基因總覽
CCL25 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 25，是一種蛋白質編碼基因，其產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。此蛋白質全長 150 個胺基酸，N 端具有一段 23 個胺基酸的訊號胜肽。來源將其描述為可能參與 T 細胞發育的趨化因子；其具體作用及不同細胞上的活性，見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000315626 ★ | 8,052,760–8,062,650 | 6 |
| ENST00000680507 | 8,052,293–8,054,843 | 4 |
| ENST00000926821 | 8,052,293–8,062,665 | 7 |
| ENST00000680646 | 8,052,312–8,062,665 | 7 |
| ENST00000926822 | 8,052,312–8,062,665 | 7 |
| ENST00000680450 | 8,052,348–8,062,665 | 7 |
| ENST00000681526 | 8,052,353–8,062,665 | 7 |
| ENST00000680506 | 8,052,375–8,062,665 | 7 |
| ENST00000253451 | 8,052,753–8,062,665 | 6 |
| ENST00001090524 | 8,052,753–8,062,665 | 6 |
| ENST00001090526 | 8,052,753–8,062,665 | 4 |
| ENST00001138906 | 8,052,760–8,062,665 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL25 可能參與 T 細胞發育。重組 CCL25 在特定細胞上具有趨化活性，但此作用並非所有受測細胞都能觀察到：胸腺細胞、巨噬細胞、THP-1 細胞及樹突細胞可對其產生趨化反應；周邊血液淋巴球與嗜中性球則未呈現此活性。因此，來源支持的是依細胞類型而異的反應，不能據此概括為對所有淋巴球或免疫細胞皆有趨化作用。
CCL25 可與 CCR9 結合。來源另指出，其異構型 2 對異構型 1 具有拮抗作用，顯示不同異構型之間的作用方向並不相同；資料未進一步說明此拮抗作用的具體分子機制或生理條件。
CCL25 也可結合非典型趨化因子受體 ACKR4，並促使 beta-arrestin（ARRB1/2）募集至 ACKR4。這項受體相關作用與前述對特定細胞的趨化活性，屬於來源分別描述的功能資訊；現有資料未提供兩者之間的因果關係或其在 T 細胞發育中的詳細作用途徑。
Promoter 與基因調控
>CCL25 ENST00000315626 GRCh38 chr19:8051760-8052860 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAGTGCTGGTATTACAGGTGTGAGCCACTGTGTCCGGCCACCGTTTTTTTTTCCATTTTTTGAGACAGG GTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCACAGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCAAGG CTCAAGCAATCCTCACACCTCAGCCTCCTGAGTGGCTGGGACTACAGGTATGCACTACTACGTCAGGCTA ATTTTTTAAAAAATTTTTGTAGTGACGCAGGTCTCTCTATATTGCCCGGGGTGGTCTTGAGCTCCTGGGC TCAAGCAATCCTCTGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGCTTACAGACATGAGCCACCATGCCTGGCCTA GAGAGTTTCTTTCTTGTTGGGGTTGTTCACCGGTGGGAGGTGCACCATTGTGCCGTGCTGACTATATTCA TAGAGTTATGTAACCATCACTCTCATCTAATTTCAGAACAAAAGGAAACCCATACCCTCTCACAGTCAGT CCTTCATTCTCCCCTCCCCCCATCCTGTGGCCACCGCTAATTTACTTTCTGTTTCTATGGATTTGCCTGT GATCACAACCAGAGGATTTCTGTGACATGCTAAGTTACCTAACCATGGTGTGGAAGGAGAGGGAAATGGA GTGAAGTTGGGGACCCACCAGGGAACAGGTGGCTTGAGGGCGGGGGGAGCATGAAGGTAAGGGCTTGTTT GGGGGCTCAAGGCAGTCTGAGCCTTGTTCGCAGGCAGCCAGTGTCCACCAGGTGTGTGCAGGTGAGGGAA ACAGGGGAAAAGGCCCTTTCTGGAGACAGTAGGGGTGCTGGCTGGGAGGCCTGGGATGGGGAGTGGGGAG GCAAGGGGGCCTGTGGGTCGAGGTTGGAGCTTGCTGTAGAAGAGGGAGAATTCCAGAGGCTGAGAGTGCA GGTGGAGAGGAGGAGGAAGGGAGGAGGGCGGGCAGGGGGTGGCTGGGTGGGGCTCTGTCTATAAAGAGTG AAGCTCAGCGTGTTGGTCCTGCAGATGGGACAGCTTGGCCTACAGCCCGGCGGGCATCAGCTCCCTTGAC CCAGTGGATATCGGTGAGTCTTTTCCTTGAACATGACTGAGATGAACAGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL25_2 ↗ | 19:8,052,343 | 正股 | 8,052,294–8,052,353 |
| CCL25_1 ↗ | 19:8,052,763 | 正股 | 8,052,714–8,052,773 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_CRKC · enhancer · 8050048–8051188 · regulatory
ENSR19_9579X · promoter · 8052096–8052385 · regulatory
ENSR19_88DKZ · enhancer · 8052386–8052522 · regulatory
· motif · 8050403–8050419 · motif
· motif · 8050579–8050588 · motif
· motif · 8050613–8050623 · motif
· motif · 8050635–8050645 · motif
· motif · 8050699–8050709 · motif
· motif · 8050763–8050773 · motif
· motif · 8050782–8050792 · motif
· motif · 8050849–8050859 · motif
· motif · 8054245–8054260 · motif
· motif · 8054402–8054415 · motif
· motif · 8054544–8054558 · motif
· motif · 8054544–8054559 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：150 aa
CCL25 蛋白質長 150 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其第 1 至 23 位胺基酸被註記為訊號胜肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 CCL25 註記為分泌型蛋白質，未提供其在細胞內不同區室間定位變化的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CCL17Q92583 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PF4V1P10720 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL25 可能參與 T 細胞發育。重組蛋白可促使胸腺細胞、巨噬細胞、THP-1 細胞及樹突細胞產生趨化反應，但對周邊血液淋巴球與嗜中性球沒有此活性。CCL25 可結合 CCR9；異構型 2 拮抗異構型 1。它也結合 ACKR4，並促使 beta-arrestin（ARRB1/2）募集至該受體。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Potentially involved in T-cell development. Recombinant protein shows chemotactic activity on thymocytes, macrophages, THP-1 cells, and dendritics cells but is inactive on peripheral blood lymphocytes and neutrophils. Binds to CCR9. Isoform 2 is an antagonist of isoform 1. Binds to atypical chemokine receptor ACKR4 and mediates the recruitment of beta-arrestin (ARRB1/2) to ACKR4 |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCAGATGGGACAGCTTGGCCTACAGCCCGGCGGGCATCAG40CTCCCTTGACCCAGTGGATATCGGTGGCCCCGTTATTCGT80CCAGGTGCCCAGGGAGGAGGACCCGCCTGCAGCATGAACC120TGTGGCTCCTGGCCTGCCTGGTGGCCGGCTTCCTGGGAGC160CTGGGCCCCCGCTGTCCACACCCAAGGTGTCTTTGAGGAC200TGCTGCCTGGCCTACCACTACCCCATTGGGTGGGCTGTGC240TCCGGCGCGCCTGGACTTACCGGATCCAGGAGGTGAGCGG280GAGCTGCAATCTGCCTGCTGCGATATTCTACCTCCCCAAG320AGACACAGGAAGGTGTGTGGGAACCCCAAAAGCAGGGAGG360TGCAGAGAGCCATGAAGCTCCTGGATGCTCGAAATAAGGT400TTTTGCAAAGCTCCACCACAACACGCAGACCTTCCAAGCA440GGCCCTCATGCTGTAAAGAAGTTGAGTTCTGGAAACTCCA480AGTTATCATCGTCCAAGTTTAGCAATCCCATCAGCAGCAG520TAAGAGGAATGTCTCCCTCCTGATATCAGCTAATTCAGGA560CTGTGAGCCGGCTCATTTCTGGGCTCCATCGGCACAGGAG600GGGCCGGATCTTTCTCCGATAAAACCGTCGCCCTACAGAC640CCAGCTGTCCCCACGCCTCTGTCTTTTGGGTCAAGTCTTA680ATCCCTGCACCTGAGTTGGTCCTCCCTCTGCACCCCCACC720ACCTCCTGCCCGTCTGGCAACTGGAAAGAGGGAGTTGGCC760TGATTTTAAGCCTTTTGCCGCTCCGGGGACCAGCAGCAAT800CCTGGGCAGCCAGTGGCTCTTGTAGAGAAGACTTAGGATA840CCTCTCTCACTTTCTGTTTCTTGCCGTCCACCCCGGGCCA880TGCCAGTGTGTCCCTCTGGGTCCCTCCAAAACTCTGGTCA920GTTCAAGGATGCCCCTCCCAGGCTATGCTTTTCTATAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。