基因總覽
CCL7 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 C-C motif chemokine ligand 7,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。這種分泌型趨化因子與免疫調節相關;其名稱及家族分類反映它是 CC 趨化因子家族的成員。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000378569 ★ | 34,270,221–34,272,242 | 3 |
| ENST00000394627 | 34,270,221–34,272,078 | 3 |
| ENST00000394630 | 34,270,224–34,272,242 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL7 是一種趨化因子,可吸引單核球、嗜酸性球、嗜鹼性球及 T 細胞移向發炎或感染部位。它與 CCR1、CCR2、CCR3、CCR5 等趨化因子受體結合,協助免疫細胞朝受感染組織移動,參與局部免疫反應。
CCL7 與 CCR2 的作用也涉及單核球從骨髓釋放至血液,有助維持單核球恆定。被募集至發炎或受傷組織的單核球,之後可分化為巨噬細胞或樹突細胞;這些細胞對免疫防禦及組織修復具有重要作用。
在巨噬細胞中,CCL7 經由 CCR1 促進 NF-kappa-B 活化,並與巨噬細胞極化及發炎因子釋放相關。另在三叉神經節神經元中,CCL7 可經由 CCR2 和 CCR3 活化 ERK、提高神經元興奮性;此作用有助於維持三叉神經病理性疼痛。
CCL7 也會調節皮膚的早期免疫反應,來源描述其作用可防止病原體散播,同時維持皮膚免疫控制。這些作用顯示 CCL7 參與不同組織中的免疫細胞募集與反應調節;其影響依所涉細胞及受體而異。
Promoter 與基因調控
>CCL7 ENST00000378569 GRCh38 chr17:34269221-34270321 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTACTTGGAAAAATATTTTCACAGCTCATTAGATGTTTTAGAAACACAGTATTTTAAGATCTTGATATG CTGTGCAGTTCCGATAGCCTATAAAACAAATAGTGGTTTTAAAACATATCCTCAAATTATTTTACACTCT TCCCATTAAGAGGTATGACTATGTTCCCTAACCTTGCACCTGGGATCCTTAAGCCATCATGCAAAATATC TAGCCATGTGGAGGGACCACTGGAAAGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAC AGAGAGAGAGAGAGACACCTGAGAAATTCCATCTGGTCCAACTGCTGGCTGTTGAAGTCCTCCCAGCCCA GACCCCAGACACTGAATGAAGGCCTTGTGATATAGTCAAGAGCAAAAAAACCCAGAAGATTGTTATTGTT TTAAGTCACTGTTTTCAGATAGATTGCTATGCAGCAATAGATTATTGAAATAGACACTACAATTTTAGGT ACTATTATTCTAAGAATATTGAATTTTATTTTTCTGCTAATGTTCTATTATTTTACTTTTCTCTGGGTTT TAGAAAGCCACCAGGATTTAAGACAGTGAAGAATCTTTGAGTCCTTTGTAGAGTTGAACCAAAGTTTGAA TGTCTCTTTGTGGACTCGTGTCCTAGGGATACCACTCCAAAGGGAAAAGGGGAATATCCCTTACATATCT TTGACTTTGGTATCCCTGATTCCTTCCTTTTTCTATAGAATGTGTCTCATTTCAGAGAAACTGGTCTCTT GATAATAGCCATAGATTACATACTGTGGTCTTCCTCTACATAGACCCTACCTCACCTACCACTCCTGGTC TTAGCTGAAAAACAGGCTAGCCTCGACTCATACTGTCATTTCCTATCCTCCCACTGAAGTGCACTGGCTC AGCAGATTTATTACTCCATAGATTTATTACTCCATTCTATGATTCATCCTCTCTGCTTCCTATAAAAGGC AGAGACAGAGCTTCCAGAGGAGCAGAGGGGCTGAGACCAAACCAGAAACCTCCAATTCTCATGTGGAAGC CCATGCCCTCACCCTCCAACATGAAAGCCTCTGCAGCACTTCTGTGTCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL7_1 ↗ | 17:34,270,221 | 正股 | 34,270,172–34,270,231 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_8327J8 · promoter · 34270039–34270234 · regulatory
· motif · 34270128–34270139 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:99 aa
CCL7 蛋白質長 99 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 23 位胺基酸為訊號胜肽區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL7 的定位註記為分泌型。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q2F862Q2F862 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNFAIP6P98066 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CCL7 以單體形式存在,並與 TNFAIP6 互作;此互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL7 是參與免疫調節的趨化因子,可吸引單核球、嗜酸性球、嗜鹼性球及 T 細胞前往發炎或感染部位,並透過 CCR1、CCR2、CCR3、CCR5 協助細胞移動。它也參與單核球由骨髓進入血液、巨噬細胞極化與發炎因子釋放,以及三叉神經元興奮性和皮膚早期免疫反應調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic factor that plays an important role in immune regulation. Attracts monocytes, eosinophils, basophils, and T-cells to sites of inflammation or infection. Upon binding to various chemokine receptors including CCR1, CCR2, CCR3, and CCR5, facilitates immune cell migration by guiding them to infected tissues. Interacts with CCR2 to facilitate the release of monocytes from the bone marrow into the bloodstream, maintaining monocyte homeostasis. In turn, monocytes recruited to inflamed or injured tissues can differentiate into macrophages or dendritic cells, which are essential for immune defense and tissue repair. Through CCR1, contributes to macrophage polarization via NF-kappa-B activation which leads to the release of inflammatory factors. In the trigeminal ganglion neurons, activates ERK via CCR2 and CCR3 to enhance neuronal excitability, which contributes to the maintenance of trigeminal neuropathic pain. Additionally, modulates the early immune response in the skin, preventing pathogen dissemination while maintaining cutaneous immune control PMID 10477718 ↗ · PMID 38417634 ↗ · PMID 9364936 ↗ |
| 交互作用 | CCL7 以單體形式存在,並與 TNFAIP6 互作;此互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCAGAGGGGCTGAGACCAAACCAGAAACCTCCAATTCTC40ATGTGGAAGCCCATGCCCTCACCCTCCAACATGAAAGCCT80CTGCAGCACTTCTGTGTCTGCTGCTCACAGCAGCTGCTTT120CAGCCCCCAGGGGCTTGCTCAGCCAGTTGGGATTAATACT160TCAACTACCTGCTGCTACAGATTTATCAATAAGAAAATCC200CTAAGCAGAGGCTGGAGAGCTACAGAAGGACCACCAGTAG240CCACTGTCCCCGGGAAGCTGTAATCTTCAAGACCAAACTG280GACAAGGAGATCTGTGCTGACCCCACACAGAAGTGGGTCC320AGGACTTTATGAAGCACCTGGACAAGAAAACCCAAACTCC360AAAGCTTTGAACATTCATGACTGAACTGAAAACAAGCCAT400GACTTGAGAAACAAATAATTTGTATACCCTGTCCTTTCTC440AGAGTGGTTCTGAGATTATTTTAATCTAATTCTAAGGAAT480ATGAGCTTTATGTAATAATGTGAATCATGGTTTTTCTTAG520TAGATTTTAAAAGTTATTAATATTTTAATTTAATCTTCCA560TGGATTTTGGTGGGTTTTGAACATAAAGCCTTGGATGTAT600ATGTCATCTCAGTGCTGTAAAAACTGTGGGATGCTCCTCC640CTTCTCTACCTCATGGGGGTATTGTATAAGTCCTTGCAAG680AATCAGTGCAAAGATTTGCTTTAATTGTTAAGATATGATG720TCCCTATGGAAGCATATTGTTATTATATAATTACATATTT760GCATATGTATGACTCCCAAATTTTCACATAAAATAGATTT800TTGTATAACA810cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。