演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CATSPERTFLJ25351

catsper channel auxiliary subunit tau

CATSPERT 編碼 catsper channel auxiliary subunit tau,是 CatSper 複合體的輔助組件,參與複合體運送至精子鞭毛及其膜定位。

Homo sapiens2q33.1UniProt Q53TS8
OFFICIAL SYMBOL
CATSPERT
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q53TS8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CATSPERT 是蛋白質編碼基因,其產物 catsper channel auxiliary subunit tau 屬於 CatSper 複合體的輔助組件。CatSper 複合體包含形成孔道的核心成員,也包含多種輔助成員;CATSPERT 是其中之一。這項定位使其與精子鞭毛中的 CatSper 複合體相關。蛋白質序列長 1820 個胺基酸,含有一個 C2 結構域,另有數段被註記為無序區域。

Official symbol
CATSPERT
Gene name
catsper channel auxiliary subunit tau
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14438
UniProt
Q53TS8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ25351ALS2CR11C2CD6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q33.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegCATSPERTpq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:201,487,421–201,619,179
Gene span
131,759 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000439140 ★201,487,421–201,619,17816
ENST00000286195201,487,421–201,619,17915
ENST00000957096201,487,421–201,619,17913
ENST00000957097201,487,421–201,619,17915
ENST00000957098201,487,421–201,619,17911
ENST00001092141201,487,421–201,619,1799
ENST00001092142201,487,421–201,619,17912
ENST00001144208201,487,421–201,619,17916
ENST00000439802201,487,525–201,619,17913
ENST00001114087201,534,324–201,619,17911
ENST00000450242201,535,004–201,619,17913
ENST00001044372201,535,022–201,619,17912

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CATSPERT 是 CatSper 複合體的輔助組件。該複合體參與精子細胞的過度活化;精子過度活化是精子運動能力的一部分,而精子運動能力對受精準備後期不可或缺。因此,CATSPERT 所屬的複合體與精子在受精前階段的運動功能相關。

CATSPERT 的具體作用包括協助 CatSper 複合體定位及運送至四線排列的奈米區域。它也將已預先組裝的 CatSper 複合體送往正在延長的鞭毛;在此運送過程中,CATSPERT 連結承載離子通道的囊泡與馬達蛋白。這些作用指向複合體從組裝後運送至鞭毛、再進入特定膜區域的定位過程。

來源將上述功能描述為 CatSper 複合體的定位與運輸角色,並指出該複合體參與精子過度活化;未提供 CATSPERT 如何調節通道活動的更細節機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 201619178 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CATSPERT ENST00000439140 GRCh38 chr2:201619078-201620178 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTCTGTTTGCATTTATTTATATTTTTAACTTTTAGGTTCAAGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATATAGG
TAAATTTTGTGTCATGGGGGTGTACAGATTATTTCATCACCCAGGTAATAAGCCTAGTGCCCAAAAGGTA
GTTTTTGATCCTCTCCCGCCTCCCACCCTTCGCCGTCAAGTAGGCCCCAGTGTCTGTTGCTCCCCTCTTT
GTGTCCATGTGTTCTCATTGTTTAGCTCGCATTTATAAGTGAGAACGTGGTATTTGGTTTTCTGTTCCTG
TGTTAGTCTGCTTAGGATAATGGCCTTCAGCTCCATTCGTTACTGCAAAGGACTAATACGGGGGCAGTGA
AAGGGATGGATGACAGCAGGTTGGCAGACCCATGAGTAAATCATTGCAATTGTCTCGTGTGTGTGTTGTC
CCAAATTAGGTGCCATAAAGGGAAAAGGTAAGTAAGATTCAGATATTTAGGGTCAGAATTTTAAAATGTG
TCTGAATGTTTAAGATTTTGTGGATATGACATTGCTGCACCAAATGAGTTTGGAACCTACTAGAGGTTTA
AGAGGGAAGATGAATATTAACGTGTTATGTGTCTGTGGAACAATTGGGTAAAGATGTCAAAGTAGACTGT
TGGATATTTAACGTCTGGAGCTCACGGGACAGTGTAGAGGAAGTAATGACTGACACTGTAAATCTTCTAG
AAAGAAATGGTGCAGGGAGAAAAGGACTCGTGAGGGCTACAGGGCGGACAAGACAGTGAACTAAAGTGGT
TGGGCCCCATGAGGGGCCTTGCTCTCCACCAGCGTGCTCTGATTTCCTTCTAAAGGAGACTGAAATGGCC
TGGCAAGTGCTTGCAGCAGACCCTCCAGGCTCGCTAAGCACGCATGCTTCCAAAGCTGCCTCCAGCCACT
CCCAGCATGGGCCCGGCCTGAGTGGGTCACTAGGCGGCACGCACGCGCTGGGAAAATGTGAGAAAGGCTG
CGGGAGGGCCGCGCCTGCGCAGTAGCGGGCCGTCGGTTGGGCGCAGACAGGCCGCAGAAGATGGAGAGAT
GGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAG
CATSPERT 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ALS2CR11_1 ↗2:201,619,178負股201,619,168–201,619,227

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_94Z2NX · promoter · 201619144–201619582 · regulatory

ENSR2_53QFF7D · CTCF_binding_site · 201619226–201619247 · regulatory

· motif · 201619228–201619244 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1820 aa

1 aa1820 aa結構域功能區域
依 Q53TS8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

catsper channel auxiliary subunit tau 長 1820 個胺基酸。序列中註記有一個 C2 結構域,位於第 87 至 222 個胺基酸;另有四段預測的無序區域,分別位於第 360–383、第 403–443、第 695–722 與第 838–857 個胺基酸。

結構域C287–222 aa
功能區域Disordered360–383 aa
功能區域Disordered403–443 aa
功能區域Disordered695–722 aa
功能區域Disordered838–857 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q53TS8…

AlphaFold · Q53TS8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell projection, cilium, flagellum membrane

CATSPERT 位於精子尾部鞭毛的主段膜。 此定位與其參與 CatSper 複合體運送及定位相符;來源未提供其他條件下的定位變化或異構型差異。

未繪示構造:Cell projection, cilium, flagellum membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ25351CATSPERTACOT11ACTN3ANKK1AP2B1BBS4CARD9CCDC172CCDC57CDR2CHCHD3CNOT11CT55DISC1DNAJA3FAM217BFHL2GOLGA2GPRASP3GRAMD4HAP1HSF2BPHSPB8IKZF3JRKKIFC3KRT13KRT15KRT31KRT40KRT75LHX1LHX3LZTS2MCRS1MEAF6MEOX1MIPOL1MTUS2NR5A1PAX6PIBF1RNF8SPATA2TACC3TCP10LTFIP11TLE5TRAF1TRAF2TRIM23
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 55 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CATSPERT 是 CatSper 複合體(亦稱 CatSpermasome)的成員;來源指出它至少與 CATSPERD 互作,並需要 CATSPERT 協助將 CatSper 複合體定位至鞭毛膜。來源未進一步說明 CATSPERT 與 CATSPERD 的互作是否直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CATSPERT 與精子生成障礙 68(SPGF68)相關。此病為體染色體隱性男性不孕症,特徵為圓頭精子症:患者精子數量正常,但精子呈圓頭且缺少頂體。部分患者也有無頂體精子與頂體較小或脫落精子混合的情形,稱為頂體發育不全。來源指出,影響 CATSPERT 的變異可能造成此病,並未將此關聯表述為確定因果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CATSPERT 是 CatSper 複合體的輔助組件;該複合體參與精子細胞過度活化,而此過程所需的精子運動能力對受精準備後期不可或缺。CATSPERT 協助複合體定位並運送至四線排列的奈米區域,也將預先組裝的複合體送往延長中的鞭毛,並連結承載通道的囊泡與馬達蛋白。推論支持
證據與來源

Auxiliary component of the CatSper complex, a complex involved in sperm cell hyperactivation. Sperm cell hyperactivation is needed for sperm motility which is essential late in the preparation of sperm for fertilization. Required for CatSper complex targeting and trafficking into the quadrilinear nanodomains. Targets the preassembled CatSper complexes to elongating flagella, where it links the channel-carrying vesicles and motor proteins

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CatSper 複合體包含 CATSPER1、CATSPER2、CATSPER3、CATSPER4 等孔道核心成員,以及多種輔助成員;HSPA1 可能也是額外的輔助成員。四個核心成員形成異源四聚體通道,部分輔助亞基構成孔道上方的亭狀結構並穩定複合體。CATSPERT 至少與 CATSPERD 互作,且需要它協助複合體定位至鞭毛膜。推論支持
證據與來源

Component of the CatSper complex or CatSpermasome composed of the core pore-forming members CATSPER1, CATSPER2, CATSPER3 and CATSPER4 as well as auxiliary members CATSPERB, CATSPERG, CATSPERD, CATSPERE, CATSPERZ, CATSPERT, CATSPERQ, CATSPERH and EFCAB9. HSPA1 may be an additional auxiliary complex member. The core complex members CATSPER1, CATSPER2, CATSPER3 and CATSPER4 form a heterotetrameric channel. The auxiliary CATSPERB, CATSPERG, CATSPERD and CATSPERE subunits form a pavilion-like structure over the pore which stabilizes the complex through interactions with CATSPER4, CATSPER3, CATSPER1 and CATSPER2 respectively. SLCO6C1 interacts with CATSPERE and CATSPERH interacts with CATSPERB, further stabilizing the complex. CATSPERT interacts at least with CATSPERD and is required for targeting the CatSper complex in the flagellar membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CATSPERT 位於細胞突起中的纖毛與鞭毛膜;在精子尾部,具體定位於主段。推論支持
證據與來源

Cell projection, cilium, flagellum membrane; Specifically located in the principal piece of sperm tail

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯精子生成障礙 68(SPGF68)是一種體染色體隱性男性不孕症,特徵為圓頭精子症;患者精子數量正常,但精子呈圓頭且缺少頂體。部分患者同時有無頂體精子,以及頂體較小或脫落的精子,後者稱為頂體發育不全。影響 CATSPERT 的變異可能造成此病。含實驗來源
證據與來源

Spermatogenic failure 68 SPGF68 An autosomal recessive male infertility disorder characterized by globozoospermia. Affected individuals have a normal sperm count, but spermatozoa are round-headed and lack the acrosome. In addition to pure globozoospermia, some patients have a mixture of acrosomeless spermatozoa and spermatozoa with small or detached acrosomes, which is defined as acrosomal hypoplasia. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619805

PMID 31985809 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000439140 · 5,702 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTAGCGGGCCGTCGGTTGGGCGCAGACAGGCCGCAGAAG40
41ATGGAGAGATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTT80
81CAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTG120
121TCCGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCC160
161CGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTTCGGT200
201CCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAG240
241AACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGGCTGCTGAACA280
281TGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACT320
321GGAAATAACACAGGAGACGCCAAATTTGGTGCCATTTGGG360
361GATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCA400
401GACATTTTATGCCTAAGATCAGTTTACAACATTATGCTAA440
441TTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGT480
481ACAAAAATGTGTAGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGA520
521ACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGT560
561ACAGGTTCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATT600
601TTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG640
641CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGT680
681AATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAAGTGTTG720
721CATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTA760
761TGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGGATTTTCACATCA800
801GTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTT840
841ATGAATCTTGCACCACCTCCAGAAAGAACAGATCCCGTGA880
881CAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATT920
921CTTATCCCCAGACCTGAATGTTACTGTTGGGACTCCAGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。