基因總覽
CCL15 是蛋白質編碼基因,其產物 C-C motif chemokine ligand 15 屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。這類分子與細胞趨化有關;就 CCL15 而言,來源記載其對 T 細胞與單核球具有吸引作用。蛋白質全長為 113 個胺基酸,含有位於第 1 至 21 個胺基酸的訊號序列。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000617897 ★ | 35,997,582–36,001,553 | 4 |
| ENST00000979506 | 35,988,463–36,002,119 | 5 |
| ENST00000979505 | 35,988,466–36,002,119 | 5 |
| ENST00000614368 | 35,996,440–35,998,370 | 3 |
| ENST00000979507 | 35,997,582–36,002,119 | 3 |
| ENST00001143488 | 35,997,582–36,002,119 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL15 是趨化因子,可吸引 T 細胞與單核球。這種作用具有細胞類型選擇性:來源指出,CCL15 不吸引嗜中性球、嗜酸性球或 B 細胞。因此,其趨化作用並非對所有免疫細胞都相同。
CCL15 主要透過 CC 趨化因子受體 CCR1 發揮作用,也會結合 CCR3。來源將 CCR1 描述為主要作用途徑,並另行指出 CCR3 結合;未提供這兩種受體在不同細胞或條件下的作用差異,也未說明 CCR3 結合是否帶來特定的細胞反應。
來源另提及數種 CCL15 片段形式:CCL15(22-92)、CCL15(25-92) 與 CCL15(29-92)。這些形式的趨化效力高於來源所稱的 CCL15;資料未進一步交代比較所用的實驗條件或各片段之間的效力差異。這項觀察顯示,CCL15 的片段形式與趨化效力有關,但來源不足以據此推論其作用機制或生理情境。
Promoter 與基因調控
>CCL15 ENST00000617897 GRCh38 chr17:36001453-36002553 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCCCTGTTTCATAGTAGGTAGTTATTCAGACATGAGCAGGGCGGGAGAGCCCCCTGCCCCACCATGAATG TCAGACAACCATCAGATGATGGTCAGGCAGTTGTTACACTGTCTCTCTAAAACAGTAATTGGTCAAAGCC AGCACCAGCAAAGACAGTCTCCCAATAGATAGAAATATCTCAAACTGGTGATCAACAGTTTCCCATTAAG ATCTCAGGAGTCAGGCAAGTAGGCTCAAGTATGTGCACTAAGAGGCAAAATGGCAGAGTTCAACTGGTAT GTGACCTAGGAACACTTGACTGGTCAAGAAGGAATGCCTCAAGTGAGCATGCGTACAACTCCAGTAAGCA CACTGTGCATGCAGCCCCTCCCTAGTGCTGGCAGACCACTGCGCATGCGGAATGCCAGCATATAAAACCC CAATCCAAAGGTCAAACCAGGCACTTGAATCTCTCCAGTCACCTGCTTGGCACTTTTCCAAGTGTTCTTT ACTTTCATTCCTGCTCTAAATCTTGTCTCGGTCTCTCACTCTGCCTTATACCCCTCAGTTGAATTATTTC TTCTGAGGAGGCAAGAACTGAGGCTGCTGCAGACTGATATGGATTCACCACTGCTAACACCTCCTGGTTG GAACTACAGGAATAGAACTGGAAAGGGAAAAAAGGCAGCATTCACCACATCCCAATCCTGAATCCAAGAG TCTAAGATAGTCCCCCACTCCTATCTCAGGCTTAGAGGATTAGATTAATCTCCTGGAGGGAAGACTCTTC CTTGAAACATTTTTTTTTATCTGCCTGTAGCTATTGGGATAATTCGGGAAATCCACAGGGACAGTTCAAG TCATCTTTGTCCTCTACTTTCTGTTGCACTCTCAGCCTTGTTCTCTTTTTAGAAACTGCATGGTAACTAT TATATAGCTAAAGAAGAGCATTCTGACCTCTGCCCTGGGACTTCCTGGATCCTCCTCTTCTTATAAATAC AAGGGCAGAGCTGGTATCCCGGGGAGCCAGGAAGCAGTGAGCCCAGGAGTCCTCGGCCAGCCCTGCCTGC CCACCAGGAGGATGAAGGTCTCCGTGGCTGCCCTCTCCTGCCTCATGCTTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL15_3 ↗ | 17:35,997,839 | 負股 | 35,997,829–35,997,888 |
| CCL15_1 ↗ | 17:36,001,550 | 負股 | 36,001,540–36,001,599 |
| CCL15_2 ↗ | 17:36,002,113 | 負股 | 36,002,103–36,002,162 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:113 aa
CCL15 蛋白質長 113 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 21 個胺基酸被註記為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL15 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供其他定位資訊或不同條件下的定位變化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
CCL15 被記載為單體,來源未指出其形成複合體或與其他蛋白質構成複合物。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL15 是趨化因子,可吸引 T 細胞與單核球,但不吸引嗜中性球、嗜酸性球或 B 細胞。它主要透過 CC 趨化因子受體 CCR1 作用,也會結合 CCR3。CCL15(22-92)、CCL15(25-92) 與 CCL15(29-92) 的趨化效力高於來源所稱的 CCL15。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemotactic factor that attracts T-cells and monocytes, but not neutrophils, eosinophils, or B-cells. Acts mainly via CC chemokine receptor CCR1. Also binds to CCR3. CCL15(22-92), CCL15(25-92) and CCL15(29-92) are more potent chemoattractants than the CCL15 PMID 15905581 ↗ |
| 交互作用 | Monomer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGGGAGCCAGGAAGCAGTGAGCCCAGGAGTCCTCGGCCAG40CCCTGCCTGCCCACCAGGAGGATGAAGGTCTCCGTGGCTG80CCCTCTCCTGCCTCATGCTTGTTGCTGTCCTTGGATCCCA120GGCCCAGTTCACAAATGATGCAGAGACAGAGTTAATGATG160TCAAAGCTTCCACTGGAAAATCCAGTAGTTCTGAACAGCT200TTCACTTTGCTGCTGACTGCTGCACCTCCTACATCTCACA240AAGCATCCCGTGTTCACTCATGAAAAGTTATTTTGAAACG280AGCAGCGAGTGCTCCAAGCCAGGTGTCATATTCCTCACCA320AGAAGGGGCGGCAAGTCTGTGCCAAACCCAGTGGTCCGGG360AGTTCAGGATTGCATGAAAAAGCTGAAGCCCTACTCAATA400TAATAATAAAGAGACAAAAGAGGCCAGCCACCCACCTCCA440ACACCTCCTGTGAGTTTCTTGGTCTGAAATACTTAAAAAA480TATATATATTGTTGTGTCTGGTAATGAAAGTAATGCATCT520AATAAAGAGTATTCAATTTTTTAACTTTGCTTGAGTTTTA560AGAGGAAATAAACTAATATAAAACTGAA588cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。