基因總覽
CCL3 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 3，是蛋白質編碼基因。其產物屬於單核因子，具有發炎與促趨化特性；來源將其稱為 MIP-1-alpha，並指出它可與 CCR1、CCR4 和 CCR5 結合。現有資料未提供更多基因或蛋白質的基本結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000613922 ★ | 36,088,256–36,090,143 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL3 的產物 MIP-1-alpha 具有發炎與促趨化特性，並可與 CCR1、CCR4 和 CCR5 結合。這些受體結合資訊說明它能與多種趨化因子受體互動；來源未進一步描述各受體所介導的細胞反應或作用機制。
MIP-1-alpha 也是 CD8+ T 細胞產生的主要 HIV 抑制因子之一。重組 MIP-1-alpha 在不同劑量下，會對多種 HIV-1、HIV-2 及 simian immunodeficiency virus（SIV）菌株產生抑制作用，且抑制程度與劑量相關。這項觀察涵蓋不同病毒類型與菌株，但來源未提供其作用途徑或各菌株的反應差異。
Promoter 與基因調控
>CCL3 ENST00000613922 GRCh38 chr17:36090043-36091143 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTTTTTCCATGCTTAGGGTTGGCAAGGAATATATATATATTTGTACAAATATATATGTGTATATGTACA AATACATGTATATATAGTACAAATATATATATATATTTGTACAATTCTTCAGACTTTGTAGAATTTGTAT AATGTCGTATCTTGCTTTTTTTAACCACTGATGTTATAAGCATATTTATGCCACTTCATTCATTTTAGAG ACTTAATAATAAATGATCTAGTGGATAATTTATCATTCCCTGATGGAGAAAAATTTAGCTTTGTTTATTT TAGAGTTATAAACGATGCTGGGTCAGGTATCTTTATGTTTGAAGATGGCTCCATATTTGGGTTGTTTCCA CAGAACTCTTTCCTAGAAATGCTTTTTCTAGGTTAATGGCTACAGATATTTCTAGGCACCTGACATATTG ACACCCACCTCTAAAGTATTTTTATGATCCACAACTAGCGTTTAACACAGCGCCCTAGTCACTACATGAC TAATAAATAGACAAATGACTGAAACATGACCTCATGCTTTCTATTCCTCCAGCTTTCATTCAGTTCTTTG CCTCTGGGAGGAGGAAGGGTTGTGCAGCCCTCCACAGCATCAGCCCATCAACCCTATCCCTGTGGTTATA GCAGCTGAGGAAGCAGAATTGCAGCTCTGTGGGAAGGAATGGGGCTGGAGAGTTCATGCACAGACCAGTT CTTATGAGAAGGGACTGACTAAGAATAGCCTTGGGTTGACATATACCCCTCTTCACACTCACAGGAGAAA CCATTTCCCTATGAAACTATAACAAGTCATGAGTTGAGAGCTGAGAGTTAGAGAATAGCTCAAAGATGCT ATTCTTGGATATCCTGAGCCCCTGTGGTCACCAGGGACCCTGAGTTGTGCAACTTAGCATGACAGCATCA CTACGCTTAAAAATTTCCCTCCTCACCCCCAGATTCCATTTCCCCATCCGCCAGGGCTGCCTATAAAGAG GAGAGCTGGTTTCAGACTTCAGAAGGACACGGGCAGCAGACAGTGGTCAGTCCTTTCTTGGCTCTGCTGA CACTCGAGCCCACATTCCGTCACCTGCTCAGAATCATGCAGGTCTCCACTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL3_1 ↗ | 17:36,090,143 | 負股 | 36,090,133–36,090,192 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B96CQ · enhancer · 36085748–36086261 · regulatory
ENSR17_9JBQS · promoter · 36090133–36090633 · regulatory
ENSR17_9JBRF · enhancer · 36092258–36092618 · regulatory
ENSR17_833MMB · enhancer · 36094911–36095098 · regulatory
· motif · 36085872–36085881 · motif
· motif · 36085872–36085881 · motif
· motif · 36086229–36086241 · motif
· motif · 36087743–36087758 · motif
· motif · 36088920–36088928 · motif
· motif · 36089038–36089050 · motif
· motif · 36089830–36089841 · motif
· motif · 36090516–36090524 · motif
· motif · 36090621–36090634 · motif
· motif · 36090650–36090658 · motif
· motif · 36090719–36090734 · motif
· motif · 36090801–36090816 · motif
· motif · 36090801–36090816 · motif
· motif · 36094959–36094976 · motif
TPA 或 PHA 可誘導相關表現；來源未提供誘導條件或表現變化幅度的進一步資訊。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：92 aa
CCL3 產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。蛋白質序列長度為 92 個胺基酸，N 端第 1 至 23 位註記為訊號胜肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL3 蛋白質為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- IDEP14735 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q2F862Q2F862 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CCL3 可自我結合；另有 MIP-1-alpha(4-69) 與 MIP-1-beta(3-69) 形成異源二聚體的記載。CCL3 也與 CCR1 互作；此處記載的是受體互作，未說明其是否構成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MIP-1-alpha 是具有發炎與促趨化特性的單核因子，可結合 CCR1、CCR4 和 CCR5，也是 CD8+ T 細胞產生的主要 HIV 抑制因子之一。重組 MIP-1-alpha 對不同 HIV-1、HIV-2 與 SIV 菌株具有隨劑量增加而增強的抑制作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monokine with inflammatory and chemokinetic properties. Binds to CCR1, CCR4 and CCR5. One of the major HIV-suppressive factors produced by CD8+ T-cells. Recombinant MIP-1-alpha induces a dose-dependent inhibition of different strains of HIV-1, HIV-2, and simian immunodeficiency virus (SIV) PMID 15905581 ↗ · PMID 8525373 ↗ |
| 交互作用 | CCL3 可自我結合，也有由 MIP-1-alpha(4-69) 與 MIP-1-beta(3-69) 形成異源二聚體的記載；此外，CCL3 與 CCR1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Self-associates. Also heterodimer of MIP-1-alpha(4-69) and MIP-1-beta(3-69). Interacts with CCR1 PMID 12070155 ↗ · PMID 15905581 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | By TPA or PHA (TPA = 12-O-tetradecanoyl phorbol-13 acetate (tumor promoter); PHA = phytohemagglutinin (T-cell mitogen)) | 資料庫紀錄 | 證據與來源By TPA or PHA (TPA = 12-O-tetradecanoyl phorbol-13 acetate (tumor promoter); PHA = phytohemagglutinin (T-cell mitogen)) |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGACACGGGCAGCAGACAGTGGTCAGTCCTTTCTTG40GCTCTGCTGACACTCGAGCCCACATTCCGTCACCTGCTCA80GAATCATGCAGGTCTCCACTGCTGCCCTTGCTGTCCTCCT120CTGCACCATGGCTCTCTGCAACCAGTTCTCTGCATCACTT160GCTGCTGACACGCCGACCGCCTGCTGCTTCAGCTACACCT200CCCGGCAGATTCCACAGAATTTCATAGCTGACTACTTTGA240GACGAGCAGCCAGTGCTCCAAGCCCGGTGTCATCTTCCTA280ACCAAGCGAAGCCGGCAGGTCTGTGCTGACCCCAGTGAGG320AGTGGGTCCAGAAATATGTCAGCGACCTGGAGCTGAGTGC360CTGAGGGGTCCAGAAGCTTCGAGGCCCAGCGACCTCGGTG400GGCCCAGTGGGGAGGAGCAGGAGCCTGAGCCTTGGGAACA440TGCGTGTGACCTCCACAGCTACCTCTTCTATGGACTGGTT480GTTGCCAAACAGCCACACTGTGGGACTCTTCTTAACTTAA520ATTTTAATTTATTTATACTATTTAGTTTTTGTAATTTATT560TTCGATTTCACAGTGTGTTTGTGATTGTTTGCTCTGAGAG600TTCCCCTGTCCCCTCCCCCTTCCCTCACACCGCGTCTGGT640GACAACCGAGTGGCTGTCATCAGCCTGTGTAGGCAGTCAT680GGCACCAAAGCCACCAGACTGACAAATGTGTATCGGATGC720TTTTGTTCAGGGCTGTGATCGGCCTGGGGAAATAATAAAG760ATGCTCTTTTAAAAGGTAAA780cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。