演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL14HCC-1

C-C motif chemokine ligand 14

CCL14 是 C-C motif chemokine ligand 14,屬於 CC 趨化因子家族;其加工形式 HCC-1(9-74) 可吸引多種免疫細胞。

Homo sapiens17q12UniProt Q16627
OFFICIAL SYMBOL
CCL14
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q16627
PDB / ALPHAFOLD
2Q8T
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL14(C-C motif chemokine ligand 14)是蛋白質編碼基因,產物屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其蛋白質具有訊號胜肽,成熟與加工形式不同時,來源所述的生物活性也有所差異;其中 HCC-1(9-74) 是經加工的形式。

Official symbol
CCL14
Gene name
C-C motif chemokine ligand 14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10612
UniProt
Q16627
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HCC-1HCC-3NCC-2SCYL2CKb1MCIFSCYA14

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL14pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:35,983,288–35,987,033
Gene span
3,746 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000618404 ★35,983,288–35,986,7293
ENST0000061400935,983,288–35,987,0042
ENST0000090590635,983,288–35,987,0334
ENST0000103350135,983,288–35,986,7723
ENST0000109300535,983,288–35,986,7722
ENST0000109300735,983,288–35,986,7723
ENST0000114336735,983,288–35,986,7723
ENST0000109300435,983,656–35,986,7723
ENST0000062252635,983,659–35,986,6494
ENST0000062099135,983,687–35,986,7723

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL14 對人類單核球具有較弱的活性,並透過也能辨識 MIP-1 alpha 的受體作用。在 100–1,000 nM 濃度下,它可引起細胞內 Ca(2+) 變化並促使酵素釋放,但不會誘導趨化;在 T 淋巴球、嗜中性球與嗜酸性球白血球中則未見活性。

CCL14 也能增強 CD34 髓系前驅細胞的增殖。加工形式 HCC-1(9-74) 的作用不同,具有趨化活性,可吸引單核球、嗜酸性球與 T 細胞;它是 CCR1、CCR3 與 CCR5 的配體。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35986729 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL14 ENST00000618404 GRCh38 chr17:35986629-35987729 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTCACAGCGTATCTTCCCAATGTGCCTGGATATGGCCTCAGAATCATTTCCAACACAGAGCTCCAGTCC
ACCACTAATCAATGAAACCTACTAGCTATCCCTGAATTAGACATTTTCTAGGGTTCCCACCAAGCTTCTT
TGCAGCAAAAGTCAGAGAAACCAGGAGAAGGTCCCAAAGAGATCCACTATCTGATTTCAGAAAGGACTAA
GACTAAAGGCTTTATAGAAAACCCATAAGCTTTTACAGAGCTCCGTTGGGAGTCCCATGTTTCTTTATGG
CATAATGGGTGAGAACACAGACTTGGAAGCCAAACCACCTGAATTTGAACCCCAGTTCCATTTACCAACT
GTCAAAAGCTTAGGCTTTGATTCTGAGCCTGTTTCCTCAACTGCTGTTCTAAAGATTAAATAGGCTAATA
TTCATAAGGCAACTGGGACAGTGGCTTGTGTGTATAGCAACCATTATATAAGTGAATTATCTACTGAGCA
CCACAGCACTTCTTCACTCCATGGTGTGGTGACCAGAATGGAGATGAGACAGAGAACTGCAGGTTCTGCT
TCGAGTTTAAGTTAGGATTTCCCTTGACCAATGAGACCTGACTTGGAGGAGTCCTGGCCTCATTCCATTA
CCCCAAACACCCTCTAGTCTCTAGATGAACAGATCCTGAATGTCCAGGCCCCACGTGGCCTGTTCTAAGG
CCTGAGATGGAATTGGATACAGGACACATCCAGCCTTGAGATCTTTTGCTAAGTGTGACACAGTGCCCCC
AGCCCTGTGCTCATGTTCATGCCTAGGGAAAGGCTTCTATCAAAAGAGTTGAACTTCTTCCCACTGGGGA
TGGAAGACCATTTCCTCCCTTAAACCTTGGCTCTCCCTGCTTCCTTCAGGCCACCAACAACACATGTGCA
GGATATGAAATTGCTGAGGCATCACTGCTTTCCTACTTCCCTTCCAAGTCTCAGCTCCCTTATTTTAAAA
AATATTTGGCCTCAATGATCATTTCTCAACAATTCCTCACCGCAGGAGCCTCTGAAGCTCCCACCAGGCC
AGCTCTCCTCCCACAACAGCTTCCCACAGCATGAAGATCTCCGTGGCTGCC
CCL14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL14_2 ↗17:35,984,716負股35,984,706–35,984,765
CCL14_1 ↗17:35,986,729負股35,986,719–35,986,778

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_833K83 · enhancer · 35982132–35982328 · regulatory

ENSR17_5BGHT2 · CTCF_binding_site · 35982570–35982591 · regulatory

· motif · 35982128–35982143 · motif

· motif · 35982128–35982143 · motif

· motif · 35982135–35982150 · motif

· motif · 35982136–35982150 · motif

· motif · 35982572–35982588 · motif

· motif · 35991219–35991234 · motif

· motif · 35991253–35991267 · motif

· motif · 35991284–35991295 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:93 aa

1 aa93 aa訊號胜肽
依 Q16627 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL14 蛋白質長 93 個胺基酸,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。其第 1 至 19 個胺基酸為訊號區域;來源亦指出,加工形式 HCC-1(9-74) 具有不同於所述未加工形式的趨化活性。

訊號胜肽1–19 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2Q8T…

PDB · 2Q8T

X-ray · 2.23 A · A/B/C/D=20-93

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL14 被註記為分泌型蛋白質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HCC-1CCL14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL14 對人類單核球的作用較弱,經也辨識 MIP-1 alpha 的受體傳遞訊號;在 100–1,000 nM 下可引起細胞內 Ca(2+) 變化與酵素釋放,但不誘導趨化。它對 T 淋巴球、嗜中性球及嗜酸性球白血球無活性,並能促進 CD34 髓系前驅細胞增殖。加工形式 HCC-1(9-74) 則可趨化單核球、嗜酸性球與 T 細胞,並結合 CCR1、CCR3 和 CCR5。含實驗來源
證據與來源

Has weak activities on human monocytes and acts via receptors that also recognize MIP-1 alpha. It induces intracellular Ca(2+) changes and enzyme release, but no chemotaxis, at concentrations of 100-1,000 nM, and is inactive on T-lymphocytes, neutrophils, and eosinophil leukocytes. Enhances the proliferation of CD34 myeloid progenitor cells. The processed form HCC-1(9-74) is a chemotactic factor that attracts monocytes, eosinophils, and T-cells and is a ligand for CCR1, CCR3 and CCR5

PMID 11085751 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000618404 · 875 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTTCTCAACAATTCCTCACCGCAGGAGCCTCTGAAGCTC40
41CCACCAGGCCAGCTCTCCTCCCACAACAGCTTCCCACAGC80
81ATGAAGATCTCCGTGGCTGCCATTCCCTTCTTCCTCCTCA120
121TCACCATCGCCCTAGGGACCAAGACTGAATCCTCCTCACG160
161GGGACCTTACCACCCCTCAGAGTGCTGCTTCACCTACACT200
201ACCTACAAGATCCCGCGTCAGCGGATTATGGATTACTATG240
241AGACCAACAGCCAGTGCTCCAAGCCCGGAATTGTCTTCAT280
281CACCAAAAGGGGCCATTCCGTCTGTACCAACCCCAGTGAC320
321AAGTGGGTCCAGGACTATATCAAGGACATGAAGGAGAACT360
361GAGTGACCCAGAAGGGGTGGCGAAGGCACAGCTCAGAGAC400
401ATAAAGAGAAGATGCCAAGGCCCCCTCCTCCACCCACCGC440
441TAACTCTCAGCCCCAGTCACCCTCTTGGAGCTTCCCTGCT480
481TTGAATTAAAGACCACTCATGCTCTTCCCTGGCCTCATTC520
521CTTTCTACGGGATTTACTCATTGGCCATGCACTGAGGACA560
561CCAGGGTGTGGCACCCTCGGCATCAAGCCTCGCTCTGCAG600
601AAGTTTTGCTGGAGCCTGGTACAAAAAATAGGTCAGGCCT640
641GCAATGCAGGTAGTGAGAAGCAGAAAGTGAGAAAGAAAAG680
681CAGTGTAAAGACCGTCTCCTCCTCAGCAACAACAGTAGCA720
721GACCCCGTTTTCTTAATGCTTTCTATACTCCAAGCACTCT760
761GCTAGGCAGTCTGTATGCATTATCTTATTTAAGCTTCATG800
801ACAAGTGTAAAAGCTACAAATCATCATTTGATTTTTTAGG840
841TAACACTTCATAAAGGGCTCTCTATAGCAGTCAAA875

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。