基因總覽
CALML3（calmodulin like 3）是蛋白質編碼基因，所屬家族為 calmodulin 家族。其產物可能與非典型 myosin-10（MYO10）相關，資料指出它可能作為 MYO10 的特定輕鏈，也可能促進 MYO10 的翻譯；這些描述保留了來源所述的推測性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000315238 ★ | 5,524,961–5,526,771 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CALML3 的產物可能參與非典型 myosin-10（MYO10）的功能，來源描述它可能是 MYO10 的特定輕鏈。這項角色仍以可能性表述；現有資料未進一步說明其在 MYO10 中的具體作用方式。
此外，CALML3 可能增強 MYO10 的翻譯。來源提出一種可能解釋：CALML3 或許充當伴護因子，協助新生的 MYO10 重鏈蛋白形成。此處描述的是對翻譯促進作用的推測機制，不能視為已確立的作用途徑。
CALML3 也可能透過與細胞內受質結合，和 calmodulin 競爭；它與不同受質的結合親和力可能各不相同。來源未列出受質名稱，也未詳述這種競爭對細胞過程的具體影響，因此其生物學後果仍無法由現有資訊確定。
Promoter 與基因調控
>CALML3 ENST00000315238 GRCh38 chr10:5523961-5525061 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTCCTCTGGGAGAGGCCGCTCCACAGCCCCAGCTCCATGCTGCCCGGAGCTCCTGGGGCAATGTGGAC CAGAGAATGATAGTGGGACTTCCTGGCTGAGCCCTTCAAGGTCTCCTTTGTCTCTCCTCCTTGTCCCCTC CCTCACAGGCCTGCAGCCCCACTGATCATCTTCCAGCCCTTGGCCCTGCCATGGCCACTCCGGCCTAGAC AGCTGCTTCTCAGCAGGAGGTCTGTCCTTGACCAGGCTGAAAGGTGACCTCGGGGTCCTGTCCATCACCA CCTTGTATGTCCATCAGCATTTATCAATAATCCCTAGTCACCTTGTTTGCATTCCTCGATCAGTTGACCT GCAAACTAGCTGTCTTGCTAGTTAACCTCACGAGGACTGGGGGTGGCTTGCCGGTCCCACTGTGTTCCCA GCTTCCAGAGTGACACTGCACCTAGTAGGCACTCAAATATCTGTGAAAGGGTGGATGAGTGAATGGGTTG GAGGAAACCCCTCCCTATTCATGTCCATTCTGAAGATAAGAAAACTCGCTGCTTCTACCTGAAGGGAAAA CCTTCCTCCTCCAAAAACCCTCCTGTTCTATATGAGGCTTTAGAAACCAAAGGCAAGGACGTTTCTTTCA TCTGCCTTTCATCCTGCAAAAAGCCCTCCACTCAAGGGAAGAAAGGGCACTGGAGTTTATTGAGTGGGAG ACAGGCGGCAGGTGGGAGACGGGGAGGGAGGAGAGAAAGGGAAATTCAGGAGGAAGGAGTCCAGCGTGGA TTGCTCCAAAGCTCACCCACCACGCCCTGACTGCAGGTGTGATTCGGGGCCCCCGTGGCTCTGCTGGGTC CAGGTGCAAGCAGGCACAGAGGTGCTGGCGTCAGCTCGATTCGCAGGCCCTGGACTCCTGTCTAAACAGG ACAGGCCCGGGCAACCGCAGGGCAGGGGCGTCTGCCAATGATGGGGGAGGACTCTGCTGCTTCTTAAGCT CCAGCGTCTCAAGCCAGGGCGAGACAGCCCGCCGGCCGCCCGGATCTCCACCTGCCACCCCAGAGCTGGG ACAGCAGCCGGGCTGCGGCACTGGGAGGGAGACCCCACAGTGGCCTCTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_7BQTX · enhancer · 5526035–5526150 · regulatory
ENSR10_86DH5 · enhancer · 5527960–5528185 · regulatory
· motif · 5528545–5528558 · motif
· motif · 5528545–5528559 · motif
· motif · 5528545–5528560 · motif
· motif · 5528545–5528560 · motif
· motif · 5528562–5528575 · motif
· motif · 5528577–5528590 · motif
· motif · 5528579–5528589 · motif
· motif · 5528584–5528594 · motif
· motif · 5529936–5529951 · motif
CALML3 的調控資料指出其受 TGFB1 調控；來源未提供調控方向、作用條件或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：149 aa
Calmodulin-like protein 3 屬於 calmodulin 家族，蛋白質長度為 149 個胺基酸。其序列註有四個 EF-hand 結構域：EF-hand 1 位於第 8–43 位、EF-hand 2 位於第 44–79 位、EF-hand 3 位於第 81–116 位，EF-hand 4 位於第 117–149 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- IQCB1Q15051-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQCNQ9H0B3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KIAA1683A0JP07 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFIQ8NCR3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYO10Q9HD67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TERF2IPQ9NYB0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CALML3 與 MYO10 有交互作用；此交互作用依賴鈣離子，且對 MYO10 執行絲狀偽足延伸功能不可或缺。來源未提供足以進一步描述其複合體組成的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CALML3 可能作為非典型 myosin-10（MYO10）的特定輕鏈，也可能促進 MYO10 翻譯；一項提出的可能解釋是，它可作為伴護因子，協助新生 MYO10 重鏈蛋白形成。此外，CALML3 可能透過與細胞內受質結合，依不同親和力與 calmodulin 競爭。 | 含實驗來源 | 證據與來源May function as a specific light chain of unconventional myosin-10 (MYO10), also enhances MYO10 translation, possibly by acting as a chaperone for the emerging MYO10 heavy chain protein. May compete with calmodulin by binding, with different affinities, to cellular substrates PMID 11278607 ↗ · PMID 18295593 ↗ |
| 交互作用 | CALML3 與 MYO10 有交互作用，此交互作用依賴鈣離子，且對 MYO10 在絲狀偽足延伸中的功能不可或缺。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with MYO10, the interaction is calcium-dependent and essential for MYO10 function in filopodial extension PMID 11278607 ↗ |
| 調控 | By TGFB1 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGACAGCCCGCCGGCCGCCCGGATCTCCACCTGCCACCC40CAGAGCTGGGACAGCAGCCGGGCTGCGGCACTGGGAGGGA80GACCCCACAGTGGCCTCTTCTGCCACCCACGCCCCCACCC120CTGGCATGGCCGACCAGCTGACTGAGGAGCAGGTCACAGA160ATTCAAGGAGGCCTTCTCCCTGTTTGACAAGGATGGGGAC200GGCTGCATCACCACCCGCGAGCTGGGCACGGTCATGCGGT240CCCTGGGCCAGAACCCCACGGAGGCCGAGCTGCGGGACAT280GATGAGTGAGATCGACCGGGACGGCAACGGCACCGTGGAC320TTCCCCGAGTTCCTGGGCATGATGGCCAGGAAGATGAAGG360ACACGGACAACGAGGAGGAGATCCGCGAGGCCTTCCGCGT400GTTCGACAAGGACGGCAACGGCTTCGTCAGCGCCGCCGAG440CTGCGACACGTCATGACCCGGCTGGGGGAGAAGCTGAGTG480ACGAGGAGGTGGACGAGATGATCCGGGCCGCGGACACGGA520CGGAGACGGACAGGTGAACTACGAGGAGTTTGTCCGTGTG560CTGGTGTCCAAGTGAGGCCGGCGCCCACCATGCTCCTGGG600CGCCCACGCGGCCCACAGGGCAAGAACCCGGGGCCTCCCG640CCTCCTCCCCCATCCCCCTGCCTCCCCTGGGCACTGTGGC680TTCCTCCTGCGCCTGGTTGATTCAGCCCACCTCTCTGCAT720CCCGCTTCCCGCGTCTCTTCTCTGCACTCCTGCCGACCTT760CCCACCTGCTCGTCTGAATGACACGGAACGCTCCCACTGC800AGGCAAACCGTGACGCCCTCCCCACTCGGGAGAAGCAGAG840CTGACCTTAGGACCGAGCACCAGGGCAGGTTGCGCTGACT880CTGCGGCCCTCCAGGACGGACACCGGGTGACCCCTTAGGG920CACCCAGGCAAGATCCCTAAGAGGCACCCAATGCCCAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。