演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL2MCP1

C-C motif chemokine ligand 2

CCL2 是 C-C motif chemokine ligand 2,屬於 CC 趨化因子家族,可透過 CCR2 傳遞訊號,並對特定免疫細胞具有趨化作用。

Homo sapiens17q12UniProt P13500
OFFICIAL SYMBOL
CCL2
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P13500
PDB / ALPHAFOLD
1DOK
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL2 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 2,是一種蛋白質編碼基因,產物屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其蛋白質長度為 99 個胺基酸,序列第 1 至 23 位被註記為訊號序列。這些資訊勾勒出 CCL2 作為 CC 趨化因子家族成員的基本特性;其與受體互動及對細胞移動的作用,詳見生物學功能段落。

Official symbol
CCL2
Gene name
C-C motif chemokine ligand 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10618
UniProt
P13500
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MCP1MCP-1MCAFSMC-CFGDCF-2HC11MGC9434SCYA2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL2pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:34,255,274–34,257,208
Gene span
1,935 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000225831 ★34,255,285–34,257,2033
ENST0000058090734,255,274–34,257,2082
ENST0000113714434,255,274–34,257,2033

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL2 是 C-C chemokine receptor CCR2 的配體。與 CCR2 結合並使其活化後,CCL2 會引發強烈的趨化反應,並促使細胞內鈣離子動員。這些作用將受體辨識與細胞移動反應連結起來。

其趨化活性具有細胞類型差異:來源指出,CCL2 對單核球與嗜鹼性球具有趨化作用,但對嗜中性球及嗜酸性球沒有此作用。因此,不能將其描述為對所有白血球皆具有相同的吸引效果。

在動脈粥樣硬化的疾病過程中,CCL2 可能參與單核球募集至動脈壁;來源以「可能」描述此關聯,並未將 CCL2 說成造成該疾病或募集現象的唯一原因。整體而言,現有資料支持 CCL2 可透過 CCR2 傳遞訊號,並對特定細胞產生趨化作用;其在動脈粥樣硬化中的角色則保留為可能參與。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34255285 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL2 ENST00000225831 GRCh38 chr17:34254285-34255385 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCTTGTCCACTGCTGCCTGCTATGCTAGCAACAGCCTCCTAACTCATAATGACTTAGCCATGAGGAATG
TTTCTAGATTCTCCTTTAGCTGTCTGCCCATTTGGAAGATGCTGAGGACAGAGAGAGGACCCAAGCAGGC
AACTAGTTGGAGGACTTGTACACGTTTCCTTCCAGCAGTATGTCAGAGAGGTGGCAGCCCACTGGGGACA
GGGCTGCCTGGGTTCTGTGCTCGAGGGGACCTTGAGCAGGCTATTTAACCCTTCTGTGCCTCAGTTGCCT
GATCTATAACATGAAAATTAGCAATCCCTACTAGATAAAGTTGGGGAATTTACAGAGTTAATATTTGTAA
AGGTCTGAGAATATTCCTGGCAGAGTAAGCACTCTGTGAGTATGACACTGGCATTTCTTCTGCAGCACTA
CATGCTGTCTATGCCTTTGTCCAAGTCTGAAACCCTAGAACTCTTAGAATTCAGTTCAATGTTTACACAA
TCCTACAGTTCTGCTAGGCTTCTATGATGCTACTATTCTGCATTTGAATGAGCAAATGGATTTAATGCAT
TGTCAGGGAGCCGGCCAAAGCTTGAGAGCTCCTTCCTGGCTGGGAGGCCCCTTGGAATGTGGCCTGAAGG
TAAGCTGGCAGCGAGCCTGACATGCTTTCATCTAGTTTCCTCGCTTCCTTCCTTTTCTGCAGTTTTCGCT
TCAGAGAAAGCAGAATCCTTAAAAATAACCCTCTTAGTTCACATCTGTGGTCAGTCTGGGCTTAATGGCA
CCCCATCCTCCCCATTTGCTCATTTGGTCTCAGCAGTGAATGGAAAAAGTGTCTCGTCCTGACCCCCTGC
TTCCCTTTCCTACTTCCTGGAAATCCACAGGATGCTGCATTTGCTCAGCAGATTTAACAGCCCACTTATC
ACTCATGGAAGATCCCTCCTCCTGCTTGACTCCGCCCTCTCTCCCTCTGCCCGCTTTCAATAAGAGGCAG
AGACAGCAGCCAGAGGAACCGAGAGGCTGAGACTAACCCAGAAACATCCAATTCTCAAACTGAAGCTCGC
ACTCTCGCCTCCAGCATGAAAGTCTCTGCCGCCCTTCTGTGCCTGCTGCTC
CCL2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL2_1 ↗17:34,255,285正股34,255,236–34,255,295

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_83274W · enhancer · 34250391–34250629 · regulatory

ENSR17_9HL3X · enhancer · 34252022–34252496 · regulatory

ENSR17_B8RJJ · promoter · 34252497–34253010 · regulatory

ENSR17_B8RJT · promoter · 34254784–34255295 · regulatory

ENSR17_9HL62 · enhancer · 34259158–34259503 · regulatory

· motif · 34252237–34252250 · motif

· motif · 34252252–34252265 · motif

· motif · 34252317–34252324 · motif

· motif · 34252442–34252449 · motif

· motif · 34252707–34252714 · motif

· motif · 34252737–34252759 · motif

· motif · 34252737–34252759 · motif

· motif · 34253106–34253117 · motif

· motif · 34254896–34254905 · motif

CCL2 在高張條件下表現上調。胰島中,IL1B 會刺激其分泌;在心臟纖維母細胞與內皮細胞中,凝血因子 Xa(F10)則以依賴 PAR-1(F2R)的方式促使其上調。另有資料指出,凝血酶(F2)會使內皮細胞中的 CCL2 上調。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:99 aa

1 aa99 aa訊號胜肽
依 P13500 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL2 蛋白質長 99 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 23 位胺基酸被註記為訊號序列。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1DOK…

PDB · 1DOK

X-ray · 1.85 A · A/B=24-99

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL2 被註記為分泌型蛋白質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MCP1CCL2CCL5CCL8PF4RNF4TMX2Q2F862TNFAIP6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CCL2 可在單體與同源二聚體狀態之間達成平衡。它也會透過蛋白聚醣的 glycosaminoglycan(GAG)側鏈繫留於內皮細胞;此外,CCL2 與 TNFAIP6 互作,涉及 TNFAIP6 的 Link domain。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL2 是 C-C chemokine receptor CCR2 的配體,結合並活化 CCR2 後會引發強烈趨化反應及細胞內鈣離子動員。它對單核球與嗜鹼性球有趨化作用,但對嗜中性球與嗜酸性球沒有此作用;在動脈粥樣硬化過程中可能參與單核球進入動脈壁。含實驗來源
證據與來源

Acts as a ligand for C-C chemokine receptor CCR2. Signals through binding and activation of CCR2 and induces a strong chemotactic response and mobilization of intracellular calcium ions. Exhibits a chemotactic activity for monocytes and basophils but not neutrophils or eosinophils. May be involved in the recruitment of monocytes into the arterial wall during the disease process of atherosclerosis

PMID 10529171 ↗ · PMID 10587439 ↗ · PMID 8107690 ↗ · PMID 8195247 ↗ · PMID 8627182 ↗ · PMID 9792674 ↗ · PMID 9837883 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CCL2 可在單體與同源二聚體狀態之間達成平衡。它可透過蛋白聚醣的 glycosaminoglycan(GAG)側鏈繫留於內皮細胞,並與 TNFAIP6 互作;該互作涉及 TNFAIP6 的 Link domain。含實驗來源
證據與來源

Monomer or homodimer; in equilibrium. Is tethered on endothelial cells by glycosaminoglycan (GAG) side chains of proteoglycans. Interacts with TNFAIP6 (via Link domain)

PMID 15033992 ↗ · PMID 27044744 ↗ · PMID 8898111 ↗ · PMID 8989326 ↗ · PMID 9792674 ↗ · PMID 9837883 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 23955712 ↗ · PMID 2513477 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控高張條件會使 CCL2 上調。胰島中,IL1B 刺激其分泌;心臟纖維母細胞與內皮細胞中,凝血因子 Xa(F10)以依賴 PAR-1(F2R)的方式促使其上調;凝血酶(F2)也會使內皮細胞中的 CCL2 上調。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated upon hypertonic conditions. In pancreatic islets, secretion is stimulated by IL1B. Up-regulated by coagulation factor Xa (F10) in PAR-1 (F2R)-dependent manner in cardiac fibroblasts and endothelial cells. Up-regulated by thrombin (F2) in endothelial cells

PMID 23233732 ↗ · PMID 23955712 ↗ · PMID 30568593 ↗ · PMID 34831181 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000225831 · 741 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGAGGCTGAGACTAACCCAGAAACATCCAATTCTCAAAC40
41TGAAGCTCGCACTCTCGCCTCCAGCATGAAAGTCTCTGCC80
81GCCCTTCTGTGCCTGCTGCTCATAGCAGCCACCTTCATTC120
121CCCAAGGGCTCGCTCAGCCAGATGCAATCAATGCCCCAGT160
161CACCTGCTGTTATAACTTCACCAATAGGAAGATCTCAGTG200
201CAGAGGCTCGCGAGCTATAGAAGAATCACCAGCAGCAAGT240
241GTCCCAAAGAAGCTGTGATCTTCAAGACCATTGTGGCCAA280
281GGAGATCTGTGCTGACCCCAAGCAGAAGTGGGTTCAGGAT320
321TCCATGGACCACCTGGACAAGCAAACCCAAACTCCGAAGA360
361CTTGAACACTCACTCCACAACCCAAGAATCTGCAGCTAAC400
401TTATTTTCCCCTAGCTTTCCCCAGACACCCTGTTTTATTT440
441TATTATAATGAATTTTGTTTGTTGATGTGAAACATTATGC480
481CTTAAGTAATGTTAATTCTTATTTAAGTTATTGATGTTTT520
521AAGTTTATCTTTCATGGTACTAGTGTTTTTTAGATACAGA560
561GACTTGGGGAAATTGCTTTTCCTCTTGAACCACAGTTCTA600
601CCCCTGGGATGTTTTGAGGGTCTTTGCAAGAATCATTAAT640
641ACAAAGAATTTTTTTTAACATTCCAATGCATTGCTAAAAT680
681ATTATTGTGGAAATGAATATTTTGTAACTATTACACCAAA720
721TAAATATATTTTTGTACAAAA741

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。