基因總覽
C-C motif chemokine ligand 26（CCL26）是蛋白質編碼基因，產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。此蛋白質長 94 個胺基酸，具有位於第 1 至第 23 個胺基酸的訊號序列，並被註記為分泌型。CCL26 的基本角色是作為趨化因子；其受體相關作用與細胞移動等功能細節見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000005180 ★ | 75,769,538–75,772,211 | 3 |
| ENST00000394905 | 75,769,533–75,789,896 | 4 |
| ENST00001141024 | 75,769,533–75,772,217 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL26 是嗜酸性球與嗜鹼性球的趨化因子，能吸引這兩類細胞。來源亦指出，CCL26 可作為 C-C chemokine receptor CCR3 的配體；在嗜酸性球中，這項配體作用會引發 Ca(2+) 動員。
CCL26 也可作為 CX3C chemokine receptor CX3CR1 的配體，並誘導細胞趨化。現有資料支持其與兩種受體的配體關係，以及各自描述的細胞反應；未提供其他作用機制或生理情境。
Promoter 與基因調控
>CCL26 ENST00000005180 GRCh38 chr7:75772111-75773211 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATATATATTATTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTAAGCCTCGGGTGATTGTGATGATCTGTC AGGTTTGGGATCTGTTAGATCTCTCAAATGCCCCCAGCCAGCCCTGGCCCTACAGGTGTGGCCCCAAGAA GATGGGCTGGCACCTGCCTGGACCCTGTTTTTAAATATCCATTGTCGAGGTTGGGCTACTCTATGATCAC ATCTTGAGACCATCCAGAGCTCCACACAGAGATAAGCAATGCTTAGAAAGGAAACAAAACTTTGCCCAAG AGCCAGAAACCTATCTTCAACAACCAATTGTGCTATAAAGTAACTTAGTTCAGTTCACTGGAATATTACT TAATTTCCTCTGCTTTTTCTTTTTAAACAAGAAAGTGTTGACTCAGCCAACAGCACTGGGAACCAGACTC CCTGGGGCCTGCCTGCCCCTGCTCTTCTCCCAAATTCTCTTCTTTTTTTGTCCCTGTTGATGGAATTCAA TAAAGGGATCTCTACCATCTGTCACTTGTTTTTTTTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGC AGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGCAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCC AGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACCCTCAGGAGTAGCTGGGATTACAGTTGCCTGCCACCATGCCCGG CCAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCT CAAGGGATCCGCCCACCTCGGTCTCCCAGAGTGCTGTGATCACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGTGCCA GATTATCTTTCTTCACTGTCTAATTTCATTCCTATGAGTATTAGTTTACTTTTCCTTTGTTGGGTCAAAA GTGCTGCTTCTGTTCCCAACCACAGAATTCTCTGGAATTGTTTTCAGGGCCGTCTCAGTCTCATAAAAGG GGATCAGGCAGGAGGAGTTTGGGAGAAACCTGAGAAGGGCCTGATTTGCAGCATCATGATGGGCCTCTCC TTGGCCTCTGCTGTGCTCCTGGCCTCCCTCCTGAGTCTCCACCTTGGAACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL26_1 ↗ | 7:75,772,211 | 負股 | 75,772,201–75,772,260 |
| CCL26_2 ↗ | 7:75,772,357 | 負股 | 75,772,347–75,772,406 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_93542L · enhancer · 75771282–75771567 · regulatory
ENSR7_93542T · promoter · 75772201–75772517 · regulatory
ENSR7_935432 · enhancer · 75772685–75773010 · regulatory
ENSR7_5MS87Z · CTCF_binding_site · 75776460–75776481 · regulatory
ENSR7_935446 · enhancer · 75776590–75776972 · regulatory
· motif · 75771272–75771281 · motif
· motif · 75772012–75772026 · motif
· motif · 75772813–75772827 · motif
· motif · 75772813–75772827 · motif
· motif · 75772949–75772963 · motif
· motif · 75776350–75776365 · motif
· motif · 75776423–75776445 · motif
· motif · 75776423–75776445 · motif
· motif · 75776462–75776478 · motif
· motif · 75776645–75776657 · motif
· motif · 75776724–75776741 · motif
· motif · 75776733–75776741 · motif
· motif · 75777066–75777077 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：94 aa
CCL26 蛋白質長 94 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。序列第 1 至第 23 個胺基酸被註記為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL26 被註記為分泌型；來源未提供其他細胞內定位或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- CCL13Q99616 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL17Q92583 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL28Q9NRJ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CXCL10P02778 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL14O95715 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PAX6P26367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTMPQ5BVD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- XCL1P47992 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CCL26 的亞基狀態註記為單體。來源未列出與其他蛋白質形成複合體的資料；受體配體關係及其功能結果另見功能說明。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL26 可吸引嗜酸性球與嗜鹼性球；它作為 C-C chemokine receptor CCR3 的配體時，會引發嗜酸性球中的 Ca(2+) 動員。此外，CCL26 也能結合 CX3C chemokine receptor CX3CR1，並誘導細胞趨化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemoattractant for eosinophils and basophils. Acts as a ligand for C-C chemokine receptor CCR3 which triggers Ca(2+) mobilization in eosinophils. Also acts as a ligand for CX3C chemokine receptor CX3CR1, inducing cell chemotaxis PMID 10415065 ↗ · PMID 10488147 ↗ · PMID 11425309 ↗ · PMID 20974991 ↗ |
| 交互作用 | Monomer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGGAGAAACCTGAGAAGGGCCTGATTTGCAGCATCATGAT40GGGCCTCTCCTTGGCCTCTGCTGTGCTCCTGGCCTCCCTC80CTGAGTCTCCACCTTGGAACTGCCACACGTGGGAGTGACA120TATCCAAGACCTGCTGCTTCCAATACAGCCACAAGCCCCT160TCCCTGGACCTGGGTGCGAAGCTATGAATTCACCAGTAAC200AGCTGCTCCCAGCGGGCTGTGATATTCACTACCAAAAGAG240GCAAGAAAGTCTGTACCCATCCAAGGAAAAAATGGGTGCA280AAAATACATTTCTTTACTGAAAACTCCGAAACAATTGTGA320CTCAGCTGAATTTTCATCCGAGGACGCTTGGACCCCGCTC360TTGGCTCTGCAGCCCTCTGGGGAGCCTGCGGAATCTTTTC400TGAAGGCTACATGGACCCGCTGGGGAGGAGAGGGTGTTTC440CTCCCAGAGTTACTTTAATAAAGGTTGTTCATAGA475cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。