演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL8MCP-2

C-C motif chemokine ligand 8

CCL8(C-C motif chemokine ligand 8)屬於 chemokine CC 家族,是可分泌的趨化因子,可吸引多種免疫細胞;其加工形式 MCP-2(6-76) 則具有不同的趨化作用。

Homo sapiens17q12UniProt P80075
OFFICIAL SYMBOL
CCL8
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P80075
PDB / ALPHAFOLD
1ESR
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL8 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 8,屬於 protein-coding gene,其產物歸在 intercrine beta(chemokine CC)家族。這類分子具有趨化因子的性質,CCL8 可吸引單核球、淋巴球、嗜鹼性球與嗜酸性球。蛋白質序列長度為 99 個胺基酸,序列註解包含位於第 1 至 23 個胺基酸的訊號序列;來源並將其標示為分泌型蛋白質。CCL8 也可與 heparin 結合。這些資料勾勒出其家族歸屬、基本序列特徵與分泌性質;其趨化作用及加工形式的差異另於功能段落說明。

Official symbol
CCL8
Gene name
C-C motif chemokine ligand 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10635
UniProt
P80075
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MCP-2HC14SCYA8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL8pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:34,319,435–34,321,402
Gene span
1,968 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000394620 ★34,319,435–34,321,4023

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL8 是趨化因子,可吸引單核球、淋巴球、嗜鹼性球及嗜酸性球。這項作用指出它能引導多類免疫細胞,來源並提及 CCL8 可能參與腫瘤形成相關過程及發炎宿主反應;這些角色以「可能」描述,並非確定的功能結論。

CCL8 可與 heparin 結合。來源未進一步說明此結合在細胞或組織中的作用,因此不宜據此推論其對趨化活動或其他生物過程的具體影響。

CCL8 的加工形式 MCP-2(6-76) 與未指出為此加工形式的 CCL8 有不同描述:MCP-2(6-76) 不具有單核球趨化活性,但會抑制趨化作用;其抑制效果以 CCL7 最為明顯,也作用於 CCL2、CCL5 與 CCL8。這項差異顯示,加工形式會影響所述的趨化活性,且抑制作用涉及多種 chemokine。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34319435 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL8 ENST00000394620 GRCh38 chr17:34318435-34319535 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCACGGAGAAACCTTAAATGCATATTGCTTAGTGAAAGAAGCCAGTCTGAAAAGGCTGCCTACTATAT
GATTCCAACTATGCATATGATACTTGGGAAAAGACAAGCTCACAGAGATAGTAAAAAGATCAGTGGTAGC
CAGAGATTTGTGGAGAGGAAAAAGGATGAATAGAAGAATACAGTGAATTCTTAGAGCAGGAAAACTTCTA
TATGATATTGTAATGATGGATAGATCAGGCCTGCAGGGGGAGTAGATGAGGTCAGTCTTTTGCAAACCTG
GTTCCTTCTTGCCACGCCCCGCCCACAGCCCCACTGTGTGTGAACCAAGAGAGTTGGAAGGCCTTCTGCA
GACGGACCCATTCCACCTGAATCTCCATGACATATTGGACTTCTCCATATAATTTCATTTGGAAAGAAAC
TTGAGCATCTAAATAAAATGTTTGGAAACCACCATGCTACAAGACCAGCATGTGCTGTCTAGTTCTTACC
CTCTGCAACAGTAAGATTCTGGGGCATTAAGACTTAGTTCCAGGATTCTGTCATTCTGCCAACGTTCTGT
GGCTGGGGTTCTAAAGGAGCTTGCCTGGCTTAGAACTGCAAGTGACTCTAGTGTGATGGAGAGCACCAGC
AAAGCCTTAGGGCCCATCCCTGGCCTCCTGTTACCCACAGAGGGGTAGGCCCTTGGCTCTCTTCCACTAT
GACGTCAGCTTCCATTCTTCCTTTCTTATAGACAATTTTCCATTTCAAGGAAATCAGAGCCCTTAATAGT
TCAGTGAGGTCACTTTGCTGAGCACAATCCCATACCCTTCAGCCTCTGCTCCACAGAGCCTAAGCAAAAG
ATAGAAACTCACAACTTCCTTGTTTTGTTATCTGGAAATTATCCCAGGATCTGGTGCTTACTCAGCATAT
TCAAGGAAGGTCTTACTTCATTCTTCCTTGATTGTGACCATGCCCAGGCTCTCTGCTCCCTATAAAAGGC
AGGCAGAGCCACCGAGGAGCAGAGAGGTTGAGAACAACCCAGAAACCTTCACCTCTCATGCTGAAGCTCA
CACCCTTGCCCTCCAAGATGAAGGTTTCTGCAGCGCTTCTGTGCCTGCTGC
CCL8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL8_1 ↗17:34,319,435正股34,319,386–34,319,445

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9HLPZ · enhancer · 34314280–34314741 · regulatory

ENSR17_8328KC · enhancer · 34318609–34318816 · regulatory

ENSR17_5B3XJR · CTCF_binding_site · 34318670–34318691 · regulatory

ENSR17_9HLRB · promoter · 34318947–34319445 · regulatory

· motif · 34314509–34314518 · motif

· motif · 34314509–34314518 · motif

· motif · 34318295–34318304 · motif

· motif · 34318295–34318304 · motif

· motif · 34318672–34318688 · motif

· motif · 34319328–34319342 · motif

· motif · 34319328–34319342 · motif

· motif · 34319335–34319346 · motif

來源列出 IFNG(IFN-gamma)、mitogens 與 IL1(interleukin-1)為 CCL8 的調控因素;但未提供調控方向、作用條件或具體機制,因此無法進一步判定這些因素如何改變其表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:99 aa

1 aa99 aa訊號胜肽
依 P80075 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL8 屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其蛋白質長度為 99 個胺基酸,序列第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號序列。來源未提供其他結構域或功能區域註解。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1ESR…

PDB · 1ESR

X-ray · 2.00 A · A=24-99

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL8 被標示為分泌型蛋白質。 來源未提供其在細胞內的定位、定位變化條件或不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MCP-2CCL8CCL2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CCL8 可在單體與同源二聚體形式之間處於平衡。來源未指出其他結合夥伴或更大型複合體,因此此處僅描述其單體與同源二聚體形式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL8 是可吸引單核球、淋巴球、嗜鹼性球與嗜酸性球的趨化因子,並可能參與腫瘤形成相關過程及發炎宿主反應。該蛋白可結合 heparin。加工形式 MCP-2(6-76) 不具單核球趨化活性,卻會抑制趨化作用,對 CCL7 的抑制最明顯,亦作用於 CCL2、CCL5 與 CCL8。含實驗來源
證據與來源

Chemotactic factor that attracts monocytes, lymphocytes, basophils and eosinophils. May play a role in neoplasia and inflammatory host responses. This protein can bind heparin. The processed form MCP-2(6-76) does not show monocyte chemotactic activity, but inhibits the chemotactic effect most predominantly of CCL7, and also of CCL2 and CCL5 and CCL8

PMID 9558113 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CCL8 可呈單體或同源二聚體形式,兩種形式之間處於平衡;來源未進一步說明此平衡的條件或其功能影響。含實驗來源
證據與來源

Monomer or homodimer; in equilibrium

PMID 8898111 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

調控來源列出 IFNG(IFN-gamma)、mitogens 與 IL1(interleukin-1)為 CCL8 的調控因素,但沒有提供調控方向、作用條件或相關機制。資料庫紀錄
證據與來源

By IFNG/IFN-gamma, mitogens and IL1/interleukin-1

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000394620 · 862 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGAGGTTGAGAACAACCCAGAAACCTTCACCTCTCATG40
41CTGAAGCTCACACCCTTGCCCTCCAAGATGAAGGTTTCTG80
81CAGCGCTTCTGTGCCTGCTGCTCATGGCAGCCACTTTCAG120
121CCCTCAGGGACTTGCTCAGCCAGATTCAGTTTCCATTCCA160
161ATCACCTGCTGCTTTAACGTGATCAATAGGAAAATTCCTA200
201TCCAGAGGCTGGAGAGCTACACAAGAATCACCAACATCCA240
241ATGTCCCAAGGAAGCTGTGATCTTCAAGACCAAACGGGGC280
281AAGGAGGTCTGTGCTGACCCCAAGGAGAGATGGGTCAGGG320
321ATTCCATGAAGCATCTGGACCAAATATTTCAAAATCTGAA360
361GCCATGAGCCTTCATACATGGACTGAGAGTCAGAGCTTGA400
401AGAAAAGCTTATTTATTTTCCCCAACCTCCCCCAGGTGCA440
441GTGTGACATTATTTTATTATAACATCCACAAAGAGATTAT480
481TTTTAAATAATTTAAAGCATAATATTTCTTAAAAAGTATT520
521TAATTATATTTAAGTTGTTGATGTTTTAACTCTATCTGTC560
561ATACATCCTAGTGAATGTAAAATGCAAAATCCTGGTGATG600
601TGTTTTTTGTTTTTGTTTTCCTGTGAGCTCAACTAAGTTC640
641ACGGCAAAATGTCATTGTTCTCCCTCCTACCTGTCTGTAG680
681TGTTGTGGGGTCCTCCCATGGATCATCAAGGTGAAACACT720
721TTGGTATTCTTTGGCAATCAGTGCTCCTGTAAGTCAAATG760
761TGTGCTTTGTACTGCTGTTGTTGAAATTGATGTTACTGTA800
801TATAACTATGGAATTTTGAAAAAAAATTTCAAAAAGAAAA840
841AAATATATATAATTTAAAACTA862

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。