基因總覽
CCL3L1 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 3 like 1。其產物屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種 CC 趨化因子。來源指出,此蛋白質可作用於特定趨化因子受體,並具有促進淋巴球與單核球移動的活性;加工後的 LD78-beta(3-70) 形式也保有受體配體作用。這些特徵構成此基因產物的基本分子與家族定位。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000615140 ★ | 250,577–252,466 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL3L1 的產物具有趨化活性,可促使淋巴球與單核球移動。它是 CCR1、CCR3 與 CCR5 的配體,並能抑制 HIV-1 感染。
加工形式 LD78-beta(3-70) 同樣可結合 CCR1、CCR3 與 CCR5,且其趨化活性比未加工形式高 20 至 30 倍。此加工形式也被描述為 HIV-1 感染的強效抑制因子。
Promoter 與基因調控
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:93 aa
CCL3L1 蛋白質長 93 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。序列第 1 至 23 個胺基酸被註記為訊號肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL3L1 蛋白質定位於細胞外的分泌環境。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- MGST2Q99735 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC41A3Q96GZ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM179BQ7Z7N9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL3L1 具有促使淋巴球與單核球移動的趨化活性,並是 CCR1、CCR3 和 CCR5 的配體;它也能抑制 HIV-1 感染。加工形式 LD78-beta(3-70) 的趨化活性提高 20 至 30 倍,且是強效的 HIV-1 感染抑制因子,同時仍可作為上述三種受體的配體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic for lymphocytes and monocytes. Is a ligand for CCR1, CCR3 and CCR5. Is an inhibitor of HIV-1-infection. The processed form LD78-beta(3-70) shows a 20-fold to 30-fold higher chemotactic activity and is a very potent inhibitor of HIV-1-infection. LD78-beta(3-70) is also a ligand for CCR1, CCR3 and CCR5 PMID 10961862 ↗ · PMID 11449371 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGACGCAGGCAGCAAAGAGTAGTCAGTCCCTTCTTG40GCTCTGCTGACACTCGAGCCCACATTCCATCACCTGCTCC80CAATCATGCAGGTCTCCACTGCTGCCCTTGCCGTCCTCCT120CTGCACCATGGCTCTCTGCAACCAGGTCCTCTCTGCACCA160CTTGCTGCTGACACGCCGACCGCCTGCTGCTTCAGCTACA200CCTCCCGACAGATTCCACAGAATTTCATAGCTGACTACTT240TGAGACGAGCAGCCAGTGCTCCAAGCCCAGTGTCATCTTC280CTAACCAAGAGAGGCCGGCAGGTCTGTGCTGACCCCAGTG320AGGAGTGGGTCCAGAAATACGTCAGTGACCTGGAGCTGAG360TGCCTGAGGGGTCCAGAAGCTTCGAGGCCCAGCGACCTCA400GTGGGCCCAGTGGGGAGGAGCAGGAGCCTGAGCCTTGGGA440ACATGCGTGTGACCTCTACAGCTACCTCTTCTATGGACTG480GTTATTGCCAAACAGCCACACTGTGGGACTCTTCTTAACT520TAAATTTTAATTTATTTATACTATTTAGTTTTTATAATTT560ATTTTTGATTTCACAGTGTGTTTGTGATTGTTTGCTCTGA600GAGTTCCCCCTGTCCCCTCCACCTTCCCTCACAGTGTGTC640TGGTGACAACCGAGTGGCTGTCATCGGCCTGTGTAGGCAG680TCATGGCACCAAAGCCACCAGACTGACAAATGTGTATCAG720ATGCTTTTGTTCAGGGCTGTGATCGGCCTGGGGAAATAAT760AAAGATGTTCTTTTAAACGGTAAA784cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。