演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CCL11eotaxin

C-C motif chemokine ligand 11

CCL11(C-C motif chemokine ligand 11)是趨化因子,參與過敏性與非過敏性發炎反應,並可促使多種白血球移動。

Homo sapiens17q12UniProt P51671
OFFICIAL SYMBOL
CCL11
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P51671
PDB / ALPHAFOLD
1EOT
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CCL11 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 11,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種趨化因子。此蛋白質可引導不同類型的白血球移動,與過敏性及非過敏性發炎反應有關。來源亦指出它能作用於內皮細胞,並參與血管新生。CCL11 是蛋白質編碼基因;其蛋白質含有訊號肽註解,且被記錄為分泌型蛋白質。

Official symbol
CCL11
Gene name
C-C motif chemokine ligand 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10610
UniProt
P51671
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
eotaxinMGC22554SCYA11

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCCL11pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:34,285,735–34,288,334
Gene span
2,600 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305869 ★34,285,742–34,288,3343
ENST0000113586234,285,735–34,288,3343

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CCL11 是趨化因子,在過敏性與非過敏性發炎反應中具有重要作用。它能誘導多種白血球移動,包括嗜酸性球、嗜鹼性球、巨噬細胞及樹突細胞,因此可參與這些細胞在發炎反應中的移行。其作用主要透過與 CCR3 受體結合而產生。

除了影響白血球,CCL11 也能誘導內皮細胞趨化,並促進血管新生;此作用與活化 PI3K/Akt 路徑有關。這些資料顯示,CCL11 的功能涵蓋免疫細胞移動及內皮細胞反應,並涉及發炎與血管新生相關過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34285742 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CCL11 ENST00000305869 GRCh38 chr17:34284742-34285842 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTATTCAATGCTGTAATCCGCTGCAGTGACTCCATTAAAGACTTTGCCTCCCTTATACCCTCTCCAACTA
GGGTGCCTAGTGTTATGAACAAAGGGATATGTATAGGTTCTTGTGTTGCCTCTCTCTTTGATATTTTTAG
CCATCAGATACCTTGTCTGCAATGTGTGCTCAGAGAGTGAGGGGGGAACTAGATGATTGATTTTCCAAAT
GTGTTCCCTAAATGTGTTCCCTGGGGAATAAGGGCACGAGAGGCTGCCTATTCTATTTCAAACAAATCCC
CTTCACTACAGTGTATTTGATGAGTTGGGGTTTGTTTTAATTCCATTTGGAAAAGGGCTTTAGCAGCTAA
GCAAATGGTTTTAAAGTGCCTCAGAAGTCAAGATTAATAGAAACTATCCAGTTCTGATGTCCTATCATGC
TAAAATTTCAGGGACTAAGATTCTGTGATCATTACATTGAAACACAGCAGCAAAGCTGTGGTGTGTTGTC
CTTCCTGGTTCAGAGATGCAACTATGTGCAGGGCTGCTGAGCTCTCTCTGCATCTGGGTGGGAGCCTAAT
GGAAGTTTTGGGGCTCCTTCCTGGTCTCCAAAATCCTCAAGACCACCATGTGAACACAGGAATCAAGGAA
GGTTCTTAGATCGACTCATCCCCCAGGCCTTTGGTTTCCTTGCTCCTTTCCCCAACTACAGGTGTTTCAT
TTCAACTCATCCCCTAGGGCCTTGGTTTTCTTGCTCTCTTCCCCCACTACAGATGTTTAACTTCATTTCA
TAACCACATATTCCCCTCCTTTTCCAAGGCAAGATCCAGATGGATTAAAAAATGTACCAAGTCCCTCCTA
CTAGCTTGCCTCTCTTCTGTTCTGCTTGACTTCCTAGGATCTGGAATCTGGTCAGCAATCAGGAATCCCT
TCATCGTGACCCCCGCATGGGCAAAGGCTTCCCTGGAATCTCCCACACTGTCTGCTCCCTATAAAAGGCA
GGCAGATGGGCCAGAGGAGCAGAGAGGCTGAGACCAACCCAGAAACCACCACCTCTCACGCCAAAGCTCA
CACCTTCAGCCTCCAACATGAAGGTCTCCGCAGCACTTCTGTGGCTGCTGC
CCL11 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CCL11_1 ↗17:34,285,742正股34,285,693–34,285,752

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

TNF、IL1A(interleukin-1 alpha)及 IFNG(IFN-gamma)可誘導 CCL11。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:97 aa

1 aa97 aa訊號胜肽
依 P51671 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CCL11 屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。來源所列蛋白質長度為 97 個胺基酸,並註解第 1 至 23 位為訊號肽區域。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1EOT…

PDB · 1EOT

NMR · - · A=24-97

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CCL11 被記錄為分泌型蛋白質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
eotaxinCCL11CCL27CCL28CCL5CCR3CXCL10CXCL12DPP4PF4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CCL11 是趨化因子,在過敏性與非過敏性發炎反應中具有重要作用,可誘導嗜酸性球、嗜鹼性球、巨噬細胞及樹突細胞等多種白血球移動。其作用主要透過結合 CCR3 受體;此外,CCL11 也能誘導內皮細胞趨化,並藉由活化 PI3K/Akt 路徑促進血管新生。含實驗來源
證據與來源

Chemokine that plays a central role in both allergic and non-allergic inflammatory reactions by inducing the migration of different leukocyte types including eosinophils, basophils, macrophages and dendritic cells. Exerts its effects primarily by binding to the CCR3 receptor. Induces also chemotaxis of endothelial cells and promotes angiogenesis by activating the PI3K/Akt pathway

PMID 28279120 ↗ · PMID 33846499 ↗ · PMID 8597956 ↗ · PMID 8631813 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 33846499 ↗ · PMID 8597956 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控CCL11 可受 TNF、IL1A(interleukin-1 alpha)及 IFNG(IFN-gamma)誘導。含實驗來源
證據與來源

Induced by TNF, IL1A/interleukin-1 alpha and IFNG/IFN-gamma

PMID 33846499 ↗ · PMID 8597956 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305869 · 1,005 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGAGGCTGAGACCAACCCAGAAACCACCACCTCTCACG40
41CCAAAGCTCACACCTTCAGCCTCCAACATGAAGGTCTCCG80
81CAGCACTTCTGTGGCTGCTGCTCATAGCAGCTGCCTTCAG120
121CCCCCAGGGGCTCGCTGGGCCAGCTTCTGTCCCAACCACC160
161TGCTGCTTTAACCTGGCCAATAGGAAGATACCCCTTCAGC200
201GACTAGAGAGCTACAGGAGAATCACCAGTGGCAAATGTCC240
241CCAGAAAGCTGTGATCTTCAAGACCAAACTGGCCAAGGAT280
281ATCTGTGCCGACCCCAAGAAGAAGTGGGTGCAGGATTCCA320
321TGAAGTATCTGGACCAAAAATCTCCAACTCCAAAGCCATA360
361AATAATCACCATTTTTGAAACCAAACCAGAGCCTGAGTGT400
401TGCCTAATTTGTTTTCCCTTCTTACAATGCATTCTGAGGT440
441AACCTCATTATCAGTCCAAAGGGCATGGGTTTTATTATAT480
481ATATATATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACGTATTGCATTT520
521AATTTATTGAGGCTTTAAAACTTATCCTCCATGAATATCA560
561GTTATTTTTAAACTGTAAAGCTTTGTGCAGATTCTTTACC600
601CCCTGGGAGCCCCAATTCGATCCCCTGTCACGTGTGGGCA640
641ATGTTCCCCCTCTCCTCTCTTCCTCCCTGGAATCTTGTAA680
681AGGTCCTGGCAAAGATGATCAGTATGAAAATGTCATTGTT720
721CTTGTGAACCCAAAGTGTGACTCATTAAATGGAAGTAAAT760
761GTTGTTTTAGGAATACATAAAGTATGTGCATATTTTATTA800
801TAGTCACTAGTTGTAATTTTTTTGTGGGAAATCCACACTG840
841AGCTGAGGGGGACAAAGATGGCTGTGGCCAAGAGGGGCTT880
881GGTTAAGGGGGTGGGAACTATGTCCCTGGGAAATGAGTTT920
921TTGGCTTAGCTGGTCTTCATTGAAATGCAGGGTGAAACTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。