基因總覽
CCN4 的正式名稱為 cellular communication network factor 4，屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物描述為細胞訊號調節因子，並指出其與細胞存活相關；資料未提供更多可用於說明其基本性質或結構的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250160 ★ | 133,191,039–133,231,690 | 5 |
| ENST00000519433 | 133,191,036–133,231,690 | 2 |
| ENST00000517423 | 133,191,036–133,231,690 | 3 |
| ENST00000220856 | 133,191,036–133,231,690 | 4 |
| ENST00001126506 | 133,191,036–133,231,690 | 3 |
| ENST00001126507 | 133,191,036–133,231,690 | 4 |
| ENST00001133192 | 133,191,036–133,231,690 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCN4 是 Wnt/Frizzled 訊號路徑的下游調節因子，並與細胞存活相關。現有資料指出，在 DNA 損傷反應中，CCN4 可透過活化 AKT kinase，減弱由 p53 介導的細胞凋亡；同時也會上調具有抗凋亡作用的 Bcl-X(L) 蛋白。這些作用將 CCN4 與細胞存活及 DNA 損傷後的凋亡調控連結起來。
此外，CCN4 可黏附於皮膚纖維母細胞與黑色素瘤纖維母細胞。體外研究顯示，CCN4 與皮膚纖維母細胞的結合可經由 proteoglycans decorin 和 biglycan 發生。此處描述的是體外結合情形，不能據此推論其他細胞環境中的結合方式。
Promoter 與基因調控
>CCN4 ENST00000250160 GRCh38 chr8:133190039-133191139 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAGACACGTGGGGACAGCTCCAGCACCAAACGGCTTCTGACCAATGAGCAGAGACGGCAAACAGCAAAT GCGTTACCGTGGCTTTCACGTGTCATGAAGGTGATGCTGTAACCTGAGCCTCAGAGCTCATTTTATTTGT GAATTCCTATCATCTCTAGATGGGTGGACTGAAAGCCACCTCTTTCGCTTGCAGCTAGGTAGAGGGGAGT GCAAGAGGGCAAATGAAAACCAGAAGTAGGGTTGGGCGCAATGCCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG GGAGGCTGATGTGGGCGGATTACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTC GTCTCTACTAAAAATACAAAAATCAGCTGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGG CTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCGCCACTGCACTC CAGCCTGGCCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGA AAAAGAAAAAGAAAAGGAAAAAGAAAACCAGAAGTAGGAGCAGCCTGAAGAAATGACAGGGAGTTGATTT CCCACTGGGAGCCCTCTCAAAGCCCACACACCCGCCTGCCTGGGGTAACAGTATCTCCTCGGACATCCTG CACCCTCCCATGCTCCCCCCTCCCTACAGTAGTGAAAGACCTAGGCAGGATGACCCCAGCTCCTCTGTGA GAATTTCACACCCTAGTGTGAAGTCATAGCCTTGTAACTTTCCCTTTAAGAACTGTCAGAGCTGGGGAGG CTGGCCAAGCTCAGGCTGGAGGTGGGGACAGAGGGAAGAAAGAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGGCAGGAA AAGTTTTTTCAGAGGAAAATGCAGGGTTTGTCCTTCACCCTGACGTCAGATCTTGCTTTAATAAAACCCC CCAAGGGCTGCGGAAGAGGCATATCTGGTGCTCCTGATGGGCCGGCCAGTCTGGGCCCAGCTCCCCCGAG AGGTGGTCGGATCCTCTGGGCTGCTCGGTCGATGCCTGTGCCACTGACGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WISP1_1 ↗ | 8:133,191,039 | 正股 | 133,190,990–133,191,049 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_BZFNH · promoter · 133190613–133191147 · regulatory
ENSR8_93XTDP · enhancer · 133193069–133193384 · regulatory
ENSR8_85WPSM · enhancer · 133195264–133195440 · regulatory
· motif · 133190810–133190822 · motif
· motif · 133190823–133190838 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：367 aa
CCN4 蛋白長 367 個胺基酸，N 端第 1–22 位為訊號序列。蛋白質含有 IGFBP N-terminal、VWFC、TSP type-1 與 CTCK 結構域，分別位於第 45–118、121–186、215–260 與 273–347 位；CCN4 屬於 CCN family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 CCN4 的定位描述為分泌型；未提供定位改變條件或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- OTX1P32242 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCN4 是 Wnt/Frizzled 訊號路徑的下游調節因子，與細胞存活相關；在 DNA 損傷反應中，透過活化 AKT kinase 減弱 p53 介導的細胞凋亡，並上調抗凋亡蛋白 Bcl-X(L)。CCN4 也可黏附皮膚與黑色素瘤纖維母細胞；體外與皮膚纖維母細胞的結合涉及 proteoglycans decorin 和 biglycan。 | 含實驗來源 | 證據與來源Downstream regulator in the Wnt/Frizzled-signaling pathway. Associated with cell survival. Attenuates p53-mediated apoptosis in response to DNA damage through activation of AKT kinase. Up-regulates the anti-apoptotic Bcl-X(L) protein. Adheres to skin and melanoma fibroblasts. In vitro binding to skin fibroblasts occurs through the proteoglycans, decorin and biglycan PMID 10716946 ↗ · PMID 11782444 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATATCTGGTGCTCCTGATGGGCCGGCCAGTCTGGGCCCAG40CTCCCCCGAGAGGTGGTCGGATCCTCTGGGCTGCTCGGTC80GATGCCTGTGCCACTGACGTCCAGGCATGAGGTGGTTCCT120GCCCTGGACGCTGGCAGCAGTGACAGCAGCAGCCGCCAGC160ACCGTCCTGGCCACGGCCCTCTCTCCAGCCCCTACGACCA200TGGACTTTACCCCAGCTCCACTGGAGGACACCTCCTCACG240CCCCCAATTCTGCAAGTGGCCATGTGAGTGCCCGCCATCC280CCACCCCGCTGCCCGCTGGGGGTCAGCCTCATCACAGATG320GCTGTGAGTGCTGTAAGATGTGCGCTCAGCAGCTTGGGGA360CAACTGCACGGAGGCTGCCATCTGTGACCCCCACCGGGGC400CTCTACTGTGACTACAGCGGGGACCGCCCGAGGTACGCAA440TAGGAGTGTGTGCACAGGTGGTCGGTGTGGGCTGCGTCCT480GGATGGGGTGCGCTACAACAACGGCCAGTCCTTCCAGCCT520AACTGCAAGTACAACTGCACGTGCATCGACGGCGCGGTGG560GCTGCACACCACTGTGCCTCCGAGTGCGCCCCCCGCGTCT600CTGGTGCCCCCACCCGCGGCGCGTGAGCATACCTGGCCAC640TGCTGTGAGCAGTGGGTATGTGAGGACGACGCCAAGAGGC680CACGCAAGACCGCACCCCGTGACACAGGAGCCTTCGATGC720TGTGGGTGAGGTGGAGGCATGGCACAGGAACTGCATAGCC760TACACAAGCCCCTGGAGCCCTTGCTCCACCAGCTGCGGCC800TGGGGGTCTCCACTCGGATCTCCAATGTTAACGCCCAGTG840CTGGCCTGAGCAAGAGAGCCGCCTCTGCAACTTGCGGCCA880TGCGATGTGGACATCCATACACTCATTAAGGCAGGGAAGA920AGTGTCTGGCTGTGTACCAGCCAGAGGCATCCATGAACTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。