演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL3L1G0S19-2

C-C motif chemokine ligand 3 like 1

CCL3L1 編碼 C-C motif chemokine ligand 3 like 1,屬於 CC 趨化因子家族,可促使淋巴球與單核球移動。

Homo sapiens17q12 alternate reference locusUniProt P16619
OFFICIAL SYMBOL
CCL3L1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P16619
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL3L1 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 3 like 1。其產物屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種 CC 趨化因子。來源指出,此蛋白質可作用於特定趨化因子受體,並具有促進淋巴球與單核球移動的活性;加工後的 LD78-beta(3-70) 形式也保有受體配體作用。這些特徵構成此基因產物的基本分子與家族定位。

Official symbol
CCL3L1
Gene name
C-C motif chemokine ligand 3 like 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10628
UniProt
P16619
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
G0S19-2LD78BETAD17S1718SCYA3LSCYA3L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome HSCHR17_10_CTG417q12 alternate reference locus
chrHSCHR17_10_CTG4 · 325,800 bp · GRCh38CCL3L11 bp325,800 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrHSCHR17_10_CTG4:250,577–252,466
Gene span
1,890 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000615140 ★250,577–252,4663

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL3L1 的產物具有趨化活性,可促使淋巴球與單核球移動。它是 CCR1、CCR3 與 CCR5 的配體,並能抑制 HIV-1 感染。

加工形式 LD78-beta(3-70) 同樣可結合 CCR1、CCR3 與 CCR5,且其趨化活性比未加工形式高 20 至 30 倍。此加工形式也被描述為 HIV-1 感染的強效抑制因子。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 252466 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
CCL3L1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 TSS 尚未取得;請在後台同步此基因來源。
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:93 aa

1 aa93 aa訊號胜肽
依 P16619 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL3L1 蛋白質長 93 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。序列第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號肽。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P16619…

AlphaFold · P16619

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL3L1 蛋白質定位於細胞外的分泌環境。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
G0S19-2CCL3L1MGST2SGTBSLC41A3TMEM179B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL3L1 具有促使淋巴球與單核球移動的趨化活性,並是 CCR1、CCR3 和 CCR5 的配體;它也能抑制 HIV-1 感染。加工形式 LD78-beta(3-70) 的趨化活性提高 20 至 30 倍,且是強效的 HIV-1 感染抑制因子,同時仍可作為上述三種受體的配體。含實驗來源
證據與來源

Chemotactic for lymphocytes and monocytes. Is a ligand for CCR1, CCR3 and CCR5. Is an inhibitor of HIV-1-infection. The processed form LD78-beta(3-70) shows a 20-fold to 30-fold higher chemotactic activity and is a very potent inhibitor of HIV-1-infection. LD78-beta(3-70) is also a ligand for CCR1, CCR3 and CCR5

PMID 10961862 ↗ · PMID 11449371 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000615140 · 784 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGAAGGACGCAGGCAGCAAAGAGTAGTCAGTCCCTTCTTG40
41GCTCTGCTGACACTCGAGCCCACATTCCATCACCTGCTCC80
81CAATCATGCAGGTCTCCACTGCTGCCCTTGCCGTCCTCCT120
121CTGCACCATGGCTCTCTGCAACCAGGTCCTCTCTGCACCA160
161CTTGCTGCTGACACGCCGACCGCCTGCTGCTTCAGCTACA200
201CCTCCCGACAGATTCCACAGAATTTCATAGCTGACTACTT240
241TGAGACGAGCAGCCAGTGCTCCAAGCCCAGTGTCATCTTC280
281CTAACCAAGAGAGGCCGGCAGGTCTGTGCTGACCCCAGTG320
321AGGAGTGGGTCCAGAAATACGTCAGTGACCTGGAGCTGAG360
361TGCCTGAGGGGTCCAGAAGCTTCGAGGCCCAGCGACCTCA400
401GTGGGCCCAGTGGGGAGGAGCAGGAGCCTGAGCCTTGGGA440
441ACATGCGTGTGACCTCTACAGCTACCTCTTCTATGGACTG480
481GTTATTGCCAAACAGCCACACTGTGGGACTCTTCTTAACT520
521TAAATTTTAATTTATTTATACTATTTAGTTTTTATAATTT560
561ATTTTTGATTTCACAGTGTGTTTGTGATTGTTTGCTCTGA600
601GAGTTCCCCCTGTCCCCTCCACCTTCCCTCACAGTGTGTC640
641TGGTGACAACCGAGTGGCTGTCATCGGCCTGTGTAGGCAG680
681TCATGGCACCAAAGCCACCAGACTGACAAATGTGTATCAG720
721ATGCTTTTGTTCAGGGCTGTGATCGGCCTGGGGAAATAAT760
761AAAGATGTTCTTTTAAACGGTAAA784

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。