演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL15HCC-2

C-C motif chemokine ligand 15

CCL15 編碼 C-C motif chemokine ligand 15,屬於 CC 趨化因子家族,可吸引 T 細胞與單核球。

Homo sapiens17q12UniProt Q16663
OFFICIAL SYMBOL
CCL15
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q16663
PDB / ALPHAFOLD
7VL9
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL15 是蛋白質編碼基因,其產物 C-C motif chemokine ligand 15 屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。這類分子與細胞趨化有關;就 CCL15 而言,來源記載其對 T 細胞與單核球具有吸引作用。蛋白質全長為 113 個胺基酸,含有位於第 1 至 21 個胺基酸的訊號序列。

Official symbol
CCL15
Gene name
C-C motif chemokine ligand 15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10613
UniProt
Q16663
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HCC-2NCC-3SCYL3MIP-5Lkn-1MIP-1dHMRP-2BSCYA15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL15pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:35,988,463–36,002,119
Gene span
13,657 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000617897 ★35,997,582–36,001,5534
ENST0000097950635,988,463–36,002,1195
ENST0000097950535,988,466–36,002,1195
ENST0000061436835,996,440–35,998,3703
ENST0000097950735,997,582–36,002,1193
ENST0000114348835,997,582–36,002,1194

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL15 是趨化因子,可吸引 T 細胞與單核球。這種作用具有細胞類型選擇性:來源指出,CCL15 不吸引嗜中性球、嗜酸性球或 B 細胞。因此,其趨化作用並非對所有免疫細胞都相同。

CCL15 主要透過 CC 趨化因子受體 CCR1 發揮作用,也會結合 CCR3。來源將 CCR1 描述為主要作用途徑,並另行指出 CCR3 結合;未提供這兩種受體在不同細胞或條件下的作用差異,也未說明 CCR3 結合是否帶來特定的細胞反應。

來源另提及數種 CCL15 片段形式:CCL15(22-92)、CCL15(25-92) 與 CCL15(29-92)。這些形式的趨化效力高於來源所稱的 CCL15;資料未進一步交代比較所用的實驗條件或各片段之間的效力差異。這項觀察顯示,CCL15 的片段形式與趨化效力有關,但來源不足以據此推論其作用機制或生理情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 36001553 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL15 ENST00000617897 GRCh38 chr17:36001453-36002553 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCCTGTTTCATAGTAGGTAGTTATTCAGACATGAGCAGGGCGGGAGAGCCCCCTGCCCCACCATGAATG
TCAGACAACCATCAGATGATGGTCAGGCAGTTGTTACACTGTCTCTCTAAAACAGTAATTGGTCAAAGCC
AGCACCAGCAAAGACAGTCTCCCAATAGATAGAAATATCTCAAACTGGTGATCAACAGTTTCCCATTAAG
ATCTCAGGAGTCAGGCAAGTAGGCTCAAGTATGTGCACTAAGAGGCAAAATGGCAGAGTTCAACTGGTAT
GTGACCTAGGAACACTTGACTGGTCAAGAAGGAATGCCTCAAGTGAGCATGCGTACAACTCCAGTAAGCA
CACTGTGCATGCAGCCCCTCCCTAGTGCTGGCAGACCACTGCGCATGCGGAATGCCAGCATATAAAACCC
CAATCCAAAGGTCAAACCAGGCACTTGAATCTCTCCAGTCACCTGCTTGGCACTTTTCCAAGTGTTCTTT
ACTTTCATTCCTGCTCTAAATCTTGTCTCGGTCTCTCACTCTGCCTTATACCCCTCAGTTGAATTATTTC
TTCTGAGGAGGCAAGAACTGAGGCTGCTGCAGACTGATATGGATTCACCACTGCTAACACCTCCTGGTTG
GAACTACAGGAATAGAACTGGAAAGGGAAAAAAGGCAGCATTCACCACATCCCAATCCTGAATCCAAGAG
TCTAAGATAGTCCCCCACTCCTATCTCAGGCTTAGAGGATTAGATTAATCTCCTGGAGGGAAGACTCTTC
CTTGAAACATTTTTTTTTATCTGCCTGTAGCTATTGGGATAATTCGGGAAATCCACAGGGACAGTTCAAG
TCATCTTTGTCCTCTACTTTCTGTTGCACTCTCAGCCTTGTTCTCTTTTTAGAAACTGCATGGTAACTAT
TATATAGCTAAAGAAGAGCATTCTGACCTCTGCCCTGGGACTTCCTGGATCCTCCTCTTCTTATAAATAC
AAGGGCAGAGCTGGTATCCCGGGGAGCCAGGAAGCAGTGAGCCCAGGAGTCCTCGGCCAGCCCTGCCTGC
CCACCAGGAGGATGAAGGTCTCCGTGGCTGCCCTCTCCTGCCTCATGCTTG
CCL15 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL15_3 ↗17:35,997,839負股35,997,829–35,997,888
CCL15_1 ↗17:36,001,550負股36,001,540–36,001,599
CCL15_2 ↗17:36,002,113負股36,002,103–36,002,162

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:113 aa

1 aa113 aa訊號胜肽
依 Q16663 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL15 蛋白質長 113 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 21 個胺基酸被註記為訊號序列。

訊號胜肽1–21 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7VL9…

PDB · 7VL9

EM · 2.60 A · L=47-113

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL15 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供其他定位資訊或不同條件下的定位變化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HCC-2CCL15
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CCL15 被記載為單體,來源未指出其形成複合體或與其他蛋白質構成複合物。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL15 是趨化因子,可吸引 T 細胞與單核球,但不吸引嗜中性球、嗜酸性球或 B 細胞。它主要透過 CC 趨化因子受體 CCR1 作用,也會結合 CCR3。CCL15(22-92)、CCL15(25-92) 與 CCL15(29-92) 的趨化效力高於來源所稱的 CCL15。含實驗來源
證據與來源

Chemotactic factor that attracts T-cells and monocytes, but not neutrophils, eosinophils, or B-cells. Acts mainly via CC chemokine receptor CCR1. Also binds to CCR3. CCL15(22-92), CCL15(25-92) and CCL15(29-92) are more potent chemoattractants than the CCL15

PMID 15905581 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer含實驗來源
證據與來源

Monomer

PMID 10320325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000617897 · 588 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGGAGCCAGGAAGCAGTGAGCCCAGGAGTCCTCGGCCAG40
41CCCTGCCTGCCCACCAGGAGGATGAAGGTCTCCGTGGCTG80
81CCCTCTCCTGCCTCATGCTTGTTGCTGTCCTTGGATCCCA120
121GGCCCAGTTCACAAATGATGCAGAGACAGAGTTAATGATG160
161TCAAAGCTTCCACTGGAAAATCCAGTAGTTCTGAACAGCT200
201TTCACTTTGCTGCTGACTGCTGCACCTCCTACATCTCACA240
241AAGCATCCCGTGTTCACTCATGAAAAGTTATTTTGAAACG280
281AGCAGCGAGTGCTCCAAGCCAGGTGTCATATTCCTCACCA320
321AGAAGGGGCGGCAAGTCTGTGCCAAACCCAGTGGTCCGGG360
361AGTTCAGGATTGCATGAAAAAGCTGAAGCCCTACTCAATA400
401TAATAATAAAGAGACAAAAGAGGCCAGCCACCCACCTCCA440
441ACACCTCCTGTGAGTTTCTTGGTCTGAAATACTTAAAAAA480
481TATATATATTGTTGTGTCTGGTAATGAAAGTAATGCATCT520
521AATAAAGAGTATTCAATTTTTTAACTTTGCTTGAGTTTTA560
561AGAGGAAATAAACTAATATAAAACTGAA588

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。