基因總覽
CCL18 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 18，是一種蛋白質編碼基因，產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其蛋白質為 89 個胺基酸長，序列包含位於第 1 至第 20 個胺基酸的訊號區段。作為趨化因子，CCL18 的基本角色是引導特定免疫細胞移動；其作用對象與可能參與的免疫反應，以下另作說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000616054 ★ | 36,064,272–36,072,032 | 3 |
| ENST00001135173 | 36,064,228–36,072,032 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL18 是趨化因子，可引導淋巴球移動；來源指出，它吸引淋巴球，但不吸引單核球或顆粒球，顯示其趨化作用具有細胞類型選擇性。這項選擇性描述限於來源所列的細胞，並未提供其對其他細胞類型的作用資訊。
在淋巴結中，CCL18 可能參與 B 細胞移入 B 細胞濾泡。此項作用以「可能參與」描述，來源並未將它表述為已確立的唯一或必要機制，因此不宜據此推論其對 B 細胞濾泡形成或其他過程的影響。
CCL18 也能吸引初始 T 淋巴球朝向樹突細胞與活化巨噬細胞所在的位置，並對初始 T 細胞、CD4+ T 細胞及 CD8+ T 細胞具有趨化活性。來源未進一步說明這些細胞如何感知 CCL18，或其移動所依賴的分子機制；可支持的重點是 CCL18 對上述 T 細胞族群具有引導移動的作用。
由於其作用涵蓋 B 細胞與多類 T 細胞，CCL18 可能同時參與體液性與細胞媒介的免疫反應。這是根據其細胞趨化作用提出的可能角色，來源沒有提供足以界定其在兩類免疫反應中具體作用階段或影響程度的資訊。
Promoter 與基因調控
>CCL18 ENST00000616054 GRCh38 chr17:36063272-36064372 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAAAGCAGATTGCCCTCTCTAATGTGGTGGGCTTCATTCAATTAGTTGAAGTTCTGAATACAACAAAAAG CCTGACCCTCCTGCCTGTAAGAGGGAATTCCTCTTGCCTGATTGCCTTCACACTGGGACATAGGTTTTTC TCCTGCCTTTGAACTTAAACTGAAACATCATCTCTTCCTGGGCCTTAAGCCTGCCCATTCTCAGGTCTTT GAACTCAAACTGGGACTACACTAGCAGCTCTCCTGGGTCTCCAGCTTGCCAGCTCACCCTGCAGATCTTG GAACTTGTCAGCCTTCATAATTAAATGAGCCAATTCTCTAATTTCTTATTTTTTATACACACACCATTGG TTCTGTGTCTCTGGGGAATCCTGACTTATACAATGGTCTTACCAATGAGTTGCCAAGGTCCATTGGGTAT TCATGTGGCAAAAAATAAATCTTGAATCCTTCTTCACACCAAACATAAAAATCAACTCCAGATGGATTGT AATTTAAATATTAATGCTAAAACAATAAAGCTTCTACAAGTTAACATAGGAGGATATCTTTATTGCCTTA GGATAGGGGAAGATTTCTCATTAGATCACGAAAGGCCTAACTGTATATAAAAGATTGAAGCATGTGACTC TCTTAAAAGGAAAAACAATTGTGAAAATCCATTAAAGCATTCTGCTCTATCAAAGGAGGCTGTGACCACT CATTTCTGAGAAATATCTGTCATGTGAAAACATAATCACATGATTATGCATAATCCTAAGCATAATCCCT GGGTGCTTCCAACTCCTGGTCACCCATCTGGAGATACAACTTCTCCATAAGCCCCTCAATCAACAAGTGA ACCACTCGTTTGTGTACCCTAAACCTTTCAAGTAACCATAGGCAACCCTGGGCTGAGAACTCACATGACA CCACCATAGTTAAAATGTCTTGCATCAGCACCTCCAATGTTCCCATGGTCCAGTCTGCCTATAAAAAGGA GAGACAACAGCTCATACCCCAGAAGGAGGCCAGGAGTTGTGAGTTTCCAAGCCCCAGCTCACTCTGACCA CTTCTCTGCCTGCCCAGCATCATGAAGGGCCTTGCAGCTGCCCTCCTTGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL18_1 ↗ | 17:36,064,272 | 正股 | 36,064,223–36,064,282 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 36064527–36064540 · motif
· motif · 36064527–36064540 · motif
· motif · 36065560–36065571 · motif
· motif · 36066758–36066770 · motif
巨噬細胞中的 CCL18 表現可由 IL4、IL13 與 IL10 誘導，並受 IFNG 抑制；糖皮質激素與 IL4 合併時則有輕微的正向協同作用。PMA 可在包括單核球 U-937 細胞在內的數種人類細胞株中強烈誘導其表現；SEA 與 SEB 也可誘導 PBMC 中的表現。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：89 aa
CCL18 蛋白質長 89 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其序列第 1 至第 20 個胺基酸標註為訊號區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL18 的定位註解為分泌型。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PITPNM3Q9BZ71 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL18 是趨化因子，可吸引淋巴球，但不吸引單核球或顆粒球。它可能參與淋巴結中 B 細胞移入 B 細胞濾泡，也能引導初始 T 淋巴球朝向樹突細胞與活化巨噬細胞，並對初始 T 細胞、CD4+ T 細胞及 CD8+ T 細胞具有趨化活性。因此，CCL18 可能參與體液性與細胞媒介的免疫反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic factor that attracts lymphocytes but not monocytes or granulocytes. May be involved in B-cell migration into B-cell follicles in lymph nodes. Attracts naive T-lymphocytes toward dendritic cells and activated macrophages in lymph nodes, has chemotactic activity for naive T-cells, CD4+ and CD8+ T-cells and thus may play a role in both humoral and cell-mediated immunity responses PMID 11745396 ↗ · PMID 11978786 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | 巨噬細胞中的 CCL18 表現可由 IL4、IL13 與 IL10 特異性誘導，並受 IFNG 抑制；糖皮質激素與 IL4 合併時具有輕微的正向協同效果。PMA 可在數種人類細胞株（包括單核球 U-937 細胞）中強烈誘導其表現；SEA 與 SEB 則可誘導 PBMC 中的表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Specifically induced in macrophages by IL4/interleukin-4, IL13/interleukin-13, and IL10/interleukin-10. Expression is inhibited by IFNG/IFN-gamma while glucocorticoids exert a slightly positive synergistic effect in combination with IL4/interleukin-4. Strongly induced in several human cell lines, including monocytic U-937 cells, by phorbol myristate acetate (PMA). Induced in PBMC by staphylococcal enterotoxins SEA and SEB PMID 11745396 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGAGGCCAGGAGTTGTGAGTTTCCAAGCCCCAGCTC40ACTCTGACCACTTCTCTGCCTGCCCAGCATCATGAAGGGC80CTTGCAGCTGCCCTCCTTGTCCTCGTCTGCACCATGGCCC120TCTGCTCCTGTGCACAAGTTGGTACCAACAAAGAGCTCTG160CTGCCTCGTCTATACCTCCTGGCAGATTCCACAAAAGTTC200ATAGTTGACTATTCTGAAACCAGCCCCCAGTGCCCCAAGC240CAGGTGTCATCCTCCTAACCAAGAGAGGCCGGCAGATCTG280TGCTGACCCCAATAAGAAGTGGGTCCAGAAATACATCAGC320GACCTGAAGCTGAATGCCTGAGGGGCCTGGAAGCTGCGAG360GGCCCAGTGAACTTGGTGGGCCCAGGAGGGAACAGGAGCC400TGAGCCAGGGCAATGGCCCTGCCACCCTGGAGGCTACCTC440TTCTAAGAGTCCCATCTGCTATGCCCAGCCACATTAACTA480ACTTTAATCTTAGTTTATGCATCATATTTCATTTTGAAAT520TGATTTCTATTGTTGAGCTGCATTATGAAATTAGTATTTT560CTCTGACATCTCATGACATTGTCTTTATCATCCTTTCCCC600TTTCCCTTCAACTCTTCGTACATTCAATGCATGGATCAAT640CAGTGTGATTAGCTTTCTCAGCAGACATTGTGCCATATGT680ATCAAATGACAAATCTTTATTGAATGGTTTTGCTCAGCAC720CACCTTTTAATATATTGGCAGTACTTATTATATAAAAGGT760AAACCAGCATTCTCACTGTGACGACTCTGTTGATTTTGTT800TCACTAATCGGAATCACAGACTGAGAGGAATTCTGGGGGA840GGAGTAGGGAAATATGAAAAGGGGCAGAAACAGCAAGATA880GGGACCAAGTACTTCTACAGTCATACCAGACATTTCCCTG920GAGATACTTTCCTGAAAAGTTGAAACAGACACCATTAGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。