基因總覽
CCL17（C-C motif chemokine ligand 17）是蛋白質編碼基因，產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其蛋白質為趨化因子，具有引導特定免疫細胞移動的特性，並參與免疫與發炎相關過程。來源將其列為分泌型蛋白質；其主要作用對象與生物學作用詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000219244 ★ | 57,404,767–57,416,063 | 4 |
| ENST00000616880 | 57,413,862–57,416,063 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL17 是具有趨化活性的 chemokine，可引導 T lymphocytes 移動，其中對 Th2 cells 的作用較為偏好；來源指出，它不對 monocytes 或 granulocytes 顯示相同的趨化活性。這種細胞選擇性使 CCL17 參與多種發炎與免疫過程。其作用方式之一，是與 T 細胞表面的 CCR4 結合。
在發炎相關反應中，CCL17 也介導由 GM-CSF/CSF2 驅動的疼痛與發炎。這項作用與其引導 T 細胞的功能有所不同，來源並未進一步說明其中的分子步驟，因此不宜延伸推定其機制。
在腦部，依相似性證據，CCL17 被描述為在穩態條件下維持海馬微膠細胞典型、高度分枝形態所必需。對於急性 lipopolysaccharide（LPS）誘發的神經發炎，CCL17 可能有助於微膠細胞形態及突觸可塑性作出適當調整；此處的功能描述帶有相似性推論，並非確定性結論。
此外，依相似性證據，CCL17 參與傷口癒合，主要方式是促進 fibroblast 移入傷口。上述作用涵蓋免疫細胞趨化、疼痛與發炎反應，以及腦部穩態和組織修復；各作用的條件與證據性質並不相同。
Promoter 與基因調控
>CCL17 ENST00000219244 GRCh38 chr16:57403767-57404867 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCCTCAGCCTCCCAAGTACCTGGGACTACAGGCACCTGCCACCACGCTCAGCTGATTTTTGTATTTTT AGTAGAGATGGGATTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACCCCTGACTTCAAGTGATCCACCTGCC TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCTAAAAAAGTTTGAAAAAGGT GAAGGAGTGAGTCCTGCAGGTATCTGGGGACAACATTCCAGGCTGAAAGAACAGTCCGTGCAAACCTCCT CAGGAAGGAGCATGTCTGTCTGGTTGGTTTGAGGCATAGGGAGGAGGCCAGGGTGGCTGGGGCAGAGTGA ACCAGGGAACCAGGAGATACAGGTGGGCAGAGAGCAGGGCACAGAACTCGCGGGGCCTCGTGGCTGCTGG AGGGTCTTGGACTTGTCCTCTGCGTGAGGTGGAGAGCCACGGGGACGTTCTGAACACGGGAGATTCATGG TCCCTCTGCTGCTGTGCTGAGAATACACTGTAGGGGGCAAGGATGGAGACAGGGAGAGCACCCAGAAGGC AGTTGTAGGAAGCCAGGGATTGATGCTGGTTTCTGGGTGTATTTGGAAAGCAGAGACATGAGCTCACCCA ACAGATGGGAAGTTGGGGGCGAGAGGAAGAGGCGTCAGGGATAGCGCCCAGGTTTCTGGCCCTAGTAACC GGAAGGAAGGGGCTGGCAGAGAAGGAGGAGAGAGCAGGTGTAGGGGTGGGTGGGAATCAGAAATTCAGCT TCAGACTTGGGGGGTTGGAGCTGCCTATTTGGTATGGCGAGTAGGCAGCTGGACGTAGAAGGAGGCTGGA GTTTGCGAGAGAAACTTGGGAGTGGTTGGCATATAGATGATATTTAAAGTCAGAAACGTGTACTATTTGC CAGATATAAGCAGTAAGGCAGTTGATGCAAACCAAAGCCTTCTAATGTAATTATTGTTATTATTTTCATT TTGCAGCTGTAGAAACTGAGGCTCAGAGAGAAGTGACTTTGAGCTCACAGTGTCACCGCCTGCTGATGGG AGAGCTGAATTCAAAACCAGGTGACCTGACCTAGAGTCTTTGCTCCTAACC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL17_1 ↗ | 16:57,413,869 | 正股 | 57,413,820–57,413,879 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 57401163–57401175 · motif
· motif · 57401165–57401180 · motif
· motif · 57401247–57401262 · motif
· motif · 57401842–57401855 · motif
· motif · 57401842–57401855 · motif
· motif · 57402134–57402147 · motif
· motif · 57402134–57402147 · motif
· motif · 57402208–57402221 · motif
· motif · 57402208–57402221 · motif
· motif · 57402209–57402222 · motif
· motif · 57402209–57402222 · motif
· motif · 57405282–57405304 · motif
· motif · 57405282–57405304 · motif
· motif · 57405294–57405306 · motif
· motif · 57406767–57406779 · motif
在 monocytes 中，IL4 及 GM-CSF/CSF2 會提高 CCL17 蛋白質層級的表現；GM-CSF/CSF2 所引發的上調依賴 IRF4。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：94 aa
CCL17 蛋白質長 94 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其序列第 1 至 23 位被註記為訊號胜肽，與來源所列的分泌型性質相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL17 被註記為分泌型蛋白質；來源未提供不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL25O15444 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL28Q9NRJ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- CCR4P51679 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCR5P51681 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL17 是趨化因子，偏好引導 T lymphocytes，尤其是 Th2 cells，而不對 monocytes 或 granulocytes 顯示趨化活性；它與 T 細胞表面的 CCR4 結合，也介導 GM-CSF/CSF2 驅動的疼痛與發炎。依相似性證據，CCL17 參與維持穩態海馬微膠細胞的高度分枝形態，可能協助其因應急性 LPS 神經發炎時的形態與突觸可塑性變化，並可能藉促進 fibroblast 移入傷口參與傷口癒合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemokine, which displays chemotactic activity for T lymphocytes, preferentially Th2 cells, but not monocytes or granulocytes. Therefore plays an important role in a wide range of inflammatory and immunological processes. Acts by binding to CCR4 at T-cell surface. Mediates GM-CSF/CSF2-driven pain and inflammation. In the brain, required to maintain the typical, highly branched morphology of hippocampal microglia under homeostatic conditions. May be important for the appropriate adaptation of microglial morphology and synaptic plasticity to acute lipopolysaccharide (LPS)-induced neuroinflammation (By similarity). Plays a role in wound healing, mainly by inducing fibroblast migration into the wound (By similarity) PMID 10540332 ↗ · PMID 27525438 ↗ · PMID 8702936 ↗ · PMID 9169480 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在 monocytes 中，IL4 與 GM-CSF/CSF2 會提高 CCL17 的蛋白質層級表現；GM-CSF/CSF2 所造成的上調依賴 IRF4。 | 含實驗來源 | 證據與來源In monocytes, up-regulated by IL4 and by GM-CSF/CSF2 in an IRF4-dependent manner (at protein level) PMID 27525438 ↗ · PMID 29871928 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCAGAGAGAAGTGACTTTGAGCTCACAGTGTCACCGCC40TGCTGATGGGAGAGCTGAATTCAAAACCAGGGTGTCTCCC80TGAGCAGAGGGACCTGCACACAGAGACTCCCTCCTGGGCT120CCTGGCACCATGGCCCCACTGAAGATGCTGGCCCTGGTCA160CCCTCCTCCTGGGGGCTTCTCTGCAGCACATCCACGCAGC200TCGAGGGACCAATGTGGGCCGGGAGTGCTGCCTGGAGTAC240TTCAAGGGAGCCATTCCCCTTAGAAAGCTGAAGACGTGGT280ACCAGACATCTGAGGACTGCTCCAGGGATGCCATCGTTTT320TGTAACTGTGCAGGGCAGGGCCATCTGTTCGGACCCCAAC360AACAAGAGAGTGAAGAATGCAGTTAAATACCTGCAAAGCC400TTGAGAGGTCTTGAAGCCTCCTCACCCCAGACTCCTGACT440GTCTCCCGGGACTACCTGGGACCTCCACCGTTGGTGTTCA480CCGCCCCCACCCTGAGCGCCTGGGTCCAGGGGAGGCCTTC520CAGGGACGAAGAAGAGCCACAGTGAGGGAGATCCCATCCC560CTTGTCTGAACTGGAGCCATGGGCACAAAGGGCCCAGATT600AAAGTCTTTATCCTCA616cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。