或作用方向以外的細節。因此，現有資訊支持將 CCN5 描述為可能調節骨骼更新，並具有上述細胞黏附、受體結合及骨鈣素生成相關作用；不宜據此延伸到未明確記載的機制或生理結果。
Promoter 與基因調控
>CCN5 ENST00000190983 GRCh38 chr20:44714369-44715469 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGTTGGTACGTACTGTTCCCTTGGCCTGGAACATTCTGCCCTCTCTCACCCTCTCTTTTCTTGGCTTTCT GAAATGGCACCTCCATCAGAAAGTGTCCCTCACTCTTGGTCTGAGCAAGGGACCTTGCCTGGTATTCCTG AACTTCCACCTGTTTTCCCTCTGTTTTCTCCCTCTCTGGGCCTTGTCCTCAGGTCAGTGTTGTGCCTCCA GCTCCTGCAGAGGCGAACTCAGAGGCGGCCGAATGAAACCAAATGGATTTGGCTTGACCCCATCATCTAG CGGTGCCCAGCAAGCGCTGGCACATAGTAGGTCCAGCCTGCCCGGACTCGCCCACCACGGGCCCCCTTCC AGAGCCGGGAGGCAGGCCAAGGGAGGCCCCTTATTGCCAAGAGCAAACAGGCCGCCCAGGGAAGTTTTGC TCTGGGTCACACCCACCTCTGGGTGGCTGCCAATCTGCCTGCCAGAAACCGCAGGCTGGGCCGCGGCTAC CCAGAGTCAGGGCCACGGAGCTTAGGAGACCTTGGGTCAGCTCTGCAAAGGGGTTGTTTACTGAATGCTT CTGGTATCTGCAGCCCCGCTGGGGTTCGGACAGGGGGTCTGGAATAGGGCTTCACAACTACAGCAGGGCT AGGACCCTCTTGGGCTGGAAGGAGCTGGAGAGGCCTCTGCAAGCTGTCACAGGCTCTTGGTGCTGGCACT GGCTCAGGCTTTCACACACACACACGCGCACACACACACACACACACACACGGACAGGCACCCCCTTGGT GGCCTTCACAGTTTCACCTTCAGGTAAATGGGCTCATCCTTTGAGCCATGAGGATGGGAAGCGAAGCAAG GAATGAAAAAGCTAGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGCGCGCGCGCGC GCGTGTGTACTCGTGCGTGTGCCTGTGTGTGCCTGGGAGTGACCTCACAGCTGCCGGAACATAAAGACTC ACAGGTCCGCCTCCCAGGCTCAAAGCTGGCTCTGCAGGGGACATGAGAGGCACACCGAAGACCCACCTCC TGGCCTTCTCCCTCCTCTGCCTCCTCTCAAAGGTAAGGAGGCCCGGGCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WISP2_1 ↗ | 20:44,714,861 | 正股 | 44,714,812–44,714,871 |
| WISP2_3 ↗ | 20:44,715,262 | 正股 | 44,715,213–44,715,272 |
| WISP2_2 ↗ | 20:44,715,370 | 正股 | 44,715,321–44,715,380 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_C6FRK · promoter · 44714354–44715379 · regulatory
ENSR20_BBTLD · enhancer · 44716184–44716834 · regulatory
ENSR20_9MQ89 · enhancer · 44717961–44718375 · regulatory
ENSR20_5DHZPS · CTCF_binding_site · 44718218–44718239 · regulatory
· motif · 44716303–44716314 · motif
· motif · 44718220–44718236 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：250 aa
CCN5 屬於 CCN family，蛋白質長 250 個胺基酸。其 N 端有訊號胜肽（第 1–23 位），並含 IGFBP N-terminal（第 24–103 位）、VWFC（第 98–164 位）及 TSP type-1（第 194–238 位）區域；其中結構域註解來自序列特徵資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCN5 的定位資料將其標示為分泌型蛋白質；來源未提供其他細胞內位置或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCN5 可能在骨骼更新調節中具有重要作用。它促進成骨細胞黏附，抑制纖維蛋白原與整合素受體的結合，並抑制骨鈣素生成；資料未進一步說明這些作用的實驗條件或分子機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May play an important role in modulating bone turnover. Promotes the adhesion of osteoblast cells and inhibits the binding of fibrinogen to integrin receptors. In addition, inhibits osteocalcin production |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CAAAGCTGGCTCTGCAGGGGACATGAGAGGCACACCGAAG40ACCCACCTCCTGGCCTTCTCCCTCCTCTGCCTCCTCTCAA80AGGTGCGTACCCAGCTGTGCCCGACACCATGTACCTGCCC120CTGGCCACCTCCCCGATGCCCGCTGGGAGTACCCCTGGTG160CTGGATGGCTGTGGCTGCTGCCGGGTATGTGCACGGCGGC200TGGGGGAGCCCTGCGACCAACTCCACGTCTGCGACGCCAG240CCAGGGCCTGGTCTGCCAGCCCGGGGCAGGACCCGGTGGC280CGGGGGGCCCTGTGCCTCTTGGCAGAGGACGACAGCAGCT320GTGAGGTGAACGGCCGCCTGTATCGGGAAGGGGAGACCTT360CCAGCCCCACTGCAGCATCCGCTGCCGCTGCGAGGACGGC400GGCTTCACCTGCGTGCCGCTGTGCAGCGAGGATGTGCGGC440TGCCCAGCTGGGACTGCCCCCACCCCAGGAGGGTCGAGGT480CCTGGGCAAGTGCTGCCCTGAGTGGGTGTGCGGCCAAGGA520GGGGGACTGGGGACCCAGCCCCTTCCAGCCCAAGGACCCC560AGTTTTCTGGCCTTGTCTCTTCCCTGCCCCCTGGTGTCCC600CTGCCCAGAATGGAGCACGGCCTGGGGACCCTGCTCGACC640ACCTGTGGGCTGGGCATGGCCACCCGGGTGTCCAACCAGA680ACCGCTTCTGCCGACTGGAGACCCAGCGCCGCCTGTGCCT720GTCCAGGCCCTGCCCACCCTCCAGGGGTCGCAGTCCACAA760AACAGTGCCTTCTAGAGCCGGGCTGGGAATGGGGACACGG800TGTCCACCATCCCCAGCTGGTGGCCCTGTGCCTGGGCCCT840GGGCTGATGGAAGATGGTCCGTGCCCAGGCCCTTGGCTGC880AGGCAACACTTTAGCTTGGGTCCACCATGCAGAACACCAA920TATTAACACGCTGCCTGGTCTGTCTGGATCCCGAGGTATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。