基因總覽
CCL5（C-C motif chemokine ligand 5）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。這種分泌型趨化因子與免疫細胞的移動及活化相關，也具有來源所述的抗病毒作用。蛋白質全長 91 個胺基酸，N 端包含 23 個胺基酸的訊號序列；其作用與加工後形式相關，不同形式的活性並不相同。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000605140 ★ | 35,871,491–35,880,360 | 3 |
| ENST00000651122 | 35,871,491–35,880,368 | 4 |
| ENST00000605509 | 35,871,491–35,880,793 | 4 |
| ENST00001006764 | 35,871,491–35,880,368 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL5 可作為趨化因子，吸引血液中的單核球、記憶型 T 輔助細胞與嗜酸性球。它也會促使嗜鹼性球釋放組織胺，並活化嗜酸性球。來源指出，CCL5 可能活化多種趨化因子受體，包括 CCR1、CCR3、CCR4 與 CCR5；其中「可能」表示受體活化的描述具有不確定性。
CCL5 是 CD8+ T 細胞產生的主要 HIV 抑制因子之一。重組 RANTES 蛋白可依劑量抑制不同株的 HIV-1、HIV-2 與 simian immunodeficiency virus（SIV），顯示其抗病毒作用會隨蛋白質劑量而變化。這些描述涵蓋不同病毒類型與病毒株，來源未進一步限定其作用條件。
蛋白質加工形式會影響 CCL5 的活性。RANTES(3-68) 可作為天然趨化作用抑制因子，且抑制 HIV-1 感染的效力高於其他所述形式；相較之下，RANTES(4-68) 的趨化活性與 HIV 抑制活性，均低於 RANTES(1-68) 和 RANTES(3-68)。因此，不能將不同加工形式的趨化或抗病毒作用視為相同。
CCL5 也可能是 G 蛋白偶聯受體 GPR75 的促效劑，活化該受體後可刺激肌醇三磷酸生成與鈣離子動員。CCL5 與 GPR75 可能透過涉及 PI3、Akt 與 MAP kinases 的下游訊息傳遞路徑參與神經元存活；此外，CCL5 活化 GPR75 也可能參與胰島細胞的胰島素分泌。這些神經元與胰島細胞相關作用在來源中均以「可能」描述，應保留其推論性質。
Promoter 與基因調控
>CCL5 ENST00000605140 GRCh38 chr17:35880260-35881360 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCTTGTGCAACTGAAGAACATGGAAAAAATGATCCCTAAAGTCCTTTGAAGCTTTCATATTCTGTAACT TTTGTGCCCAAGAAGGCCTTACAGTGAGATGGGATCCCAGTATTTATTGAGTTTCCTCATTCATAAAATG GGGATAATAATAGTAAATGAGTTGACACGCGCTAGGACAGTGGAATAGTGGCTGGCACAGATAAGCCCTC GGTAAATGGTAGCCAATAATGATAGAGTATGCTGTAAGATATCTTTCTCTCCCTCTGCTTCTCAACAAGT CTCTAATCAATTATTCCACTTTATAAACAAGGAAATAGAACTCAAAGACATTAAGCACTTTTCCCAAAGG TCGCTTAGCAAGTAAATGGGAGAGACCCTATGACCAGGATGAAAGCAAGAAATTCCCACAAGAGGACTCA TTCCAACTCATATCTTGTGAAAAGGTTCCCAATGCCCAGCTCAGATCAACTGCCTCAATTTACAGTGTGA GTGTGCTCACCTCCTTTGGGGACTGTATATCCAGAGGACCCTCCTCAATAAAACACTTTATAAATAACAT CCTTCCATGGATGAGGGAAAGGAGGTAAGATCTGTAATGAATAAGCAGGAACTTTGAAGACTCAGTGACT CAGTGAGTAATAAAGACTCAGTGACTTCTGATCCTGTCCTAACTGCCACTCCTTGTTGTCCCCAAGAAAG CGGCTTCCTGCTCTCTGAGGAGGACCCCTTCCCTGGAAGGTAAAACTAAGGATGTCAGCAGAGAAATTTT TCCACCATTGGTGCTTGGTCAAAGAGGAAACTGATGAGCTCACTCTAGATGAGAGAGCAGTGAGGGAGAG ACAGAGACTCGAATTTCCGGAGGCTATTTCAGTTTTCTTTTCCGTTTTGTGCAATTTCACTTATGATACC GGCCAATGCTTGGTTGCTATTTTGGAAACTCCCCTTAGGGGATGCCCCTCAACTGGCCCTATAAAGGGCC AGCCTGAGCTGCAGAGGATTCCTGCAGAGGATCAAGACAGCACGTGGACCTCGCACAGCCTCTCCCACAG GTACCATGAAGGTCTCCGCGGCAGCCCTCGCTGTCATCCTCATTGCTACTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL5_1 ↗ | 17:35,880,360 | 負股 | 35,880,350–35,880,409 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_744Z3L · promoter · 35879807–35879918 · regulatory
ENSR17_B9593 · promoter · 35880350–35880883 · regulatory
· motif · 35875629–35875641 · motif
· motif · 35875647–35875662 · motif
· motif · 35875803–35875816 · motif
· motif · 35877240–35877252 · motif
· motif · 35877812–35877824 · motif
· motif · 35877815–35877822 · motif
· motif · 35877816–35877829 · motif
· motif · 35877819–35877831 · motif
· motif · 35877822–35877829 · motif
· motif · 35877822–35877837 · motif
· motif · 35877867–35877879 · motif
· motif · 35878059–35878074 · motif
· motif · 35880333–35880342 · motif
· motif · 35880333–35880342 · motif
· motif · 35880752–35880765 · motif
· motif · 35880752–35880765 · motif
CCL5 的調控資料指出，mitogens 與其相關；來源未提供更具體的調控條件或作用方式。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：91 aa
CCL5 蛋白質長 91 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其第 1 至第 23 個胺基酸為訊號序列，與蛋白質分泌特徵相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL5 的定位註記為分泌型；來源未提供其他定位位置或不同條件下的定位變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- CCL11P51671 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL13Q99616 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCL16O15467 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL17Q92583 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- CCL2P13500 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL20P78556 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL24O00175 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCL25O15444 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CCL27Q9Y4X3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL28Q9NRJ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCR1P32246 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCR5P51681 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CXCL10P02778 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- CXCL14O95715 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL17Q6UXB2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL2P19875 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL6P80162 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 4 筆來源紀錄
- PPBPP02775 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- XCL1P47992 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
CCL5 可與其他趨化因子形成同源或異源寡聚體；此外，來源記載其與 brown dog tick evasin-4 互作。資料未進一步說明這些互作是否形成特定複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL5 可吸引血液單核球、記憶型 T 輔助細胞與嗜酸性球，促使嗜鹼性球釋放組織胺並活化嗜酸性球，也可能活化 CCR1、CCR3、CCR4、CCR5。CD8+ T 細胞產生的 CCL5 可抑制多種 HIV 與 SIV；RANTES(3-68) 抑制趨化並較能抑制 HIV-1 感染，RANTES(4-68) 的趨化及抗 HIV 活性則較低。CCL5 也可能透過 GPR75 參與神經元存活與胰島素分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemoattractant for blood monocytes, memory T-helper cells and eosinophils. Causes the release of histamine from basophils and activates eosinophils. May activate several chemokine receptors including CCR1, CCR3, CCR4 and CCR5. One of the major HIV-suppressive factors produced by CD8+ T-cells. Recombinant RANTES protein induces a dose-dependent inhibition of different strains of HIV-1, HIV-2, and simian immunodeficiency virus (SIV). The processed form RANTES(3-68) acts as a natural chemotaxis inhibitor and is a more potent inhibitor of HIV-1-infection. The second processed form RANTES(4-68) exhibits reduced chemotactic and HIV-suppressive activity compared with RANTES(1-68) and RANTES(3-68). May also be an agonist of the G protein-coupled receptor GPR75, stimulating inositol trisphosphate production and calcium mobilization through its activation. Together with GPR75, may play a role in neuron survival through activation of a downstream signaling pathway involving the PI3, Akt and MAP kinases. By activating GPR75 may also play a role in insulin secretion by islet cells PMID 1380064 ↗ · PMID 15923218 ↗ · PMID 16791620 ↗ · PMID 17001303 ↗ · PMID 23979485 ↗ · PMID 8525373 ↗ · PMID 9516414 ↗ |
| 交互作用 | CCL5 可與其他趨化因子形成同源或異源寡聚體，並與 brown dog tick evasin-4 互作；來源未提供這些互作的進一步功能說明。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homo and heterooligomers with other chemokines. Interacts with the brown dog tick evasin-4 PMID 32817341 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | 來源記載 CCL5 與 mitogens 有關，但未提供更具體的調控條件或作用方式。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CCTGCAGAGGATCAAGACAGCACGTGGACCTCGCACAGCC40TCTCCCACAGGTACCATGAAGGTCTCCGCGGCAGCCCTCG80CTGTCATCCTCATTGCTACTGCCCTCTGCGCTCCTGCATC120TGCCTCCCCATATTCCTCGGACACCACACCCTGCTGCTTT160GCCTACATTGCCCGCCCACTGCCCCGTGCCCACATCAAGG200AGTATTTCTACACCAGTGGCAAGTGCTCCAACCCAGCAGT240CGTCTTTGTCACCCGAAAGAACCGCCAAGTGTGTGCCAAC280CCAGAGAAGAAATGGGTTCGGGAGTACATCAACTCTTTGG320AGATGAGCTAGGATGGAGAGTCCTTGAACCTGAACTTACA360CAAATTTGCCTGTTTCTGCTTGCTCTTGTCCTAGCTTGGG400AGGCTTCCCCTCACTATCCTACCCCACCCGCTCCTTGAAG440GGCCCAGATTCTACCACACAGCAGCAGTTACAAAAACCTT480CCCCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC520ACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGG560AGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCATCT600CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTAGCGGG640CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA680ATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAG720ATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC760TCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAAAAT800TAGCCGGGCGTGGTGGCCCACGCCTGTAATCCCAGCTACT840CGGGAGGCTAAGGCAGGAAAATTGTTTGAACCCAGGAGGT880GGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTTCACTCCAG920CCTGGGTGACAAAGTGAGACTCCGTCACAACAACAACAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。