演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL22MDC

C-C motif chemokine ligand 22

C-C motif chemokine ligand 22(CCL22)屬於 CC 趨化因子家族,可吸引多類免疫細胞,並可能參與活化或效應 T 淋巴球移往發炎部位。

Homo sapiens16q21UniProt O00626
OFFICIAL SYMBOL
CCL22
CHROMOSOME
16
UNIPROT
O00626
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL22 是由人類蛋白質編碼基因 CCL22 產生的分泌型趨化因子,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其產物 C-C motif chemokine ligand 22 是一種參與免疫細胞移動的訊號分子;來源資料指出它可與 CCR4 結合。蛋白質全長為 93 個胺基酸,序列 N 端的第 1 至 24 位胺基酸被註記為訊號肽。

Official symbol
CCL22
Gene name
C-C motif chemokine ligand 22
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10621
UniProt
O00626
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MDCSTCP-1ABCD-1DC/B-CKA-152E5.1MGC34554SCYA22

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q21
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegCCL22pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:57,357,925–57,366,191
Gene span
8,267 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000219235 ★57,358,783–57,366,1893
ENST0000094119557,357,925–57,366,1914
ENST0000113398257,358,776–57,366,1913

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL22 的功能與多種免疫細胞的趨化有關。來源指出,它可吸引單核球、樹突細胞與自然殺手細胞;對初級活化 T 淋巴球的吸引作用較弱,對慢性活化 T 淋巴球則較強。這些差異顯示其趨化作用會隨 T 淋巴球的活化狀態而異,不能概括為對所有 T 淋巴球具有相同效果。

CCL22 對部分細胞並無趨化活性:嗜中性球、嗜酸性球及靜止型 T 淋巴球均不受其吸引。來源亦指出 CCL22 可結合 CCR4,但未進一步描述此結合如何造成各細胞類型間的趨化差異,因此不宜將特定受體作用機制延伸到資料未載明的細節。

此外,CCL22 可能參與活化型或效應型 T 淋巴球移往發炎部位,也可能涉及活化 T 淋巴球生理的其他面向;這些角色以「可能」描述,仍保留來源的不確定性。經加工形成的 MDC(3-69)、MDC(5-69) 與 MDC(7-69) 則似乎沒有活性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57358783 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL22 ENST00000219235 GRCh38 chr16:57357783-57358883 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATTAAAGGCCAGGGACAGGCCGCAGTCCCTTTTGAGGAAGTGTGAGGAGTGTGGTGTGATCCCTCAGG
GGAAGGAGACCAGTGGGGAAAGGCCTGTCCGGAAACGGGGCCTTGAAGGCCACAGACAGGAGCCCGGGAC
CTGCCTTTAGGTGAATGGGGAGCCACGGCAGGGTTCTGAAGCAGGAGAGAGAGTGTGTAGCTCTGGACCA
CTCACGCTGGCTGCTGCAGGGTGGGGATGGCATTGAGGAGGCCAGCATCCCAGCCTGAGGTGGAGGTGGC
CTGGACTGGGCAGGAACAGTGGGGTTGGAGAGAAGGAGCAGATCTGAGAGAGATTTAGGAAGCAGAATCA
ACGGGACATGGACATGGTGAGGGACTGAGACAGGAGTGGGGGAGGGAGAGCCCGGCAGCCACTGGGAAGG
AAGATCAGGCAGGACAGAAGTGTGGGTAGATGCTTTCCATAAACCGTTGAGAAATCCACGACCTGGCCCA
AATGTGGACTTCACGAGAAGCCCCAGATGGGTCAATGGGTCCATAGGCCTCTCCCATTGAAGAGAGACCA
GTAATGCCGTCATTAAGGGTACAAGACAGGCCTCAATTCTAGGTGAGGGTTGGTCCACGTTCTCACTTGA
TTTACAACCAGTGAAGTCAACAGAGCTGTGAAACCATCTCCCCCATTTCCAGATGGGGAAACCAAGTCCC
AGAGACACCCAGACATGGCCAAGGCCACACAGTGCAGAGACCCTGGGGAGCACAAGCCTCTAAGAGGGGG
ATTTTACAAGTCTGTCTGAAACCAGAGGCGAGGACAGAGTTGAGGGGGGGTCCCCTCTGAGTGGTTCCCC
GCCAAAGAGAATTTCTCCACTTTGGAGGAAGTGGGAGGTAGTTCTTCTTTTGAGATGTGAATGTCAAGTG
ACTCTGGGCACCCCGGTGACTAAGAGGTAAGTAAGTGAGGCTTGTGGGTGGAGCCAGCACCTTAAATAGC
AGGTCTTCCTATGTCCCTTTGCAGACACCTGGGCTGAGACATACAGGACAGAGCATGGATCGCCTACAGA
CTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTGCTGTGGCGCTTCAAGCAACTG
CCL22 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL22_1 ↗16:57,358,783正股57,358,734–57,358,793

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_83NJDN · promoter · 57358625–57358793 · regulatory

· motif · 57355237–57355246 · motif

· motif · 57355237–57355246 · motif

· motif · 57357428–57357443 · motif

· motif · 57357433–57357445 · motif

· motif · 57357436–57357443 · motif

· motif · 57357815–57357826 · motif

· motif · 57358300–57358315 · motif

· motif · 57358344–57358357 · motif

· motif · 57358344–57358357 · motif

· motif · 57358520–57358533 · motif

· motif · 57358520–57358533 · motif

· motif · 57358617–57358628 · motif

· motif · 57358661–57358674 · motif

· motif · 57358999–57359016 · motif

· motif · 57359008–57359023 · motif

· motif · 57359111–57359126 · motif

· motif · 57359622–57359642 · motif

· motif · 57361042–57361054 · motif

· motif · 57361044–57361051 · motif

· motif · 57361044–57361059 · motif

· motif · 57361737–57361749 · motif

· motif · 57362186–57362208 · motif

· motif · 57362186–57362208 · motif

· motif · 57363312–57363324 · motif

· motif · 57363388–57363399 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:93 aa

1 aa93 aa訊號胜肽
依 O00626 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL22 蛋白質全長為 93 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。序列第 1 至 24 位胺基酸註記為訊號肽;來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。

訊號胜肽1–24 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O00626…

AlphaFold · O00626

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL22 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供其他定位資訊,也未描述定位隨條件或異構型變化的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MDCCCL22AQP6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL22 可能參與活化型或效應型 T 淋巴球移往發炎部位及活化 T 淋巴球的其他生理活動。它可吸引單核球、樹突細胞與自然殺手細胞;對初級活化 T 淋巴球的趨化作用較弱,對慢性活化 T 淋巴球則較強,但不吸引嗜中性球、嗜酸性球或靜止型 T 淋巴球。CCL22 可結合 CCR4;MDC(3-69)、MDC(5-69) 與 MDC(7-69) 等加工型似乎沒有活性。資料庫紀錄
證據與來源

May play a role in the trafficking of activated/effector T-lymphocytes to inflammatory sites and other aspects of activated T-lymphocyte physiology. Chemotactic for monocytes, dendritic cells and natural killer cells. Mild chemoattractant for primary activated T-lymphocytes and a potent chemoattractant for chronically activated T-lymphocytes but has no chemoattractant activity for neutrophils, eosinophils, and resting T-lymphocytes. Binds to CCR4. Processed forms MDC(3-69), MDC(5-69) and MDC(7-69) seem not be active

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000219235 · 2,917 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGACACCTGGGCTGAGACATACAGGACAGAGCATGGAT40
41CGCCTACAGACTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTG80
81CTGTGGCGCTTCAAGCAACTGAGGCAGGCCCCTACGGCGC120
121CAACATGGAAGACAGCGTCTGCTGCCGTGATTACGTCCGT160
161TACCGTCTGCCCCTGCGCGTGGTGAAACACTTCTACTGGA200
201CCTCAGACTCCTGCCCGAGGCCTGGCGTGGTGTTGCTAAC240
241CTTCAGGGATAAGGAGATCTGTGCCGATCCCAGAGTGCCC280
281TGGGTGAAGATGATTCTCAATAAGCTGAGCCAATGAAGAG320
321CCTACTCTGATGACCGTGGCCTTGGCTCCTCCAGGAAGGC360
361TCAGGAGCCCTACCTCCCTGCCATTATAGCTGCTCCCCGC400
401CAGAAGCCTGTGCCAACTCTCTGCATTCCCTGATCTCCAT440
441CCCTGTGGCTGTCACCCTTGGTCACCTCCGTGCTGTCACT480
481GCCATCTCCCCCCTGACCCCTCTAACCCATCCTCTGCCTC520
521CCTCCCTGCAGTCAGAGGGTCCTGTTCCCATCAGCGATTC560
561CCCTGCTTAAACCCTTCCATGACTCCCCACTGCCCTAAGC600
601TGAGGTCAGTCTCCCAAGCCTGGCATGTGGCCCTCTGGAT640
641CTGGGTTCCATCTCTGTCTCCAGCCTGCCCACTTCCCTTC680
681ATGAATGTTGGGTTCTAGCTCCCTGTTCTCCAAACCCATA720
721CTACACATCCCACTTCTGGGTCTTTGCCTGGGATGTTGCT760
761GACACCCAGAAAGTCCCACCACCTGCACATGTGTAGCCCC800
801ACCAGCCCTCCAAGGCATTGCTCGCCCAAGCAGCTGGTAA840
841TTCCATTTCATGTATTAGATGTCCCCTGGCCCTCTGTCCC880
881CTCTTAATAACCCTAGTCACAGTCTCCGCAGATTCTTGGG920
921ATTTGGGGGTTTTCTCCCCCACCTCTCCACTAGTTGGACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。