基因總覽
CCL20 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 20，屬於蛋白質編碼基因，產物是 intercrine beta（chemokine CC）家族的趨化因子。其蛋白質全長為 96 個胺基酸，序列 N 端具有訊號區段，與其分泌型性質相符。CCL20 的基本角色是作為 CCR6 的配體；這組配體與受體在皮膚及黏膜表面具有生理與免疫相關性，也與發炎狀態下的細胞移動有關。下方功能說明將進一步整理其對不同細胞的作用及其他已報告的生物學效應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000358813 ★ | 227,813,842–227,817,556 | 4 |
| ENST00000646475 | 227,805,739–227,813,987 | 2 |
| ENST00000409189 | 227,813,842–227,817,564 | 4 |
| ENST00001145007 | 227,813,842–227,817,564 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL20 是 C-C chemokine receptor 6（CCR6）的配體。與 CCR6 結合並活化受體後，CCL20 可引發趨化反應及細胞內鈣離子動員，促使特定細胞移動。CCL20–CCR6 配體—受體組合參與樹突細胞、效應／記憶 T 細胞及 B 細胞的趨化，在皮膚與黏膜表面，不論穩態或發炎條件下都具有作用；此軸線也與癌症及多種自體免疫疾病等病理狀況相關，但來源並未將其描述為疾病的直接成因。
就細胞招募而言，CCL20 可吸引淋巴球，對嗜中性球則只有較弱的吸引作用，且不吸引單核球。它也參與將促發炎、產生 IL17 的輔助 T 細胞（Th17）與調節性 T 細胞（Treg）招募至發炎部位。依相似性資料，CCL20 對胸腺天然調節性 T 細胞（nTreg）及 DN1 早期胸腺細胞前驅細胞的最佳遷移亦屬必要。經 C 端加工的形式，對白血球仍具有相同程度的趨化活性。
CCL20–CCR6 的作用也見於精子：CCL20 結合 CCR6 後可引發精子內 Ca2+ 動員，並正向調節精子運動能力及趨化。另一方面，在集落形成試驗中，CCL20 會抑制骨髓系前驅細胞增殖。這些結果顯示其作用不只涉及免疫細胞移動，也涵蓋特定生殖細胞反應與前驅細胞增殖調節。
依相似性資料，CCL20 可能藉由吸引淋巴球與樹突細胞朝向上皮細胞，參與黏膜淋巴組織的形成與功能。此外，研究報告指出 CCL20 對 E. coli ATCC 25922 與 S. aureus ATCC 29213 具有抗菌活性。這些不同效應的證據層級各異；其中黏膜淋巴組織相關作用為相似性推論，不應視為已由該來源直接證實。
Promoter 與基因調控
>CCL20 ENST00000358813 GRCh38 chr2:227812842-227813942 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCCTTTTTATTTCCGGTAACATTAAAAAAAAATCTATTTTGTCTGATATAGGCATCACCAACTCCAGTT CTCTTTTGTTTACTGTTTGGTATACCTTTCTTTTGATCCTTTTACTTTCAACCTATTTGGGTCTAGTGGA GAGTTCTTATACTGCCTTAGGTTAGGGATTCATATTACATTATCATCATTAGTACTGTTATTTGACATTT GCTGTGCTGACTAGCTACTGCTGATAGGTTTTCTTTCCTCAACAATTCTGAGGCTCTATATTGAGTTATA TTAGTACATCATCATGGAGAGTTAAAGGTAGGTAAGGATTATTTTCTGAACTGCAATATTGATTAAAGCC ATGTGAATGTATAAGATTCTTAGAAGAGTTGACATTAAATCAAGGTGAAGCTGAGGTTTGAGCCTTACTT AAAGGCTGATATTTTCCACTCTAACTGCGGACAGTACTGTAGCACTGTTATAGTACCTGCTCTGAATGTT AGTCTAGCAACTCAGGGTCTTCTTCATGACAGCTGAACCTCAACCATGTGATGGTAAATGTGTAGCAGAG TATGCCTGGCATCCCACCTGCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTTGACTGGTTCTGGAAAGCAAATAGGGTGTA ACAATAGGAGTTCTGGAATGTTCCTGTGTGGGGCTGACCTTTGTATCGCTGTTAATCCTCTATTTTCAGA CACAAAAATGATTAAGTTAAAACTGGATGAAAGTCTTTTCTGGGTCACAGGGCTGAGCTGCTTTTGCTCT TTGCAAATACAAAGAATTTAACAGGATTCTCCCCTTCTCAACTTCCTGTCCCCCACCCTGACCTTCGCAC CTTCCCAATATGAGGAAAAAGCAGGAAGTTTTCCTTGCGGGTTTTTTTTATGATGACATGATGGGGCCAG TTGATCAATGGGGAAAACCCCATGTGGCAACACGCCTTCTGTGTACATTCCCAATATTTGCTATAAATAG GGCCATCCCAGGCTGCTGTCAGAATATAACAGCACTCCCAAAGAACTGGGTACTCAACACTGAGCAGATC TGTTCTTTGAGCTAAAAACCATGTGCTGTACCAAGAGTTTGCTCCTGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL20_2 ↗ | 2:227,805,752 | 正股 | 227,805,703–227,805,762 |
| CCL20_1 ↗ | 2:227,813,842 | 正股 | 227,813,793–227,813,852 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_7HDNND · promoter · 227813752–227813852 · regulatory
ENSR2_88NSWH · enhancer · 227816848–227817047 · regulatory
ENSR2_95CFGK · enhancer · 227817828–227818311 · regulatory
ENSR2_95CFGP · promoter · 227818312–227818812 · regulatory
· motif · 227811784–227811796 · motif
· motif · 227813505–227813519 · motif
· motif · 227813669–227813683 · motif
· motif · 227813670–227813683 · motif
· motif · 227814524–227814533 · motif
· motif · 227818067–227818079 · motif
· motif · 227818377–227818391 · motif
· motif · 227818377–227818391 · motif
· motif · 227818387–227818399 · motif
· motif · 227818541–227818552 · motif
CCL20 可受細菌脂多醣（LPS）、TNF 與 IFNG／IFN-γ 誘導；佛波醇 12-肉豆蔻酸 13-乙酸酯（PMA）則在 U-937 細胞株及 Bowes 黑色素瘤細胞中誘導其表現。相對地，IL10／interleukin-10 會抑制其表現。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：96 aa
CCL20 蛋白質長 96 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其第 1 至第 26 個胺基酸被註記為訊號區段；此序列特徵與資料所列的分泌性相符。來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL20 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供其在不同細胞狀態、條件或異構型之間定位改變的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RALBP1Q15311 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL20 結合並活化 CCR6，可引發趨化反應與細胞內鈣離子動員；此配體—受體組合參與樹突細胞、效應／記憶 T 細胞及 B 細胞移動，並作用於皮膚與黏膜的穩態和發炎環境，也與癌症及多種自體免疫疾病相關。CCL20 可吸引淋巴球、稍微吸引嗜中性球但不吸引單核球，並參與 Th17、Treg 招募；胸腺 nTreg 與 DN1 細胞遷移的作用依相似性推論。C 端加工形式仍具白血球趨化活性。CCL20 亦可透過 CCR6 促進精子運動與趨化，抑制骨髓系前驅細胞增殖，可能參與黏膜淋巴組織形成與功能，並對指定的 E. coli 及 S. aureus 菌株具有抗菌活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a ligand for C-C chemokine receptor CCR6. Signals through binding and activation of CCR6 and induces a strong chemotactic response and mobilization of intracellular calcium ions. The ligand-receptor pair CCL20-CCR6 is responsible for the chemotaxis of dendritic cells (DC), effector/memory T-cells and B-cells and plays an important role at skin and mucosal surfaces under homeostatic and inflammatory conditions, as well as in pathology, including cancer and various autoimmune diseases. CCL20 acts as a chemotactic factor that attracts lymphocytes and, slightly, neutrophils, but not monocytes. Involved in the recruitment of both the pro-inflammatory IL17 producing helper T-cells (Th17) and the regulatory T-cells (Treg) to sites of inflammation. Required for optimal migration of thymic natural regulatory T cells (nTregs) and DN1 early thymocyte progenitor cells (By similarity). C-terminal processed forms have been shown to be equally chemotactically active for leukocytes. Positively regulates sperm motility and chemotaxis via its binding to CCR6 which triggers Ca2+ mobilization in the sperm which is important for its motility. Inhibits proliferation of myeloid progenitors in colony formation assays. May be involved in formation and function of the mucosal lymphoid tissues by attracting lymphocytes and dendritic cells towards epithelial cells (By similarity). Possesses antibacterial activity towards E.coli ATCC 25922 and S.aureus ATCC 29213 PMID 11035086 ↗ · PMID 11352563 ↗ · PMID 12149255 ↗ · PMID 20068036 ↗ · PMID 23765988 ↗ · PMID 25122636 ↗ · PMID 9038201 ↗ · PMID 9129037 ↗ · PMID 21376174 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | CCL20 可受細菌脂多醣（LPS）、TNF 及 IFNG／IFN-γ 誘導；PMA 在 U-937 細胞株與 Bowes 黑色素瘤細胞中也會誘導其表現。相對地，IL10／interleukin-10 會抑制 CCL20。 | 含實驗來源 | 證據與來源By bacterial lipopolysaccharides (LPS), TNF and IFNG/IFN-gamma. Induced by phorbol myristate acetate (PMA) in U-937 cell line and bowes melanoma. Repressed by IL10/interleukin-10 PMID 9013939 ↗ · PMID 9038201 ↗ · PMID 9129037 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAATATAACAGCACTCCCAAAGAACTGGGTACTCAACAC40TGAGCAGATCTGTTCTTTGAGCTAAAAACCATGTGCTGTA80CCAAGAGTTTGCTCCTGGCTGCTTTGATGTCAGTGCTGCT120ACTCCACCTCTGCGGCGAATCAGAAGCAGCAAGCAACTTT160GACTGCTGTCTTGGATACACAGACCGTATTCTTCATCCTA200AATTTATTGTGGGCTTCACACGGCAGCTGGCCAATGAAGG240CTGTGACATCAATGCTATCATCTTTCACACAAAGAAAAAG280TTGTCTGTGTGCGCAAATCCAAAACAGACTTGGGTGAAAT320ATATTGTGCGTCTCCTCAGTAAAAAAGTCAAGAACATGTA360AAAACTGTGGCTTTTCTGGAATGGAATTGGACATAGCCCA400AGAACAGAAAGAACCTTGCTGGGGTTGGAGGTTTCACTTG440CACATCATGGAGGGTTTAGTGCTTATCTAATTTGTGCCTC480ACTGGACTTGTCCAATTAATGAAGTTGATTCATATTGCAT520CATAGTTTGCTTTGTTTAAGCATCACATTAAAGTTAAACT560GTATTTTATGTTATTTATAGCTGTAGGTTTTCTGTGTTTA600GCTATTTAATACTAATTTTCCATAAGCTATTTTGGTTTAG640TGCAAAGTATAAAATTATATTTGGGGGGGAATAAGATTAT680ATGGACTTTCTTGCAAGCAACAAGCTATTTTTTAAAAAAA720ACTATTTAACATTCTTTTGTTTATATTGTTTTGTCTCCTA760AATTGTTGTAATTGCATTATAAAATAAGAAAAATATTAAT800AAGACAAATATTGAAAATAAAGAAACAAAAAGTT834cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。