演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNG8

calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8

CACNG8 編碼 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8,屬於 CACNG 子家族的膜蛋白,可調節特定 L 型鈣離子通道,並影響 AMPA 型麩胺酸受體的運送與閘控。

Homo sapiens19q13.42UniProt Q8WXS5
OFFICIAL SYMBOL
CACNG8
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q8WXS5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CACNG8 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8,屬於 PMP-22/EMP/MP20 family 的 CACNG 子家族。此蛋白質具有多個跨膜螺旋區段,呈多次穿膜膜蛋白特徵;其序列另有數段被註記為無序區。作為通道輔助次單元,CACNG8 與 L 型鈣離子通道及 AMPA-selective glutamate receptors 有關。對 AMPA 受體的調節不具次單元特異性,來源指出其作用涵蓋所有 AMPAR 次單元。

Official symbol
CACNG8
Gene name
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13628
UniProt
Q8WXS5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25CACNG8pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:53,962,937–53,990,215
Gene span
27,279 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000270458 ★53,962,937–53,990,2154

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNG8 可調節含有 CACNA1C 孔道形成次單元的 L 型鈣離子通道活性;此項功能標示為依相似性推定,應視為相似性證據,而非此處直接驗證的結論。

CACNG8 也調節 AMPA-selective glutamate receptors(AMPARs)的細胞內運送與閘控特性。它促進 AMPARs 運送至細胞膜及突觸,並改變受體閘控的時間特性:使受體活化、去活化與去敏感化的速率減慢,同時促進受體再敏感化。因此,其作用涵蓋受體抵達膜與突觸的位置,以及受體反應隨時間變化的特性。

這種調節並不依 AMPAR 的次單元種類而有所區別;來源指出 CACNG8 可調節所有 AMPAR 次單元。現有資料支持其參與鈣離子通道活性調控及 AMPAR 運送、閘控調節,但未提供足以進一步說明下游生理結果的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 53962937 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNG8 ENST00000270458 GRCh38 chr19:53961937-53963037 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTTGAAGAGAGGTTGAGAGATTTATTTTTTCCTAAGGAGAGGAAACTGTGGGGGACCATTTGGAGTGAT
GGAATGACAAAAGCCAGACCGGAGGGGGCTCGCGGAGGTTACTCCCACGGAAGTGGTGCTACTCGGGCTT
CTTAAGTTGTGGAGACGCTCAGGGAAAAGTTGGGCTGACAGGGAAGGGTTCTAGCGGGTGGAGAGGTGGG
GCTTGCAGGGGAAGAGTGGGGAGAGCTGGTGGGCGCCGCATGGTGATGGGGCGGGGGTCGCTAAGGAAGG
AAGAACGCGACGGGGGCTCCTGGGGAGGAGGCGGCGGCGTGGGGCTTGGCATCATGGCGGGGGGTGGCTT
CCCATGCGATGAGGATCGTGGAGCCCCCTGGGGCGGAGGCGGCGCGGGCTAGGGGCGAGGGCTGTGAGTG
TGAGCGGTGGTGGGGACTCCTCCGAGTGGGGTTAGTGGGATGGTGGGACGACTTTCTTGGGCAGAAGACA
GGAGTGGAGAGAGATTTCATCTTATTTATTAATTATTAGCGGTGGTGGGGACTCCTCCGAGTGGGGTTAG
TGGGATGGTGGGACGACTTTCTTGGGCAGAAGACAGGAGTGGAGAGAGATTTCATCTTATTTATTAATTA
TTAGCGGTGGTGGGGACTCCTCCGAGTGGGGTTAGTGGGATGGTGGGACGACTTTCTTGGGCAGAAGACA
GGAGTGGAGAGAGATTTCATCTTATTTATTAATTATTAGCGGTGGTGGGGACTCCTCCGAGTGGGGTTAG
TGGGATGGTGGGATGACTTTCTTGGGCAGAAGACAAGAGTGGAGAGAGATTTCATCTTATTTATTAATTA
TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTGAGAAAGAGAAGCAGTGGAGCCCCGAGTGGAAGGAGTT
TCTGGAGCTGAGGCAGGGATTTTGGGGGGGGGGGGGCGGGGACTGGGGGAGGTACCTGTGCCTTCTTCTC
CTCTAATGCGAGATCTCGCTCCTTGCCCTCCACCAGCCGCCGACCATGGCCGCGCTCTGACCCCCTCCCC
GGCCGCAGCCTCCTCCTCGCCGCCCCCCTCCCCAGCCCCGCCGGCCCCGGG
CACNG8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CACNG8_1 ↗19:53,962,959正股53,962,910–53,962,969

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83KSHX · enhancer · 53958354–53958556 · regulatory

ENSR19_9RFB2 · enhancer · 53961816–53962157 · regulatory

· motif · 53958193–53958203 · motif

· motif · 53958198–53958208 · motif

· motif · 53959464–53959474 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:425 aa

1 aa425 aa功能區域跨膜區
依 Q8WXS5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNG8 蛋白質長 425 個胺基酸,屬於 PMP-22/EMP/MP20 family 的 CACNG 子家族。序列註解列出五段螺旋型跨膜區,位於第 19–39、129–149、158–178、208–228 與 318–338 個胺基酸;另有三段區域被註記為無序區。

跨膜區Helical19–39 aa
跨膜區Helical129–149 aa
跨膜區Helical158–178 aa
跨膜區Helical208–228 aa
跨膜區Helical318–338 aa
功能區域Disordered272–304 aa
功能區域Disordered343–365 aa
功能區域Disordered377–425 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WXS5…

AlphaFold · Q8WXS5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Postsynaptic density membrane

CACNG8 位於細胞膜,並被註記為多次穿膜膜蛋白;另有其位於突觸後緻密區膜的定位記錄。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Postsynaptic density membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 19 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CACNG8CACNG8APBA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZPATJTJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNG8 與 CACNA1C 有交互作用,並被鑑定存在於含 CACNA1C、CACNA2D1,以及 CACNB1 或 CACNB2 的 L 型鈣離子通道複合體。對 AMPAR,CACNG8 作為輔助次單元;資料記載其與 GRIA1、GRIA2、GRIA3、GRIA4、CNIH2、CNIH3、CACNG2、CACNG3、CACNG4、CACNG5 及 CACNG7 同屬一複合體,並與 CNIH2 交互作用。另有依相似性記載的複合體包含 GRIA1–GRIA4、DLG4 與 CNIH2。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CACNG8 可調節含 CACNA1C 孔道形成次單元的 L 型鈣離子通道活性,但此項依相似性推定。它也調節 AMPAR 的運送與閘控,促進受體到達細胞膜及突觸,使活化、去活化和去敏感化速率減慢,並促進再敏感化;其調節涵蓋所有 AMPAR 次單元。含實驗來源
證據與來源

Regulates the activity of L-type calcium channels that contain CACNA1C as pore-forming subunit (By similarity). Regulates the trafficking and gating properties of AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Promotes their targeting to the cell membrane and synapses and modulates their gating properties by slowing their rates of activation, deactivation and desensitization and by mediating their resensitization. Does not show subunit-specific AMPA receptor regulation and regulates all AMPAR subunits

PMID 20805473 ↗ · PMID 21172611 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CACNG8 與 CACNA1C 交互作用,並與 CACNA2D1 及 CACNB1 或 CACNB2 一同出現在 L 型鈣離子通道複合體中。它是 AMPAR 的輔助次單元,並被記載於含 GRIA1–GRIA4、CNIH2、CNIH3、CACNG2–CACNG5 及 CACNG7 的複合體;另與 CNIH2 交互作用。含 DLG4 的複合體記載依相似性推定。推論支持
證據與來源

Interacts with CACNA1C. Identified in a complex with the L-type calcium channel subunits CACNA1C, CACNA2D1 and either CACNB1 or CACNB2. Acts as an auxiliary subunit for AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Found in a complex with GRIA1, GRIA2, GRIA3, GRIA4, CNIH2, CNIH3, CACNG2, CACNG3, CACNG4, CACNG5 and CACNG7. Interacts with CNIH2. Found in a complex with GRIA1, GRIA2, GRIA3, GRIA4, DLG4 and CNIH2 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CACNG8 的定位記錄包括細胞膜與突觸後緻密區膜,並註記為多次穿膜膜蛋白;此資料未列出定位改變的條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Postsynaptic density membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000270458 · 8,850 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTGCCCTCCACCAGCCGCCGACCATGGCCGCGCTCTGA40
41CCCCCTCCCCGGCCGCAGCCTCCTCCTCGCCGCCCCCCTC80
81CCCAGCCCCGCCGGCCCCGGGCCCCCCGCTTCTGCCTGCG120
121CTGTGAACCCCCCCCCAGCCGCCGGCACGGCCCCGCCCCC160
161GCTGCCCCGGTGGTGGCCCACGGCCCCCCGGCTGCCCGTG200
201GTCAAACTGGAGTCGCTGAAGCGCTGGAACGAAGAGCGGG240
241GCCTCTGGTGCGAGAAGGGGGTGCAGGTGCTGCTGACGAC280
281GGTGGGCGCCTTCGCCGCCTTCGGCCTCATGACCATCGCC320
321ATCAGCACTGACTACTGGCTCTACACGCGCGCCCTCATCT360
361GCAACACCACCAACCTCACGGCCGGCGGCGACGACGGGAC400
401CCCCCACCGCGGGGGCGGCGGCGCCTCGGAGAAGAAGGAC440
441CCCGGCGGCCTCACGCACTCGGGCCTCTGGAGGATCTGCT480
481GCCTGGAAGGGTTGAAAAGAGGCGTCTGCGTGAAGATCAA520
521TCATTTCCCGGAGGACACGGACTACGACCACGACAGCGCG560
561GAGTATCTACTCCGAGTTGTCCGGGCCTCCAGCATCTTCC600
601CCATCCTTAGCGCCATCCTGCTGCTGCTCGGGGGTGTGTG640
641CGTGGCGGCCTCCCGCGTCTACAAGTCCAAGAGGAACATC680
681ATTCTGGGCGCAGGGATCCTGTTCGTGGCAGCAGGCCTGA720
721GCAACATCATCGGCGTGATCGTGTACATCTCCGCCAACGC760
761GGGCGAGCCGGGCCCGAAGCGGGACGAGGAGAAGAAAAAC800
801CACTACTCGTACGGCTGGTCCTTCTACTTCGGCGGGCTGT840
841CGTTCATCCTGGCCGAGGTGATAGGCGTGCTGGCCGTCAA880
881CATCTACATCGAGCGCAGCCGCGAGGCGCACTGCCAGTCT920
921CGCTCGGACCTGCTCAAGGCCGGCGGGGGCGCGGGCGGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。