演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL7MCP-3

C-C motif chemokine ligand 7

CCL7 編碼一種分泌型趨化因子,參與免疫調節,能引導多類免疫細胞移向發炎或感染部位。

Homo sapiens17q12UniProt P80098
OFFICIAL SYMBOL
CCL7
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P80098
PDB / ALPHAFOLD
1BO0
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL7 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 C-C motif chemokine ligand 7,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。這種分泌型趨化因子與免疫調節相關;其名稱及家族分類反映它是 CC 趨化因子家族的成員。

Official symbol
CCL7
Gene name
C-C motif chemokine ligand 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10634
UniProt
P80098
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MCP-3NC28FICMARCMCP3SCYA6SCYA7

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL7pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:34,270,221–34,272,242
Gene span
2,022 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000378569 ★34,270,221–34,272,2423
ENST0000039462734,270,221–34,272,0783
ENST0000039463034,270,224–34,272,2422

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL7 是一種趨化因子,可吸引單核球、嗜酸性球、嗜鹼性球及 T 細胞移向發炎或感染部位。它與 CCR1、CCR2、CCR3、CCR5 等趨化因子受體結合,協助免疫細胞朝受感染組織移動,參與局部免疫反應。

CCL7 與 CCR2 的作用也涉及單核球從骨髓釋放至血液,有助維持單核球恆定。被募集至發炎或受傷組織的單核球,之後可分化為巨噬細胞或樹突細胞;這些細胞對免疫防禦及組織修復具有重要作用。

在巨噬細胞中,CCL7 經由 CCR1 促進 NF-kappa-B 活化,並與巨噬細胞極化及發炎因子釋放相關。另在三叉神經節神經元中,CCL7 可經由 CCR2 和 CCR3 活化 ERK、提高神經元興奮性;此作用有助於維持三叉神經病理性疼痛。

CCL7 也會調節皮膚的早期免疫反應,來源描述其作用可防止病原體散播,同時維持皮膚免疫控制。這些作用顯示 CCL7 參與不同組織中的免疫細胞募集與反應調節;其影響依所涉細胞及受體而異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34270221 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL7 ENST00000378569 GRCh38 chr17:34269221-34270321 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTACTTGGAAAAATATTTTCACAGCTCATTAGATGTTTTAGAAACACAGTATTTTAAGATCTTGATATG
CTGTGCAGTTCCGATAGCCTATAAAACAAATAGTGGTTTTAAAACATATCCTCAAATTATTTTACACTCT
TCCCATTAAGAGGTATGACTATGTTCCCTAACCTTGCACCTGGGATCCTTAAGCCATCATGCAAAATATC
TAGCCATGTGGAGGGACCACTGGAAAGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAC
AGAGAGAGAGAGAGACACCTGAGAAATTCCATCTGGTCCAACTGCTGGCTGTTGAAGTCCTCCCAGCCCA
GACCCCAGACACTGAATGAAGGCCTTGTGATATAGTCAAGAGCAAAAAAACCCAGAAGATTGTTATTGTT
TTAAGTCACTGTTTTCAGATAGATTGCTATGCAGCAATAGATTATTGAAATAGACACTACAATTTTAGGT
ACTATTATTCTAAGAATATTGAATTTTATTTTTCTGCTAATGTTCTATTATTTTACTTTTCTCTGGGTTT
TAGAAAGCCACCAGGATTTAAGACAGTGAAGAATCTTTGAGTCCTTTGTAGAGTTGAACCAAAGTTTGAA
TGTCTCTTTGTGGACTCGTGTCCTAGGGATACCACTCCAAAGGGAAAAGGGGAATATCCCTTACATATCT
TTGACTTTGGTATCCCTGATTCCTTCCTTTTTCTATAGAATGTGTCTCATTTCAGAGAAACTGGTCTCTT
GATAATAGCCATAGATTACATACTGTGGTCTTCCTCTACATAGACCCTACCTCACCTACCACTCCTGGTC
TTAGCTGAAAAACAGGCTAGCCTCGACTCATACTGTCATTTCCTATCCTCCCACTGAAGTGCACTGGCTC
AGCAGATTTATTACTCCATAGATTTATTACTCCATTCTATGATTCATCCTCTCTGCTTCCTATAAAAGGC
AGAGACAGAGCTTCCAGAGGAGCAGAGGGGCTGAGACCAAACCAGAAACCTCCAATTCTCATGTGGAAGC
CCATGCCCTCACCCTCCAACATGAAAGCCTCTGCAGCACTTCTGTGTCTGC
CCL7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL7_1 ↗17:34,270,221正股34,270,172–34,270,231

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_8327J8 · promoter · 34270039–34270234 · regulatory

· motif · 34270128–34270139 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:99 aa

1 aa99 aa訊號胜肽
依 P80098 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL7 蛋白質長 99 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 23 位胺基酸為訊號胜肽區段。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1BO0…

PDB · 1BO0

NMR · - · A=24-99

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL7 的定位註記為分泌型。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MCP-3CCL7UBQLN1UBQLN2Q2F862TNFAIP6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CCL7 以單體形式存在,並與 TNFAIP6 互作;此互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL7 是參與免疫調節的趨化因子,可吸引單核球、嗜酸性球、嗜鹼性球及 T 細胞前往發炎或感染部位,並透過 CCR1、CCR2、CCR3、CCR5 協助細胞移動。它也參與單核球由骨髓進入血液、巨噬細胞極化與發炎因子釋放,以及三叉神經元興奮性和皮膚早期免疫反應調節。含實驗來源
證據與來源

Chemotactic factor that plays an important role in immune regulation. Attracts monocytes, eosinophils, basophils, and T-cells to sites of inflammation or infection. Upon binding to various chemokine receptors including CCR1, CCR2, CCR3, and CCR5, facilitates immune cell migration by guiding them to infected tissues. Interacts with CCR2 to facilitate the release of monocytes from the bone marrow into the bloodstream, maintaining monocyte homeostasis. In turn, monocytes recruited to inflamed or injured tissues can differentiate into macrophages or dendritic cells, which are essential for immune defense and tissue repair. Through CCR1, contributes to macrophage polarization via NF-kappa-B activation which leads to the release of inflammatory factors. In the trigeminal ganglion neurons, activates ERK via CCR2 and CCR3 to enhance neuronal excitability, which contributes to the maintenance of trigeminal neuropathic pain. Additionally, modulates the early immune response in the skin, preventing pathogen dissemination while maintaining cutaneous immune control

PMID 10477718 ↗ · PMID 38417634 ↗ · PMID 9364936 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CCL7 以單體形式存在,並與 TNFAIP6 互作;此互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Interacts with TNFAIP6 (via Link domain)

PMID 27044744 ↗ · PMID 8898111 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000378569 · 810 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAGAGGGGCTGAGACCAAACCAGAAACCTCCAATTCTC40
41ATGTGGAAGCCCATGCCCTCACCCTCCAACATGAAAGCCT80
81CTGCAGCACTTCTGTGTCTGCTGCTCACAGCAGCTGCTTT120
121CAGCCCCCAGGGGCTTGCTCAGCCAGTTGGGATTAATACT160
161TCAACTACCTGCTGCTACAGATTTATCAATAAGAAAATCC200
201CTAAGCAGAGGCTGGAGAGCTACAGAAGGACCACCAGTAG240
241CCACTGTCCCCGGGAAGCTGTAATCTTCAAGACCAAACTG280
281GACAAGGAGATCTGTGCTGACCCCACACAGAAGTGGGTCC320
321AGGACTTTATGAAGCACCTGGACAAGAAAACCCAAACTCC360
361AAAGCTTTGAACATTCATGACTGAACTGAAAACAAGCCAT400
401GACTTGAGAAACAAATAATTTGTATACCCTGTCCTTTCTC440
441AGAGTGGTTCTGAGATTATTTTAATCTAATTCTAAGGAAT480
481ATGAGCTTTATGTAATAATGTGAATCATGGTTTTTCTTAG520
521TAGATTTTAAAAGTTATTAATATTTTAATTTAATCTTCCA560
561TGGATTTTGGTGGGTTTTGAACATAAAGCCTTGGATGTAT600
601ATGTCATCTCAGTGCTGTAAAAACTGTGGGATGCTCCTCC640
641CTTCTCTACCTCATGGGGGTATTGTATAAGTCCTTGCAAG680
681AATCAGTGCAAAGATTTGCTTTAATTGTTAAGATATGATG720
721TCCCTATGGAAGCATATTGTTATTATATAATTACATATTT760
761GCATATGTATGACTCCCAAATTTTCACATAAAATAGATTT800
801TTGTATAACA810

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。