基因總覽
CCL16（C-C motif chemokine ligand 16）是由蛋白質編碼基因產生的趨化因子，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其蛋白質全長 120 個胺基酸，帶有位於第 1 至第 23 個胺基酸的訊號序列，與其分泌型特徵相符。CCL16 的基本角色與免疫細胞移動及骨髓系細胞增殖調節相關；具體的細胞反應與作用條件見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000611905 ★ | 35,976,499–35,981,497 | 3 |
| ENST00000890728 | 35,976,192–35,981,537 | 3 |
| ENST00000890729 | 35,976,192–35,981,537 | 3 |
| ENST00001117484 | 35,976,192–35,981,537 | 2 |
| ENST00001141908 | 35,976,192–35,981,537 | 3 |
| ENST00001092971 | 35,980,093–35,981,537 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL16 具有趨化活性，但不同免疫細胞的反應並不相同。資料指出，它可吸引淋巴球與單核球，對嗜中性球則沒有相同作用；重組 SCYA16 的觀察進一步顯示，該蛋白可吸引單核球及 THP-1 單核球細胞，但未對靜止狀態的淋巴球或嗜中性球呈現趨化活性。因此，淋巴球是否處於靜止狀態，是來源所述反應差異中的一項條件。
在 THP-1 細胞中，CCL16 會誘發鈣離子通量。若細胞先前因 RANTES 表現而產生去敏化，這項鈣離子反應也受到去敏化。這表示 CCL16 所引發的細胞反應，會受到細胞先前接觸或表現 RANTES 的狀態影響；來源未進一步說明此現象涉及的分子機制。
除趨化作用外，CCL16 也具有強效的骨髓抑制活性，能抑制骨髓系前驅細胞增殖。這項效應與其促進特定免疫細胞移動的作用有所不同，顯示 CCL16 的功能涵蓋細胞趨化及骨髓系前驅細胞生長抑制。現有資料未提供這些作用在體內的具體情境或相互關係，因此不宜據此推定其生理效果範圍。
Promoter 與基因調控
>CCL16 ENST00000611905 GRCh38 chr17:35981397-35982497 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGGATCTGCACAGTCCCTGTTTCTGCCCCTGCCTCCCACTGCCCTCAACACCTGAAACACATCACCTAT GCCTCTAAAGCTTGCTGTCCATCAACAGCAAAATCCCTTATATCTTTGATCTCTTCTCTAAATGCAGCTT TCAACATGGAAAAGGGTCCTGAGGCACCTGAAGAGAGAGGAAGCTGTGGGACAGGTCCAGCCAGAGCCCA GGCCAGAGGGGCAGAAGCTGGAGTCCTGGAGCACAGACGCAGGTTGTCAGGTGCACAGAGTTGGAGGGTC CCCTGCTGGTCATGGTTGGCCATGGGGGCACCCAGGAGGGATCAGCGAGCTGGCTACACCTAAAAATCAG TCCAAAGTCCGAGGTCCAAAGAGATAAATAAAAACATTGACAAATAAGTCAAACGGTCCAGCAACAAATG GGGACCCAAGGATCAGGCACATTGTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTATTAGCATACACTGTGACAGGAAAGA GTGTGAGCTCAATCATGTGGCCTTGGACTGGGAGAGGGCATTTCCTTCTCAGAGGCAACTAAGCCCTACC TTTGCCTCAGTCTGGGCTCTGTAATCCTGCTTTGTGCTCATCTCCCCAAGACTGATCACCTGGGGGAAGC TGGGGTGGTTCAACCCTGCCTGCCCTTCCCCAACATACAGATGGTGGCAGGTAACATGGTGAAATCAAAC AGATCTGGTTTTTCATCCGCCTATCCACCCAGGTGACCTTGGACAATTTATTTAGCCTCTAGGCCTCAGT AGTCCCAGGGAAGTAATAATCGCTATTCACTATTTTAAGGATTATATAAGATAGGGCATGTAAGGTAGCT GACACACATTCGCCCATTTCTTCACGTGAATTCAGATTCTACTGAATTCAGCTCTGCACCAAGTCCCATC CTCTGCTGCCCTCTGTTTCAGCAAACACTGAGGCCTGTTGTTTCTCCTCCTCTACCGGCTCTGATGCGGT CAAGGTCCAGAGAGCTGAGTAGTTGGCAAGCGGACCACCAGCAACAGACAACATCTTCATTCGGCTCTCC CTGAAGCTGTACTGCCTCGCTGAGAGGATGAAGGTCTCCGAGGCTGCCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL16_1 ↗ | 17:35,981,497 | 負股 | 35,981,487–35,981,546 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_833K83 · enhancer · 35982132–35982328 · regulatory
ENSR17_5BGHT2 · CTCF_binding_site · 35982570–35982591 · regulatory
· motif · 35978491–35978503 · motif
· motif · 35979608–35979619 · motif
· motif · 35979841–35979848 · motif
· motif · 35979899–35979911 · motif
· motif · 35979902–35979909 · motif
· motif · 35979902–35979917 · motif
· motif · 35980160–35980172 · motif
· motif · 35980163–35980170 · motif
· motif · 35980163–35980177 · motif
· motif · 35980164–35980177 · motif
· motif · 35980270–35980292 · motif
· motif · 35980270–35980292 · motif
· motif · 35980297–35980312 · motif
· motif · 35980303–35980315 · motif
· motif · 35980305–35980312 · motif
· motif · 35980305–35980320 · motif
· motif · 35980736–35980749 · motif
· motif · 35980918–35980933 · motif
· motif · 35981507–35981522 · motif
· motif · 35982128–35982143 · motif
· motif · 35982128–35982143 · motif
· motif · 35982135–35982150 · motif
· motif · 35982136–35982150 · motif
· motif · 35982572–35982588 · motif
來源資料將 CCL16 與 IL10（interleukin-10）連結，指出其受 IL10 調控；未提供調控方向、作用條件或機制細節。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：120 aa
CCL16 蛋白質全長 120 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。其第 1 至第 23 個胺基酸為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL16 為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL16 可吸引淋巴球與單核球，但不吸引嗜中性球，並具有強效骨髓抑制活性，可抑制骨髓系前驅細胞增殖。重組 SCYA16 可吸引單核球及 THP-1 單核球細胞，但對靜止狀態的淋巴球與嗜中性球沒有趨化活性；它也會在 THP-1 細胞誘發鈣離子通量，而該反應會受到先前 RANTES 表現造成的去敏化影響。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Shows chemotactic activity for lymphocytes and monocytes but not neutrophils. Also shows potent myelosuppressive activity, suppresses proliferation of myeloid progenitor cells. Recombinant SCYA16 shows chemotactic activity for monocytes and THP-1 monocytes, but not for resting lymphocytes and neutrophils. Induces a calcium flux in THP-1 cells that were desensitized by prior expression to RANTES |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | CCL16 與 IL10（interleukin-10）相關，來源指出其受 IL10 調控，但未提供調控方向或機制細節。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTTGGCAAGCGGACCACCAGCAACAGACAACATCTTCAT40TCGGCTCTCCCTGAAGCTGTACTGCCTCGCTGAGAGGATG80AAGGTCTCCGAGGCTGCCCTGTCTCTCCTTGTCCTCATCC120TTATCATTACTTCGGCTTCTCGCAGCCAGCCAAAAGTTCC160TGAGTGGGTGAACACCCCATCCACCTGCTGCCTGAAGTAT200TATGAGAAAGTGTTGCCAAGGAGACTAGTGGTGGGATACA240GAAAGGCCCTCAACTGTCACCTGCCAGCAATCATCTTCGT280CACCAAGAGGAACCGAGAAGTCTGCACCAACCCCAATGAC320GACTGGGTCCAAGAGTACATCAAGGATCCCAACCTACCTT360TGCTGCCTACCAGGAACTTGTCCACGGTTAAAATTATTAC400AGCAAAGAATGGTCAACCCCAGCTCCTCAACTCCCAGTGA440TGACCAGGCTTTAGTGGAAGCCCTTGTTTACAGAAGAGAG480GGGTAAACCTATGAAAACAGGGGAAGCCTTATTAGGCTGA520AACTAGCCAGTCACATTGAGAGAAGCAGAACAATGATCAA560AATAAAGGAGAAGTATTTCGAATATTTTCTCAATCTTAGG600AGGAAATACCAAAGTTAAGGGACGTGGGCAGAGGTACGCT640CTTTTATTTTTATATTTATATTTTTATTTTTTTGAGATAG680GGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGA720TCTTGGCTCACTTGATCTTGGCTCACTGTAACCTCCACCT760CCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCACCCCAGCCTCCCGAGTA800GCTGGGACTACAGGCTTGCGCCACCACACCTGGCTAATTT840TTGTATTTTTGGTAGAGACGGGATTCTACCATGTTGCCCA880GGCTGGTCTCAAACTCGTGTGCCCAAGCAATCCACCTGCC920TCAGCCTTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。