演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL4L1AT744.2

C-C motif chemokine ligand 4 like 1

CCL4L1 編碼 C-C motif chemokine ligand 4 like 1,屬於 CC 趨化因子家族,可誘導表現 CCR5 或 CCR1 的細胞移動,並抑制特定單核球中的 HIV 複製。

Homo sapiens17q12 alternate reference locusUniProt Q8NHW4
OFFICIAL SYMBOL
CCL4L1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q8NHW4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL4L1 是位於人類 17 號染色體、屬於蛋白質編碼基因的基因,其產物名稱為 C-C motif chemokine ligand 4 like 1。這種蛋白質屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種趨化因子。蛋白質長 92 個胺基酸,序列 N 端具有 23 個胺基酸的訊號序列。

Official symbol
CCL4L1
Gene name
C-C motif chemokine ligand 4 like 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10631
UniProt
Q8NHW4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
AT744.2LAG-1SCYA4LCCL4L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome HSCHR17_10_CTG417q12 alternate reference locus
chrHSCHR17_10_CTG4 · 325,800 bp · GRCh38CCL4L11 bp325,800 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrHSCHR17_10_CTG4:266,611–268,581
Gene span
1,971 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000634014 ★266,611–268,5813

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL4L1 的產物是一種趨化因子,可促使表現 CCR5 或 CCR1 的細胞發生趨化,也就是朝特定方向移動。來源描述了受體表現與細胞移動之間的關聯,但未進一步指出涉及哪些細胞類型、移動方向或分子步驟。

此外,CCL4L1 可抑制表現 CCR5 的周邊血液單核球中的 HIV 複製。此作用描述限定於這類單核球,並未提供抑制幅度、作用機制或是否適用於其他細胞的資訊,因此不宜延伸為對所有細胞或情境均有相同效果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 266611 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
CCL4L1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 TSS 尚未取得;請在後台同步此基因來源。
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:92 aa

1 aa92 aa訊號胜肽
依 Q8NHW4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL4L1 蛋白長 92 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其 N 端第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號序列。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8NHW4…

AlphaFold · Q8NHW4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL4L1 的定位註記為分泌。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 33 個夥伴 · 最多顯示 50 個
AT744.2CCL4L1AQP6ARL13BCATSPER4CERS4CLRN1COMTCOQ9CPLX4CREB3L1EBPELOVL4ERVFRD-1FAM209AGET1GPR152GPR42ITM2CJAGN1MFSD14BMFSD5MRM1REEP4RETREG3SGPL1SLC10A2SLC18A1SLC30A2SLC7A1SLC7A14SSMEM1TMEM179BTMEM51VSIR
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CCL4L1 與 CCR5 有互作註記;此資料指出兩者互作,但未提供互作形式或是否形成複合體的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL4L1 是一種趨化因子,可誘導表現 CCR5 或 CCR1 的細胞發生趨化;此外,它能抑制表現 CCR5 的周邊血液單核球中的 HIV 複製。含實驗來源
證據與來源

Chemokine that induces chemotaxis of cells expressing CCR5 or CCR1. Inhibits HIV replication in peripheral blood monocytes that express CCR5

PMID 15240137 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CCL4L1 與 CCR5 有互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CCR5

PMID 15240137 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000634014 · 822 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CCCTGGGGAAGAGAAGCTGAGAGGAACTCCTCACTCAGCT40
41AGCTTCAGGAGCCATGACATCATCTCTACCATGGAAATTC80
81CACTCACTCTCCTGTGCCCCCACATTTGTCCTAGGCCTCA120
121GAGTCCCTATAAAGAGAGATTCCCAACTCAGTATCAGCAC160
161AGGACACAGCTAGGTTCTGAAGCTTCTGAGTTCTGCAGCC200
201TCACCTCTGAGAAAACCTCTTTGCCACCAATACCATGAAG240
241CTCTGCGTGACTGTCCTGTCTCTCCTCGTGCTAGTAGCTG280
281CCTTCTGCTCTCTAGCACTCTCAGCACCAATGGGCTCAGA320
321CCCTCCCACCGCCTGCTGCTTTTCTTACACCGCGAGGAAG360
361CTTCCTCGCAACTTTGTGGTAGATTACTATGAGACCAGCA400
401GCCTCTGCTCCCAGCCAGCTGTGGTATTCCAAACCAAAAG440
441AGGCAAGCAAGTCTGCGCTGACCCCAGTGAGTCCTGGGTC480
481CAGGAGTACGTGTATGACCTGGAACTGAACTGAGCTGCTC520
521AGAGACAGGAAGTCTTCAGGGAAGGTCACCTGAGCCTGGA560
561TGCTTCTCCATGAGCCGCATCTCCTCCATACTCAGGACTC600
601CTCTCCGCAGTTCCTGTCTCTTCTCTTAATGTAATCTCTT640
641TTATGTGCTGTATTATTGTATTAGGTGTTATTTCCATTAT680
681TTATATTAGTTTAGCCAAAGGATAAGTGTCCCCTATGGGG720
721ATGGTCCACTCTCACTCTTTCTCTGCTGTTGCAAATACAT760
761GGATAACACCGTTAATTCCATGTGTTTTCATAATAAAACT800
801TTAAAATAAAATGCAAACAGTT822

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。