演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CADPSCAPS

calcium dependent secretion activator

CADPS(calcium dependent secretion activator)是蛋白質編碼基因,其產物參與神經傳遞物質與神經胜肽囊泡的胞吐;其作用可能涉及致密核心囊泡融合前的調控。

Homo sapiens3p14.2UniProt Q9ULU8
OFFICIAL SYMBOL
CADPS
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q9ULU8
PDB / ALPHAFOLD
1WI1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CADPS 是位於人類第 3 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 calcium dependent secretion activator。其產物為鈣離子結合蛋白,與神經細胞分泌囊泡的胞吐有關,可能參與成熟分泌囊泡的形成或維持。現有資料指出,它與神經傳遞物質及神經胜肽囊泡的分泌相關;具體作用方式及其在不同囊泡類型中的角色仍有不確定性。

Official symbol
CADPS
Gene name
calcium dependent secretion activator
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1426
UniProt
Q9ULU8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAPSKIAA1121CAPS1UNC-31CADPS1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p14.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegCADPSpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:62,398,346–62,875,563
Gene span
477,218 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000383710 ★62,398,348–62,875,41630
ENST0000061243962,398,346–62,875,56328
ENST0000035794862,398,346–62,875,56327
ENST0000028326962,398,346–62,875,56328
ENST0000093517462,398,346–62,875,56327
ENST0000095169262,398,346–62,875,56329
ENST0000095169362,398,346–62,875,56328
ENST0000095169462,398,346–62,875,56328
ENST0000095169562,398,346–62,875,56329
ENST0000095169662,398,346–62,875,56329
ENST0000113928362,398,346–62,875,56330
ENST0000047363562,398,348–62,481,85510

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CADPS 產物是鈣離子結合蛋白,參與裝載神經傳遞物質與神經胜肽的囊泡胞吐。它可能在囊泡與細胞膜融合之前作用,參與成熟分泌囊泡的形成或維持;資料亦指出其可調節致密核心囊泡(DCVs)的兒茶酚胺裝載。

一種可能的作用模式是,CADPS 作為 PtdIns(4,5)P2 結合蛋白,在 ATP 依賴的囊泡預備步驟之後、融合之前發揮作用,並參與 DCVs 與細胞膜的融合。依此推測,它可能特別參與大型致密核心囊泡及其他致密核心囊泡的鈣離子依賴性胞吐;不過,來源將這些作用描述為可能性,並非確定結論。

CADPS 也可能參與小型透明突觸囊泡(SVs)的胞吐,但目前不清楚這項作用是否與鈣離子觸發有關。因而,資料支持它與多類分泌囊泡胞吐相關,同時也保留了不同囊泡途徑及鈣離子作用關係尚未釐清的限制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 62875416 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CADPS ENST00000383710 GRCh38 chr3:62875316-62876416 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATAAATATAGGCGATGAAGTGGAGAGGTCTCTAGATAGCCTAAGTTCTGAAGGTGGCTGGCTGGTGGTT
TGTTTTCATCCATCTGCGTGCGGGTCGCAGGTTACATTCAGCACGTTGGCCAGCTCCCTCGTTTACCAGG
TTTACTGGCCTAAGTGAAAGGAGCACGGGGAAGGCAGGCACCATCTGCTGCTTTGTATTAATAGTTTACC
CGAGAGGCAGGGGTGAACAGAGTGCGACAGTCGACGCATTAGATGTTGACGCCGCTGAGTTCTTAGGGTG
TCTTTGTCTGATCGCGGGGTCCCCAAGCCTCCACCGAGCCAGAATGGAGGGAGGGTTAAGCAACCAGAAA
CCCTTCTATTTTTCTGGTAGGCTCACCTCAGCAGAAAGCATTCCCAGGTCTTGGGAACTGAAGAAGATTC
ATCATAGATTTTGGGGGTGGGGGTAGGCAAGGTCGGGGGCGCTACATAAATGGTTGAGTTGCCTGGTCGA
AACACCAATCCATTCAAAATTTGATTCACTTTTATTTTAATTAGACTGGGCGCATGCGGAATAAGTTGCT
GGAATCAGAGTTTACACAGGTGGGACAAACACGCTGCCCAGCCCCCACGCCCCCCACGCCCCAGGTGTAA
AGAAGCCTGGGGAAAGGAGATGGACCCTTTCTTTCCCGTATAAGATCTCACGGACTTCCTCCTCCTAAGT
AAGACCTCTCGATTTAGCGTCTCCAAACAGCCCGCTCGGCTGGTTTCTGGATTTCTCCCTCCCCCAAGAA
CTTTTTGTCCGCGGGAGGGGAAAAGGGGTTGAGGCAATGAGAGCCAGATATCAACAAAAAAATTATCCAC
GAAGCCGGCAGGGGAGGAGGGTGGCAAGGTATTGGGGTCAGAAGTACTGAGGCTCTGAGGACGCTCCGCG
CTCTCCCCCCTCCAGCCCTCTGCAGCAGCCCTTTACGCCGCGGACACGGGAGAGTTAAGCCAATAAACAC
GTAAGCGCCGCTCCCTCCCCAATCGGCAAGATGCCTCTTCGGCTCTTGGCTGCATCGACAGCTTGCAACA
CTCGGCATCTTTTCTGGAGGCGCCTCCTTCAGCAGCCGCAGATGGCATCCG
CADPS 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CADPS_2 ↗3:62,875,360負股62,875,350–62,875,409
CADPS_1 ↗3:62,875,515負股62,875,505–62,875,564

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_9WXQN · enhancer · 62870383–62870649 · regulatory

ENSR3_5JR9SB · CTCF_binding_site · 62873771–62873792 · regulatory

ENSR3_BGGWJ · promoter · 62875019–62875691 · regulatory

ENSR3_5JRB3C · CTCF_binding_site · 62875075–62875096 · regulatory

ENSR3_9WXSC · enhancer · 62876002–62876433 · regulatory

· motif · 62873773–62873789 · motif

· motif · 62875077–62875093 · motif

· motif · 62875720–62875734 · motif

· motif · 62878099–62878113 · motif

· motif · 62878240–62878254 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1353 aa

1 aa1353 aa結構域功能區域
依 Q9ULU8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CADPS 蛋白長 1,353 個胺基酸,含有 C2、PH 與 MHD1 結構域。資料註記第 1–109 位及第 1,329–1,353 位為無序區。第 790–1,129 位區域與 DRD2 互作;第 1,177–1,353 位區域則被註記為介導其靶向致密核心囊泡及與之結合。

結構域C2380–495 aa
結構域PH521–624 aa
結構域MHD1931–1111 aa
功能區域Disordered1–109 aa
功能區域Interaction with DRD2790–1129 aa
功能區域Mediates targeting and association with DCVs1177–1353 aa
功能區域Disordered1329–1353 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1WI1…

PDB · 1WI1

NMR · - · A=522-634

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Synapse;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, neuronal dense core vesicle membrane

CADPS 與囊泡相關,並在突觸分餾中高度富集;其偏好結合致密核心囊泡,而非突觸囊泡。 它對磷脂醯肌醇類具有結合能力,且對 PtdIns(4,5)P2 的選擇性高於 PtdIns(3,4,5)P3。 資料推測 CADPS 與 CADPS2 可能定位於不同囊泡。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAPSCADPSFAM9BSDCBPZNF572
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CADPS 被註記可形成同源二聚體,並與 RASL10B 互作;前兩項關係均標示為依相似性推定。此外,資料指出 CADPS 與多巴胺受體 DRD2 互作。來源未提供這些關係是否構成同一複合體的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CADPS 產物是鈣離子結合蛋白,參與神經傳遞物質與神經胜肽囊泡胞吐,可能在成熟分泌囊泡形成或維持及囊泡融合前發揮作用,並調節 DCVs 的兒茶酚胺裝載。它可能透過結合 PtdIns(4,5)P2 參與預備後的融合步驟;亦可能參與小型透明 SVs 胞吐,但其是否涉及鈣離子觸發尚不清楚。推論支持
證據與來源

Calcium-binding protein involved in exocytosis of vesicles filled with neurotransmitters and neuropeptides. Probably acts upstream of fusion in the biogenesis or maintenance of mature secretory vesicles. Regulates catecholamine loading of DCVs. May specifically mediate the Ca(2+)-dependent exocytosis of large dense-core vesicles (DCVs) and other dense-core vesicles by acting as a PtdIns(4,5)P2-binding protein that acts at prefusion step following ATP-dependent priming and participates in DCVs-membrane fusion. However, it may also participate in small clear synaptic vesicles (SVs) exocytosis and it is unclear whether its function is related to Ca(2+) triggering (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CADPS 被描述為可形成同源二聚體,並與 RASL10B 互作;這兩項關係均標示為依相似性推定。資料另指出 CADPS 與多巴胺受體 DRD2 互作,但未說明這些分子是否共同形成複合體。含實驗來源
證據與來源

Homodimer (By similarity). Interacts with RASL10B (By similarity). Interacts with the dopamine receptor DRD2

PMID 15857609 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CADPS 與囊泡膜相關,在突觸分餾中高度富集,且偏好結合致密核心囊泡而非突觸囊泡。它能結合磷脂醯肌醇類,對 PtdIns(4,5)P2 的選擇性高於 PtdIns(3,4,5)P3;另推測其囊泡定位可能不同於 CADPS2。推論支持
證據與來源

Synapse; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, neuronal dense core vesicle membrane / Peripheral membrane protein; Membrane-associated to vesicles. Strongly enriched in synaptic fractions. Preferentially binds to dense core vesicles but not to synaptic vesicles. Binds phosphoinosides, with a strong selectivity for PtdIns(4,5)P2 over PtdIns(3,4,5)P3. Probably localizes to different vesicles compared to CADPS2

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000383710 · 5,507 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AATCGGCAAGATGCCTCTTCGGCTCTTGGCTGCATCGACA40
41GCTTGCAACACTCGGCATCTTTTCTGGAGGCGCCTCCTTC80
81AGCAGCCGCAGATGGCATCCGGCTGCGGGCTCGGGGCTCG120
121CAATTGATTCTCCCCCTTGCCCACCTCGAGTCCACGGACG160
161CACCTCTCCCTTCCCCTCCTCCCTTCGCGCTTCTGGGTCT200
201GAGCCCAGCTCGCGACCGCCGGGCAGAGGATCAGTCGCGG240
241CGGCCGAGGCTGAGCAGCAGCGCTCTCGCTCCCTGACCTG280
281GGGAGAAGCGCCCACCCGGGAGAGCTGATCCCCGGCTGCC320
321TCCAGCGCCCCCCACCTTTTGCACTCCAAGCCGGGGGCTC360
361CAGAGACCCCGCTCCCCAGGCGCCACTATGCTGGACCCTT400
401CGTCCAGCGAAGAAGAATCGGATGAGATCGTGGAGGAGGA440
441GAGCGGCAAGGAGGTGCTCGGCTCGGCCCCGTCCGGCGCG480
481CGCCTGTCTCCCAGCCGTACCAGCGAGGGCTCGGCCGGCA520
521GCGCCGGGCTGGGGGGCGGCGGCGCCGGCGCCGGAGCCGG560
561GGTGGGTGCAGGCGGCGGCGGGGGCAGCGGCGCGAGCAGC600
601GGCGGCGGGGCCGGGGGGCTGCAACCCAGCAGCCGCGCTG640
641GCGGCGGCCGGCCCTCCAGCCCCAGCCCGTCGGTGGTGAG680
681CGAGAAGGAGAAGGAAGAGTTGGAGCGGCTGCAGAAAGAG720
721GAGGAGGAGAGGAAGAAGAGGCTGCAGCTGTATGTGTTCG760
761TGATGCGCTGCATCGCCTACCCCTTTAATGCCAAGCAGCC800
801CACCGACATGGCTCGCCGGCAGCAGAAGATCAGCAAACAG840
841CAGCTGCAGACAGTCAAGGACCGGTTTCAGGCTTTCCTCA880
881ATGGGGAAACCCAGATCATGGCTGACGAAGCCTTCATGAA920
921CGCTGTGCAGAGTTACTATGAGGTGTTCCTGAAGAGCGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。