基因總覽
CCL22 是由人類蛋白質編碼基因 CCL22 產生的分泌型趨化因子,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其產物 C-C motif chemokine ligand 22 是一種參與免疫細胞移動的訊號分子;來源資料指出它可與 CCR4 結合。蛋白質全長為 93 個胺基酸,序列 N 端的第 1 至 24 位胺基酸被註記為訊號肽。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000219235 ★ | 57,358,783–57,366,189 | 3 |
| ENST00000941195 | 57,357,925–57,366,191 | 4 |
| ENST00001133982 | 57,358,776–57,366,191 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL22 的功能與多種免疫細胞的趨化有關。來源指出,它可吸引單核球、樹突細胞與自然殺手細胞;對初級活化 T 淋巴球的吸引作用較弱,對慢性活化 T 淋巴球則較強。這些差異顯示其趨化作用會隨 T 淋巴球的活化狀態而異,不能概括為對所有 T 淋巴球具有相同效果。
CCL22 對部分細胞並無趨化活性:嗜中性球、嗜酸性球及靜止型 T 淋巴球均不受其吸引。來源亦指出 CCL22 可結合 CCR4,但未進一步描述此結合如何造成各細胞類型間的趨化差異,因此不宜將特定受體作用機制延伸到資料未載明的細節。
此外,CCL22 可能參與活化型或效應型 T 淋巴球移往發炎部位,也可能涉及活化 T 淋巴球生理的其他面向;這些角色以「可能」描述,仍保留來源的不確定性。經加工形成的 MDC(3-69)、MDC(5-69) 與 MDC(7-69) 則似乎沒有活性。
Promoter 與基因調控
>CCL22 ENST00000219235 GRCh38 chr16:57357783-57358883 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACATTAAAGGCCAGGGACAGGCCGCAGTCCCTTTTGAGGAAGTGTGAGGAGTGTGGTGTGATCCCTCAGG GGAAGGAGACCAGTGGGGAAAGGCCTGTCCGGAAACGGGGCCTTGAAGGCCACAGACAGGAGCCCGGGAC CTGCCTTTAGGTGAATGGGGAGCCACGGCAGGGTTCTGAAGCAGGAGAGAGAGTGTGTAGCTCTGGACCA CTCACGCTGGCTGCTGCAGGGTGGGGATGGCATTGAGGAGGCCAGCATCCCAGCCTGAGGTGGAGGTGGC CTGGACTGGGCAGGAACAGTGGGGTTGGAGAGAAGGAGCAGATCTGAGAGAGATTTAGGAAGCAGAATCA ACGGGACATGGACATGGTGAGGGACTGAGACAGGAGTGGGGGAGGGAGAGCCCGGCAGCCACTGGGAAGG AAGATCAGGCAGGACAGAAGTGTGGGTAGATGCTTTCCATAAACCGTTGAGAAATCCACGACCTGGCCCA AATGTGGACTTCACGAGAAGCCCCAGATGGGTCAATGGGTCCATAGGCCTCTCCCATTGAAGAGAGACCA GTAATGCCGTCATTAAGGGTACAAGACAGGCCTCAATTCTAGGTGAGGGTTGGTCCACGTTCTCACTTGA TTTACAACCAGTGAAGTCAACAGAGCTGTGAAACCATCTCCCCCATTTCCAGATGGGGAAACCAAGTCCC AGAGACACCCAGACATGGCCAAGGCCACACAGTGCAGAGACCCTGGGGAGCACAAGCCTCTAAGAGGGGG ATTTTACAAGTCTGTCTGAAACCAGAGGCGAGGACAGAGTTGAGGGGGGGTCCCCTCTGAGTGGTTCCCC GCCAAAGAGAATTTCTCCACTTTGGAGGAAGTGGGAGGTAGTTCTTCTTTTGAGATGTGAATGTCAAGTG ACTCTGGGCACCCCGGTGACTAAGAGGTAAGTAAGTGAGGCTTGTGGGTGGAGCCAGCACCTTAAATAGC AGGTCTTCCTATGTCCCTTTGCAGACACCTGGGCTGAGACATACAGGACAGAGCATGGATCGCCTACAGA CTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTGCTGTGGCGCTTCAAGCAACTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL22_1 ↗ | 16:57,358,783 | 正股 | 57,358,734–57,358,793 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_83NJDN · promoter · 57358625–57358793 · regulatory
· motif · 57355237–57355246 · motif
· motif · 57355237–57355246 · motif
· motif · 57357428–57357443 · motif
· motif · 57357433–57357445 · motif
· motif · 57357436–57357443 · motif
· motif · 57357815–57357826 · motif
· motif · 57358300–57358315 · motif
· motif · 57358344–57358357 · motif
· motif · 57358344–57358357 · motif
· motif · 57358520–57358533 · motif
· motif · 57358520–57358533 · motif
· motif · 57358617–57358628 · motif
· motif · 57358661–57358674 · motif
· motif · 57358999–57359016 · motif
· motif · 57359008–57359023 · motif
· motif · 57359111–57359126 · motif
· motif · 57359622–57359642 · motif
· motif · 57361042–57361054 · motif
· motif · 57361044–57361051 · motif
· motif · 57361044–57361059 · motif
· motif · 57361737–57361749 · motif
· motif · 57362186–57362208 · motif
· motif · 57362186–57362208 · motif
· motif · 57363312–57363324 · motif
· motif · 57363388–57363399 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:93 aa
CCL22 蛋白質全長為 93 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。序列第 1 至 24 位胺基酸註記為訊號肽;來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL22 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供其他定位資訊,也未描述定位隨條件或異構型變化的情形。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL22 可能參與活化型或效應型 T 淋巴球移往發炎部位及活化 T 淋巴球的其他生理活動。它可吸引單核球、樹突細胞與自然殺手細胞;對初級活化 T 淋巴球的趨化作用較弱,對慢性活化 T 淋巴球則較強,但不吸引嗜中性球、嗜酸性球或靜止型 T 淋巴球。CCL22 可結合 CCR4;MDC(3-69)、MDC(5-69) 與 MDC(7-69) 等加工型似乎沒有活性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May play a role in the trafficking of activated/effector T-lymphocytes to inflammatory sites and other aspects of activated T-lymphocyte physiology. Chemotactic for monocytes, dendritic cells and natural killer cells. Mild chemoattractant for primary activated T-lymphocytes and a potent chemoattractant for chronically activated T-lymphocytes but has no chemoattractant activity for neutrophils, eosinophils, and resting T-lymphocytes. Binds to CCR4. Processed forms MDC(3-69), MDC(5-69) and MDC(7-69) seem not be active |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCAGACACCTGGGCTGAGACATACAGGACAGAGCATGGAT40CGCCTACAGACTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTG80CTGTGGCGCTTCAAGCAACTGAGGCAGGCCCCTACGGCGC120CAACATGGAAGACAGCGTCTGCTGCCGTGATTACGTCCGT160TACCGTCTGCCCCTGCGCGTGGTGAAACACTTCTACTGGA200CCTCAGACTCCTGCCCGAGGCCTGGCGTGGTGTTGCTAAC240CTTCAGGGATAAGGAGATCTGTGCCGATCCCAGAGTGCCC280TGGGTGAAGATGATTCTCAATAAGCTGAGCCAATGAAGAG320CCTACTCTGATGACCGTGGCCTTGGCTCCTCCAGGAAGGC360TCAGGAGCCCTACCTCCCTGCCATTATAGCTGCTCCCCGC400CAGAAGCCTGTGCCAACTCTCTGCATTCCCTGATCTCCAT440CCCTGTGGCTGTCACCCTTGGTCACCTCCGTGCTGTCACT480GCCATCTCCCCCCTGACCCCTCTAACCCATCCTCTGCCTC520CCTCCCTGCAGTCAGAGGGTCCTGTTCCCATCAGCGATTC560CCCTGCTTAAACCCTTCCATGACTCCCCACTGCCCTAAGC600TGAGGTCAGTCTCCCAAGCCTGGCATGTGGCCCTCTGGAT640CTGGGTTCCATCTCTGTCTCCAGCCTGCCCACTTCCCTTC680ATGAATGTTGGGTTCTAGCTCCCTGTTCTCCAAACCCATA720CTACACATCCCACTTCTGGGTCTTTGCCTGGGATGTTGCT760GACACCCAGAAAGTCCCACCACCTGCACATGTGTAGCCCC800ACCAGCCCTCCAAGGCATTGCTCGCCCAAGCAGCTGGTAA840TTCCATTTCATGTATTAGATGTCCCCTGGCCCTCTGTCCC880CTCTTAATAACCCTAGTCACAGTCTCCGCAGATTCTTGGG920ATTTGGGGGTTTTCTCCCCCACCTCTCCACTAGTTGGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。