基因總覽
CCL11 的正式名稱為 C-C motif chemokine ligand 11,屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族,是一種趨化因子。此蛋白質可引導不同類型的白血球移動,與過敏性及非過敏性發炎反應有關。來源亦指出它能作用於內皮細胞,並參與血管新生。CCL11 是蛋白質編碼基因;其蛋白質含有訊號肽註解,且被記錄為分泌型蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305869 ★ | 34,285,742–34,288,334 | 3 |
| ENST00001135862 | 34,285,735–34,288,334 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CCL11 是趨化因子,在過敏性與非過敏性發炎反應中具有重要作用。它能誘導多種白血球移動,包括嗜酸性球、嗜鹼性球、巨噬細胞及樹突細胞,因此可參與這些細胞在發炎反應中的移行。其作用主要透過與 CCR3 受體結合而產生。
除了影響白血球,CCL11 也能誘導內皮細胞趨化,並促進血管新生;此作用與活化 PI3K/Akt 路徑有關。這些資料顯示,CCL11 的功能涵蓋免疫細胞移動及內皮細胞反應,並涉及發炎與血管新生相關過程。
Promoter 與基因調控
>CCL11 ENST00000305869 GRCh38 chr17:34284742-34285842 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTATTCAATGCTGTAATCCGCTGCAGTGACTCCATTAAAGACTTTGCCTCCCTTATACCCTCTCCAACTA GGGTGCCTAGTGTTATGAACAAAGGGATATGTATAGGTTCTTGTGTTGCCTCTCTCTTTGATATTTTTAG CCATCAGATACCTTGTCTGCAATGTGTGCTCAGAGAGTGAGGGGGGAACTAGATGATTGATTTTCCAAAT GTGTTCCCTAAATGTGTTCCCTGGGGAATAAGGGCACGAGAGGCTGCCTATTCTATTTCAAACAAATCCC CTTCACTACAGTGTATTTGATGAGTTGGGGTTTGTTTTAATTCCATTTGGAAAAGGGCTTTAGCAGCTAA GCAAATGGTTTTAAAGTGCCTCAGAAGTCAAGATTAATAGAAACTATCCAGTTCTGATGTCCTATCATGC TAAAATTTCAGGGACTAAGATTCTGTGATCATTACATTGAAACACAGCAGCAAAGCTGTGGTGTGTTGTC CTTCCTGGTTCAGAGATGCAACTATGTGCAGGGCTGCTGAGCTCTCTCTGCATCTGGGTGGGAGCCTAAT GGAAGTTTTGGGGCTCCTTCCTGGTCTCCAAAATCCTCAAGACCACCATGTGAACACAGGAATCAAGGAA GGTTCTTAGATCGACTCATCCCCCAGGCCTTTGGTTTCCTTGCTCCTTTCCCCAACTACAGGTGTTTCAT TTCAACTCATCCCCTAGGGCCTTGGTTTTCTTGCTCTCTTCCCCCACTACAGATGTTTAACTTCATTTCA TAACCACATATTCCCCTCCTTTTCCAAGGCAAGATCCAGATGGATTAAAAAATGTACCAAGTCCCTCCTA CTAGCTTGCCTCTCTTCTGTTCTGCTTGACTTCCTAGGATCTGGAATCTGGTCAGCAATCAGGAATCCCT TCATCGTGACCCCCGCATGGGCAAAGGCTTCCCTGGAATCTCCCACACTGTCTGCTCCCTATAAAAGGCA GGCAGATGGGCCAGAGGAGCAGAGAGGCTGAGACCAACCCAGAAACCACCACCTCTCACGCCAAAGCTCA CACCTTCAGCCTCCAACATGAAGGTCTCCGCAGCACTTCTGTGGCTGCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CCL11_1 ↗ | 17:34,285,742 | 正股 | 34,285,693–34,285,752 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
TNF、IL1A(interleukin-1 alpha)及 IFNG(IFN-gamma)可誘導 CCL11。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:97 aa
CCL11 屬於 intercrine beta(chemokine CC)家族。來源所列蛋白質長度為 97 個胺基酸,並註解第 1 至 23 位為訊號肽區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CCL11 被記錄為分泌型蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CCL27Q9Y4X3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL28Q9NRJ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCR3P51677 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL10P02778 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DPP4P27487 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CCL11 是趨化因子,在過敏性與非過敏性發炎反應中具有重要作用,可誘導嗜酸性球、嗜鹼性球、巨噬細胞及樹突細胞等多種白血球移動。其作用主要透過結合 CCR3 受體;此外,CCL11 也能誘導內皮細胞趨化,並藉由活化 PI3K/Akt 路徑促進血管新生。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chemokine that plays a central role in both allergic and non-allergic inflammatory reactions by inducing the migration of different leukocyte types including eosinophils, basophils, macrophages and dendritic cells. Exerts its effects primarily by binding to the CCR3 receptor. Induces also chemotaxis of endothelial cells and promotes angiogenesis by activating the PI3K/Akt pathway PMID 28279120 ↗ · PMID 33846499 ↗ · PMID 8597956 ↗ · PMID 8631813 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | CCL11 可受 TNF、IL1A(interleukin-1 alpha)及 IFNG(IFN-gamma)誘導。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGAGGCTGAGACCAACCCAGAAACCACCACCTCTCACG40CCAAAGCTCACACCTTCAGCCTCCAACATGAAGGTCTCCG80CAGCACTTCTGTGGCTGCTGCTCATAGCAGCTGCCTTCAG120CCCCCAGGGGCTCGCTGGGCCAGCTTCTGTCCCAACCACC160TGCTGCTTTAACCTGGCCAATAGGAAGATACCCCTTCAGC200GACTAGAGAGCTACAGGAGAATCACCAGTGGCAAATGTCC240CCAGAAAGCTGTGATCTTCAAGACCAAACTGGCCAAGGAT280ATCTGTGCCGACCCCAAGAAGAAGTGGGTGCAGGATTCCA320TGAAGTATCTGGACCAAAAATCTCCAACTCCAAAGCCATA360AATAATCACCATTTTTGAAACCAAACCAGAGCCTGAGTGT400TGCCTAATTTGTTTTCCCTTCTTACAATGCATTCTGAGGT440AACCTCATTATCAGTCCAAAGGGCATGGGTTTTATTATAT480ATATATATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACGTATTGCATTT520AATTTATTGAGGCTTTAAAACTTATCCTCCATGAATATCA560GTTATTTTTAAACTGTAAAGCTTTGTGCAGATTCTTTACC600CCCTGGGAGCCCCAATTCGATCCCCTGTCACGTGTGGGCA640ATGTTCCCCCTCTCCTCTCTTCCTCCCTGGAATCTTGTAA680AGGTCCTGGCAAAGATGATCAGTATGAAAATGTCATTGTT720CTTGTGAACCCAAAGTGTGACTCATTAAATGGAAGTAAAT760GTTGTTTTAGGAATACATAAAGTATGTGCATATTTTATTA800TAGTCACTAGTTGTAATTTTTTTGTGGGAAATCCACACTG840AGCTGAGGGGGACAAAGATGGCTGTGGCCAAGAGGGGCTT880GGTTAAGGGGGTGGGAACTATGTCCCTGGGAAATGAGTTT920TTGGCTTAGCTGGTCTTCATTGAAATGCAGGGTGAAACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。