基因總覽
CCL4L1 是位於人類 17 號染色體、屬於蛋白質編碼基因的基因,其產物名稱為 C-C motif chemokine ligand 4 like 1。這種蛋白質屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種趨化因子。蛋白質長 92 個胺基酸,序列 N 端具有 23 個胺基酸的訊號序列。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000634014 ★ | 266,611–268,581 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL4L1 的產物是一種趨化因子,可促使表現 CCR5 或 CCR1 的細胞發生趨化,也就是朝特定方向移動。來源描述了受體表現與細胞移動之間的關聯,但未進一步指出涉及哪些細胞類型、移動方向或分子步驟。
此外,CCL4L1 可抑制表現 CCR5 的周邊血液單核球中的 HIV 複製。此作用描述限定於這類單核球,並未提供抑制幅度、作用機制或是否適用於其他細胞的資訊,因此不宜延伸為對所有細胞或情境均有相同效果。
Promoter 與基因調控
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:92 aa
CCL4L1 蛋白長 92 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其 N 端第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL4L1 的定位註記為分泌。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
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CCL4L1 與 CCR5 有互作註記;此資料指出兩者互作,但未提供互作形式或是否形成複合體的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL4L1 是一種趨化因子,可誘導表現 CCR5 或 CCR1 的細胞發生趨化;此外,它能抑制表現 CCR5 的周邊血液單核球中的 HIV 複製。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemokine that induces chemotaxis of cells expressing CCR5 or CCR1. Inhibits HIV replication in peripheral blood monocytes that express CCR5 PMID 15240137 ↗ |
| 交互作用 | CCL4L1 與 CCR5 有互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CCCTGGGGAAGAGAAGCTGAGAGGAACTCCTCACTCAGCT40AGCTTCAGGAGCCATGACATCATCTCTACCATGGAAATTC80CACTCACTCTCCTGTGCCCCCACATTTGTCCTAGGCCTCA120GAGTCCCTATAAAGAGAGATTCCCAACTCAGTATCAGCAC160AGGACACAGCTAGGTTCTGAAGCTTCTGAGTTCTGCAGCC200TCACCTCTGAGAAAACCTCTTTGCCACCAATACCATGAAG240CTCTGCGTGACTGTCCTGTCTCTCCTCGTGCTAGTAGCTG280CCTTCTGCTCTCTAGCACTCTCAGCACCAATGGGCTCAGA320CCCTCCCACCGCCTGCTGCTTTTCTTACACCGCGAGGAAG360CTTCCTCGCAACTTTGTGGTAGATTACTATGAGACCAGCA400GCCTCTGCTCCCAGCCAGCTGTGGTATTCCAAACCAAAAG440AGGCAAGCAAGTCTGCGCTGACCCCAGTGAGTCCTGGGTC480CAGGAGTACGTGTATGACCTGGAACTGAACTGAGCTGCTC520AGAGACAGGAAGTCTTCAGGGAAGGTCACCTGAGCCTGGA560TGCTTCTCCATGAGCCGCATCTCCTCCATACTCAGGACTC600CTCTCCGCAGTTCCTGTCTCTTCTCTTAATGTAATCTCTT640TTATGTGCTGTATTATTGTATTAGGTGTTATTTCCATTAT680TTATATTAGTTTAGCCAAAGGATAAGTGTCCCCTATGGGG720ATGGTCCACTCTCACTCTTTCTCTGCTGTTGCAAATACAT760GGATAACACCGTTAATTCCATGTGTTTTCATAATAAAACT800TTAAAATAAAATGCAAACAGTT822cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。