演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CALCACGRP

calcitonin related polypeptide alpha

CALCA 產生可分泌的胜肽;其產物包括能降低血鈣的 katacalcin,並與 calcitonin 一同由甲狀腺旁濾泡細胞分泌。

Homo sapiens11p15.2UniProt P01258
OFFICIAL SYMBOL
CALCA
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P01258
PDB / ALPHAFOLD
2JXZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

calcitonin related polypeptide alpha 是蛋白質編碼基因,所產生的胜肽屬於 calcitonin family。來源描述其中的 katacalcin 為具降血鈣作用的血漿胜肽;此胜肽由 calcitonin precursor 的 C 端切割而來,並與 calcitonin 一同由甲狀腺旁濾泡細胞分泌,兩者分泌量約相等。這些資訊指出 CALCA 產物具有可分泌的胜肽性質,並與 calcitonin precursor 的加工相關。

Official symbol
CALCA
Gene name
calcitonin related polypeptide alpha
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1437
UniProt
P01258
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CGRPCGRP-alphaCALC1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegCALCApq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:14,966,622–14,972,357
Gene span
5,736 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000331587 ★14,968,501–14,972,3514
ENST0000070604214,966,622–14,972,3575
ENST0000048620714,966,622–14,972,3575
ENST0000070604314,967,682–14,972,3574
ENST0000114068014,968,501–14,972,3574
ENST0000039637214,968,706–14,972,3574

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CALCA 產物中的 calcitonin 是一種胜肽荷爾蒙,可與 calcitonin receptor(CALCR)結合並以高親和力活化受體。受體訊號主要透過 Gs/adenylate cyclase 傳遞,啟動 cAMP 依賴性路徑;此外也能促使細胞內鈣動員,並活化 ERK 訊號。這些作用與 calcitonin 對骨吸收及血鈣的調節有關。

calcitonin 可在短時間內降低血鈣,主要方式是抑制破骨細胞介導的骨吸收。受體活化後,破骨細胞會迅速失去皺褶緣、細胞質回縮,細胞移動能力與骨吸收活性也受到抑制。這些細胞反應使骨骼釋出鈣的過程減少,構成其降低血鈣的主要作用途徑。

calcitonin 也有助於限制骨骼重塑與骨轉換;在哺乳等鈣需求增加的時期,可能保護母體骨骼,並限制誘發性高血鈣。不過,來源指出它在基礎血鈣恆定中的作用僅占較小部分。另有資料指出,由 calcitonin precursor C 端切割而來的 katacalcin 是具降血鈣作用的胜肽;CALCA 相關胜肽的作用不應因此與 calcitonin 的受體訊號機制混為一談。

此外,該 C 端胜肽可能透過依賴 cAMP/PKA 蛋白的路徑,促進 CD14(+) 周邊血液單核球移動。此作用以可能性描述,來源並未提供更多條件或機制細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 14972351 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CALCA ENST00000331587 GRCh38 chr11:14972251-14973351 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTACGGGGCCGGAATAGAATGTCTCTGGGACATCTTGGCAAACAGCAGCCGGAAGCAAAGGGGCAGCTGT
GCAAACGGCTCAGGCAGGTGATGGATGGCAGGGTAGGAAGGGGGAGGTCCAGAGGTCTGGATGGAGGCTT
CCGCATCTGTACCTTGCAACTCACCCCTCAGGCCCAGCAGGTCATCGGCCCCCTCCTCACACATGTAATG
GATCTGAAGAGTACCCCGGGACAGTCCGGGGAGATGGAGATTCGGAAAGTATCCATGGAGATCTTACAGA
ATCCCCTGTGCGGACCAGGAAACTCTTGTAGATCCCTGCCTATCTGAGGCCCAGGCGCTGGGCTGTTTCT
CACAATATTCCTTCAAGATGAGATTGTGGTCCCCATTTCAAAGATGAGTACACTGAGCCTCTGTGAAGTT
ACTTGCCCATGATCACACAACCAGGAATTGGGCCAACTGTAATTGAACTCCTGTCTAACAAAGTTCTTGC
TCCCAGCTCCGTCTCTTGTTTCCCACGAGCCCTGGCCCTCTGTGGGTAATACCAGCTACTGGAGTCAGAT
TTCTTGGGCCCAGAACCCACCCTTAGGGGCATTAACCTTTAAAATCTCACTTGGGCAGGGGTCTGGGATC
AGAGTTGGAAGAGTCCCTACAATCCTGGACCCTTTCCGCCAAATCGTGAAACCAGGGGTGGAGTGGGGCG
AGGGTTCAAAACCAGGCCGGACTGAGAGGTGAAATTCACCATGACGTCAAACTGCCCTCAAATTCCCGCT
CACTTTAAGGGCGTTACTTGTTGGTGCCCCCACCATCCCCCACCATTTCCATCAATGACCTCAATGCAAA
TACAAGTGGGACGGTCCTGCTGGATCCTCCAGGTTCTGGAAGCATGAGGGTGACGCAACCCAGGGGCAAA
GGACCCCTCCGCCCATTGGTTGCTGTGCACTGGCGGAACTTTCCCGACCCACAGCGGCGGGAATAAGAGC
AGTCGCTGGCGCTGGGAGGCATCAGAGACACTGCCCAGCCCAAGTGTCGCCGCCGCTTCCACAGGGCTCT
GGCTGGACGCCGCCGCCGCCGCTGCCACCGCCTCTGATCCAAGCCACCTCC
CALCA 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CALCA_1 ↗11:14,972,351負股14,972,341–14,972,400

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_55J3TL · CTCF_binding_site · 14970004–14970025 · regulatory

ENSR11_8FTWC · enhancer · 14971897–14972095 · regulatory

ENSR11_8FTWK · promoter · 14972263–14972444 · regulatory

ENSR11_DQ3L · enhancer · 14973376–14975521 · regulatory

ENSR11_55J4JB · CTCF_binding_site · 14973825–14973846 · regulatory

· motif · 14970006–14970022 · motif

· motif · 14972453–14972462 · motif

· motif · 14973827–14973843 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:141 aa

1 aa141 aa功能區域訊號胜肽
依 P01258 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

蛋白質長度為 141 個胺基酸,屬於 calcitonin family。其 N 端第 1 至 25 位胺基酸註記為訊號序列;第 64 至 85 位及第 111 至 141 位則各有一段被註記為無序區域。

訊號胜肽1–25 aa
功能區域Disordered64–85 aa
功能區域Disordered111–141 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2JXZ…

PDB · 2JXZ

NMR · - · A=85-116

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

此蛋白質的定位註記為分泌。 來源未提供其他細胞內位置、定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CGRPCALCAANKRD11ATP2B2ATP2B4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能calcitonin 是由甲狀腺旁濾泡細胞分泌的胜肽荷爾蒙,能高親和力活化 calcitonin receptor/CALCR,主要透過 Gs/adenylate cyclase 啟動 cAMP 依賴性訊號,也可動員細胞內鈣並活化 ERK。其可藉抑制破骨細胞骨吸收迅速降低血鈣,且參與限制骨轉換、鈣壓力時保護母體骨骼及限制誘發性高血鈣;對基礎血鈣恆定的作用較小。含實驗來源
證據與來源

Peptide hormone secreted by thyroid parafollicular (C) cells that acts as a high-affinity agonist of the calcitonin receptor/CALCR that primarily couples to Gs/adenylate cyclase signaling, resulting in activation of cAMP-dependent pathways, and can additionally mobilize intracellular calcium and activate ERK signaling. Acutely lowers blood calcium levels predominantly by inhibiting osteoclast-mediated bone resorption. In osteoclasts, receptor activation rapidly induces loss of the ruffled border, cytoplasmic retraction, and suppression of cell motility and resorptive activity. Functions to restrain bone remodeling and turnover, protect the maternal skeleton during periods of calcium stress such as lactation, and limit induced hypercalcemia, while playing only a minor role in basal calcium homeostasis (By similarity)

PMID 17535751 ↗ · PMID 35324283 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能一種胜肽由 calcitonin precursor 的 C 端切割而來,並與 calcitonin 由甲狀腺旁濾泡細胞共同分泌,兩者分泌量約相等。該胜肽可能透過依賴 cAMP/PKA 蛋白的路徑,促進 CD14(+) 周邊血液單核球移動;此作用仍以可能性描述。含實驗來源
證據與來源

Peptide cleaved from the C-terminal region of the calcitonin precursor and co-secreted with calcitonin from thyroid parafollicular (C) cells in approximately equimolar amounts. May stimulates the migration of CD14(+) peripheral blood monocytes through a cAMP/PKA protein-dependent pathway

PMID 12369791 ↗ · PMID 3350911 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能Katacalcin 是一種效力強的降血鈣胜肽,可降低血漿中的鈣含量;來源未提供其作用機制或發生條件。含實驗來源
證據與來源

Katacalcin is a potent plasma calcium-lowering peptide

PMID 6132180 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000331587 · 840 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATCAGAGACACTGCCCAGCCCAAGTGTCGCCGCCGCTTCC40
41ACAGGGCTCTGGCTGGACGCCGCCGCCGCCGCTGCCACCG80
81CCTCTGATCCAAGCCACCTCCCGCCAGAGAGGTGTCATGG120
121GCTTCCAAAAGTTCTCCCCCTTCCTGGCTCTCAGCATCTT160
161GGTCCTGTTGCAGGCAGGCAGCCTCCATGCAGCACCATTC200
201AGGTCTGCCCTGGAGAGCAGCCCAGCAGACCCGGCCACGC240
241TCAGTGAGGACGAAGCGCGCCTCCTGCTGGCTGCACTGGT280
281GCAGGACTATGTGCAGATGAAGGCCAGTGAGCTGGAGCAG320
321GAGCAAGAGAGAGAGGGCTCCAGCCTGGACAGCCCCAGAT360
361CTAAGCGGTGCGGTAATCTGAGTACTTGCATGCTGGGCAC400
401ATACACGCAGGACTTCAACAAGTTTCACACGTTCCCCCAA440
441ACTGCAATTGGGGTTGGAGCACCTGGAAAGAAAAGGGATA480
481TGTCCAGCGACTTGGAGAGAGACCATCGCCCTCATGTTAG520
521CATGCCCCAGAATGCCAACTAAACTCCTCCCTTTCCTTCC560
561TAATTTCCCTTCTTGCATCCTTCCTATAACTTGATGCATG600
601TGGTTTGGTTCCTCTCTGGTGGCTCTTTGGGCTGGTATTG640
641GTGGCTTTCCTTGTGGCAGAGGATGTCTCAAACTTCAGAT680
681GGGAGGAAAGAGAGCAGGACTCACAGGTTGGAAGAGAATC720
721ACCTGGGAAAATACCAGAAAATGAGGGCCGCTTTGAGTCC760
761CCCAGAGATGTCATCAGAGCTCCTCTGTCCTGCTTCTGAA800
801TGTGCTGATCATTTGAGGAATAAAATTATTTTTCCCCAAA840

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。