基因總覽
CCL13（C-C motif chemokine ligand 13）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。這類分子與白血球的趨化有關；CCL13 可吸引單核球、淋巴球、嗜鹼性球及嗜酸性球，但不吸引嗜中性球。其蛋白質長 98 個胺基酸，序列註解指出第 1 至 16 個胺基酸為訊號肽，且蛋白質會被分泌。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000225844 ★ | 34,356,480–34,358,610 | 3 |
| ENST00001142770 | 34,356,438–34,358,610 | 3 |
| ENST00000577681 | 34,357,485–34,358,610 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL13 是趨化因子，可吸引特定白血球移動。其趨化作用涵蓋單核球、淋巴球、嗜鹼性球與嗜酸性球；來源明確指出，嗜中性球不受其吸引。CCL13 透過 CCR2B 與 CCR3 受體傳遞訊號，並藉此參與白血球的聚集。
在過敏性與非過敏性發炎中，CCL13 均參與白血球在發炎區域兩側的累積。這項描述指出其作用與不同類型發炎情境中的白血球分布相關，但未進一步界定各類細胞在不同情境下的相對貢獻。
CCL13 也可能參與動脈粥樣硬化病程中單核球被招募至動脈壁的過程；此角色以「可能」描述，不能視為已確立的作用。此外，在長期暴露於外源性病原體的組織中，CCL13 可能參與吸引單核球。這些可能的功能顯示其趨化作用或與特定組織環境及疾病過程中的單核球募集相關，但來源未提供更細節的分子機制。
Promoter 與基因調控
>CCL13 ENST00000225844 GRCh38 chr17:34355480-34356580 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCACTGGGCTTATTTTGCTATAGTGGAATGCAGAGGGATGAGTATTCCAGGAAGGCACAAAAACTGTGCC AAGTCTTGGAGCTAGGGATGAGTGGGAAAGGGACATGTTCAACCATTTTAAGCCATTCCCTCCCCACCTC CCAGCTCCCAGATATGTGCCCCTCGCAGGAGGAGCCCAGGAATGGGCCAAACACCTCACTTCTTTGCTCT GAGGGCCACCCCAGCCCTCCCATCAACAGCTCTAGAAACCCAATGGTCCTTCCTGGAAACACGGGGCCTG CATCAATCAGAGGTGTTTGAACCATGTCCCTCTGGGCCTGAGGGGCAGAAGGGGACACAATATGTAATGT AAGGAGCCCCTGTCATCAGAAATCTGACTTAATCTGTTTCAGATATTAGACTTCCACATAAAAGTTGACT TGGAAAAAGACTTCTGCTGCTAAACAAAAGTTGAAACTGCCTTGGTGATAAAATATAAGCAGACCAGCTT TCTCTTCTAGCTTTCCCTCTCATTTCCCATAAGATTTTGGTCAAGTTATTTAATCTCTCTGCATCCGTTT CCTCTTCTATGAAATGGGCATGATAATAATGGTATGTACCTCCTCAAACTAAATATATAACGTGAACAGA GTCCTTAGCACAGCACTCTTTCTCTACAGGAGTTAATTTTCATTGTTTTTCTCTTTCCTGTTGGAGAAAG TAAGAAGAAAACAGCTCCTTTATGGCTTCCCATGGTGAATGGCTGGGGCGCGTCTGTGTCCCTTTCTCCT CTCTGGCTCCTTGTGGCCTGAACAGCCAGAAGGAAGCCATGCCATGCTGTTTCAGCCCTCAGCTTCCCTC TTGCATTTCCTAGAAAAGTCTTTGGTGCCCAGCTCCAGCTCAGCAGATTCAGGATCCCCCTTCATCATGA CTTGGTCAACGCCCTGCTCAGGCCAAGGTCCTCTGAGAGTTCCAAGCTTCTCCACTCCCTATAAAAGGCC GGCGGAACAGCCAGAGGAGCAGAGAGGCAAAGAAACATTGTGAAATCTCCAACTCTTAACCTTCAACATG AAAGTCTCTGCAGTGCTTCTGTGCCTGCTGCTCATGACAGCAGCTTTCAAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL13_1 ↗ | 17:34,356,480 | 正股 | 34,356,431–34,356,490 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_8329C9 · enhancer · 34354767–34354897 · regulatory
· motif · 34354780–34354789 · motif
CCL13 的調控與 IL1／interleukin-1 及 TNF 有關；來源未進一步說明調控方向或作用條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：98 aa
CCL13 蛋白質長 98 個胺基酸，屬於 intercrine beta（chemokine CC）家族。序列註解將第 1 至 16 個胺基酸標示為訊號肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL13 為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CCL21O00585 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL10P02778 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL11O14625 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- XCL1P47992 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL13 可吸引單核球、淋巴球、嗜鹼性球與嗜酸性球，但不吸引嗜中性球，並透過 CCR2B 和 CCR3 傳遞訊號。它參與過敏性及非過敏性發炎兩側的白血球累積；在動脈粥樣硬化中可能促進單核球進入動脈壁，也可能吸引長期暴露於外源性病原體的組織中的單核球。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Chemotactic factor that attracts monocytes, lymphocytes, basophils and eosinophils, but not neutrophils. Signals through CCR2B and CCR3 receptors. Plays a role in the accumulation of leukocytes at both sides of allergic and non-allergic inflammation. May be involved in the recruitment of monocytes into the arterial wall during the disease process of atherosclerosis. May play a role in the monocyte attraction in tissues chronically exposed to exogenous pathogens |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | CCL13 的調控與 IL1／interleukin-1 及 TNF 有關；此敘述未提供調控方向、作用條件或更具體的調控機制。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGAGAGGCAAAGAAACATTGTGAAATCTCCAACTCTTAAC40CTTCAACATGAAAGTCTCTGCAGTGCTTCTGTGCCTGCTG80CTCATGACAGCAGCTTTCAACCCCCAGGGACTTGCTCAGC120CAGATGCACTCAACGTCCCATCTACTTGCTGCTTCACATT160TAGCAGTAAGAAGATCTCCTTGCAGAGGCTGAAGAGCTAT200GTGATCACCACCAGCAGGTGTCCCCAGAAGGCTGTCATCT240TCAGAACCAAACTGGGCAAGGAGATCTGTGCTGACCCAAA280GGAGAAGTGGGTCCAGAATTATATGAAACACCTGGGCCGG320AAAGCTCACACCCTGAAGACTTGAACTCTGCTACCCCTAC360TGAAATCAAGCTGGAGTACGTGAAATGACTTTTCCATTCT400CCTCTGGCCTCCTCTTCTATGCTTTGGAATACTTCTACCA440TAATTTTCAAATAGGATGCATTCGGTTTTGTGATTCAAAA480TGTACTATGTGTTAAGTAATATTGGCTATTATTTGACTTG520TTGCTGGTTTGGAGTTTATTTGAGTATTGCTGATCTTTTC560TAAAGCAAGGCCTTGAGCAAGTAGGTTGCTGTCTCTAAGC600CCCCTTCCCTTCCACTATGAGCTGCTGGCAGTGGGTTTGT640ATTCGGTTCCCAGGGGTTGAGAGCATGCCTGTGGGAGTCA680TGGACATGAAGGGATGCTGCAATGTAGGAAGGAGAGCTCT720TTGTGAATGTGAGGTGTTGCTAAATATGTTATTGTGGAAA760GATGAATGCAATAGTAGGACTGCTGACATTTTGCAGAAAA800TACATTTTATTTAAAATCTCCTA823cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。