基因總覽
CCL24 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 24,是由蛋白質編碼基因產生的趨化因子,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其蛋白質前段具有訊號序列,與分泌型蛋白質的特徵相符。研究描述其能對不同免疫細胞產生程度不一的趨化作用,也記錄了對多潛能造血前驅細胞株集落形成的抑制作用。這些資料指出 CCL24 具有免疫細胞移動與造血細胞生長調節相關的活性;其具體作用對象與效應則須依各項研究結果分別理解。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222902 ★ | 75,810,825–75,813,806 | 3 |
| ENST00000416943 | 75,810,825–75,823,413 | 4 |
| ENST00000967332 | 75,810,825–75,823,943 | 6 |
| ENST00000967333 | 75,810,825–75,823,413 | 6 |
| ENST00000967334 | 75,810,825–75,823,413 | 6 |
| ENST00001141094 | 75,810,825–75,813,812 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL24 可誘導靜止型 T 淋巴球與嗜酸性球產生趨化反應,表示這些細胞能朝 CCL24 所形成的化學訊號移動。其對不同細胞的作用並不相同:對嗜中性球也有趨化活性,但程度較低;在所述研究中,對單核球及活化型淋巴球則未觀察到趨化作用。因此,不能將其作用概括為對所有白血球都具有相同的吸引效果,細胞類型及活化狀態是理解其趨化效應的重要條件。
CCL24 與 CCR3 結合。這項受體結合資料與其趨化活性相互補充,指出 CCL24 可透過與特定受體的結合參與細胞反應;來源未進一步提供受體下游訊號或詳細分子機制,因此不宜延伸推論其他訊號路徑或細胞效應。
除免疫細胞趨化外,CCL24 也被報告能強烈抑制多潛能造血前驅細胞株形成集落。這一結果描述的是特定細胞株中的集落形成抑制作用,與前述白血球移動反應屬於不同觀察結果;來源未說明該抑制作用是否由 CCR3 介導,也未提供其作用機制。合併來看,現有資料支持 CCL24 具有依細胞種類而異的趨化活性,並可在造血前驅細胞株中抑制集落形成,但這些結果應限於來源所述的細胞與實驗觀察。
Promoter 與基因調控
>CCL24 ENST00000222902 GRCh38 chr7:75813706-75814806 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTGGAGTCGGCATCCCTCTGGCAGACATTGGCCACCTCAGAGGATGTGAATTTCCAGGCATTTCCCACT TCCCTAGAATCTTGGTGACTAAGTGGCTCCGGCAACTTGAGGGTACAGGCGATGGCTGTTGGGACTTCAA GGCCACCGAGAGCTGATGGAAAGCGGTCCTGACAGCATCTGCTTTGCTCTGTCAAGACTTGTCATGGACT GATTGATTGATTGGTTGATTGATTGATTTTAAGACAGGGTGTTGCTCTGTTGCCCAGCCTGGAGAGGCAG TGGTGTGATCACAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGGTTCAAGTCATCCTTCCACCTCAGCCTCCCCA AGAGCTGAGACTACAAGCCTGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTATTTTTTATAGAGATAGGGTCTT GCTTTGTTGCCTAGGCTGGTCTCAAAGTCCTGGCCTCAAATGATCCTCCCACTTGAAACTTCCAAAGCAC AGGGATTACAAGCATGAGCCCCCGTGCCCAGCTGACCTCTCATTGTCTGTTACACACACTTGATCACAAA TCTGTCTCCCCATTAGAGTCCTCCCAGTGCCTGGCACAGACCACATGCCTAATAAATAATTGGGTGAATG AATGAATGAATGAATGGAAGGGAGAAGATAGGGATGACTCTGCCCATTTTCAGCTGAAGTAACTGAGGCT CAGGGAGGTGAGTGACTTATCCAGGATCCCACAGGGAGTGGCCAACACAGCCAGGATCCCATGGGCCTTC TGACAATGCATCCAACACCTTTGAACTTGGCCTAGGTGGGGTGATGTCCCCTCCCCCAGTTCTTTCGTTC GGAGCCCAAGATAACCCTTGACTCAGCTGGGCAACAACGGGACAACAACTTCCTCTTTCCAGACCACAGG CCTCAGGATTTTCAAGGAAGCGTGGAGGGGGCTCGGGGGCGTGTTTCCTTCTAGTTGCCCCATAAAGGGC AGAGGGAGGGAGTTTGGGGTACTCTGCAAGGACCCGAGCTATTTATCCCTAGGTCCTTTCCTCCTGCACG TCAGCTTTGAGCCCCGAGCTGGTGCTTCTGCTCTCTGAGACATGGCAGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL24_1 ↗ | 7:75,813,806 | 負股 | 75,813,796–75,813,855 |
| CCL24_2 ↗ | 7:75,823,369 | 負股 | 75,823,359–75,823,418 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:119 aa
CCL24 蛋白質長 119 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 26 個胺基酸區段註解為訊號序列;此為蛋白質序列特徵,不代表來源提供了其他結構域或功能區域的資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL24 被記錄為分泌型蛋白質。 來源未提供特定條件下的定位變化或異構型差異,因此此處僅描述其分泌定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL24 可誘導靜止型 T 淋巴球與嗜酸性球趨化,對嗜中性球的趨化活性較低,對單核球及活化型淋巴球則無趨化作用。它也能強烈抑制多潛能造血前驅細胞株形成集落,並可與 CCR3 結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic for resting T-lymphocytes, and eosinophils. Has lower chemotactic activity for neutrophils but none for monocytes and activated lymphocytes. Is a strong suppressor of colony formation by a multipotential hematopoietic progenitor cell line. Binds to CCR3 PMID 9104803 ↗ · PMID 9365122 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCTGCAAGGACCCGAGCTATTTATCCCTAGGTCCTTTC40CTCCTGCACGTCAGCTTTGAGCCCCGAGCTGGTGCTTCTG80CTCTCTGAGACATGGCAGGCCTGATGACCATAGTAACCAG120CCTTCTGTTCCTTGGTGTCTGTGCCCACCACATCATCCCT160ACGGGCTCTGTGGTCATCCCCTCTCCCTGCTGCATGTTCT200TTGTTTCCAAGAGAATTCCTGAGAACCGAGTGGTCAGCTA240CCAGCTGTCCAGCAGGAGCACATGCCTCAAGGCAGGAGTG280ATCTTCACCACCAAGAAGGGCCAGCAGTTCTGTGGCGACC320CCAAGCAGGAGTGGGTCCAGAGGTACATGAAGAACCTGGA360CGCCAAGCAGAAGAAGGCTTCCCCTAGGGCCAGGGCAGTG400GCTGTCAAGGGCCCTGTCCAGAGATATCCTGGCAACCAAA440CCACCTGCTAATCCCCGCCCAGCCCTCCAGCCCTGAGTTT480GGGCCTGAGCTGCTTGGCGGGCTACTCGGGGCCTGGAGAA520GCCACAGTGATGGGGGGAAGAGCTAATTTTCCTGTTTCTT560AGCAACACTCTCCAGGGATGTGTCTCTTCTATGAAAAACC600CGAGGGAGCAGGTGATGTGGTTCCCGGGGGCTGAGCAATG640GCTCCAAGCATCCAAGGCCCCTTGCCTTTCTGGAGCTGGG680TGAGAAGATCCCAGAAGGAGAGCAGTGGCAACTCTTTGCC720TTCTCCTCCTGACCTGGTTCTGATGCTTTTTCTTTTTTTT760TTTTTTCTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGG800AGTGCAGTGGCACAATCTCGGTTCACTGCAACCTCCGCCT840CCTGGGTTCAAGTGATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCGAGTA880CCTGGGACTACAGGTGTGTACCACCACACCCAACTAACTT920TTGTATTTTTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。