基因總覽
CALCR 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 calcitonin receptor。其產物屬於 G protein-coupled receptor 2 family，是多次穿膜的細胞膜受體。受體可與 receptor-activity-modifying proteins（RAMP）形成不同複合體；這些複合體具有各自的受體名稱，並可對多種胜肽配體作出反應。CALCR 的蛋白質序列長 474 個胺基酸，包含細胞外區域、七段螺旋型穿膜區域及較長的細胞質區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000426151 ★ | 93,424,486–93,574,724 | 14 |
| ENST00000649521 | 93,424,486–93,574,730 | 15 |
| ENST00000394441 | 93,424,486–93,559,810 | 13 |
| ENST00000887175 | 93,424,486–93,575,738 | 13 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CALCR 可由 amylin（IAPP）、calcitonin（CT/CALCA）及 calcitonin gene-related peptide type 1（CGRP1/CALCA）等胜肽配體活化。配體結合會引起受體構形改變，進而啟動經由 G proteins 傳遞的訊號，並調節下游效應因子的活性；其中包括活化 cAMP-dependent pathway。
CALCR 與 RAMP1、RAMP2 或 RAMP3 分別組成 AMYR1、AMYR2 或 AMYR3 受體複合體。IAPP、CT 與 CGRP1 對 CALCR 及 AMYRs 的活化方式有所不同，並與不同的表型結果相關。這表示配體種類及受體複合體組成，均是來源所述受體活化差異的一部分；來源未進一步界定各種表型的具體內容。
另有資料將一種 CALCR 蛋白描述為非功能性：該蛋白無法與 G proteins 偶聯或活化 adenylyl cyclase，且配體結合後不會進行受體內化。來源未在此說明這項描述適用的異構型或其他條件，因此不宜據此概括所有 CALCR 受體的功能。
Promoter 與基因調控
>CALCR ENST00000426151 GRCh38 chr7:93574624-93575724 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAGGTTGAGGGTGACTCGTCCTTGGAATCAACTTGCCTGCCTCCCAGGGCGTGCCTGCCAGCCTCCGCT GCGCCCCGCCTGGTATTGGATTGTCCCGGACTCCTGCTGACATCGAGGGCTTTAGGGGGAAAGAAGAGGA GTCGCAGTGTCCGGCACCAAGTCAGGCACCCCATATCCCCGTCTTCCCTCGCCATCCTCTCTGTTTTCAT TCACCCTAAAACACTGTGCCCACCAGCAGTCCCCTACACGGAGGGCACTCTTTCTCCAAATCCAAGTTAT GCCTCCAGCCTACAGCCGCCCAACTCCGGACGCTTTCCCAGGGCTTGCCTGACCCCCAAGGTGTCTCTTC TCATCTCCTTCCTCTCAGCACTTTTTTCCTTTTAGCACCCCAGCTCTTAGCCAGCCGTCTTCCCACGTCC TCACCCCACTTTCACTACCTAGCCCACTACCGACCCTCCCTCCACAGGCTCCCTAGTGCTGTCCCCGGAG TGGCGGCTGAAGAAGCCAGGGTCACAATGTCTCTGGGATAAGGTTCTTGTGGAAACTCACCTCCCTCCGG AATTTGCATTCTCCGGGGAGGGGACAGGGCTCCCAGAAAGCTGTCTCCCAGTCCAGACTGTCGCCCCCCT CTCCCTCCCTACTCAAGGTCTAACTCGGGTCCCTCGCCTGCTTCCTGTGTTTACGCGGCGCTTTAGTCTC CCGGACTCGCAGGGTGAGCCCCAGCCCTGACTGGAGCGAGACAGCAGCCGCGAGCGCAGCCCCACTCGCG GGCCGGGGCGACTGGGGCTGGCGCGAGGCGCACGGAGCTCACCAGCTCGCCCCTCCCTCTCCTGGGACAG GAGGGGGCTGACTGGGGTGGCGGGGTCCGGGAAGGGGGGCTGGCTCTCATCAATTCTGCTGCCACCTCCT CTGCCGCCTGTCGGGAGGCGGGCGGGGGTGGGGCGGGAGCGCAGGCTAGGATTGAGACTCTTAAGTCAGG AGAAGTTTGCGCACAGCTTCACAGCTGGGAGAGCGCAGGAAGGCGCCGGGAAGGTGAGCCTCCTGGACTC TGGGGAGGTAGAAAGCAAGCCAGGGGAAAGAACAGTTGTCTTTTAGCTGAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CALCR_1 ↗ | 7:93,574,724 | 負股 | 93,574,714–93,574,773 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_93D5RX · enhancer · 93574309–93574713 · regulatory
ENSR7_93D5S4 · promoter · 93574714–93575220 · regulatory
· motif · 93578784–93578799 · motif
· motif · 93578784–93578799 · motif
· motif · 93578785–93578799 · motif
· motif · 93578786–93578799 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：474 aa
CALCR 蛋白長 474 個胺基酸，屬於 G protein-coupled receptor 2 family。其序列註解包含 N 端訊號區、細胞外與細胞質區域，以及七段螺旋型穿膜區；C 端較長，位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
CALCR 位於細胞膜，屬於多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件改變或異構型間差異的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
CALCR 分別與 RAMP1、RAMP2 或 RAMP3 形成異源二聚體，構成 AMYR1、AMYR2 或 AMYR3 受體複合體；這些複合體可回應 amylin/IAPP、calcitonin/CT 與 CGRP1 配體。另有資料記載 CALCR 與 GPRASP2 互作，但未說明其互作形式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CALCR 是可受 amylin（IAPP）、calcitonin（CT/CALCA）及 CGRP1/CALCA 活化的 G protein-coupled receptor。它可與 RAMP1、RAMP2 或 RAMP3 分別形成 AMYR1、AMYR2 或 AMYR3；IAPP、CT 與 CGRP1 對 CALCR 及 AMYRs 的活化方式不同，並產生特定表型。配體結合引發構形改變，促成 G proteins 訊號傳遞、調節下游效應因子，並活化 cAMP-dependent pathway。 | 含實驗來源 | 證據與來源G protein-coupled receptor activated by ligand peptides amylin (IAPP), calcitonin (CT/CALCA) and calcitonin gene-related peptide type 1 (CGRP1/CALCA). CALCR interacts with receptor-activity-modifying proteins RAMP1, 2 and 3 to form receptor complexes AMYR1, 2 and 3, respectively. IAPP, CT and CGRP1 activate CALCR and AMYRs with distinct modes of receptor activation resulting in specific phenotypes. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors. Activates cAMP-dependent pathway PMID 35324283 ↗ · PMID 38603770 ↗ · PMID 7476993 ↗ |
| 功能 | 來源將該蛋白描述為非功能性：它無法與 G proteins 偶聯，也不能活化 adenylyl cyclase；配體結合後亦不會發生受體內化。此描述未指出適用的異構型或其他條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-functional protein. Unable to couple to G proteins and activate adenylyl cyclase. Does not undergo receptor internalization following ligand binding PMID 7476993 ↗ |
| 交互作用 | CALCR 可分別與 RAMP1、RAMP2 或 RAMP3 形成異源二聚體，這些受體複合體依序稱為 AMYR1、AMYR2 與 AMYR3，並能回應 amylin/IAPP、calcitonin/CT 及 CGRP1 配體。另有資料記載 CALCR 與 GPRASP2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer of CALCR and RAMP1, RAMP2 or RAMP3; the receptor complexes function as AMYR1, AMYR2 and AMYR3 receptors, respectively, and respond to amylin/IAPP, calcitonin/CT and CGRP1 ligands. Interacts with GPRASP2 PMID 15086532 ↗ · PMID 35324283 ↗ · PMID 38603770 ↗ |
| 細胞定位 | CALCR 位於細胞膜，屬於多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACAGCTGGGAGAGCGCAGGAAGGCGCCGGGAAGGAAAGCC40AGCCCACCAGCGTCTGGGTGGGCTGCGCCGCGCGGCTGGC80GGACCTTCCCGGGTTGGAGAAGTGCGCACGTCCGCACCTC120ACCCTGCGGCTGACATCTCCTGCCCAGGAGATGGGCGCTG160AAGCTTGAGCGCCTGAGTCCCTGGAGCCACACCTGCGAAC200ACCCTTTGCTTCTATTGAGCTGTGCCCAGCCGCCCAGTGA240CAGAATTCCAGGACAAAGAGATCTTCAAAAATCAAAAATG280AGGTTCACATTTACAAGCCGGTGCTTGGCACTGTTTCTTC320TTCTAAATCACCCAACCCCAATTCTTCCTGCCTTTTCAAA360TCAAACCTATCCAACAATAGAGCCCAAGCCATTTCTTTAC400GTCGTAGGACGAAAGAAGATGATGGATGCACAGTACAAAT440GCTATGACCGAATGCAGCAGTTACCCGCATACCAAGGAGA480AGGTCCATATTGCAATCGCACCTGGGATGGATGGCTGTGC520TGGGATGACACACCGGCTGGAGTATTGTCCTATCAGTTCT560GCCCAGATTATTTTCCGGATTTTGATCCATCAGAAAAGGT600TACAAAATACTGTGATGAAAAAGGTGTTTGGTTTAAACAT640CCTGAAAACAATCGAACCTGGTCCAACTATACTATGTGCA680ATGCTTTCACTCCTGAGAAACTGAAGAATGCATATGTTCT720GTACTATTTGGCTATTGTGGGTCATTCTTTGTCAATTTTC760ACCCTAGTGATTTCCCTGGGGATTTTCGTGTTTTTCAGGA800GCCTTGGCTGCCAAAGGGTAACCCTGCACAAGAACATGTT840TCTTACTTACATTCTGAATTCTATGATTATCATCATCCAC880CTGGTTGAAGTAGTACCCAATGGAGAGCTCGTGCGAAGGG920ACCCGGTGAGCTGCAAGATTTTGCATTTTTTCCACCAGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。