基因總覽
CCL27（C-C motif chemokine ligand 27）是由蛋白質編碼基因 CCL27 產生的趨化因子，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。此蛋白質具有訊號胜肽註解，並被記載為分泌型。其已知特性包括吸引與皮膚相關的記憶 T 淋巴球，以及與 CCR10 結合；可能參與淋巴球移入皮膚部位的過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000259631 ★ | 34,661,890–34,662,657 | 3 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL27 是具有趨化作用的因子，可吸引與皮膚相關的記憶 T 淋巴球。這項作用與淋巴球前往皮膚部位的過程相關；來源指出，CCL27 可能參與淋巴球歸巢至皮膚的調節，但未將此角色表述為已確定的機制。
CCL27 可結合趨化因子受體 CCR10。來源提供了受體結合及細胞吸引的功能資訊，但沒有進一步說明結合如何導致細胞移動，也未提供其他細胞類型、組織或條件下的作用描述。因此，對其功能的整理應限於皮膚相關記憶 T 淋巴球的吸引，以及可能涉及的皮膚歸巢角色。
Promoter 與基因調控
>CCL27 ENST00000259631 GRCh38 chr9:34662557-34663657 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCCAGGAAGGAGGCTGGAATTTGAGTAAAACAAAGATGTAATTGAGTGCTTGAGTCCAATGTCTTCAAC AAGTCAGGGACTGGATCTGGAGACCCTAGGCCCCTGCTGGCAAGAGGTTGGCATTCCTGGAACAGGACTA GACAAAAACAGGAAGGTAAGATTCACTGGGCCTTTTACCTGTTTTGACAACAGTAACCTAGCACCAAAGA GCTTTTATCTTCCCTCCTTATCTACCCCACCTTTCCTCCCTGTCTCATCATCCTGGGGAAAGCTGCCCCA CCTCAGCATCTCCAAAACACCCTTAATATTACCATAAAGGGCCTTCCCCCAGCTTCTCTGAATGGGGCTG GCCTCAGCCAAGAACCCTCCTCAGCCAGAAGGGCCTGCTCTAGGGACCCATTCCCATCCATTTCTTCTGA TAAGACAGGCAGGCCAAGCCAGGAAGTGGGGAGGAGAAGGTGAAGGCAAGTTGGTGCTTGCCTGCCCTCT GCTCCCACCCCACCCACAACTCCCCTGTCAGAATCTGTGTGTGCTAGTGTGAATTTGCTTGTGATTGGAT GACTGTGAAAACACAATTGGGTGGGAGAGGGACTTTGAGTATAACCGGGGCTATATAATTTTGTCTACGG TTGTCTGATCATGAGTATGACTTTGTGAGGTTGACCAAGTGATTGAGGAGTGACTTTGAATGTGTGGCTA TGCGTATTTGAGTGTGAATGTCTATCATTAGATGCTGCTGTGGATGCTTGACTGCCCTTACTCACTGTTC CATCAGTCCCTACATCACACACTAATCCTTCCCCCAGCTTCACTGCCCAGAGCTTAGGAGCACATGGGAA ATGGCTATCCTAGATGAGGAAGGAGTCTGTGGCAACAGGCCGAGAATTAGGGCCCAGGAGTGTCACAGGT TACACAGTACATCTCCAACTGCCTCTGACTCACCTAGTGCCCCAGGTAAAAGGCACCCAGATAAAAGGTA GGGGAGGAGGAGAGAGAGAGAAGGAAGAGTCTAGGCTGAGCAACATGAAGGGGCCCCCAACCTTCTGCAG CCTCCTGCTGCTGTCATTGCTCCTGAGCCCAGACCCTACAGCAGGTGAGTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL27_2 ↗ | 9:34,662,657 | 負股 | 34,662,647–34,662,706 |
| CCL27_1 ↗ | 9:34,665,385 | 負股 | 34,665,375–34,665,434 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_5B6525 · CTCF_binding_site · 34659592–34659613 · regulatory
ENSR9_5B653T · CTCF_binding_site · 34659971–34659992 · regulatory
ENSR9_9HQGT · enhancer · 34663035–34663474 · regulatory
ENSR9_5B65SP · CTCF_binding_site · 34664471–34664492 · regulatory
ENSR9_B8TQ8 · promoter · 34664971–34665675 · regulatory
ENSR9_5B6633 · CTCF_binding_site · 34665626–34665647 · regulatory
ENSR9_9HQHL · enhancer · 34665676–34666017 · regulatory
ENSR9_B8TQD · promoter · 34666018–34666602 · regulatory
· motif · 34659594–34659610 · motif
· motif · 34659861–34659870 · motif
· motif · 34659973–34659989 · motif
· motif · 34664473–34664489 · motif
· motif · 34664497–34664512 · motif
· motif · 34664497–34664512 · motif
· motif · 34664498–34664512 · motif
· motif · 34665002–34665017 · motif
· motif · 34665010–34665017 · motif
· motif · 34665499–34665512 · motif
· motif · 34665536–34665549 · motif
· motif · 34665583–34665596 · motif
· motif · 34665613–34665626 · motif
· motif · 34665628–34665644 · motif
· motif · 34665963–34665973 · motif
· motif · 34665980–34665990 · motif
· motif · 34666037–34666046 · motif
· motif · 34666055–34666068 · motif
· motif · 34666055–34666068 · motif
· motif · 34666100–34666109 · motif
· motif · 34666106–34666116 · motif
· motif · 34666171–34666181 · motif
· motif · 34666507–34666520 · motif
· motif · 34666507–34666520 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：112 aa
CCL27 蛋白質長 112 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其序列第 1 至 24 個胺基酸被註解為訊號胜肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL27 被記載為分泌型蛋白質。 來源未提供其定位變化條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CCL11P51671 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CCL27 可呈單體、二聚體及四聚體形式；heparin 會強烈促進其寡聚化。此外，CCL27 與 TNFAIP6 互作，涉及 TNFAIP6 的 Link domain。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL27 是趨化因子，可吸引與皮膚相關的記憶 T 淋巴球；它可能參與淋巴球歸巢至皮膚部位的過程，並可與 CCR10 結合。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Chemotactic factor that attracts skin-associated memory T-lymphocytes. May play a role in mediating homing of lymphocytes to cutaneous sites. Binds to CCR10 |
| 交互作用 | CCL27 可形成單體、二聚體與四聚體；heparin 會強烈促進其寡聚化。CCL27 也會透過 TNFAIP6 的 Link domain 與 TNFAIP6 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer, dimer, and tetramer. Heparin avidly promotes oligomerization. Interacts with TNFAIP6 (via Link domain) PMID 20200157 ↗ · PMID 27044744 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AAGGAAGAGTCTAGGCTGAGCAACATGAAGGGGCCCCCAA40CCTTCTGCAGCCTCCTGCTGCTGTCATTGCTCCTGAGCCC80AGACCCTACAGCAGCATTCCTACTGCCACCCAGCACTGCC120TGCTGTACTCAGCTCTACCGAAAGCCACTCTCAGACAAGC160TACTGAGGAAGGTCATCCAGGTGGAACTGCAGGAGGCTGA200CGGGGACTGTCACCTCCAGGCTTTCGTGCTTCACCTGGCT240CAACGCAGCATCTGCATCCACCCCCAGAACCCCAGCCTGT280CACAGTGGTTTGAGCACCAAGAGAGAAAGCTCCATGGGAC320TCTGCCCAAGCTGAATTTTGGGATGCTAAGGAAAATGGGC360TGAAGCCCCCAATAGCCAAATAATAAAGCAGCATTGGATA400ATAATTTCTGAGTATAA417cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。